利用加权基因共表达网络分析方法挖掘香菇发育不同阶段的关键基因

香菇是世界产量第二大食用菌,栽培历史悠久。在木屑袋料栽培模式下,香菇发育可以分为菌丝生长期（G）、菌丝褐化期（B）、原基形成期（P）以及出菇期（FB）4个阶段。褐化期和原基形成期是香菇从营养生长期到生殖生长两个关键发育阶段,对香菇子实体产量和质量至关重要。本研究以3种不同栽培材料为重复,对香菇发育的前3个阶段进行了转录组分析。主成分分析和相似性分析表明,基因随着发育进程的推进,不同栽培基质样本的基因表达特征相似。以菌丝生长阶段的转录本为参照,通过基因差异表达分析,获得与菌丝褐化成熟和原基形成相关的基因,并对这些基因进行GO和KEGG功能富集分析;其次,对9个转录本数据进行加权基因共表达网络分析（WGCNA）,分别获得了与菌丝生长、褐化阶段及原基形成各阶段高度相关的黑色、蓝色及黄色基因模块,并利用网络节点分析获得了与菌丝褐化成熟和原基形成得到7个关键基因;最后,结合差异基因和基因模块分析,得到了菌丝生长阶段的17个重要基因、褐化阶段的167个重要基因以及原基形成阶段的67个重要基因。通过多分析手段结合为筛选候选基因提供了更为高效的方法。     

热声成像技术及其在生物医学中的研究进展

摘要：成像技术在疾病的诊断、治疗和监测中起着重要的作用。热声成像作为一种非电离和非侵入性的新型生物医学成像技术,结合了微波成像高对比度和超声成像高分辨率的优点。因其具有利用内源性对比剂（如水和离子）或多种外源性对比剂（或两者兼有）提供结构、功能、和分子信息的能力,在预临床和临床应用中显示出了巨大的潜力。近几十年来,由于微波辐射源和超声硬件的不断发展,热声成像技术已被广泛用于生物医学成像领域。本文阐述了热声成像的基本原理及成像特点,介绍了近年来热声成像技术在生物医学上的应用、当前在解决相应临床问题应用中的优势及研究现状,最后针对热声成像技术在现有生物医学中面临的挑战对该技术进行了展望。     

术前营养支持在慢性放射性肠炎合并肠梗阻临床手术中的应用效果

目的：探讨慢性放射性肠炎合并肠梗阻患者应用术前营养支持对手术效果的影响。方法：选择青岛市中心医院慢性放射性肠炎合并肠梗阻患者,根据患者是否接受术前营养支持分为观察组和对照组,探讨术前营养支持对患者营养指标、手术指标及术后恢复情况的影响。结果：与对照组相比,观察组患者手术时各项营养指标均有提升,前白蛋白、转铁蛋白和白蛋白水平显著优于入院时水平,术后总并发症发生率、造口率和住院时间亦优于对照组,差别均具有统计学意义（P＜005）;观察组组内比较,接受胃肠内营养支持或联合营养支持的患者总并发症发生率、造口率和住院时间明显低于全胃肠外营养者,差异明显（P＜005）。结论：将术前营养支持应用于慢性放射性肠炎合并肠梗阻患者临床治疗中,可提升患者营养状况、降低术后不良并发症、缩短住院时间,值得临床推广。     

中国东北汉族群体3个MiniSTR基因座的遗传多态性研究

我们使用D10S1248、D14S1434和D22S1045三个miniSTR基因座对东北汉族群体的141名随机个体样本进行遗传多态性研究, 通过荧光标记多重PCR扩增, 310遗传分析仪电泳, 确定个体的基因型, 获得相应的群体遗传数据。对所得数据进行统计学分析。共检出25个等位基因, 56种基因型。3个基因座在所检测群体内均符合哈迪温伯格平衡, 具有较高的杂合度、个体识别率和非父排除率。累积个体识别率为0.99876, 累计非父排除率为0.89819。3个基因座在东北汉族均具有高度的遗传多态性,在群体遗传学和法医学研究中有一定的应用价值。     

急性低氧暴露与低氧运动习服的血液学评价指标

目的：探索急性低氧暴露发生和低氧运动习服的血液学评价指标。方法：Phase 1：61名北方汉族大学生在模拟海拔4 800 m的常压低氧舱急性暴露6 h,入舱30 min后以恒定负荷（80 W,60 rPm）蹬车20 min,常氧安静（NMI）和低氧暴露结束（HYI）时测定血清ANP、ET-1及eNOS水平。Phase 2：恢复1周后,48名受试者进行3周（模拟海拔2 500 m、3 500 m和4 800 m各1周）渐进式低氧训练。恢复1周,重复Phase 1的低氧暴露和运动,常氧安静（NMⅡ）和低氧暴露结束（HYⅡ）时测定ANP、ET-1及eNOS水平。结果：与NMI时比较,HYI时受试者的ANP与eNOS水平显著降低（P<0.01）,ET-1轻微上升;3周低氧训练后,低氧习服与未习服组NMⅡ时的ANP水平均比NMI时显著升高（P<0.01）,与未习服组NMⅡ时比较,低氧习服后的eNOS水平显著升高（P<0.01）。结论：血清ANP和eNOS水平是急性低氧暴露的敏感指标,ANP变化量与低氧习服效果有关,eNOS两次低氧暴露后变化量可作为低氧运动习服效果的评价指标。     

交替氧化酶抑制剂研究进展及应用前景

交替氧化酶(alternative oxidase,AOX)是线粒体呼吸电子传递链中抗氰呼吸途径的末端氧化酶,它广泛存在于高等植物、藻类、部分真菌及原生生物中。同时,AOX也被发现存在于某些人体寄生虫中,如布氏锥虫(Trypanosoma brucei)等。布氏锥虫可引起人类"嗜睡病",不经治疗往往有致命的危险。据统计,在非洲地区每年有高达7 000多万人存在感染布氏锥虫病的风险。值得注意的是,人类细胞中不含有AOX。因此,AOX可能是治疗该类疾病最有效的潜在靶标。现主要就布氏锥虫交替氧化酶的特点及其抑制剂的设计和作用效果进行阐述,并展望AOX抑制剂的应用前景及研究挑战。     

蛋白质定点PEG化研究：97Cys－IFH－γ的巯基专—PEG修饰

蛋白质定点ＰＥＧ化研究：９７Ｃｙｓ－ＩＦＨ－γ的巯基专—ＰＥＧ修饰唐微,常远,徐　飞,郑仲承,刘新垣（中国科学院上海生物化学研究所,２０００３１）关键词人干扰素－γ;定点修饰;半胱氨酸目前进行的ＰＥＧ化反应,多是针对蛋白质肽链上自由末端氨基进行的,由...     

运用代谢组学研究RSV与水稻的互作初探

水稻条纹叶枯病严重威胁着我国的水稻生产,该病由水稻条纹病毒（Rice stripe virus,RSV）引起。目前,对水稻与RSV互作机制的认识还较少,这是制定有效措施来对RSV进行防控的一大障碍。代谢组学是新近发展起来的一种研究手段,它通过考察生物体系包括细胞、组织或整个生物体在受到刺激或扰动后,在代谢水平上的应答,来研究一系列的生物现象。运用代谢组学对水稻与RSV的互作进行了初步探索。GC-MS分析表明,RSV的侵染能显著影响水稻的代谢谱,且在代谢组水平上,不同抗感性的水稻对RSV的响应存在着差异。与NIST质谱数据库中的信息比较,从武育粳3号健康植株中鉴定到内源性代谢物12种、武育粳3号发病植株中11种、KT95-418健康植株中9种、KT95-418发病植株中14种。     

不同光环境对麻栎和刺槐幼苗生长和光合特征的影响

通过搭建遮阳棚设置3个光照强度,模拟森林幼苗生长的林缘、林窗和林下光环境,研究麻栎和刺槐幼苗形态结构、光合特性、生物量积累及其分配对不同光照强度的响应。结果表明,极度弱光环境限制了幼苗的株高、基径、总叶面积、冠面积、叶面积指数和总叶数等形态指标的增长,与全光环境相比,适度遮荫有利于幼苗的形态生长,光照对麻栎形态的异速生长曲线影响较小,刺槐较麻栎的曲线变化更明显一些,弱光降低了异速生长指数。随遮荫程度的增加,麻栎的净光合速率、蒸腾速率、气孔导度逐渐降低,刺槐的净光合速率则在适度遮荫下最大,两者的光能利用效率均显著增大,水分利用效率先升后降。随光照强度的减弱,麻栎各器官的生物量积累降低,叶面积比率的增加和根冠比的减少有利于增加光能的捕获,而刺槐的生物量积累和分配则在适度遮荫下达到最优;各叶绿素含量均显著上升,而叶绿素a/b则逐渐下降。麻栎和刺槐显示出不同的生存策略和光利用策略,在一定程度上可以揭示它们在阔叶林群落中不同的演替地位。     

基于网络爬虫技术对电子商务多肉物种资源数据的研究

【目的】近年来,通过电子商务平台获取境外珍贵的多肉物种资源已成为一种重要渠道,大量濒危物种通过第三方物流方式非法流入我国。甄别濒危物种并梳理出多肉物种资源重点查验名单,能够为物种资源查验尤其是植物多肉类濒危物种查验提供参考。【方法】以跨境多肉物种资源交易的热门平台"多肉之家"为研究对象,基于网络爬虫技术平台,获取电商多肉植物926条种类数据,并对数据进行筛选和归类分析。【结果】"多肉之家"平台上交易的多肉植物共涉及23科878种,其中包含18种CITES附录Ⅰ以及120种CITES附录Ⅱ濒危物种,约占16%。进一步对濒危植物进行归类分析发现,濒危植物中仙人掌科和大戟科多肉植物种类最多,分别为66和36种,两者占总计濒危植物种类的74%。【结论】网络爬虫技术在获取电商类平台的交易植物的种类数据上具有较好的实用性。