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1.
人腺病毒41型(Human adenovirus 41,HAdV-41)是引起儿童腹泻的重要病原之一.为了解北京地区腹泻儿童中HAdV-41 Fiber基因的分子变异和遗传进化特征,选取2010-2019年首都儿科研究所附属儿童医院门诊腹泻患儿HAdV-41阳性的粪便标本,扩增Fiber全基因,使用多种生物信息学软件进行系统发生、遗传进化、种群演变和选择压力等分析.结果显示HAdV-41本地毒株存在1644碱基(547氨基酸)和1689碱基(562氨基酸)两种长度的Fiber基因,截短的15个氨基酸位于Fiber蛋白纤维轴区.Mann-Whitney U秩和检验提示检测到感染短Fiber基因的HAdV-41的患儿年龄更小(P=0.036).同源性分析结果显示Fiber基因的核苷酸和氨基酸序列同源性均大于97%,主要分为四个进化分支(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ),其中Ⅰ和Ⅲ是主要的流行分支,分支Ⅰ主要在国内流行,而分支Ⅲ全球均有流行.HAdV-41共祖起源可追溯到1856年,平均进化速率每年为6.81×105碱基替换/位点,10年间理论有效种群一直比较平稳呈缓慢下降趋势.压力选择分析表明,一个正向和三个负向选择位点均位于Fiber蛋白的纤维轴区.上述结果表明2010-2019年间不同进化分支的HAdV-41在北京地区流行,进化速率稳定.Fiber蛋白轴区存在两种不同类型的氨基酸缺失.  相似文献   

2.
为了解重庆地区流行的7型腺病毒(Human adenovirus 7,HAdV-7)基因型型别,从全基因组水平探讨HAdV-7b和HAdV-7d可能的致病性差异,收集儿童急性下呼吸道感染患儿的呼吸道分泌物标本分离培养,提取DNA后进行HAdV-7基因型别鉴定、限制性酶切分析和全基因组测序,再利用MEGA6比较分析。本研究在2009年6月~2013年1月间共收集4334份急性下呼吸道感染患儿的鼻咽抽吸物标本,随机选取2411份进行病毒分离培养,共有164份(164/2411,6.8%)鼻咽抽吸物HAdV阳性,其中HAdV-7 87例。限制性酶切分析显示,随机挑选的3株HAdV-7分离株均为HAdV-7d。CQ1198株行全基因组测序并与其他HAdV-7全基因组构建进化树,结果发现16株中国地区的HAdV-7为HAdV-7d基因型,且上述16株HAdV-7与7d2的同源性为99.9%,与7b的同源性为98.2%。相较于ak40株(HAdV-7b),CQ1198共有49处核苷酸替换,其中20处可导致非同义替换;4处核苷酸插入,其中24bp和18bp 2个片段插入分别位于病毒相关RNAⅡ(Virus-associated RNAⅡ,VA RNAⅡ)和L3的pⅥ区域。HAdV-7可有多个基因型致病,且一直处于进化过程中,其主要流行基因型由HAdV-7b变为HAdV-7d。应加强对HAdV分子流行病学监测,明确其进化规律,为HAdV疫苗研发提供分子流行病学依据。  相似文献   

3.
为了解2018-2020年间广州地区急性呼吸道感染儿童中腺病毒的流行病学特征,收集广东省妇幼保健院番禺院区和暨南大学附属第一医院儿科住院部急性呼吸道感染患儿咽拭子标本,采用荧光定量PCR技术检测腺病毒核酸,分析腺病毒的流行病学特征。所有腺病毒阳性标本接种A549细胞进行病毒分离,获得临床分离株后,对不同型别分离株的生长特点进行研究,并比较了感染患儿的临床特征。结果显示,在收集的701份急性呼吸道感染患儿的咽拭子标本中,腺病毒阳性率为4.99%(35/701),易感人群为5岁以下儿童。系统发育分析显示主要型别为B种3型腺病毒(42.86%)与B种7型腺病毒(14.29%)。经细胞培养后获得腺病毒阳性毒株28株,分离率为80%。临床分离株感染特征分析结果显示,PCR检测B种7型腺病毒分离株病毒基因组拷贝数显著高于其他基因型。对感染患儿临床特征的分析显示,B种3型腺病毒感染患儿中性粒细胞增高伴淋巴细胞降低。上述结果表明,2018-2020年间急性呼吸道感染的住院儿童腺病毒阳性患儿中,B种3型与B种7型为优势流行基因型,病毒基因进化高度保守。临床分离株中,B种7型腺病毒生长速率较高。  相似文献   

4.
江苏省不明原因轻型呼吸道传染病暴发的病因学研究   总被引:5,自引:0,他引:5  
自2004年4月18日起至6月末,江苏省东台市发生以发热、咽部充血、扁桃体肿大为临床表现的原因不明的疫情暴发,发病人群以中小学生、幼儿为主,地域以许河镇、新街镇以及临近乡镇为主。疫情涉及东台市9个镇,合计报告709例,分布在75个学校,240个班级。暴发的特点为传染性强,短期内出现大量的患者,发病有班级聚集性特点,未发现成人感染。临床表现以发烧(100%)、咽部充血(91.40%)、扁桃体肿大(60.22%)、咽痛(50.00%)为主;X线检查可发现肺纹理增强(90.3%)。用Hep-2细胞从患儿20份咽拭子标本中分离到12株病毒,经PCR扩增腺病毒L3部分基因及其PCR产物的序列测定和分析,证实这12株病毒为腺病毒3型;对28份咽拭子标本直接进行DNA提取和PCR扩增,有17份标本PCR扩增L3部分基因呈阳性,经序列测定和分析,也为腺病毒3型。这29个阳性标本L3基因的1446个核苷酸的序列与GenBank上所发表的腺病毒3型序列同源性高达99,5%。双份血IgG检测:对江苏省采集10份患儿急性期和恢复期双份血清,以从患儿咽拭子分离到的腺病毒3型作为抗原,进行病毒抗体测定,6份患儿的双份血清腺病毒总IgG滴度呈4倍以上增高。患儿急性期血IgA检测:对暴发疫情34例患儿急性期血清(发病时间为1~3天)进行腺病毒IgA抗体测定,结果有9份标本为阳性,1份标本为可疑阳性,阳性率为26.47%。IgA阳性率低可能与血清采集时间过早有关,机体还未全部产生IgA。另外,还对江苏省送检的从患儿血培养基培养的细菌毒株进行了鉴定,对其16S rRNA基因进行了基因扩增及序列分析,序列测定和分析提示为A组M3型化脓性链球菌。实验研究结果并结合此次疫情的流行病学和患儿的临床表现,证实腺病毒3型是引起此次儿童不明原因轻型呼吸道传染病暴发的病原体,部分病例伴有原发或继发化脓性链球菌感染。  相似文献   

5.
探讨2016年12月深圳市光明新区某小学一起急性呼吸道病毒感染暴发疫情的流行病学及病原学特点。采用相应的流行病学个案调查表对疫情进行现场调查,采集患者咽拭子标本,使用实时荧光定量PCR方法对标本进行流感样病例筛查,筛查后的阴性标本进行呼吸道病毒核酸检测,用腺病毒六邻体蛋白基因作为靶基因对腺病毒初筛阳性标本进行扩增并测序,测序结果在GenBank上进行序列比较后使用BLAST和MEGA 5.0软件进行分析。该起疫情首例病例发病时间为2016年12月2日,末例病例发病时间为2016年12月17日,共发病34例,期间出现3次发病高峰,患者均为学生,其中男女生各17例,男女比例1∶1。患者体温均39℃,大部分有头晕、头痛症状,少数伴有咽痛、咳嗽症状。发病的四个班级间的罹患率差异有统计学意义。共采集8份咽拭子标本,经实时荧光定量PCR检测均为腺病毒阳性,其中1份合并鼻病毒阳性。8份标本用分型引物检测并分析序列确定均为腺病毒E亚属4型。此次急性呼吸道感染暴发疫情为连锁式传播,由腺病毒4型引起,毒株序列与深圳、国内其他城市分离的腺病毒4型毒株序列具有高度同源性,提示该毒株可用于疫苗株筛选。早期发现可疑病例并采取隔离措施是预防腺病毒感染暴发的最佳手段。  相似文献   

6.
为了解北京地区腺病毒的流行毒株,从北京儿童医院收集25份儿童肺炎患者的痰洗液标本(2004年冬到2005年春),患者的年龄在2个月到2岁,临床表现以持续高热、咳喘和气促为主。对25份标本分别用Hep-2细胞进行了病毒分离培养、腺病毒属特异性引物PCR扩增以及PCR产物的序列测定分析。结果发现25份标本中有9份PCR扩增阳性,其中2份病毒培养物观察到典型的细胞病变;将9份PCR阳性产物纯化后进行序列测定,结果7份标本核苷酸序列完全一致,同源性100%,并与GenBank发表的序列相比较,发现与腺病毒7型最为接近,同源性皆为99.7%;2份与腺病毒3型最接近,同源性为99.6%。结果表明,此次病毒分离株为腺病毒B亚群。北京儿童医院2004年12月至2005年3月腺病毒引起的肺炎主要以7型和3型为主,7型占优势,与国内其它地区的情况相似。  相似文献   

7.
摘要:目的 探讨大连市腺病毒感染流行性角结膜炎的病原分布。方法 选取大连市区三家医院眼科结膜炎患者眼结膜囊分泌物为样本,眼拭标本采用real-time PCR方法对腺病毒进行核酸检测。结果 243份标本中,121份为腺病毒阳性,其中27份3型阳性,61份8型阳性,24份19/37型阳性,1份3型和8型同时阳性,8份未分型。结论 人腺病毒8型是大连市急性病毒性结膜炎的主要病原,3型、19/37型次之。  相似文献   

8.
目的分析不同季节及不同年龄段腹泻患儿感染轮状病毒(RV)与腺病毒(Eads)情况,为临床提供早期、快速、准确、可靠的依据,以便及时采取相应的治疗使患儿早日康复。方法采用杭州艾博医药有限公司提供的轮状病毒(A组)/腺病毒检测试剂盒(乳胶法),对2012年1月至2015年12月浙江省人民医院门诊和住院就诊的3 368例腹泻儿童粪便标本进行轮状病毒和腺病毒抗原检测。结果 3 368例腹泻儿童粪便中,RV阳性578例占17.16%,Eads阳性106例占3.15%。11月至次年1月为轮状病毒感染的高发月份,1~3岁为儿童感染的高发年龄;腺病毒感染阳性率低,呈散发性。结论杭州地区近年1~3岁婴幼儿的腹泻主要是由轮状病毒和腺病毒引起,其中轮状病毒感染率明显高于腺病毒,且有明显的季节性;而腺病毒感染呈散发流行,未表现出明显的季节性及年龄分布。  相似文献   

9.
人腺病毒(Humanmastadenoviruses,HAdV)是一种常见的病毒病原体,在儿科患者中普遍存在.本研究首次报道了 2017年从辽宁省急性弛缓性麻痹(AFP)病例的粪便标本中分离到的一株人腺病毒1型重组株LN2017,并对其全基因组进行测序和分析.我们首先测定了 LN2017的全基因组序列,并将其与从GenBank数据库中下载的来自8个国家的38个参考株一起,构建了基于全基因组、Hexon基因,Penton base基因,Fiber基因和E3基因的系统发育树,并用RDP4.97和SimPlot3.5.1软件进行了重组分析.结果显示,LN2017病毒为HAdV-C亚属,其Hexon,Penton base和Fiber基因与HAdV-1高度相似,但是其E3基因和HAdV-2、HAdV-6高度相似.重组分析显示毒株LN2017是一个重组病毒,在E3基因区域和HAdV-2发生了重组,重组区域位于28045-31042.本研究首次证实了LN2017与 GenBank 中的 JX173080(埃及株 E13)、MH183293(上海株 SH2016)和 MH121110(德国株43C1)具有相同的重组方式,在HAdV-1内构成一个独立的分支.未来,有必要对该分支人腺病毒1型重组株的致病性和临床特征进行进一步研究,并继续加强对HAdV的分子流行病学监测.  相似文献   

10.
【背景】自2014年以来,H5N6禽流感病毒在我国家禽和活禽市场持续进化,成为人类和动物健康的重大威胁。【目的】对2017-2019年中国南方地区93株高致病性H5N6禽流感病毒的HA基因进行分子进化分析。【方法】接种9-11日龄鸡胚分离核酸检测阳性的H5N6标本,运用下一代测序平台对病毒分离物进行全基因组测序,从NCBI和GISAID数据库下载参考序列,利用BLAST、MEGA6.1及Clustal X等软件进行序列分析。【结果】2017-2019年,从189份江苏省H5亚型禽类/环境标本和1名H5N6患者咽拭子标本中共分离到43株病毒,完成了33株H5N6病毒的全基因组测序。下载网上同时期中国其他地区流行的H5N6毒株序列,对总计93株H5N6病毒的HA基因进行分子进化分析。93株H5N6病毒中有78株属于Clade 2.3.4.4h,9株病毒属于Clade 2.3.4.4e,4株H5N6病毒属于Clade 2.3.4.4b,1株属于Clade 2.3.4.4f,1株属于Clade 2.3.4.4g。所有93株病毒HA蛋白的裂解位点含有多个碱性氨基酸,表明它们都属于高致病性禽流感病毒。所有93株病毒HA蛋白的Q222和G224位氨基酸没有发生突变,保留了禽类受体α2-3半乳糖苷唾液酸(SAα2-3Gal)结合特性;158位点丧失糖基化,同时124位出现一个新的潜在糖基化位点。【结论】2017-2019年间中国南方地区H5N6病毒进化活跃,具有明显的基因多样性,需要加强对病毒分子进化的监测。  相似文献   

11.
目的:探讨人腺病毒55型感染肺部病变与外周血淋巴细胞改变的关系及致病意义。方法:以50例经胸部CT证实为腺病毒肺炎的患者为研究对象(肺炎组),调查其外周血细胞及T淋巴细胞亚群变化情况,并与同期腺病毒55型感染未出现肺部病变的患者30例(非肺炎组)对照;亚组分析50例肺炎组中多肺叶病变与单肺叶病变患者之间T淋巴细胞变化的差异。结果:与非肺炎组患者相比,肺炎组患者急性期外周血淋巴细胞比例明显降低、单核细胞比例明显升高(P0.01);肺炎组CD3+T淋巴细胞比例、CD3+CD4+T淋巴细胞比例及CD4/CD8比值较非肺炎组均有明显降低(P0.01)。亚组分析显示,肺炎组患者肺部病变范围不同,T淋巴细胞亚群的变化亦有差异,多肺叶病变组患者CD3+CD8+T淋巴细胞比例较单肺叶病变组明显升高、CD4/CD8比值较单肺叶病变组明显降低(P0.05)。结论:HAdv-55感染引起肺炎病变时,宿主存在明显的细胞免疫功能受损,且与肺部病变程度有一定正相关。  相似文献   

12.
用改进的ELISA法检测94份咽拭子标本中的腺病毒抗原,标本先接种人肾细胞,使病毒有一定程度的增殖,同时与传统的病毒分离作对比,结果表明,腺病毒分离阳性的18例,ELISA法检测全部阳性,76例分离阴性(盲传3代)者ELISA法也全都阴性,两者完全相符,ELISA法检测增殖24、48、72小时的细胞培养物腺病毒抗原的阳性率分别为16.7%,72.2%和83.3%,本法特异、可靠、判断客观、可用来检测腺病毒抗原。  相似文献   

13.
目的:分析儿童重症腺病毒肺炎(SAP)的临床特点。方法:选择2011年01月至2015年01月广州市妇女儿童医疗中心重症监护室收治的被诊断为SAP的患儿53例。患儿入监护室后24 h内采集静脉血,检测血常规、血气、生化等指标,并结合病史与常规生化等检测指标同步给出PCIS评分。根据患儿的转归,将所有患儿分为生存组和死亡组进行比较分析。结果:53例重症腺病毒肺炎患儿,男女比例为3.4:1,2岁以下发病者48例,夏秋季发病共40例。死亡组患儿共8例(15.1%),其LDH、AST、Pa CO2水平、肺叶受累数量、并发症种类较存活组患儿明显升高,危重症评分(PCIS)、血小板、白蛋白、Pa O2水平、Pa O2/FIO2比值均较生存组显著降低(P均0.05)。结论:儿童SAP炎症反应重,常伴肺内外各种损害,早期的LDH、AST、白蛋白水平、血小板数量、Pa O2、Pa CO2、Pa O2/Fi O2及PCIS评分是疾病预后的早期预测指标,有助于临床医生对重症腺病毒肺炎患儿病情危重程度尽早作出正确判断。  相似文献   

14.
近期的研究表明蝙蝠可以携带腺病毒。为了进一步了解我国蝙蝠腺病毒的分布状况和遗传多样性特征,本研究采集了北京市、湖南省、江西省、云南省、贵州省和海南省六个省份的共11种蝙蝠的咽拭和肛拭样本,使用套式PCR方法进行蝙蝠腺病毒检测。对阳性结果通过克隆测序进行遗传多态性分析,并采用基于氨基酸相似性的核酸序列数据进行分子进化研究。结果表明,我国约20%的蝠种携带腺病毒,特别是大足鼠耳蝠可能普遍携带蝙蝠腺病毒。并且在贵州省南蝠样本中同时检测出两种不同的蝙蝠腺病毒。总体而言,蝙蝠腺病毒DNA聚合酶保守区核酸和蛋白序列的平均相似性分别只有66.6%和74.7%。蝠种和地域上的巨大差异可能导致了蝙蝠腺病毒的适应性进化,而形成了显著的遗传多样性。  相似文献   

15.
目的:构建携带抑癌基因Fhit的重组腺病毒并通过其研究Fhit蛋白对结直肠癌细胞增殖能力的影响。方法:利用PCR方法从人胎肝文库中克隆Fhit基因片段,Fhit基因PCR产物连入T载体构建重组质粒pMD18T-Fhit。测序正确后,将基因片段导入ptrack-CMV穿梭质粒中,构建重组穿梭载体ptrack-CMV-Fhit。将经PmeⅠ 单酶切线性化的ptrack-CMV-Fhit和骨架腺病毒质粒pAdEasy-1共转BJ5183大肠杆菌,使ptrack-CMV-Fhit和pAdEasy-1发生同源重组。经PacI酶切鉴定正确后,将重组腺病毒质粒转染293A细胞获得表达Fhit蛋白的重组腺病毒rAd-Fhit,将获得的重组腺病毒感染结肠癌细胞,采用蛋白印迹法检测外源Fhit蛋白的表达,并进一步观察其对细胞增殖能力的影响。结果:我们成功构建了携带有Fhit基因的重组腺病毒,且能够在结肠癌细胞中成功表达Fhit蛋白。在结肠癌细胞中,Fhit蛋白明显减弱了结肠癌细胞的增殖能力。结论:在结肠癌细胞中,Fhit基因可能扮演抑癌基因的角色,而表达Fhit的重组腺病毒很可能成为一种结肠癌生物治疗的新策略。  相似文献   

16.
An anion-exchange–high-performance liquid chromatography (AE–HPLC) method for the quantification of adenovirus type 5 (Ad5) total particles was validated according to performance criteria of precision, specificity, linearity of calibration and range, limit of detection, limit of quantification, accuracy and recovery. The viral particles were detected by absorbance at 260 nm using photodiode array detector (PDA). Cesium chloride (CsCl) purified Ad5 and lysate samples were used for the validation of the method. Relative standard deviations (RSDs) for the inter-day, intra-day precision and reproducibility for both the lysate and the Ad5 standard were less than 10 and 2% for the peak area and retention time, respectively. The method was specific for Ad5 which was eluted at 8.0 min. The presence of DNA does not affect the recovery of Ad5 particles for accurate quantification. Based on the error in prediction to be less than 10%, the working range was established between 2×1010 and 7×1011 VP/ml with correlation coefficient of 0.99975, standard deviation of 6.14×109 VP/ml and a slope of 3.04×105 VP/ml. The recovery of the method varied between 88 and 106% in all of the lysate samples investigated which is statistically similar to 100% recovery at 95% confidence interval.  相似文献   

17.
The von Hippel-Lindau (VHL) is a known tumor suppressor that binds to alpha-subunits of hypoxia-inducible factors and induces ubiquitin-mediated degradation of the protein in an oxygen-dependent manner. VHL is also involved in the regulation of tumor angiogenesis, glycolysis, cell cycle regulation, and apoptosis. In the present study, we showed that ectopic expression of VHL induces apoptosis in renal cell carcinoma 786-O cells which contain only the mutant VHL, evidenced by TUNEL assay and DAPI staining. Furthermore, biochemical studies indicated that expression of VHL in 786-O cells results in both PARP and CPP32 cleavage, suggesting that VHL-induced apoptosis in 786-O cells is caspase dependent. Moreover, we also observed that apoptosis induced by ectopic VHL expression was associated with up-regulation of p27 as well as Bax, implicating the roles of these two proteins in VHL-induced apoptosis. The up-regulation of p27 and Bax by VHL was specific since we did not detect any changes in the level of other apoptotic factors including Fas and Bcl2 by the expression of VHL. We next examined the effect of VHL expression on the tumor growth of 786-O renal cell carcinoma cells in nude mouse. The results showed that injection of Ad.VHL adenovirus regresses the tumor growth of 786-O cells in nude mouse. The analysis by TUNEL assay as well as DAPI staining of 786-O tumors injected with Ad.VHL showed clear evidence of apoptosis. These results suggest that ectopic VHL expression induces apoptotic response in 786-O VHL mutant cells both in vitro and in vivo.  相似文献   

18.
We developed a HPLC method on a novel continuous bed matrix (UNO Q, Bio-Rad) for the direct quantification of adenoviral type 5 (Ad5) particles produced in 293S Human Embryonic Kidney cells and compared this with an existing HPLC method on a conventional ion-exchange resin (Resource Q, Pharmacia). The 293S cell extract contained large amounts of DNA. This contaminated the viral peak on the Resource Q column and only after Benzonase treatment was it possible to quantify the viral particles in the cell extract. In contrast, the virus peak on the UNO Q column was resolved from the DNA which eliminates the need for pretreatment of the sample with Benzonase. Cross-analysis of the Ad5 fraction from the UNO Q column using a size-exclusion HPLC column revealed no additional contaminating peaks. We conclude that the purity of the Ad5 virus peak on the continuous bed matrix UNO Q column was superior to the purity of the virus on the conventional Resource Q column, which is essential for reliable quantification.  相似文献   

19.
重组腺病毒载体乙肝疫苗的免疫学研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的比较腺病毒(Adenovirus,Ad)载体乙型肝炎病毒(Hapotitis B virus,HBV)疫苗鼻腔黏膜、皮下注射接种小鼠免疫效果.方法以腺病毒为载体、以HBV preS2/S为目的基因构建重组疫苗,然后将重组疫苗分别鼻黏膜和皮下接种BALB/c小鼠,与阴性对照组(载体对照组、生理盐水对照组)比较接种重组疫苗35、72 d的免疫效果.结果鼻腔接种Ad HBV疫苗组动物在72 d时血清抗体终末效价为1/2 470,同时可提高NK细胞杀伤能力和干扰素-γ、IL-2含量升高.皮下注射Ad HBV在免疫35 d和72 d、1∶200血清稀释度均未测到阳性抗体(A值,P/N值<2.1).结论重组疫苗黏膜接种诱导小鼠产生特异抗体和细胞免疫反应高于皮下接种途径.  相似文献   

20.
目的了解本地区婴幼儿腹泻患者中轮状病毒和腺病毒的感染情况,为临床治疗提供依据。方法收集2013年1月-12月门诊和住院腹泻患儿的粪便,进行轮状病毒和腺病毒抗原检测,并对结果进行统计学分析。结果在检测的2 579例婴幼儿腹泻中轮状病毒阳性为616例,阳性率为23.89%,高发季节为1月、11月和12月,高发年龄组为13-24月婴幼儿,腺病毒阳性共102例,阳性率为3.96%,程散发状况,高发年龄组为7-12月的婴幼儿。结论轮状病毒和腺病毒都能引起婴幼儿腹泻,但是轮状病毒为最主要的病原体,及时检测轮状病毒抗原,为临床治疗和疾病监测提供参考。  相似文献   

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