黑叶猴和灰叶猴的线粒体DNA限制性片段长度多态研究

本文以15种限制性内切酶分析黑叶猴和灰叶猴种内及种间mtDNA多态。从各个样品中分别检出了41—50个酶切位点。综合15种限制内酶的酶切类型,在2只黑叶猴和2只灰叶猴中分别检出了两种限制性类型,并与其4个地理来源相对应。结合恒河猴和红面猴的资料,构建了4种猴科动物的分子系统树。结果表明,黑叶猴和灰叶猴种内的分歧分别始于30和35万年以前,两种叶猴的分离始于190万年以前,猴亚科和疣猴亚科的分离应早于1100万年。叶猴属在中国的扩散不是很晚才发生的。     

纪念《动物学研究》创刊三十周年——主编寄语

《动物学研究》创刊于1980年,迄今走过了三十年的发展历程。古人云:"三十而立"。作为一本进入而立之年的学术期刊,经过三十年时代风雨的洗礼,得到了动物学界学者们的普遍赞誉与好评。对此,我们深感欣慰。借此机会,我谨向一贯关心支持本刊的历届编委、审稿专家、广大作者和读者,以及编辑们的辛勤耕耘,致以诚挚的敬意和由衷的感谢!     

白腹锦鸡和红腹锦鸡的遗传分化

白腹锦鸡Chrysolophus amherstiae (Leadbeater)和红腹锦鸡Chrysolophus pictus (L.)是两个种还是两个亚种尚有争议。测定了白腹锦鸡C.amherstiae两个个体部分细胞色素b基因序列,得到完全相同的861bp的序列。与红腹锦鸡C.pictus的同源序列相比,在21个位点上出现变异,应用木村资生的双参数法算出两者的遗传距离为2.5％。根据鸡形目细胞色素b基因核苷酸替换的速率约为每百万年0.5％～ 0.7％,推断出两种锦鸡的分化时间至少为1.7百万年。从而在分子水平上支持白腹锦鸡(C.amherstiae)和红腹锦鸡(C.pictus)是两个独立种。 Abstract：It was disputed that Chrysolophus amherstiae (Leadbeater) and Chrysolophus pictus (L.) were two species or two subspecies.DNA sequences spanning 861 nucleotide bases of the mitochondrial cytochrome-b gene were reported in two C.amherstiae.21 sites were different compared with C.pictus's homologous sequences. Genetic distance between C.amherstiae and was 2.5％ based on the Kimura's two parameter's methods.The divergence time between C.amherstiae and C.pictus was at least 1.7My based on the substitution rate of nucleotide acid of cytothrome-b gene in Galliformes.We suggested that Chrysolophus amherstiae and Chrysolophus pictus are two distinct species.     

基于MiSeq测序分析新疆泥火山土壤细菌群落多样性

【目的】以新疆乌苏泥火山土壤为研究对象,了解泥火山细菌群落结构及其时空动态变化。【方法】选择泥火山4种不同生境土壤在4、7、11月份采样,应用Illumina Mi Seq测序技术测定泥火山土壤细菌的16S r RNA基因V3–V4变异区序列,分析乌苏泥火山不同生境土壤细菌群落组成。【结果】泥火山土壤细菌在97%的相似水平下共得到OTU个数为29 005,在细菌门水平上共有38种细菌类群,Proteobacteria、Actinobacteria、Bacteroidetes为优势菌群,在属水平上共有72种细菌类群,其中含量最高的是未分类细菌;多样性分析表明生境D的丰度指数和多样性指数最高,将泥火山细菌群落多样性与理化因子结合分析,发现其多样性随着土壤养分的增加而基本降低,说明物种多样性指数与理化因子之间呈负相关关系;OTU水平的分析表明生境A的群落组成在时空动态上没有显著差异,其样品群落组成较为相似,而生境C的物种组成差异较大。【结论】相比较于传统方法,Mi Seq测序能够更全面解析环境样品中微生物多样性,揭示了乌苏泥火山群蕴含着丰富的微生物资源,这将为深入研究泥火山生态系统奠定基础,为合理利用和开发泥火山微生物资源提供指导。     

婆罗门牛mtDNA D-loop变异及其遗传背景

对10头原种婆罗门牛mtDNAD-loop全序列912 bp测序,婆罗门牛遗传多样性丰富,检测到的9种单倍型兼有瘤牛(B.indicus)与普通牛(B.taurus)的遗传背景,核苷酸变异率为6.25 %,单倍型多态度为0.978±0.054 ,核苷酸多态度为0.014 30±0.008 68。所有单倍型聚为明显的两大分支,婆罗门牛的大部分单倍型为普通牛单倍型类群,并占绝对优势(90 %) ,仅Brah-6与亚洲瘤牛聚在一起,属于亚洲瘤牛线粒体单倍型,表明婆罗门牛的确是集亚洲瘤牛、欧洲普通牛等优良特性于一身(易产犊、产肉性能好、耐热与体表寄生虫等)的瘤牛品种之一。育种学家引种瘤牛的目的是改善当地牛的生产力与适应性,现代普通牛表现出明显又普遍的瘤牛渐渗现象。对现代的瘤牛品种而言,除亚洲瘤牛品种外,普通牛对其他瘤牛品种育成的贡献同样高。支持瘤牛(B.indicus)为独立驯化、起源于印度次大陆的假说。     

鱼类多样性的遗传基础

鱼类的多样性正伴随着地球的生物多样性危机而日益受到关注。对鱼类多样性的阐释也成为研究中的热点之一。“机会垂青于有所准备的基因组”。目前的研究表明,基因组的可塑性（ｐｌａｓｔｉｃｉｔｙ）成为物种分化、形态演化以及适应环境改变等的遗传基础。本文侧重于染色体水平,即鱼类染色体数目变化极大、染色体倍型多态、鱼类性别决定系统的多态和超数染色体（Ｂ染色体）的存在提示鱼类基因组的可塑性很强;同时鱼类在基因组中存     

猪科的系统发育与系统地理分化

猪科动物是最为昌盛的哺乳动物之一，但它们的分类及系统发育关系却尚待解决。为此， 用PCR直接测序法测定了一个红河猪(Potamochoerus porcus)、一个马来西亚野猪(Sus barbatus)以及数头欧亚野猪(Sus scorfa)线粒体细胞色素b全序列1 140 bp。结合从GenBank中获得的其他猪科物种胞色素b序列，用邻接法和最大简约法构建了猪科物种的系统发育关系，其结果显示苏拉威西鹿猪与其他猪科物种为姐妹群的关系。非洲物种疣猪和河猪聚为一枝，而欧亚猪属物种聚为另一支。各物种在系统发育关系中的位置与它们的地理分布对应。猪属物种可以被划分为3个种组：分布于菲律宾群岛、苏拉威西岛及其邻近岛屿的猪属物种形成一个种组，包括苏拉威西岛疣猪、菲律宾疣猪和印度尼西亚疣猪；欧亚野猪种组，包括欧亚野猪和姬猪；须猪和爪哇疣猪形成一个种组。     

云南保山猪线粒体DNA D-loop区序列初步分析 Primary Analysis of Mitochondrial DNA D-loop Region Sequence in Baoshan Pig

摘要：为了解云南保山猪(Baoshan pig)的遗传多样性及其遗传背景,我们测定了19个个体线粒体DNA D-loop高变区I 15 363～15 801片段序列438 bp。检测到10种单倍型,包括8个多态位点,其中5次T/C转换、1次G/A转换、1次G/C颠换和1次A/T颠换,其A、T、G、C碱基的平均含量分别为35.4%、26.9%、13.2%和24.5%,A+T含量(62.3%)明显高于G+C含量(37.7%)。对于保山猪的保种及其持续利用有着重要的理论指导意义。 Abstract:To investigate the genetic diversity and genetic data of Baoshan pig in Yunnan province,the mitochondrial DNA D-loop hypervariable segment I sequences 15 363～15 801 (438 bp) in 19 individuals of Baoshan pig were sequenced.Ten mitochondrial haplotypes were identified in the samples,with 8 sites showing polymorphism,which were 5 T/C and 1 G/A transitions,1 G/C and 1 A/T transversions.The contents of A,T,G and C were 35.4%,269%,13.2% and 24.5%,respectively.The content of A+T (62.3%) was significantly higher than that of G+C (37.3%).It will be of importance to conservation and sustainable utilization in Baoshan pig.     

Ribosomal DNA gene and phylogenetic relationships of Diplura and lower Hexapods

HennigdividedInsectas.lat.(=Hexapoda)intotwowelldefinedtaxonomicgroups:Entog-nathaandEctognatha[1].ThemostdistinctivecharacterofEntognatha(includingProtura,Col-lembolaandDiplura)liesintheenclosedmouthpartscondition,whereasthepresenceofexposedmouthpartsisthemainfeatureofEctognatha(includingMicrocoryphia,Zygentomaandtheptery-goteinsects).ControversiesaboutthephylogeneticrelationshipsofhightaxaEntognathahavekeptgrowinginrecentyears,withthemonophylyofDipluraandthephylogeneticpositionsofDiplur…     

中国家鸡的起源探讨

测定了6个家鸡品种30个个体的线粒体D0环区539bp的碱基序列,并与GenBank中的红原鸡、灰原鸡、绿原鸡、黑尾原鸡及鹌鹑的相应序列作比较分析,构建了分析系统树。结果表明,原鸡属4个种间差异较大,其中家鸡与泰国及邻近地区红原鸡关系最近,与印尼红原鸡、黑尾原鸡、灰原鸡、绿原鸡及鹌鹑的关系依次变远。提示中国家鸡可能起源于泰国及邻近地区的红原鸡。结果还显示,该原鸡的两个亚种（G.g.gallus和G.g.spadiceus)间的遗传分化程度显著低于家鸡亚种内的分化程度,这两个亚种似乎可以归为同一亚种。