NKX蛋白结构和功能的研究进展

NKX蛋白是NKL同源框转录因子亚类中最主要的类型,被发现广泛参与调控胚胎发育过程中的细胞命运决定与形体模式形成,尤其对神经系统的发育影响甚广,并参与甲状腺癌、肺癌、前列腺癌等多种肿瘤的发生。鉴于NKX蛋白在胚胎发育和肿瘤发生过程中的重要作用,本文系统性综述了NKX同源框蛋白7个家族17个蛋白质的结构生物学、生理机制以及疾病相关性的研究进展,为相关疾病的基因靶向治疗提供理论基础,同时讨论了一些NKX基因缺乏组学研究和模式动物疾病模型构建等问题,为今后的研究提供方向。     

基于Hi-C数据的染色体三维分析计算方法

真核生物的染色质在细胞核中高度折叠且有序排列,这种三维结构对基因转录和DNA复制等细胞功能发挥至关重要。近年来Hi-C数据的涌现,使得研究染色质三维交互作用及其空间结构成为了可能。自2009年Hi-C被开发以来,已经出现了许多用于处理Hi-C数据的生物信息学工具,从原始序列比对到接触矩阵的可视化,均提供了系统的Hi-C数据处理过程或解决某一个特定问题的方法。本研究全面介绍了传统的Hi-C数据处理工作流程,以及近十年来新兴的Hi-C数据处理工具以及其未来发展方向。     

NavRh的结构与工作机理被揭示

清华新闻网5月22日电5月21日,清华大学医学院颜宁教授研究组在《自然》(Nature)在线发表了名为《电压门控钠离子通道细菌同源蛋白的晶体结构》(Crystal structure of an orthologue of the NaChBac voltage-gated     

肝脏类器官芯片在生物医学中的研究进展

肝脏类器官芯片是一种基于三维培养并搭配微流控系统的特殊芯片。肝脏类器官可依托芯片技术，在体外构建出具有三维结构的人体肝脏生理微系统。该文概述了肝脏类器官芯片在生物医学领域的最新研究成果，归纳总结包括三维肝细胞芯片、肝血窦芯片和肝小叶芯片在内的不同类型的肝脏类器官芯片特点，分析肝脏类器官芯片领域发展面临的诸多机遇和挑战，展望了肝脏类器官芯片未来的发展方向。肝脏类器官芯片技术将为人类疾病和健康领域开创新的研究途径。     

两株中和性抗hTNFa单抗可变区与hTNFa相互作用的计算机模拟及实验研究

在ＳＧＩ图形工作站上，用同源蛋白结构预测的方法，建立了２－株中和性抗ｈＴＮＦα小鼠单抗（１Ｃ３Ｅ６，３Ｆ６Ａ１０）可变区的三结构模型，并在实验研究２株单抗表位表异性的基础上，根据２株单抗与ｈＴＮＦα分子表面的形状、静电性、疏水性、氢键等性质，对２株单抗可变区与ｈＴＮＦα分子的可能结合模式进行了模拟和分析，再根据结合模型，设计并制备了２个ｈＴＮＦα突变体，然后从实验与计算机模拟两方面着手，对比研究了     

布尼亚病毒核蛋白的结构与功能

布尼亚病毒分布广，传染性强，致死率高，是对全世界的公共卫生事业有重大影响的负链RNA病毒，开发疫苗和寻找药物是预防布尼亚病毒感染的关键。病毒的核蛋白(nucleoprotein, NP)是合成病毒RNA所必需的，其与病毒RNA结合形成核衣壳，参与病毒的组装与RNA转录，在病毒的增殖过程中发挥重要作用；此外，NP还具有B细胞和T细胞表位，能诱发细胞免疫和体液免疫，因此，NP是疫苗设计和药物开发的理想靶点。鉴于NP的丰度和特异性，NP也常用于病毒病的检测。目前，越来越多的布尼亚病毒NP结构及NP-RNA复合物的结构得以解析，研究者已经通过这些结构发现2个重要的抗病毒靶点，即NP的末端臂和RNA结合口袋。本文就布尼亚病毒NP的功能和三维结构以及NP作为抗病毒靶点的研究进展作一综述，以期为布尼亚病毒病的防治提供理论依据。     

树鼩脑三维结构重建的研究 Ⅲ.脑外形立体结构的计算机辅助绘图

作者曾经详细介绍过树鼩脑切片二维结构重建的数据采集、计算机处理数据的算法及图形生成技术。在此基础上,本文介绍树鼩脑三维结构重建的数学模型及其自动生成三维图形的基本技术与计算机绘图的部分结果。     

美丽中国建设时空演变及耦合研究

美丽中国是党的"十八大"提出的新战略思想，也是生态文明建设发展的延续。本文以2000-2017年为研究时段，选取我国31个省、市、自治区为研究区域，借助GeoDa空间自相关分析及动静态耦合模型，探索我国美丽中国建设的时空分异规律、空间分布格局及系统耦合协调度。结果表明：①研究期内，我国美丽中国的发展呈波动上升趋势，且存在东部>西部>中部的空间分布特征。②我国美丽中国的发展格局稳定，但东西部地区两极分化问题严重；子系统中，除制度体系不显著外，均存在显著正向空间关联，且社会、经济、文化与环境高集聚区空间分布错位。③我国社会、环境、经济、文化、制度的静态耦合协调度呈波动上升趋势，东西部区域发展差异明显；动态耦合不及静态耦合协调水平，部分省市存在社会发展、绿色环境、经济增长、以及文化和制度发展受阻现象。     

英国约克郡海相下白垩统完整保存的假拟节柏枝条(英文)

首次描述英格兰北部东约克郡海相下白垩统斯匹敦泥岩组欧特里夫阶岩段所产出已灭绝的掌鳞杉科松柏稀枝假拟节柏保存特别完好的营养枝。由于很高程度的黄铁矿化,这些枝条几乎没有受到挤压而是呈三维立体形状,并且其内部解剖构造很大程度上得到保存,尤其是木质组织。这些枝条为原来的角质层所包裹,因而其表皮构造的解剖细节,包括气孔器的特征也完好保存着。本文是对斯匹敦泥岩组中可资鉴定植物化石的首次详尽的报道。此研究拓展和补充了先前局限于对英格兰南方和其它地区主要为陆相岩层中产出的稀枝假拟节柏研究。