人类线粒体DNA世系的系统发育关系研究

本文以人类线粒体DNA为例,回顾了其系统发育关系的重建的研究历史,进而总结介绍了该分析方法在人类进化历史研究、线粒体DNA数据质量评估以及疾病相关线粒体DNA突变的甄别等方面的应用,以期对该方法在国内的推广应用有所裨益。     

遗传学视角下东亚人群的起源和演化

东亚是研究解剖学意义上现代人迁徙和演化的重要地带之一,该地区现代人群的起源及形成问题一直都是人类学领域广泛关注的焦点。遗传学研究为重建东亚人群历史提供了新的视角和见解。越来越多的遗传学证据表明,现代人约20万年前起源于非洲的晚期智人,并于10万年前走出非洲,大约在5~6万年前沿海岸线快速到达东亚南部,进而扩散到整个东亚地区。早期智人可能对走出非洲的现代人有一定程度的遗传贡献。早期定居、文化同化、人群迁徙以及基因交流等,对东亚人群的起源和演化起着至关重要的作用。前期的研究对东亚人群的源流历史进行了细致的分析,很大程度上解决了考古学、历史学等领域长期以来存在的分歧,然而这还需通过全基因组学和古DNA研究的进一步验证。本文从遗传学视角梳理和总结了东亚人群起源、迁徙和演化的历史,完善了对东亚人群演变的系统认识,并对未来东亚人群源流历史研究的发展方向做了展望。     

滇南小耳猪遗传多样性的血液蛋白电泳研究

本文采用蛋白电泳技术研究滇南小耳猪血液蛋白多态性。共分析了滇南小耳猪32个遗传位点,其中AKP、CAT、ES、PA、6PGD和TF等6个位点检测到多态性,多态位点百分比P＝0.1875, 平均杂合度H＝0.0712。结果表明滇南小耳猪的血液蛋白多态程度较高,反映在蛋白质水平上的遗传多样性较为丰富。     

中国地方黄牛的遗传多样性*

中国黄牛起源复杂,我国地方黄牛群体不同品种在毛色、形态外貌、细胞遗传学、血液蛋白座位分析均表现出多样性。计算我国黄牛群体6个毛色座位平均杂合度和6个血液蛋白座位平均杂合度分别为0.3144和0.4873,表明我国地方黄牛群体的遗传多样性非常丰富。计算我国黄牛群体的6个毛色座位和6个血液蛋白座位的基因分化系数分别为0.3404和0.095,表明我国黄牛群体毛色差异中有34.04％是由品种间的差异造成的。血液蛋白的多态性有9.5％是由品种间的差异造成的。我国黄牛群体的遗传多样性主要来自品种内的遗传多样性。保存我国黄牛品种资源多样性不仅要从整个中国黄牛群体上考虑,而且要针对每个品种（或类群）进行保种。     

中国部分猪种SLA-DQB外显子2遗传多样性

运用PCR-SSCP和克隆测序对中国部分猪种的SLA-DQB基因外显子2的多态性分析表明：有功能的DQB基因有68个新等位基因,假基因（SLA-DXB）等位基因有5个。各等位基因的数量分布极其不平衡,而且许多品种都表现出共享等位基因。9个主要等位基因中, C08广泛分布在中国猪种的6大地方类型11个品种及云南和四川野猪中,它为中国猪种特有的共享等位基因,占总数的55.10%。在单一的个体中拥有5条以上序列,说明SLA-DQB基因座在某些品种中拷贝数为3个。SLA-DQB外显子2的等位基因核苷酸和氨基酸多态变异位点分别高达81个和49个,等位基因多样度（H=0.889）以及核苷酸多样度（Pi =0.047）都很高,总体表现为β折叠区的Pi值均高于α螺旋区。综合分析表明华南型、西南型猪H和Pi均较高,高原型的藏猪最低。类群内遗传距离排序与Pi值高低排序一样,可见各地方类型中核苷酸替换的差异正比于核苷酸多样度。类群间遗传距离比较,江海型与华北型间的距离最大,而华中型和高原型间的遗传距离最小。     

乙醛脱氢酶2（ALDH2）基因研究进展及其与饮酒行为的关系

亚洲人群中普遍存在突变型的乙醛脱氢酶2（ALDH2*2）。此酶突变后活性缺失,导致乙醛在肝脏内大量累积使突变携带者在喝酒后会有脸红等不适反应,因此这可能影响他们的饮酒行为。由于ALDH2*2等位基因与饮酒行为相关,它也可能与酒精引起的肝脏损伤及某些癌症密切相关,而且,它在不同的亚洲人群中有不同的频率分布。近年来对ALDH2*2等位基因的序列结构、表达及其重要功能等有了更深入的了解,对ALDH2的多态性在研究方法、研究群体分布范围等都有很大进展。本文还讨论了不同地理分布、不同年龄结构、性别差异条件下,中国人群中ALDH2基因型频率与饮酒行为的关系。 Abstract: An atypical allele （ALDH2*2） in low Km aldehyde dehydrogenase (ALDH2), which is highly prevalent in Asian, may influence drinking behavior because of higher production of acetaldehyde in the liver. High alcohol sensitivity such as flushing after drinking has been shown to be mainly due to the atypical ALDH2 genotypes. The atypical allele is associated with alcohol-induced liver injury and some cancers. Recently, the researches on the polymorphisms not only in the gene itself but also its frequencies in different Asian populations have been made great progress. Three factors, including different sex, age and geography, were also analyzed with the genotypes of ALDH2 in Chinese populations.     

川金丝猴垂体生长激素基因的克隆与初步分析

本研究通过PCR克隆测序,初步确定了川金丝猴(Rhinopithecus roxellanae)的垂体生长激素基因的全部外显子核苷酸序列及推断出相应的氨基酸序列（包括26个氨基酸的信号肽序列以及191个氨基酸的成熟蛋白序列）。我们构建了灵长类7个物种垂体生长激素基因进化关系的基因树。垂体生长激素氨基酸序列的比较和垂体生长激素重要功能位点分析的结果显示：猴科的猕猴与疣猴科的川金丝猴垂体生长激素基因差异非常小。我们推测在猴超科动物中,垂体生长激素无明显功能上的差异。 Abstract:Putative pituitary growth hormone gene of Rhinopithecus roxellanae was cloned and sequenced.All exons sequences and deduced amino acid sequence (containing 26 residues signal peptide and 191 residues mature protein) were obtained.We constructed a phylogenetic tree,which well reflected the true evolutionary relationship of pituitary growth hormone genes from 7 primates species.From the results of amino acids sequence comparison and analysis of functionally important sites of growth hormone,pituitary growth hormone of macaque from Cercopithecidae and snub-nosed golden monkey from Colobidae show little difference.We indicated that pituitary growth hormone from Cercopithecoidea species have no apparently functional difference.     

生物、信息技术是农业发展双引擎

现代农业是以现代生物学和生物技术为支撑、以现代工业装备为物质条件,以科技进步为主要推动力的新型农业。未来10年,我国食物和纤维需求总量将显著增长,消费结构将发生根本变化。生物技术和信息技术是现代农业发展的引擎,推动着农业常规技术的效率革命和农业体系的创新升级,是农业科技的主体。生物、信息技术是农业科技主体以"组学"为基础的生命科学将引领农业生物科技革命精准农业技术、农业智能装备将会得到快速发展记者:中央一号文件提出:"实现农业持续稳定发展、长期确保农产品有效供给,根本出路在科技"。对此您如何理解?张亚平:我认为,发展现代农业,实现农业持续稳定发展,长期     

人猿超科和旧大陆猴7种高等灵长类FKN全基因序列的测定及进化分析

测定人猿超科(人、黑猩猩、大猩猩、红毛猩猩和长臂猿)和旧大陆猴(猕猴和叶猴)7种高等灵长类FKN全基因序列, 探讨其系统进化分析。用简并引物PCR(Degenerated PCR)法分别扩增FKN的3个外显子, 其产物经琼脂糖凝胶回收、纯化后测序, 然后用BioEdit软件剪切拼接FKN基因全序列, 用DNAStar比对后比较基因和氨基酸序列同源性, Mega软件重构FKN基因进化树, 应用Datamonkey分析FKN的负选择位点。序列分析发现人猿超科较旧大陆猴FKN基因除了有散在的点突变外, 还有一明显的30 bp的核苷酸缺失突变; 人FKN基因序列与黑猩猩、大猩猩、红毛猩猩、长臂猿、猕猴和叶猴的同源性分别是99.2%、98.4%、98.1%、96.5%、95.9%和93.8%, 由此推导的氨基酸序列同源性分别是98.5%、98.0%、97.7%、94.7%、93.7%和90.5%; FKN基因进化树表明人与黑猩猩关系更近, FKN基因进化和通常认为的物种进化一致; Datamonkey分析结果显示FKN存在3个负选择位点53Q、84D、239N。成功获得人、黑猩猩、大猩猩、红毛猩猩、长臂猿、猕猴和叶猴7种高等灵长类物种FKN全基因序列, 为后续探讨FKN在高等灵长类物种进化过程中免疫学功能演变及其结构与功能的关系奠定基础。     

江苏省能源农业发展的资源现状与发展潜力

在讨论江苏省农村生物质类型和资源总量的基础上,利用已有统计资料和数据,对江苏省能源农业发展的资源基础现状进行定量的估算,并通过对发展能源农业的种质和可利用土地、江苏省农业和畜牧业发展态势的分析研究,对江苏省能源农业的发展潜力进行了预测.研究表明,2006年江苏省农村生物质能总蕴藏量和可利用量折合标准煤分别达到14238.06万t和2311.54万t.到2010年和2015年,江苏省农村生物质能资源量折合标准煤将分别达到5390万t和6109万t.