TYR基因外显子1的序列变异

为了分析家猪与野猪的遗传多样性及起源,测定了来自１２个中国地方家猪品种、３个欧洲引进猪品种以及8个中国野猪和2个越南野猪共36个个体的酪氨酸酶基因（TYR）外显子1的序列,共检出６个单核苷酸多态性位点（SNPs）,且这6个位点的变异均为同义突变,根据这些变异可将酪氨酸酶基因DNA序列归结为４种单倍型。结合已发表的数据,构建了简约中介网络图。 在网络图中,单倍型TYR*2主要为欧洲家猪与欧洲野猪和三条亚洲家猪染色体。大部分亚洲家猪和野猪共享单倍型TYR*1,表明这是一个亚洲类型的单倍型;同时也有部分欧洲家猪与野猪携带这一单倍型。 而单倍型TYR*3和TYR*4为本研究检测到的稀有单倍型,这两种单倍型主要由中国家猪与亚洲野猪组成。这种网络图结构支持家猪的欧洲和亚洲独立起源学说,同时也表明相当部分的欧洲家猪品种受到亚洲猪的基因渗透,而少量中国家猪和日本野猪也受到了欧洲猪的基因渗透。     

贵州四个山羊品种mtDNA多态性及起源分化

采用１５种限制性内切酶,研究贵州省４个山羊品种共９３只个体的线粒体ＤＮＡ多态性。其中ＢｏｍＨＩ、ＨｉｎｄⅢ和ＳａｌⅠ３种酶的酶切类型存在多态。共检测到１８种限制性态型,归结为３种ｍｔＤＮＡ单倍型。单倍型Ⅰ、Ⅱ在贵州山羊４个品种分布频率较高,分别为７７．４２％和２１．５０％,单倍型Ⅲ分布频率较低（１．０８％）;品种间亲缘关系聚类分析表明白山羊和黑山羊亲缘关系最近,其次为黔林羊,而与小香羊的亲缘关系最     

云南保山猪线粒体DNA D-loop区序列初步分析 Primary Analysis of Mitochondrial DNA D-loop Region Sequence in Baoshan Pig

摘要：为了解云南保山猪(Baoshan pig)的遗传多样性及其遗传背景,我们测定了19个个体线粒体DNA D-loop高变区I 15 363～15 801片段序列438 bp。检测到10种单倍型,包括8个多态位点,其中5次T/C转换、1次G/A转换、1次G/C颠换和1次A/T颠换,其A、T、G、C碱基的平均含量分别为35.4%、26.9%、13.2%和24.5%,A+T含量(62.3%)明显高于G+C含量(37.7%)。对于保山猪的保种及其持续利用有着重要的理论指导意义。 Abstract:To investigate the genetic diversity and genetic data of Baoshan pig in Yunnan province,the mitochondrial DNA D-loop hypervariable segment I sequences 15 363～15 801 (438 bp) in 19 individuals of Baoshan pig were sequenced.Ten mitochondrial haplotypes were identified in the samples,with 8 sites showing polymorphism,which were 5 T/C and 1 G/A transitions,1 G/C and 1 A/T transversions.The contents of A,T,G and C were 35.4%,269%,13.2% and 24.5%,respectively.The content of A+T (62.3%) was significantly higher than that of G+C (37.3%).It will be of importance to conservation and sustainable utilization in Baoshan pig.     

猪STCH基因的Bi-PASA遗传标记及多态性研究

微粒体应激 70蛋白三磷酸腺苷酶 (STCH)基因属于应激 70蛋白基因伴侣家族 ,在机体免疫反应和疾病抵抗力等方面起重要作用。根据人和小鼠STCH基因的保守序列设计引物 ,PCR扩增到猪STCH基因第5外显子 4 4 5bp片段。序列测定显示 ,猪STCH基因与人和小鼠STCH基因分别具有 87 13%和 80 4 5 %的同源性。通过测定和比较中国梅山猪、欧洲约克夏猪及PIC商品猪的STCH基因序列 ,发现在猪STCH基因编码区第 5外显子 10 5 0位点上存在一个单碱基突变位点。利用双向特定等位基因PCR扩增法 (Bi PASA)建立了检测猪STCH基因变异的遗传标记 ,并用该标记分析了STCH基因在中国家猪 (梅山猪、荣昌猪和金华猪 )、欧洲家猪 (约克夏猪、大白猪 )、商品猪 (PIC合成系 )以及欧洲野猪的基因频率和多态性。本研究建立的Bi PASA遗传标记和基因变异信息 ,将为进一步分析猪STCH基因变异与经济性状的相关分析提供基础资料。     

贵州黄牛品种间mtDNA的限制性片段长度多态性研究

以１５种限制性内切酶,用限制性片段长度多态方法分析了贵州黄牛４个地方品种和１个育成品种－贵州黑白花奶牛的ｍｔＤＮＡ多态性。发现贵州黄牛有两种类型ｍｔＤＮＡ分子,即普通黄牛类型和瘤牛类型,两者的频率分别是４４．０７％和５５．９３％,没有发现重组和中间类型。贵州黑白花奶牛的ｍｔＤＮＡ与贵州黄牛类似。贵州黄牛可能起源于普通牛和瘤牛。此外,根据品种间亲缘关系的推断,对“盘江黄牛”和“巫陵黄牛”两个品种的命     

雪峰乌骨鸡自然群体遗传多样性的微卫星分析

雪峰乌骨鸡是具有独特遗传特性的优质肉药兼用地方家禽品种.为了评价雪峰乌骨鸡现有品种资源的遗传背景、群体遗传结构等,提出合理的保种方法和措施,本研究筛选了家鸡基因组23条染色体上的23个微卫星标记,对采自湖南怀化的50只纯种乌骨鸡个体进行了多态性检测.结果表明:23个微卫星座位共检测到79个等位基因,所有座位都呈现出多态性,每个座位的等位基因数在2-6个之间,平均为3.435个.群体表现出较高的平均杂合度和平均多态信息含量,分别为0.6285和0.5496,说明雪峰乌骨鸡自然群体具有较丰富的遗传多样性.研究结果将为雪峰乌骨鸡种的保护和利用提供重要的理论依据.     

甘蔗细茎野生种云南不同生态类型的RAPD分析

利用25个随机引物对来自云南不同生态类型的82份甘蔗细茎野生种（Saccharnm spontanenm L．）和4份国外种材料进行RAPD标记,结果表明：云南甘蔗细茎野生种不同生态类型的遗传变异较大,具有丰富的遗传多样性,低续度类型的遗传多样性明显高于高纬度类型,在相同的纬度范围内,随着海拔的升高,其多态性逐渐减少,基于分子聚类分析,86份材料被划分为8个不同群体,表现出明显的地理分布的特点,结果初步证明了云南甘蔗细茎野生种可能起源于云南南部低海拔,低纬度地区,而后逐渐向高海拔,高纬度的西北和东北部演化,扩散,提出了云南南部可能是野生甘蔗起源中心之一的观点。     

胆固醇酯转运蛋白基因多态性与冠心病关系的研究进展

胆固醇酯转运蛋白(CETP)是杀菌蛋白基因家族的重要成员,其主要功能是介导血浆中的胆固醇酯逆向从外周组织转运至肝脏中。目前,CETP基因被广泛认为是冠状动脉疾病(CHD)易感基因之一,CETP基因位点的遗传差异表明其与高密度脂蛋白浓度的变化有关,而高密度脂蛋白的浓度高低与冠心病的形成有很大的关系。因此,CETP的功能、遗传差异及与冠心病的关系是当前心血管疾病研究中的一个热点。本文较全面地阐述了CETP的生物学特性、功能以及CETP基因多态性与冠心病的关系。     

单核苷酸多态性技术在鸡遗传变异中的研究及应用

单核苷酸多态性(SNP)是继限制性片段长度多态性、微卫星标记之后的第三代分子标记,通常呈双等位基因多态。本文从SNP的特点、SNP的发现与检测、SNP数据库、SNP的频率及其与表型的关系等方面简述了SNP在鸡遗传变异中的研究及应用进展。     

中国主要鹅品种的线粒体DNA多态性与起源分化研究

运用19种限制性内切酶对中国11个家鹅品种138个样本进行了mtDNA的限制性片段长度多态性（RFLP）分析。在使用的19种内切酶中,有7个酶检测出多态。综合27种限制性态型（restrictionmorph）,可得到6种mtDNA单倍型（hopotype）。伊犁鹅与另外10个鹅品种没有共享的单倍型,遗传距离和UPGMA聚类分析也表明,伊犁鹅与这些品种具有不同的起源。EcoRV、HaeⅡ、HincⅡ和KpnⅠ4种酶的限制性态型可作为鉴别两种起源家鹅的母系遗传标记。起源于鸿雁的10个鹅品种群体内出现一定的遗传差异,其群体多态度（π）、单倍型间平均遗传距离（P）、品种间平均净遗传距离（δnet）分别为0．025％、0．266％和0．029％。白羽鹅品种在形成过程中经历过创立者效应（foUndereffect）。这10个鹅品种可能起源于两个不同地理区的鸿雁类群。