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101.
黑色素皮质素受体1基因对水牛毛色遗传的影响 总被引:1,自引:0,他引:1
MC1R在很多动物的色素沉积过程中发挥关键作用。为了阐明MC1R基因是否与水牛毛色性状相关,本研究对216头遗传背景清楚的水牛进行了该基因编码区DNA序列测定。研究的样品包括49头黑色河流型水牛(包括摩拉水牛和尼里-拉菲水牛),136头毛色为灰色或白色的沼泽型水牛(包括德宏水牛、滇东南水牛、德昌水牛、贵州水牛和西林水牛)和31头尼里-拉菲水牛或摩拉水牛与沼泽型水牛的杂交后代。序列分析发现在水牛群体中存在3个单核苷酸突变位点(SNPs),其中SNP684是同义替换,而SNP310和SNP384为非同义替换,并分别导致p.G104S和p.M128I氨基酸的改变。只有基因型为河流型等位基因纯合子胪铲的个体毛色表型为黑色。对黑色河流型水牛与灰色沼泽型水牛的杂交后代基因型和毛色表型的分析进一步揭示:河流型等位基因E^BR或编码p.104S的等位基因对保证MC1R具有正常功能起重要作用。生物信息学功能分析显示,p.G104S和p.M128I两个氨基酸替换对MC1R的功能有显著影响,进一步支持矿。等位基因或编码p.104S的等位基因与水牛黑色性状相关。 相似文献
102.
蝮亚科蛇线粒体细胞色素b基因序列分析及其系统发育 总被引:35,自引:0,他引:35
对中国产蝮亚科(Crotaline)亚洲蝮属(Gloydius)6种蛇(其中短属蝮取自两个不同地区)[短尾蝮Gloydius brevicaudus (Stejneger).黑眉蝮Gloydius saxatilis(Emelianov),蛇岛蝮Gloydius shedaoensis(Zhao),雪山蝮Gloydius strauchii(Bedriaga),高原蝮Gloydius strauchii monticola monticlal (Werner),乌苏里蝮Gloydius ussurriensis(Emelianov)]与竹叶青属竹叶青蛇Trimeresurus stejnegeri Schmidt共7种蛇8个个体测定了789bp或744bp线粒体细胞色素b基因序列,用MEGA1.02软件分析了其碱基组成及变异情况,以游蛇科链蛇属半棱鳞链蛇Dinodon semicarinatus序列为外群,用PAUP4.0b2软件构建最简约分子系统树,结果显示,竹叶青蛇在全部受试物种中处于原始地位,分布于东北地区的蛇岛蝮,乌苏里蝮,黑眉蝮与浙江与陕西产的短尾蝮所组成的分枝与横断山区的高原蝮,雪山蝮聚集形居的分枝组成姐妹群,支持分布于中国境内的亚洲蝮属蛇种的两个起源及分化地的假说,同时探讨了蝮蛇的分类地位问题。 相似文献
103.
哺乳动物cd59基因的进化 总被引:1,自引:0,他引:1
采用PCR以及BLAST方法从5种哺乳动物中获得了cd59基因的编码区序列, 结合 GenBank中已有的序列, 计算cd59基因在哺乳动物中的核苷酸替换速率. 对非同义替换速率和同义替换速率进行比较的结果显示, cd59在哺乳动物中总体上受到负选择作用; 用PAML软件“位点-特异”模型检测到4个受到正选择作用的位点, 4个位点分布于分子表面, 其中2个位于功能重要的区域; 此外, 用“支-位点-特异”模型在小鼠通过基因复制后形成的cd59a和cd59b上检测正选择引起的加速进化, 并检测到该支系特异的正选择位点1个. 相似文献
104.
在大鼠基因组数据库中搜索得到两个泌乳刺激素基因家族的新成员。进一步分析显示该基因家族起源于啮齿目和其他哺乳动物分歧之后,而且大部分基因座位的重排在大、小鼠分歧之前已经完成。但PL-Ⅰ和PL-Ⅱ基因簇却是例外,它们在基因树上以物种特异的方式聚类。结合基因转换的检验、染色体上相对位置比较和基因重复时间估计的结果,认为啮齿目PL-Ⅰ和PL-Ⅱ基因是物种特异的,它们由一系列在大、小鼠分歧之后发生的基因重复事件形成。结果还揭示了在啮齿目泌乳刺激素基因家族进化过程中持续不断的发生了基因重复和基因分化事件。 相似文献
105.
猪科的系统发育与系统地理分化 总被引:2,自引:0,他引:2
猪科动物是最为昌盛的哺乳动物之一,但它们的分类及系统发育关系却尚待解决。为此,用PCR直接测序法测定了一个红河猪(Potamochoerusporcus)、一个马来西亚野猪(Susbarbatus)以及数头欧亚野猪(Susscorfa)线粒体细胞色素b全序列1140bp。结合从GenBank中获得的其他猪科物种胞色素b序列,用邻接法和最大简约法构建了猪科物种的系统发育关系,其结果显示苏拉威西鹿猪与其他猪科物种为姐妹群的关系。非洲物种疣猪和河猪聚为一枝,而欧亚猪属物种聚为另一支。各物种在系统发育关系中的位置与它们的地理分布对应。猪属物种可以被划分为3个种组:分布于菲律宾群岛、苏拉威西岛及其邻近岛屿的猪属物种形成一个种组,包括苏拉威西岛疣猪、菲律宾疣猪和印度尼西亚疣猪;欧亚野猪种组,包括欧亚野猪和姬猪;须猪和爪哇疣猪形成一个种组。 相似文献
106.
107.
动物线粒体DNA多态性的研究概况 总被引:116,自引:12,他引:104
从Nass等(1962)发现线粒体DNA(mtDNA)以来,在mtDNA的结构、组成、复制、转录、基因表达及调控等方面已积累大量的资料(Brown,1983)。人、小鼠、牛、非洲爪蟾(Xenopus laevis)、果蝇和海胆的mtDNA全序列已经清楚。有关 相似文献
108.
非损伤性方法的建立及其在亚洲黑熊分子遗传学研究中的应用 总被引:8,自引:0,他引:8
哺乳动物野生群体和濒危物种的分子遗传学研究长期以来受到组织样品来源的限制。因为传统的分析方法,如蛋白质电泳、DNA限制性片段长度多态及DNA序列分析等,需要采集诸如血液、肌肉、肝脏、心脏、肾脏和脾脏等组织材料以提取足量的蛋白质和DNA。而这又常常涉及捕捉、损伤甚至杀死动物。本工作探索建立一种非损伤性的途径以解决这一困难。我们采用Bio—Rad公司“InstaGenePurificationMatrix”从遗落于地上的亚洲黑熊单根毛发样品中提取出基因组DNA。这种方法简便、快速,仅需一个步骤──在该试剂中以100℃裂解细胞。不必再经酚和氯仿抽提。我们用PCR技术从这种毛发DNA中扩增了线粒体细胞色素b基因片段,并测定了该片段的DNA序列。我们的工作为开展亚洲黑熊及其他哺乳动物野生群体的分子遗传学研究奠定了基础。 相似文献
109.
中国貉随机扩增多态DNA及其亚种分化关系 总被引:29,自引:2,他引:27
对来自陕西、云南、越南、安徽和广西等地的8只中国貉(Nyctereutesprocyonides)进行随机扩增多态DNA分析。应用28个10bp的随机引物,平均每只貉获得的RAPD标记数约为130条。遗传距离计算结果显示,中国貉个体间的平均遗传距离指数值为11.20%,最大值为14.93%,最小值为2.94%。以赤狐(Vulpesvulpes)为外群,应用PHYLIP3.0计算软件包中的UPGMA和NJ聚类方法构建分子系统树。结果表明,不同地理群体间的中国貉存在遗传分化;中国貉可分为4组:(1)广西貉,(2)安徽貉,(3)陕西貉,(4)云南貉和越南貉。其中安徽貉和广西貉间的关系稍近,陕西貉则与云南貉-越南貉稍近。对合中国貉的形态分类、地理分布、mtDNA多态分析以及进化遗传学的观点,认为陕西貉、广西貉和安徽貉可能与云南貉-越南貉具有等同的分类地位。 相似文献
110.
人与大猩猩,黑猩猩和猩猩亲缘关系的探讨 总被引:3,自引:0,他引:3
有关人锆超科的系统发育仍然存在刍议。争论焦点在与大猩猩和黑猩猩哪 个关系更近一点。酪氨酸酶是黑色素合成中的关键酶,酪氨酶基因的突变将导致白化病。测定了人猿科中大猩猩,黑猩猩、猩猩和长臂锆产基因全部5个外显子的DNA序列。 相似文献