PON基因簇序列变异筛查研究

摘要：系统筛查PON1、PON2及PON3基因编码、剪接及侧翼序列,以期发现所有潜在功能多态基因座,为进一步探讨PON基因家族与心血管疾病的关系做准备。随机选择48例冠心病患者作为筛查对象, 以PCR产物直接测序检测DNA序列变异。扩增片断涵盖整个外显子, 其两侧部分内含子区域及5’和3’侧翼序列。（1）13.9kb测序范围内共发现31个多态性基因座,均为单核甘酸多态（SNP）,其中17个SNP为首次报道。（2）国人中SNP构成和等位基因频率与高加索人群存在显著差异。（3）一个基因内部两个或多个多态性基因座间存在完全或近乎完全连锁不平衡相当常见。中国汉族人群中PON基因簇多个潜在功能多态基因座的识别及这些基因座间的强连锁不平衡状态,为在国人中探讨PON基因簇与心血管疾病关系提供了重要的基础数据。     

渐近混合群体的混合连锁不平衡及其遗传连锁推断

在渐近混合模型中,混合现象发生在每一世代,通过对其混合连锁不平衡的理论分析,发现混合连锁不平衡与两个子群体间的基因频率差成正比。基于这一点,构造了一个对重组率严格单调的函数（△ker=△／（p1-p2）,其中△代表连锁不平衡）,进而据此推断标记基因座与疾病基因座的遗传连锁。应用人类基因组上不连锁的标记基因提供的连锁不平衡信息,基于病人组数据构造了一个准似然比统计量。模拟结果显示,此检验可用于精确的基因定位。文章亦讨论了参数对检验的影响。     

棉铃虫对氰戊菊酯抗性遗传分析

本文采用剂量对数-死亡机率值回归线(LD-P线)分析法, 利用室内选育的棉铃虫 Heliccverpa armitera(Hubner)对氰戊菊酯抗性晶系和敏感品系,研究了棉铃虫对氰戊菊酯的抗性遗传规律。结果表明,棉铃虫对氰戊菊酯的抗性为多基因遗传,其主要基因为不完全显性,抗性不属性连锁遗传。利用增效剂对抗性机理进行的研究表明,多功能氧化酶(MFO)是棉铃虫对氰戊菊酯产生抗药性的主要因子,因此,可以推断多功能氧化酶基因为不完全显性。     

有关T·H·Morgan规律中几个问题的讨论

Thomas Hunt Morgan发现的基因的连锁和互换规律揭示了连锁遗传的本质。由于不完全连锁是连锁遗传的普遍形式 ,所以探讨不完全连锁遗传中的“基因交换教学图解”、F1产生 2 n 种配子的归纳过程及其证明等几个问题 ,对于全面、系统地认识摩尔根规律以及透彻理解其实质都有着极其重要的意义。1　关于基因交换教学图解的问题在有关教科书、教学挂图以及论文中 ,雌果蝇的不完全连锁遗传教学图解主要有 3种 :图 1- 1图 1- 2图 1- 3　　这 3种图解都是解释 n=2时 ,雌果蝇不完全连锁遗传的 ,究竟哪一种合理呢 ?还是都不合理 ?而 n=3时的图解又是…     

PCR片段测序和基因分型两种方法对Kennedy遗传病的诊断

X连锁脊延髓肌萎缩症（SBMA）或肯尼迪病是一种成年人发病的神经变性疾病,以肌无力与慢性、进行性肌萎缩为特征. 通过PCR片段测序和基因分型法准确检测雄激素受体（AR）基因CAG复制数目,兄弟俩（来自同一个中国家庭）被确诊为隐性遗传性SBMA. 为了得到该中国家庭SMBA家系人员AR基因的CAG复制数目,我们采用了PCR片段测序和基因分型两种方法. 在该SMBA家系中有两个已发病的成年男性、未发病的年轻男性,及女性基因携带者. 两个已发病男性患者AR基因中CAG三核苷酸串重复数目分别是48和45. 以前的研究表明特定三核苷酸串重复数目的扩增可导致人类遗传性神经障碍疾病发病。我们的研究结果完全支持这一观点,SMBA中国家系的三核苷酸CAG拷贝数目检测结果表明,AR基因CAG扩增数目与SMBA发病相关. 关键词雄性激素受体; CAG多重三核苷酸重复; 肯尼迪病; 脊延髓肌萎缩症; X连锁     

为什么两个遗传型先天性聋哑人婚配后代会出现正常小孩?

答：首先应该考虑遗传异质性。遗传异质性即是同一种疾病,可以由不同的遗传基础所致。对于先天性聋哑来说,大约90％为常染色体隐性遗传（AR）,10％为X一连锁隐性遗传（XR）或常染色体显性遗传（AD）。在AR型先天性聋哑中,至少有35个基因座位与之有关,每个座位隐性纯合均可导致先天性聋哑。我们假设一对夫妇均为AR型的情形,其中之一如果是由一对基因隐性纯合（aa）而致先天性聋哑,对方是由于另一对基因隐性纯合（bb）而致先天性聋哑,他们婚后于代中出现不聋哑的孩子是完全可能的。具体的发病风险,取决于该夫妇的基因型,分析如…     

Y连锁遗传的通径分析

在XX-XY型生物中,限雄遗传性状即只能 由父亲传至儿子的性状,完全由Y染色体传 递(1]。人类中,属于Y连锁的性状,已知有辜丸 决定因子（TDF）和Y组织相容性抗原（HY抗 原）,可能还包括毛耳等少数几个性状131。鉴于 Y染色体仅载有少数几个基因,不像X染色体 携带着大量基因,因而至今关于伴性遗传的群 体遗传分析几乎只以X染色体为对象,很少对 Y连锁遗传进行分析。今后随着实验手段等的 发展,Y染色体上的基因肯定会逐渐地增加,因 此有必要对此加以讨论。     

连锁互换实验的好材料—矮败小麦

连锁互换实验的好材料──矮败小麦刘秉华，杨丽（中国农业科学院作物育种栽培研究所北京１０００８１）矮败小麦是具有矮秆基因标记的显性核不育材料，显性雄性不育基因ＭＳＺ与显性矮秆基因Ｒｈｔ１０连锁十分紧密，连锁交换值仅为０．１８％。矮败小麦接受非矮秆品种的...     

中国大麦矮秆种质资源的基因分析——Ⅱ.矮秆基因的染色体定位

根据连锁遗传原理,利用全套染色体形态性状标记系,对２０份中国大麦矮秆种质资源的矮秆基因,进行了染色体定位。结果表明：１５份单基因矮秆中,有１份其矮秆基因与宽护颖基因Ｚ连锁,位于２（２Ｈ）染色体短臂上;１０份的矮秆基因与ｕｚ基因等位,由３（３Ｈ）长臂携带;４份的矮秆基因与钩芒基因Ｋ连锁,位于４（４Ｈ）长臂上。５份双基因矮秆中,有３份的矮秆基因分别位于２（２Ｈ）短臂和４（４Ｈ）长臂上;１份的矮秆基因各由其３（３Ｈ）和４（４Ｈ）长臂携带;其余１份的两对矮秆基因,１对与ｕｚ基因等位,由３（３Ｈ）长臂携带,另１对则与宽护颖基因ｗ连锁,位于２（２Ｈ）短臂之上。     

家畜近亲繁殖群体连锁不平衡的分析

本文分析了家畜近亲繁殖群体连锁位点基因遗传平衡的实现,推导出了配子型频率及基因型频率通用递推公式．研究证明,近交群体不同于随机交配大群体,其连锁不平衡值d（绝对值）随世代的下降速率不仅取决于重组率,而且也依赖于近交速率．近交越剧烈,则d下降越慢;达平衡态时,近交群体d值并不一定等于0．连锁越紧密,近交越剧烈,则平衡d值越大．最后讨论了研究结果在家畜育种中的应用．     

TNFR2基因的CA重复多态性在两个独立的白人群体中与肥胖表型的连锁和关联

我们先前通过全基因组扫描发现lp36与体重指数显提示性连锁（LOD=2．09）。肿瘤坏死因子受体2（1NFR2）定位于lp36,是肥胖的一个极好的图位和功能侯选基因。本研究采用数量传递连锁不平衡检验在两个大的独立的白人样本中进行了TNFR2基因与肥胖表型的连锁与关联检验。第一组受试者由来自79个多代家系的1836个个体组成;第二组受试者由来自157个核心家庭的636个个体组成。所检测的肥胖表型包括体重指数、脂肪量和脂肪量百分数。在多代家系中我们发现TNFR2基因变异与BMI显著连锁（P=0．0056）。结果表明,TNFR2基因是影响白人BMI变异的一个数量性状位点。     

动物模型的特征

动物模型是一系列具有不同结构的线性混合模型,共同特征是估测动物个体本身的育种值。在动物模型下,任一个体育种值的估计都能按最佳形式利用其所有可知亲属的记录资料。从统计学意义上看,动物模型在提供育种值的最佳线性无偏预测（BLUP）的同时,提供固定效应的最佳线性无偏估计（BLUE）,使固定环境效应易除得最为合理。对于由大量加性基因控制的性状,动物模型能反映选择、遗传漂为对群体遗传均值和方差的影响。近交和连锁不平衡的影响也可视为选择的结果。因此动物模型适用于存在选择、漂变、近交以及连锁不平衡的群体。     

利用与PKD1紧密连锁的微卫星多态性对黑龙江省汉族人群进行ADPKD的症前诊断

目的：利用与PKD1紧密连锁的微卫星的多态性对黑龙江省汉族人群常染色体显性遗传性多裳肾病（autosomal dominant polycystic diseaseADPKD）家系成员进行症状前诊断。方法：扩增PKD1基因内部（KG8）及基因两侧（AC2．5、CW4）共三个微卫星遗传标记,并采用聚丙烯酰胺凝胶电泳进行检测,银染,最后进行家系连锁分析。结果：家系1中一名男孩携带了PKD1突变基因,处于发病前期。结论：通过连锁分析ADPKD进行连锁分析能高效、快捷、准确地进行早期诊断.     

论受控于X连锁基因性状的变异性

本文应用数量遗传学方法,结合概率运算,从理论上分析了由X连锁基因控制的性状在雌雄群体中的变异情况。表明雄（男）性群体的这类性状遗传变异范围有大于雌（女）性群体的倾向。对这一问题的探讨,将有助于对X连锁基因及所决定性状的遗传特性、进化特点及基因定位等的研究提供新的思路。     

中国大麦矮秆种质资源的基因分析Ⅱ．矮秆基因的染色体定位

根据连锁遗传原理,利用全套染色体形态性状状标记系,对２０份中国大麦筹秆南资源的矮秆基因,进行了染色体定位,结果表明,１５份单基因矮杆中,有１份其矮秆基因与宽护颖基因w连锁,位于２（２Ｈ）染色体短臂上;１０份的矮秆基因与uz基因等等位,由３（３Ｈ）长臂携带;４份的矮秆基因与钩芒K ,锁位于４（４Ｈ）长臂上,５份双基因矮秆中,有３份的筹秆基因分别位于２（２Ｈ）短臂和４（４Ｈ）长 臂上;１份的筹秆基因各由其３（３Ｈ）和４（４Ｈ）长臂携带;其余１份的两对矮秆基因,１对与uz基因等位,由于３（３Ｈ）长臂携带,另１对则与宽护颖基因w连锁,位于２（２Ｈ）短臂之上。     

猪Pitx2c基因4个SNPs的鉴定及其与肉质性状的关联分析

为研究猪Pitx2c基因与肉质性状的关系,在猪Pitx2c基因中共发现了8个SNPs位点,对其中的4个SNPs位点在4个商业猪种及8个中国地方猪种进行了等位基因频率检测,并在大白×梅山猪F2资源家系中进行了性状关联分析.结果显示,位点c.474C〉T（P〈0.01）及c.636C〉T（P〈0.05）与肉色（MCV1）存在显著或极显著相关;位点c.＊37G〉A及c.＊47G〉A与滴水损失（DLR）、系水力（WHC）及肉色（MCV1）均存在显著相关（P〈0.05）.连锁不平衡分析表明,临近的位点两两之间存在连锁不平衡（LD）.单倍型分析显示,存在两种主要单倍型,并且两拷贝的单倍型-CCGG-有利于肉质的改善.     

人类混血群体连锁不平衡的遗传学模型与基因定位

人类混血群体可以说是混合群体的一种特例．在无选择、无突变、无限随机交配群体的假定前提下,研究了亲本群体的基因频率对混血群体及其衍生后代群体连锁不平衡结构的影响,导出了各群体连锁不平衡值的表达式,建立了一个估计基因间重组率的简便方法;同时, 采用估算分子标记与QTL之间连锁不平衡系数的统计分析方法,分析了人类混血群体及其衍生后代群体QTL检测与估计的关系,建立了该关系的系列理论公式．研究结果表明,本方法不仅适用于人类疾病(包括复杂遗传疾病)基因定位,而且适合于人类正常基因的定位,同时也适用于人类普通多基因性状的QTL分析．     

亚洲玉米螟对氰戊菊酯抗性遗传的研究

本文利用生物测定法来分析亚洲玉米螟对氰戊菊酯抗性品系（３８．３倍）的遗传。氰戊菊酯抗性品系（Ｒ）和敏感品系（Ｓ）两杂交后代Ｆ＿１（Ｓ♀ｘＲ♂）及（Ｒ♀ｘＳ♂）,对氰戊菊酯的ＬＤ＿（５０）和毒力回归线均在Ｒ和Ｓ品系之间,且两杂交后代的反应值均相近,抗性与性别无关。抗性的显性程度（Ｄ）测定得出,两Ｄ值分别为－０．０１和０．０５,均接近于０,表明该抗性为中间型,并由１个或多个不完全显性基因控制的。     

水稻叶色与若干农艺性状连锁遗传的分析

以遗传方式为抑制互作的两对叶色基因为遗传标记,检测了绿叶品种Y双402与紫叶品种紫稻的杂交F₂中遗传标记与7个数量性状的基因间的连锁关系．发现控制株高、有效分孽、穗长、粒重和穗粒数的QTL（拟名为ht-1,tl, pal, gw和gn）与色素抑制基因I-P1(t）连锁,重组率分别为0、0、0.06,0.04和0.06．另一控制株高的QTL(拟名ht-2)与色素基因Pl(t)连锁,重组率为0.09．对株高、穗长和粒重3个性状而言,增效基因对减效基因为完全显性;有效分孽和穗粒数两性状的QTL只表现简单的加性效应．     

一种有效的复杂疾病基因定位的检测法

连锁不平衡（LD）应用于某些复杂疾病基因的定位,近年来发展了许多LD定位方法,除TDT外,大多数LD定位方法须先假定无人群混和,人群混合可增大在疾病基因定位时犯Ⅰ类错误的机率,产生无效结果。此方法利用LD来检测标记位点和疾病敏感位点（DSL）的连锁（有连锁不平衡）相关（有连锁）。分析时采用不相关样本,已知其父母基因型和至少父母之一为杂合子,再将随机样本依基因型不同分类,然后对来自不同类的数据应用有力的统计方法进行单独和联合分析。此LD定位法不仅适用于患病和正常个体,而且有效消除据父母基因分类的样本定位时人群混合的影响,分析结果和模拟结果也表明此方法解决了在检测标记位点和疾病敏感位点之间的连锁和相关时人群混和的问题,但与TDT比,此法在检测的位点为DSL时丙能有效和充分地利用矫正数据,检测位点不是DSL时,此法和TDT法可相互补充更有效地检测连锁的DSL。