短胶法预处理含高浓度去垢剂的蛋白样品

蛋白质组学研究中常使用含高浓度去垢剂的缓冲液以提高蛋白提取效率,但这种缓冲液会对下游蛋白质定量、酶解、质谱分析等步骤造成干扰。短胶法可用于含高浓度去垢剂样品的预处理,文中进一步评价了短胶法(Short gel)用于含高去垢剂的蛋白样品定量和预处理的效果。使用牛血清白蛋白作为标准蛋白分析了短胶法定量的线性范围,结果发现短胶法定量的线性范围为1-8μg,提示可对这一范围内的样品蛋白进行定量检测。对标准蛋白定量的线性度达到0.999,且重复性好,不容易受到蛋白表达模式变化的影响,结果可靠。短胶法定量的蛋白可通过胶内酶解,直接进行液相色谱-质谱联用(Liquid chromatography-tandem mass spectrometry,LC-MS/MS)分析,质谱信号较好。结果提示直接用短胶法预处理含高浓度去垢剂的蛋白样品,值得在蛋白质组学研究中推广。     

过表达长非编码RNA SLC25A25-AS1可抑制HeLa细胞的增殖、迁移和侵袭

长非编码RNA SLC25A25-AS1在结直肠癌的发展中具有肿瘤抑制作用,然而,其在宫颈癌中作用机制有待深入研究。本文研究了宫颈癌和宫颈上皮内瘤变（cervical intraepithelial neoplasia,CIN）病人血清中SLC25A25-AS1的异常表达,并探讨了SLC25A25-AS1在宫颈癌发展中可能的作用机制。采用RT-qPCR检测正常对照组,宫颈癌病人和CIN病人血清中SLC25A25-AS1的表达水平。在体外和体内研究中分析了SLC25A25-AS1在宫颈癌系HeLa细胞中的重要作用。与健康对照组相比,宫颈癌病人血清中的SLC25A25-AS1含量降低。在体外,SLC25A25-AS1的过表达抑制HeLa细胞的增殖、迁移和侵袭。体内裸鼠成瘤实验表明,注射过SLC25A25-AS1过表达的HeLa细胞的裸鼠皮下肿瘤的重量和体积明显小于注射对照细胞的裸鼠（P<0.05）。SLC25A25-AS1在宫颈癌的发生发展中可能发挥重要作用,有望成为宫颈癌的新治疗靶点。     

豌豆细胞中rRNA前体剪切位点研究

利用ITS1探针原位杂交标记和抗核仁纤维蛋白单克隆抗体免疫标记技术, 研究了豌豆(Pisum sativum)根端分生细胞中rRNA的剪切位点. 结果表明, rRNA前体剪切发生在核仁的致密纤维组分(dense fibrillar component, DFC)和颗粒组分(granular com- ponent, GC), 而纤维中心(fibrillar center, FC)没有标记信号. 放线菌素D(actinomycin D, AMD)处理豌豆根端分生组织细胞, 使rDNA的转录受到抑制. 随着AMD处理时间的延长, rRNA剪切的标记信号逐渐减弱, 说明rRNA前体的剪切是一个逐渐的过程.     

食管鳞癌MLH1基因改变及其与微卫星不稳定的关系

MLH1是位于3p21．3上的一个DNA错配修复基因,其异常与多种肿瘤相关。为探索食管鳞癌中MLH1基因改变及其与微卫星不稳定(MSI)的关联情况,采用微卫星分析和RT—PCR方法检测了14个微卫星标志在食管癌中的状况及MLH1转录水平的表达,发现35％的食管癌出现至少一个微卫星的不稳定,66．7％的肿瘤在MLH1基因内标志D3S1611位点表现为杂合性丢失,但是MLH1没有明显的mRNA表达下调。MSI与食管癌分期、分级、淋巴结转移、患者年龄和性别等参数及MLH1基因杂合性丢失(LOH)之间无统计学意义的相关性。这些结果表明：食管癌中MLH1存在较高频率的等位基因丢失,但其mRNA表达水平并无明显异常;所测微卫星标志的不稳定是食管癌的频发事件,与MLH1基因LOH不存在必然联系。     

复杂疾病基因定位策略与肿瘤易感基因鉴定

对于不存在某单一基因位点经典的孟德尔显性或隐性遗传模式的疾病,称为复杂疾病,肿瘤是最常见的类型之一 . 目前,以连锁和相关分析为基础的功能克隆、功能候选克隆、定位克隆、定位候选克隆、系统生物学等复杂疾病易感基因定位策略逐渐发展起来 . 其中,系统生物学策略由于整合了从 DNA 到蛋白质的各个层面的信息,对复杂疾病基因调控网络做出了良好诠释,使其成为最有潜力的方法之一 . 目前,虽然已有近 100 种肿瘤 / 遗传性癌综合症的易感基因被鉴定出来,但未来的复杂疾病易感基因定位工作仍充满了挑战 .     

维甲酸信号通路的生物学进展

本文阐述了受维甲酸信号调控的基因表达多样性的分子机制,描述了维甲酸受体的特征、维甲酸反应元件的多态性、转录中介因子包括辅活化因子和辅抑制因子在维甲酸受体介导的转录调控中的作用,主要的维甲酸应答基因及维甲酸在肿瘤治疗中的应用。     

维甲酸激活基因cDNA RA538诱发人食管癌细胞终末分化与凋亡

将含有RA538的真核表达载体pCDV1与含neo基因的表达载体pDOR-neo经Lipofectin法共转染到人食管癌细胞系EC8712,EC109细胞,结果表明:RA538的表达对两细胞系均有很强的生长抑制作用,引起细胞形态的明显改变,诱发细胞终末分化与死亡。RT-PCR分析发现,RA538的表达激活了谷氨酰胺转移酶(transglutaminase,TGase)基因的表达,引起c-myc基因表达下降,被膜素(involu-crin)基因表达增加.而对TGF-β基因的表达没有明显的影响.应用凋亡细胞原位检测法证实,RA538表达诱发的细胞死亡是通过细胞凋亡而实现的.以上结果与直接用维甲酸处理人食管癌细胞后所得结果相似 因此认为:RA538是维甲酸诱导人食管癌细胞发生终末分化和凋亡过程中一系列被激活基因中的1个关键基因.     

食管癌细胞抗失巢凋亡基因UBCH7的发现与鉴定

失巢凋亡(Anoikis)是细胞失去与细胞外基质(Extra-cellular matrix, ECM)粘附时发生的特殊形式的凋亡, 是机体维持组织稳态的关键机制之一。抗失巢凋亡能力的获得是肿瘤细胞发生远处转移的前提条件之一。为了鉴定与食管癌细胞抗失巢凋亡相关的基因, 文章首先构建食管癌细胞系的逆转录病毒文库, 感染对失巢凋亡敏感的NIH3T3细胞, 利用感染病毒cDNA文库的混合细胞系进行软琼脂集落形成实验, 挑取在悬浮条件下仍可生长成为较大集落的细胞单克隆(潜在具有抗失巢凋亡能力的细胞), 通过逆转录病毒载体特异的引物PCR扩增失巢凋亡抗性克隆基因组中的插入cDNA片段, 以此获得食管癌细胞系cDNA文库中潜在的具有失巢凋亡抗性的基因。经测序发现其中一个失巢凋亡克隆中整合的cDNA片段包括人UBCH7/UBE2L3基因全长的编码序列(开放阅读框)。利用携带pMSCV-UBCH7的逆转录病毒感染NIH3T3细胞进行验证, 结果显示细胞失巢凋亡抗性增强, 并且在具有高转移潜能的食管癌细胞系MLuC1中降调UBCH7表达可减弱其失巢凋亡抗性。这些结果表明, UBCH7/UBE2L3是一个与食管癌失巢凋亡抗性相关的基因。     

人食管癌EC9706单克隆的分离培养及其生物学特性的研究

用限制性稀释法对食管癌EC9706细胞系进行单细胞克隆分离,建立了3个亚系,分别命名为EC1、EC2和EC3。细胞遗传学分析显示,EC1仍为混合克隆,EC2和EC3的染色体众数分别为117条和62条。对EC2和EC3的生物学特性进行比较,生长曲线、平皿集落形成能力实验、流式细胞分析和细胞运动能力实验均表明,两者的恶性程度有显著差别,EC2较低,EC3较高。成功分离的2个食管癌单克隆细胞亚系,可为食管癌发生发展的分子机制研究、基因治疗研究、耐药机制研究以及抗肿瘤药物筛选提供实验材料。     

RAI——一候选的人肺腺癌分化相关基因

通过进一步分析采用全反式维甲酸(all trans retinoic acid,ATRA)诱导人肺腺癌GLC-82细胞,经cDNA文库消减杂交构建的cDNA消减文库,得到一在ATRA诱导GLC-82细胞分化过程中激活表达(retinoic acid induced,RAI)的基因的cDNA片段,应用菌落原位杂交技术在胎脑cDNA文库中进行筛选,克隆RAI的全长cDNA序列并测序.RT-PCR分析表明,RAI在多种胎儿组织中表达.结果表明,RAI可能与细胞分化有关,并在细胞基本生命活动中发挥重要作用.