桃GRF基因家族的序列及其组织特异性表达分析

转录因子家族基因GRF(growth-regulating factor)是植物中特有的一类生长调控因子基因,在水稻和拟南芥中,GRF家族基因编码的蛋白质具有正向调控茎和叶生长发育的功能。为了探究在桃中GRF基因是否参与了狭叶桃"金蜜狭叶"的叶片发育,本试验首先分析桃基因组中鉴定出的GRF基因的序列信息;然后,以正常叶片的"上海水蜜"桃为对照,通过荧光定量PCR检测了这些GRF基因在"金蜜狭叶"桃的组织特异性表达情况;最后,利用126对简单序列重复标记对1个F2杂交群体进行连锁分析,定位狭叶性状,辅助筛选狭叶性状的候选基因。结果表明:桃基因组GRF基因包括10个成员,分布在除4和8外的其他染色体上,编码蛋白的氨基酸长度在191~612之间。蛋白序列分析表明,除ppa011917m的QLQ结构域中的Leu残基被Phe代替外,这10个GRF的N端均含保守的QLQ和WRC结构域。系统进化树将桃上的10个GRF基因分为3组。从10个GRF基因的表达结果可以看出,6个基因在茎尖的表达量高于幼叶,也高于其他成熟组织和器官;其中2个基因在狭叶桃中的表达显著高于正常叶对照。通过连锁分析将"金蜜狭叶"桃的狭叶性状定位在第6染色体的15.7~21.1 Mb之间,该区间仅含有1个GRF基因ppa003017m,是狭叶性状的候选基因。本研究将为"金蜜狭叶"桃狭叶性状基因的鉴定和高光效种质筛选奠定研究基础。     

非培养法研究成年CF患者长期呼吸道菌群的变化特点

目的研究成年肺囊性纤维化(cystic fibrosis,CF)患者1年内呼吸道菌群的变化特点。方法收集9例已确诊的CF患者痰液标本,平均每月1次,共1年,同时记录患者一般临床状态。对痰液标本分别进行传统细菌培养和16S rRNA测序确定样本中的菌种。根据基因测序确定的菌种结果分析患者1年内呼吸道菌群的变化特点,及其可能与患者的临床状态间的关系。结果通过非培养方法检测到的菌种和临床状态之间无显著相关性。研究初期发现的菌种数量和后续新菌种的获得率之间没有显著关系(所有患者的成对皮尔森相关,P=0.631,r2=0.5)。反Bray-Curtis相似性指数评估在12月内群落组成的总体变化,CF患者之间细菌菌群的变化是不同的,每个患者菌群平均丰度与其时间的变化间无相关性(皮尔森相关P=0.252,R=0.389)。采用DDR检测样本间的相似性是否完全由于样本收集间的时间间隔造成,结果显示1个受试者的距离衰减关系差异有统计学意义(患者5,P=0.041),其他受试者的结果两个采样点的菌落组成与采样的时间间隔没有显著关系,这表明上述观察到的菌落稳定性并非是一个简单的采样频率函数。结论成年CF患者的呼吸道菌群尽管彼此有差异,但各自的长期定植菌群构成相对稳定,不易受呼吸道感染和抗生素应用的影响。     

河南省金岗台自然保护区两栖动物资源及保护

1999年4月～2009年9月,运用样带法、编目法和访问调查等方法对河南省金岗台自然保护区的两栖动物资源状况进行为期10年的调查.结果显示,金岗台自然保护区现有两栖动物21种,隶属于2目8科16属;区系成分以东洋界为主,兼有古北界和广布种,体现了保护区地理过渡带和气候过渡带的特点.金岗台自然保护区面积狭小,不能满足现有两栖类生态和繁殖所需要的空间和资源,有必要提升保护区级别,扩大保护区面积.     

河南黄柏山国家森林公园两栖动物多样性调查

2008 ～2010年采用踏查法和访问法对河南省黄柏山国家森林公园两栖动物资源进行调查.结果显示,黄柏山国家森林公园现有两栖动物21种,隶属于2目7科16属;区系组成以东洋界成分为主;蛙科( Ranidae)为优势科,中华蟾蜍指名亚种(Bufo gargarizans gargarizans)、黑斑侧褶蛙(Peloph...     

检测H5亚型禽流感的压电免疫传感器的研究

目的：为研制检测H5亚型禽流感的压电免疫传感器。方法：用巯基丙酸在镀银电极石英晶体自组装巯基丙酸单分子膜再通过N-乙基-N’-（3-二甲氨基）丙基碳化二亚胺盐酸（EDC）和N-羟基琥珀酰亚胺（NHS）偶联抗H5亚型禽流感病毒的特异性单抗构建传感器芯片,建立了可以检测H5亚型禽流感病毒的免疫传感器。结果：结果表明,该法具有较好的特异性,不与H9亚型流感病毒和NDV反应;检测灵敏度达到10—50个EID50。结论：本文结果为检测禽流感病毒免疫传感器的进一步深入研究奠定了基础,这为其它相关病毒的监测提供了一种新途径。     

猪源肠道乳酸菌的分离与生物学特性研究

目的分离猪消化道中的乳酸菌。方法无菌采集健康猪的新鲜粪便,接种MRS培养基,厌氧培养分离乳酸菌。并对分离菌形态学,生化特性,产酸性,耐酸性,耐胆汁性,高温耐受性,抑菌性等方面进行研究。结果分离到5株嗜酸乳杆菌,分离的细菌对2株致病菌明显具有抑制性。结论为研制高效专一的猪用微生态制剂奠定基础。     

砂梨EST-SSR引物开发及其应用

利用GenBank和GDR数据库中的995条梨EST序列开发砂梨SSR引物,并根据开发的EST-SSR引物对砂梨'西子绿'×'喜水'F1群体的遗传变异进行分析.结果发现:(1)60个SSR位点分布于54条EST序列中,占整个EST数据库的5.4%,其中二核苷酸重复基元出现频率最高,达51.7%,其次为三核苷酸重复基元占25%.23类重复基序中AT重复基序出现的频率最高,为32.3%.(2)利用开发的25对EST-SSR引物对'西子绿'×'喜水'F1群体的遗传变异分析结果表明,其中9对引物呈现多态性,多态性引物占设计引物的36%;多态性引物扩增产物在F1群体中的等位基因数(No)平均为2,有效等位基因数(Ne)平均为1.932 4,平均杂合度观测值(Ho)和期望杂合度(He)分别为1和0.480 9.     

禽流感病毒NP蛋白与T4噬菌体SOC蛋白的融合表达

利用PCR技术扩增禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)NP基因。将NP基因克隆至T4噬菌体表达质粒pSOC的SOC基因(T4噬菌体表面非结构蛋白基因)下游,构建成T4噬菌体SOC位点表达NP的表达载体pSOC-NP。将其转化至大肠杆菌BL21(DE3),经IPTG诱导后表达的目的蛋白SOC-NP进行SDS-PAGE与Western-blot方法检测。结果表明,表达的SOC-NP蛋白相对分子质量约58kD,表达量占菌体总蛋白量的20.34%,并具有与AIV特异性抗体反应的活性。     

表达H5亚型AIV血凝素的重组NDV构建及免疫原性

利用反向遗传技术获得表达H5亚型禽流感病毒(AIV)血凝素(HA)的新城疫病毒(NDV)。克隆NDV clone 30的全长基因,通过在NDV的融合蛋白基因和血凝素-神经氨酸酶(HN)基因之间插入编码高致病性AIV分离株A/chicken/italy/8/98(H5N2)的血凝素基因开放阅读框从而获得两株重组新城疫病毒NDVH5和NDVH5m。NDVH5感染的细胞可以检测到两种HA转录产物。对于重组病毒NDVH5m,NDV位于HA ORF的转录终止信号序列被沉默突变消除,产生2.7个全长HA转录产物的折叠,从而使修饰过的HA得到稳定地高表达。1日龄小鸡的脑内接种证实了两种重组病毒均无致病性。鸡群在NDVH5m诱导产生的NDV和H5亚型AIV HA特异性抗体的免疫力下能够免于致死剂量的NDV与高致病性AIV的感染。血清学研究结果表明NDVH5m免疫鸡群产生的抗体可结合NP蛋白抗体的检测从而用于区分免疫和感染AIV的动物。因此,NDVH5m重组病毒可作为抗NDV和AIV的"二联疫苗",也可成为控制AJ的标记疫苗。     

新城疫液相芯片快速检测方法的建立

目的：建立可检测新城疫病毒（Newcastle disease virus,NDV）的液相芯片快速检测技术。方法：用DNAStar软件对GEN-BANK中NDV的NP基因进行序列分析设计NDV特异性探针并标记生物素,利用该探针与荧光编码微球偶联后与抽提的NDV病毒RNA的RT-PCR产物杂交反应,用液相芯片检测仪（Liquichip 200）检测荧光信号建立了NDV快速液相芯片检测方法。结果：检测结果显示,该法具有较好的特异性,不与H5AIV和H9AIV反应;检测灵敏度达到150个EID50;该法与鸡胚病毒分离法检出NDV的符合率达到97.1%。结论：初步建立了检测NDV的液相芯片技术,为进一步搭建NDV全新快速高通量检测平台奠定了基础,也为其他同类病毒的快速高通量检测提供了借鉴和经验。