Sox and Zfx genes in giant panda

ＯｎｅｏｆｔｈｅｒｅｃｅｎｔｂｒｅａｋｔｈｒｏｕｇｈｓｏｆｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔａｌｂｉｏｌｏｇｙｉｓｔｈｅｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎｏｆｔｈｅｔｅｓｔｉｓｄｅｔｅｒｍｉｎｉｎｇｆａｃｔｏｒｇｅｎｅｏｎｔｈｅｍａｍｍａｌｉａｎＹｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ[1],ＳＲＹｇｅｎｅ,ｂｙａｌｏｎｇｈｉｓｔｏｒｙｏｆｓｅａｒｃｈｆｏｒｔｈｅｇｅｎｅ,ｆｒｏｍＢｋｍ,ＨＹａｎｔｉｇｅｎ,ＺＦＸ/ＺＦＹｔｏＳＲＹ/ＳＯＸ(ＳＲＹｂｏｘｇｅｎｅｆａｍｉｌｙ).Ｒｅｃｅｎｔｓｔｕｄｉｅｓｓｈｏｗｔｈａｔａｎｕｍｂｅｒｏｆｃｌｏ…     

金丝猴属物种高海拔适应遗传机制

正金丝猴属(Rhinopithecus)属于灵长目、猴科、疣猴亚科,是亚洲疣猴亚科中特化程度最高的一个类群。金丝猴属包括5个近缘物种:滇金丝猴(R.bieti)、怒江金丝猴(R.strykeri)、川金丝猴(R.roxellana)、黔金丝猴(R.brelichia)和越南金丝猴(R.avunculus)。所有物种均被列为红色物种名录濒危物种。除了重要保护生物学价值,金丝猴属物种还发展出以树叶为食的特化食性,而且占据了从低海拔到高海拔的生境类型(800~4500 m)。黔金丝猴和越南金丝猴     

核糖核酸酶基因超家族分子进化

核糖核酸酶基因(Ribonuclease A, RNASE A)超家族是进化生物学中研究新基因起源及新功能演变的重要模式系统之一。RNASE A超家族中的很多成员表现出基因复制的进化模式, 而且在适应性(正)选择的驱动下, 发生了功能分化。文章综述了RNASE A超家族成员在不同动物类群中进化模式的研究进展, 包括近年来越来越多在基因组水平上开展的相关研究, 显示该基因超家族可能具有比人们以往认识的更为复杂的基因进化模式。随着越来越多动物基因组数据的产生, 对更多动物代表类群进行RNASE A超家族研究, 将有望揭示新的进化机制和功能分化, 为系统认识动物适应进化的遗传机制奠定基础。     

SLA的分型与检测

传统的强调抗原多态性的SLA分型方法主要是血清学、细胞学和生物化学的方法,随着分子生物学技术发展,各具特点的SLA分型技术不断涌现,如PCR-RFLP法、PCR-SSCP法、微卫星（MS）法、DNA序列的测定等,本文基于强调SLA的抗原多态性的分型和强调抗原保守性的功能学上的新分型技术（如SLA超型和超基序）进行了详细探讨,比较了各类方法的优缺点,指明了未来SLA分型的发展趋势。此外本文还指出了现行参考教材血清学SLA单倍型的编写错误以及重点强调了SLAⅡ-DQB基因的准确分型技术必须借鉴于克隆测序。Abstract：Traditionally the cluster of swine leukocyte antigen(SLA) was typed by serological, cytological and biochemical methods. Many special molecular typing methods have been developed with the progress of molecular biological technology, such as PCR-RFLP, PCR-SSCP , MS and DNA sequencing. Here we discussed the advantages and disadvantages of each method based on the polymorphic and conservative (from the functional aspect, such as supertype and supermotif) characteristics of SLA, and illustrated the development of typing for SLA in the future. In addition, we pointed out the editorial mistakes about the serological haplotye of SLA in reference book and emphasized that the accurate polymorphism of SLA-DQB gene must be based on the cloning sequencing.     

分子钟及其存在的问题

有关分子钟的理论是目前分子进化研究中的热点问题之一。虽然分子钟假说自提出之后对其合理性的怀疑一直存在 ,但目前分子钟在分子系统发育关系重建中有着越来越广泛而深入的应用 ;为了帮助人们消除对分子钟的误解及了解应用中可能存在的问题 ,本文简述了分子钟的概念、对分子钟假说合理性的挑战、引起分子异速进化的原因、如何建立正确的分子钟以及如何在系统关系重建时合理地应用这个概念的一些简要原则     

基于全基因组正选择基因揭示大狐蝠和小棕蝠功能分化分子机制

小棕蝠(Myotis lucifugus)和大狐蝠(Pteropus vampyrus)在生理和行为上有诸多差异,应被诉诸于分子水平并加以系统探讨。该研究对包括小棕蝠和大狐蝠在内的7个哺乳动物全基因组同源编码序列进行了高质量比对,使用比对序列进行了分别以两个蝙蝠枝为前景枝的全基因组水平选择压力分析,并对两种蝙蝠中的正选择基因进行了富集聚类分析。结果表明,在小棕蝠枝受到正选择的基因数高于大狐蝠枝;两种蝙蝠中独立受到正选择的基因富集于不同的功能类别;且正选择基因的富集差异与小棕蝠和大狐蝠在免疫、运动协调、能量代谢和感觉器官发育等关键生物学功能方面的分化大体吻合。     

基于线粒体控制区序列的猕猴属系统发育研究

通过线粒体部分控制区DNA序列数据探讨7种猕猴属物种的分子系统发育关系。结果表明熊猴的核苷酸多样度最高,而藏酋猴核苷酸多样度较低。基于控制区序列数据所构建的最大似然树,不考虑食蟹猴的位置,7种猕猴物种可粗略地分为3个种组,即狮尾猴组(包括北平顶猴)、头巾猴组(包括红面猴、熊猴和藏酋猴)和食蟹猴组(包括恒河猴和台湾猴)。与前人(Fooden＆Lanyon,1989;Tosi et al,2003a;Deinard＆Smith,2001;Evans et al,1999;Hayasaka et al,1996;Morales＆Melnick,1998)的结果不同,我们的结果支持食蟹猴比北平顶猴分化早的假设;东部恒河猴(相对于台湾猴)和东部熊猴(相对于藏酋猴)出现并系。与Y染色体、等位酶、核基因以及部分形态学数据推测的结果(Delson,1980;Fooden＆Lanyon。1989;Fooden,1990;Tosi et al,2000,2003a,b;Deinard＆Smith,2001)一致,红面猴应归于头巾猴组,但此结论与前人(Hayasaka et al,1996;Morales＆Melnick,1998;Tosi et al,2003a)依据线粒体得到的结果有较大分歧。     

除虫菊和茼蒿核糖体ＤＮＡ ＩＴＳ区的序列

除虫菊(Pyrethrum cinerariifolium),又称白花除虫菊,是众所周知的著名杀虫植物,也是目前世界上唯一集约化栽培的天然杀虫剂原料,至今仍为肯尼亚、厄瓜多尔等一些国家的支柱产业。除虫菊的头状花序中含有6种0.4 %～2 %的杀虫成分,即除虫菊酯Ⅰ,Ⅱ(pyrethrin-I,II),瓜菊酯Ⅰ,Ⅱ(cinerin-I,II)和茉莉菊酯Ⅰ,Ⅱ(Jasmolin-I,II),6个成分组成的复合植物杀虫剂,对家蝇的杀虫活性LD50为15～20μg/g,对大白鼠的毒性LD50为2124～2416 mg/kg,对温血动物毒性更低。面对呼唤绿色产业的21世纪,除虫菊的产业开发又成为天然农药开发的一个热点。我们…     

Timeless与生物钟基因

综述了timeless基因的发现、多态性和重要功能。timeless是最先被发现的两个生物钟基因之一。生物钟的昼夜节律由PER、TIM、CLOCK和CYCLE4个生物钟齿轮组成的正负反馈回路进行调节。其中TIM可以受光因子调控,它还可以与PER形成异二聚体,通过正负调控方式调节果蝇的昼夜节律行为。