异硫氰酸胍-酚-氯仿—步法提取RNA时某些操作技术的改进

在异硫氰酸肥和卜流基乙醇等变性剂存在的情况下，RNase是不会起作用的，含RNA，DNA和RNase的溶液（水相）在酸性pH下经酚／氯仿反复抽提使RNase蛋白变性，而RNA游离进入水相的能力明显优于DNA，反复抽提后的水相经异丙醇沉淀，便可获得高质量的RNA。样品粉碎后，酚／氯仿反复抽提在超净台中进行，其余操作在带盖的经处理的离心管内完成，排除了外源RNase污染的可能性。由于变性剂始终和＊＊A在一起（水相），内源RNase虽存在，但不起作用。故该方法具有快速、简便、能同时处理多个样品的优点，重复性和RNA质量都较好，完全能满…     

乙醇保存的动物标本基因组DNA提取方法的比较

为提高从乙醇长期保存的动物标本中提取大分子DNA的质量,用5种不同方法对动物组织进行预处理实验,然后采用SDS／蛋白酶K裂解,酚一氯仿抽提和乙醇沉淀提取总DNA,通过0．8％琼脂糖凝胶对模板进行电泳和PCR产物作鉴定,经比较,用0．9％NaCL法、PBS法和混合液法进行预处理,消除乙醇对Taq酶的影响以及蛋白质和核酸交联问题,为提取动物基因组DNA的3种更理想方法。     

泡桐丛枝病类菌原体DNA的分子克隆与序列分析

以部分纯化的泡桐丛枝病类菌原体为材料,抽提ＤＮＡ,进行ＥｃｏＲ Ⅰ－Ｈｉｎｄ Ⅲ双酶切,回收的ＤＮＡ 片段插入到载体ｐＧＥＭ－３Ｚｆ（＋ ）中,转化Ｅ．ｃｏｌｉＤＨ ５α。经双重杂交初筛以及Ｄｏｔｂｌｏｔ和Ｓｏｕｔｈｅｒｎ ｂｌｏｔ杂交的回交确证,获得两个仅与患丛枝病泡桐总核酸有杂交而与健康对照无杂交的克隆（Ａ４,１．６９ ｋｂ;Ｃ４２,２．０８ ｋｂ）。部分测序的结果表明：Ａ４ 和Ｃ４２插入片段中Ａ＋Ｔ含量分别为７２．５％ 和６７．９％ ,具有典型支原体属微生物的碱基组成特征     

常用的核糖核酸制备条件对牛胰核糖核酸酶活力的影响

(1)RNA的存在与否对牛胰RNase在酚水两相体系中的分配性质有决定性的影响。(2)6%以上的苯酚基本上抑制了RNase的活力,加入鼠肝匀浆,抑制作用不变。但用乙醚将苯酚除去后,RNaso活力可以恢复。(3)水层中的RNase能和RNA、DNA或白蛋白一同为乙醇所沉淀。RNase也能和RNA为1M氯化钠所共沉。(4)比较了几种常用的RNA制备方法对牛胰RNase活力的影响。磺酸十二酯钠和苯酚相似,是RNase的可逆抑制剂,膨润土是除去RNase的良好材料。(5)对文献上RNA样品不稳定的原因进行了分析。     

一种简单高效的食用真菌总RNA提取方法

以金针菇为材料,建立了一种适合于富含RNase、多酚、多糖和糖蛋白的食用真菌RNA的提取方法,此方法在高浓度变性剂存在的条件下2次用苯酚-氯仿-异戊醇进行抽提去除DNA、蛋白质,并用异丙醇和乙酸钠选择性沉淀RNA、去除多糖,得到完整、均一的RNA样品。 Abstract:With Flammulina velutipes material,an improved method was developed for extracting total RNA from domestic fungus that are rich in RNase,polyphenols,polymeric carbohydrates and proteoglycans..Phenol-chloroform-isoamyl alcohol were used twice to clear DNA and protein under higher concentration of denaturing solution and isopentanol,sodium acetate were used to precipitate RNA selectively.Pure and intact RNA can be effectively prepared by this method.     

一株貂肠炎病毒某些特性的研究

采用猫肾传代细胞FK增殖华东地区分离的貂传染性肠炎病毒(mink infectious enteritis virus,MEV-S_1)能产生明显的细胞病变。浓缩的病毒液经Sepharose-4B柱层析提纯处理后置电镜下观察,可见典型的病毒粒子。经蛋白酶K、SDS裂解病毒,用苯酚-氯仿法抽提病毒核酸,二苯胺试验和酶消化试验表明该病毒核酸为DNA类型。吖啶橙染色试验表明该DNA为单链。甲酰胺法进行核酸分子展层,病毒核酸呈线状,长度为1.5～2.0/μm。     

大型纤毛虫总RNA的提取方法

以冠突伪尾柱虫为材料,建立了一种适合于富含RNase和多糖的大型纤毛虫总RNA的提取方法。该方法采用异硫氰酸弧和β-巯基乙醇联合快速变性,酚、氯仿和异戊醇抽提,同时在变性剂存在的条件下两次选择性地沉淀RNA,从而有效地去除了DNA、蛋白质和多糖。所得RNA样品经电泳、紫外分光光度法检测和RT-PCR分析,证实为完整、均一且无基因组污染的总RNA.这为构建冠突伪尾柱虫有小核系与无小核系之间的削减文库、筛选两细胞系差异表达的基因奠定了基础。     

G-四链体:核酸的“新”结构

<正>核酸(包括DNA和RNA)是体内最重要一类生物大分子,DNA主要作为遗传信息载体,而RNA则作为信息中介分子、调节因子和酶等发挥多重生物学功能。核酸分子空间结构形式复杂、可变,可采用多种构象,在体内DNA主要为双螺旋结构,而RNA采取单链为主局部双螺旋结构,此外还存在一些特殊结构,如Z-DNA和G-四链体(G-quadruplex)等,这些结构对保证基因组完整性、基因表达和调控都具有重要作用。由于结构     

嗜热古菌Archaeoglobus fulgidus RecJ核酸酶的表达纯化及酶学特征

【目的】克隆表达嗜热古菌Archaeoglobus fulgidus (A.fulgidus)来源的RecJ核酸酶基因(ORF编号AF_0699,NCBI数据库基因登陆号为AF_RS03550),对该重组蛋白的核酸酶活性及酶学特征进行鉴定和分析。【方法】将A.fulgidus RecJ (AfuRecJ)核酸酶在大肠杆菌中进行重组表达,经亲和层析纯化得到电泳纯蛋白;利用人工合成的带有末端荧光标记的寡核苷酸作为底物,体外反应后,利用8 mol/L尿素变性聚丙烯酰胺凝胶电泳鉴定AfuRecJ核酸酶的水解产物。【结果】AfuRecJ核酸酶具有单链DNA特异性的3’–5’外切核酸酶活性,酶活性依赖于二价金属离子Mn2+或Mg2+,且Mn2+存在条件下的催化效率明显优于Mg2+;其最适反应温度范围为55–65℃;高于200 mmol/L的NaCl会显著抑制AfuRecJ的核酸酶活性。AfuRecJ还具有单链RNA 3’–5’外切酶活性,且活性高于单链DNA底物。单链核酸3’末端的磷酸基团对水解活性有一定抑制作用。AfuRecJ对单链核酸的长度有一定的选择性,可以有效水解长度≥4个核苷酸长度的单链RNA、≥12个核苷酸长度的单链DNA,而且对双链DNA中的3’单链DNA结构(3’突出单链尾巴与末端分叉结构)具有类似单链DNA的水解活性。【结论】本研究证实AfuRecJ是一种单链核酸特异性的3’–5’外切核酸酶,且相比单链DNA,单链RNA为优势底物,推测其在胞内可能参与RNA降解与DNA修复。     

一种简易高效提取多种植物纯净DNA的方法

植物组织中次生代谢产物较多,要从中快速提取高质量的DNA比较困难。本文利用一种改良的CTAB法,通过在裂解后直接添加RNase A去除RNA污染,然后再经过一系列的抽提、沉淀、洗涤,获得纯净的DNA。经用琼脂糖凝胶电泳及核酸检测仪检测总DNA的纯度、浓度及质量。以提取的DNA为模版,PCR能够获得清晰的目的条带。结果表明通过该法可以简易、快速、高通量的提取多种植物的纯净DNA,为后续的分子生物学分析奠定了技术基础。     

一种高质量麦冬总RNA的提取方法

本方法采用CTAB作为去污剂,分别用氯仿/异戊醇反复抽提、LiCl沉淀,以去除蛋白质、碳水化合物和次生代谢物等杂质,用DNase处理去除DNA污染,最后用无水乙醇沉淀获得总RNA。该方法不仅能获得完整性好、纯度高的总RNA,而且操作简单、成本低廉、RNA产率高,对富含次生物质的中草药材植物组织总RNA的提取具有借鉴意义。     

双歧杆菌分泌RNA的实验

目的：通过双歧杆菌对数生长期培养液中出现核酸的性质的研究探索双歧杆菌作用于机体的分子机制。方法：采用液体培养双歧杆菌方法;提取对数生长的双歧杆菌培养发酵液中的总核酸;将纯化后的核酸用RNA降解酶降解,电泳观察核酸条带电泳结果。结果：双歧杆菌对数生长期培养发酵液中仅存在RNA。结论：双歧杆菌对数生长期可能分泌100bp RNA。     

植原体DNA提取方法的改良

在总结多种植原体DNA提取方法的基础上 ,发展了一种提取植原体DNA新方法。用此方法提取的DNA经琼脂糖凝胶电泳检测到大于 15kb的DNA主带 ,基本无DNA碎带 ,不用RNase处理 ,也无RNA干扰 ,OD2 60 / 2 80 值显示产物纯度较高 ,无需任何处理 ,即可以作为模板扩增     

从少量培养细胞中同时提取微量蛋白和RNA的方法探讨

为建立一项从少量培养细胞中同时提取RNA和蛋白质的技术 ,向 2～ 3× 10 5细胞中加入 1ml自制RNA提取试剂 ,RNA抽提后剩下的中下两相 ,用异丙醇、盐酸胍和无水乙醇抽提蛋白质 .同时用进口Tripure试剂、经典的异硫氰酸胍 苯酚 氯仿一步抽提RNA法和分子克隆实验手册裂解液制备蛋白质的方法 ,作为对照 .自制试剂提取的总RNA ,18S、2 8S清晰可见 ,2 8S比 18S带亮度强 2～ 3倍 ,带与带之间无拖尾现象 ,5S隐约可见 ,而且成功地进行了Northern印迹、RT PCR分析 ,与经典方法差异不大 ;用此法所提蛋白质 ,经SDS PAGE检测 ,蛋白分离效果很好 ,无杂质 ,且Western印迹检测Giα蛋白 ,可见一条清晰的特异带 ,与常规提取蛋白质 ,结果相似 .从微量细胞中同时提取的RNA和蛋白质 ,得率高、纯度好 ,具有化学完整性和生物学性质     

生物大分子分离技术:过去、现状和未来

生物大分子包括多肽、酶、蛋白质、核酸(DNA和RNA)以及多糖等。生物大分子分离技术是生命科学研究中的关键技术之一。当前,各学科之间的交叉渗透为生物大分子分离技术的发展提供了更多的契机。对以沉淀、透析、超滤和溶剂萃取为代表的传统分离技术,以及色谱,电泳等现代分离技术的发展概况、原理、特点及应用进行了综述。并结合生命科学的发展现状,展望了生物大分子分离技术的发展前景。     

一种从培养细胞中分离高分子量DNA的有效方法

简便快速地分离高分子量DNA技术,无论对核酸分子生物学基础研究还是对重组DNA研究都是十分必需的。Blin和Stafford报道了从组织培养细胞中分离高分子量DNA的方法,此方法步骤繁杂,包括酚、氯仿等有毒溶剂抽提、RNase处理、较长时间反复透析乃至长时间氯化铯梯度离心等,所得样品经乙醇沉淀后往往溶解度偏低。但由于此法确能得到较高分子量的DNA制品,所以沿用至今。近年来由于     

核酸及蛋白质合成、提取、纯化

920805通过酚抽提法从服硫氛酸中纯化质粒〔英〕/Fishe-r,J .A.…了Anal.Bioehem一1991,194(2)一309~315【译自DBA,1991,10(15),91-08441〕 该方法利用自动核营酸提取设备。基本操作是于pH4.5时用酚从IM的脏氰酸中进行抽提,这样能从水相中有效地去除染色体DNA,而超螺旋的质粒DNA仍留在水相中。51核酸酶消化表明,去除的染色体DNA已经变性,因而可溶于有机相。整套方法包括:用溶菌酶、RNA酶A和蛋白酶K连续预处理细菌细胞;消化后的溶液用酚/氯仿十水混合物抽提二次,再用氯仿抽提一次。通过异丙醇沉淀收集纯化的质粒。这样提纯的质粒中…     

一种提取高质量油菜种子和种皮RNA的方法

提取高质量的RNA是从基因表达水平上研究油菜种子和种皮发育的必要条件。现有方法因为油菜种子脂肪、多酚和多糖,难以快速获得完整、高纯度的油菜种子总RNA。本试验针对油菜种子和种皮特点,利用苯酚-氯仿抽提后用无水乙醇沉淀RNA,建立了在油菜种子和种皮中快速提取高质量总RNA的提取方法,电泳分析表明28S rRNA亮度约为18S rRNA的2倍;紫外分光光度计检测A260/A280介于1.8～2.0之间。用该法分离的RNA,已成功用于RT-PCR、Northern blot分析和基因全长的克隆等分子生物学研究。     

一种新的核糖核酸酶-栝楼核糖核酸酶的纯化

从一种高等植物栝楼中分离出一种新的单一碱基特异性核楼核酸内切酶—栝楼核糖核酸酶(RNase TCS),它在pH 3.57M脲的变性条件下,能单一地把RNA分子中尿嘧啶核苷酸的5′端切开,纯化酶在SDS-PAGE中呈单一泳带,分子量为24.2KD,最大吸收峰279nm,比活12800U/mg。     

用酚-氯仿直接从克隆中提取质粒DNA

目的:对用酚-氯仿直接从克隆中提取质粒DNA的方法进行了研究。方法:采用不同次数的酚-氯仿抽提,在不同RNaseA作用温度及作用时间下提取了三种质粒。结果:用酚-氯仿抽提2次,RNase A45℃作用8min,质粒纯度(OD260/OD280)为1.85左右、产量大于0.8μg/克隆。结论:本法不但快速,且所提质粒均能满足后续实验如酶切鉴定、测序等方面的需要。对于大批量重组克隆的筛选尤为适合。