银染RD-PCR方法分离基因片段

从正常培养的SH-SY5Y细胞中提取总RNA,经oligo(dT)纤维素柱纯化分离出mRNA,然后以oligo(dT18)为锚定引物反转录生成单链cDNA再以此为模板合成DNA的第二条链;将双链DNA经Sau3AI酶切之后,接上接头,经通用引物和选择性引物进行扩增;采用5%非变性PAGE胶电泳分离后,用银染的方法显示DNA条带;在直视下回收DNA带,经过扩增后克隆入pMD18-T载体中并鉴定。结果建立了非放射性同位素的银染RD-PCR方法,用于分离基因片段。     

一种简单、快速、经济的mRNA分离方法

对oligo(dT)纤维素纯化poly(A)RNA的方法进行了改良.缩小了层析柱床的体积,使填料用量仅为常规量的1/50-1/100,即在移液器尖嘴中进行层析.与常规方法相比,它具有实验时间短、洗脱的mRNA可直接合成cDNA和得率较高等优点.     

应用限制性显示PCR技术构建细菌poly(A)化mRNA的cDNA文库

针对细菌mRNA poly(A)化位点的高度多态性,利用oligo(dT)与poly(A)特异结合的特性,以oligo(dT)一纤维素纯化mRNA,并以oligo(dT)18为引物逆转录合成cDNA,用限制性内切酶消化cDNA,所得的限制性内切酶片段与通用接头相连,通过10个选择性引物组合进行选择性PCR,使各片段得以扩增并分布于10个亚组中,并进行克隆,成功地克隆了100多个基因片段,已对其中40个进行了测序分析,探讨了限制性显示PCR技术在细菌poly(A)化mRNA cDNA库构建中的应用价值。     

几种层析柱吸附多聚腺苷酸和与多聚腺苷酸相连的信使核糖核酸能力的比较

我们选用上海试剂二厂生产的oligo(dT)-纤维素,美国P-L厂生产的oligo(dT)-纤维素,瑞典Phamacia厂生产的Poly(U)-Sepharos-4B和美国Sizma厂生产的Sigma cell 38微晶纤     

应用RD-PCR技术制备基因芯片靶基因片段

应用RD－PCR技术分离SH－SY5Y细胞的基因片段。从正常培养的SH－SY5Y细胞中提取总RNA,经oligo(dT）纤维素柱纯化分离出mRNA,然后以oligo(dT18)为锚定引物反转录生成单链cDNA,再以此为模板合成DNA的第二条链;将双链DNA经Sau3AI酶切之后,接上接头,经通用引物和选择性引物进行扩增;然后与载体pMD18-T相连,克隆鉴定、筛选、测序。所分离的cDNA片段经过扩增后用于制备基因芯片的靶基因,杂交检测的结果表明,此种方法所分离的基因片段可以用于基因芯片的靶基因片段,所制备的芯片将为进一步研究神经细胞基因表达提供了条件。     

糖皮质激素受体mRNA的检测

用盐酸胍法和苯酚法从大鼠肝脏分离出了完整的RNA,通过oligo(dT)纤维素亲和层析从中纯化mRNA。然后用GRcDNA探针和mRNA进行Northern印迹杂交和斑点印迹杂交,放射自显影后用光密度计对糖皮质激素受体mRNA进行定量,获得了重复性较好的结果,本方法为从基因转录水平上研究GR的变化打下了必要的基础。     

野生大豆未成熟种子总mRNA的分离及其cDNA的分子克隆

用氯化锂沉淀法从野生大豆(G.soja)未成熟种子中制备总RNA,经oligo(dT)-纤维素柱亲和层析,获得总mRNA,在兔网织红细胞体系中表现出一定翻译活性。以总mRNA为模板,oligo(dT)_(12)(?)为引物,反转录酶催化合成第一链cDNA,RNase H-DNA聚合酶Ⅰ协同合成第二链cDNA。双链cDNA的长度大约为200—5000 bp,且不存在发夹结构。将双链cDNA修补后钝端连接到pUC 19质粒的Sma 1位点,转化E.coli JM107,获得800多个白色重组子克隆。快速电泳检测及酶切分析表明,多数重组子带有插入片段,其中3个重组子的插入片段长度大致为1700 bp、2600 bp和1400 bp。     

大肠杆菌poly(A)化mRNA基因的芯片制备

利用大肠杆菌mRNA中存在的一定程度的poly(A)现象,利用oligo(dT)与poly(A)特异结合的特性,纯化并逆转录mRNA,并应用RD-PCR双方法获得了170多条大肠杆菌poly(A)化mRNA的基因片段,利用这些片段打印成基因芯片,以供后续大肠杆菌的基因表达研究。     

以胸腺嘧啶核苷酸钙盐为材料的Oligo(dT)-纤维素的制备

分离生物体内的mRNA是深入研究遗传信息翻译过程的首要条件,因而为分离mRNA所特需的Oligo(dT)—纤维素在核酸研究中极为重要。目前,一般在制备这种纤维素时,都采用胸腺嘧啶核苷酸铵盐或钠盐。但这两种原料不易多得,而胸腺嘧啶核     

大肠杆菌poly(A)化mRNA基因的芯片制备*

利用大肠杆菌mRNA中存在的一定程度的poly (A)现象 ,利用oligo (dT)与poly(A)特异结合的特性 ,纯化并逆转录mRNA ,并应用RD PCR方法获得了 1 70多条大肠杆菌poly (A)化mRNA的基因片段 ,利用这些片段打印成基因芯片 ,以供后续大肠杆菌的基因表达研究。     

用钙沉淀法分离植物poly(A)-mRNA

本文对Lendes等人用钙沉淀poly(A)—mRNA的方法作了改进。在不加poly(A)的情况下,适当增加总RNA浓度,用15mM CaCl_2沉淀poly(A)—mRNA。使用改进的方法能够得到大量的poly(A)—mRNA。用改进法制各的poly(A)—mRNA;可以用poly(U)—Sepharose4β或oligo (dT)—Cellulose亲和层析作进一步的纯化,也可以直接作为反转录或翻译的模板.     

兔胰mRNA的制备与有胰岛素免疫活性多肽的体外翻译

本文报道从兔胰组织中提取出总RNA后,经oligo(dT)纤维素柱层析纯化,得到兔胰mRNA。研究了此mRNA在麦胚无细胞体系中的翻译。不同的pH和不同浓度的乙酸钾对兔胰mRNA的翻译活性有不同程度的影响。当麦胚体系中镁离子低到1.5mM时,精脒的浓度对兔胰mRNA的翻译也有重要的作用。 利用放射免疫的方法,在麦胚无细胞体系所翻译的混合产物中,测出了胰岛素的免疫活性,大约每50微升中含有2.5微单位。     

鼻咽癌转移淋巴结中EB病毒相关的DNA多聚酶的分离及其特性研究

一种新的DNA多聚酶已从鼻咽癌(NPC)转移淋巴结胞核酶液,通过DEAE-纤维素柱层析而被部分纯化,并可与细胞的α-及β-DNA多聚酶分开。 此酶有下列特点可与细胞DNA多聚酶区分:(1)可放DEAE-纤维素吸附,需用130mMK_2HPO_4缓冲液方可洗脱下来。(2)可被浓盐所激活,150——200mMKCl或75mM(NH_4)_2SO_4可使它显示最高的酶活性。(3)最适pH为8.0。(4)对磷酰甲酸盐的抑制较敏感。(5)能很好地利用某些合成模板,如poly(dA)·oligo(dT)_(10)及poly(dA)·oligo(dT)_(12-18)。但不能利用poly(rA)·oligo(dT)_(10),证明此酶并非细胞的γ-DNA多聚酶,而与巴基特淋巴瘤的EB病毒相关的(EBV)DNA多聚酶性质十分相似。对照的Raji细胞未见此种EBV-DNA多聚酶。 从鼻咽癌淋巴结中分离出此种EBV-DNA多聚酶,将对EB病毒与NPC的发病关系提供新的证据。     

表达基因鉴定的一种新策略：筛选poly（dA／dT）—cDNAs

低丰度表达基因及组织细胞等特异基因的鉴定是人类表达基因鉴定的瓶颈,Wang等认为cDNA中的长序列poly(dA/dT)是限制低丰度表达基因等鉴定效率的主要原因,为此提出了一种新策略,即用3′端锚定oligo(dT)11代替常规oligo(dT)引物逆转录合成cDNA,并将3′端携带11个（dA/dT)s序列的cDNA称之为poly(dA/dT)^-cDNA,筛选poly(dA/dT)^-cDNAs差减文库可以提高这些基因的鉴定效率。     

原核细胞mRNA差异显示技术的引物设计

由于原核细胞mRNA3'端不存在ploy(A)结构,因而原核细胞DDRT-PCR引物设计不同于真核细胞。尽管不能根据oligo(dT)设计引物,但利用全基因中高度分散重复的短序列或回文序列却能有效克服mRNA分子结构的影响,最大限度地扩增全长cDNA;并且这2种引物设计方法还可以提高RNA指纹图谱的重复性,降低反应的假阳性,从而为原核细胞DDRT-PCR引物设计提供新的思路。     

Oligo(dT)-纤维素与Oligo(U)-纤维素的合成及其应用

Oligo(dT)-纤维素与Oligo(U)-纤维素具有分离信使RNA(mRNA)的功能。这是由于大多数的mRNA 分子的3’-末端含有多聚腺嘌呤核苷酸的片段(亦有例外,如一类组蛋白的mRNA),在低温与高离子强度的条件下,此片段能与多聚脱氧胸腺嘧啶核苷酸或多聚尿嘧啶核苷酸形成互补的碱基配对,而核糖核蛋白体RNA(rRNA)与转移RNA(tRNA)缺少多聚腺嘌呤核苷酸的片段,不能被该树脂吸附,利用这一特性可将mRNA与其它RNA分离开来。     

几种提取RNA的方法

以肝脏组织和NDV感染的鸡胚尿囊液为例,简单介绍了几种提取细胞或组织液中总RNA及mRNA的方法－SOD－蛋白酶K法、异硫氰酸胍法、loigo(dT）纤维素亲和层析法。SDS－蛋白酶K法提取RNA经济可靠,但纯度稍低;异硫氰酸胍法适于提取细胞中的总RNA,纯度较高;利用ligo(dT)能与mRNA poly（A^ )尾结合的特性提取组织细胞中的mRNA.     

北京鸭珠蛋白mRNA的分离纯化及其cDNA的合成

 从人工贫血的北京鸭网织红细胞中直接提取总RNA,经Oligo(dT)-纤维素柱层析分离获得珠蛋白mRNA,并经蔗糖密度梯度离心首次得到了电泳单一条带的北京鸭球蛋白mRNA。从凝胶电泳以及蔗糖密度梯度离心鉴定其沉降系数为9S。在麦胚无细胞体外翻译体系中测定了它们的蛋白翻译活力。鸭珠蛋白mRNA促进了~3H-亮氨酸参入新生蛋白的活力,达到对照组的10倍。所翻译的蛋白产物在SDS-聚丙烯酰胺凝胶上的电泳行为与天然鸭珠蛋白一致。 经Oligo(dT)-纤维素及蔗糖密度梯度离心提纯的珠蛋白mRNA,在AMV反转录酶及DNA聚合酶的作用下,分别合成了单链及双链cDNA。其双链链长,经凝胶电泳分析,约为500碱基对。     

人胎肝中肝细胞生长因子poly(A)~ mRNA在非洲爪蟾卵母细胞内的翻译

采用SDS/氯仿/苯酚法和oligo(dT)纤维素亲和层析从人胎肝提取poly(A)~ mRNA,注入非洲爪蟾卵母细胞,翻译出肝细胞生长因子(HGF),产物能从卵母细胞中分泌。在9种细胞(包括人与小鼠的4种不同组织和5种细胞系)检测系统中,证明翻译的HGF与直接提取的HGF活性一致,应用滤膜超滤法估计分子量均在10～30kDa,可以初步认为两者是同一物质。从而,支持了人胎肝HGF是胎儿肝脏细胞基因表达的产物。     

枯草杆菌A_(17)中含Poly(A)的RNA的分离和体外翻译

在以甘油(0.24％)或谷氨酸(0.5％)作为碳源,低磷(6.4×10~(-5)M)合成培养基,37℃下生长15小时的枯草杆菌A_(17),细胞中的含有poly(A)的RNA,可被oligo(dT)-纤维素分离。在培养基中加入赤霉酸(GA_3)30 μg/ml的情况下,含poly(A)的 RNA(峰Ⅱ)约为上柱总RNA的0.16～1.27％,不加GA_3的则为0.16～0.45％。这种含poly(A)的RNA能在麦胚非细胞合成系统中刺激~3H-亮氨酸掺入蛋白质,可为对照的4～8倍,其放射比活性为7000～23000 cpm/μg RNA,说明这种含 poly(A)的 RNA具有mRNA活性。