| 基于Hi-C数据的染色体三维分析计算方法 |
| |
| 引用本文： | 黄月月,丰继华,刘珂,牟锦,郭亚茹.基于Hi-C数据的染色体三维分析计算方法[J].基因组学与应用生物学,2020,39(4):1588-1594. |
| |
| 作者姓名： | 黄月月 丰继华 刘珂 牟锦 郭亚茹 |
| |
| 作者单位： | 云南民族大学电气信息工程学院,昆明,650500;云南民族大学电气信息工程学院,昆明,650500;云南民族大学电气信息工程学院,昆明,650500;云南民族大学电气信息工程学院,昆明,650500;云南民族大学电气信息工程学院,昆明,650500 |
| |
| 摘 要： | 真核生物的染色质在细胞核中高度折叠且有序排列,这种三维结构对基因转录和DNA复制等细胞功能发挥至关重要。近年来Hi-C数据的涌现,使得研究染色质三维交互作用及其空间结构成为了可能。自2009年Hi-C被开发以来,已经出现了许多用于处理Hi-C数据的生物信息学工具,从原始序列比对到接触矩阵的可视化,均提供了系统的Hi-C数据处理过程或解决某一个特定问题的方法。本研究全面介绍了传统的Hi-C数据处理工作流程,以及近十年来新兴的Hi-C数据处理工具以及其未来发展方向。
|
| 关 键 词： | Hi-C数据 染色体三维分析 染色质相互作用 |
Three-Dimensional Analysis and Calculation Methods of Chromosome Based on Hi-C Data |
| |
| Huang Yueyue,Feng Jihua,Liu Ke,Mou Jin,Guo Yaru.Three-Dimensional Analysis and Calculation Methods of Chromosome Based on Hi-C Data[J].Genomics and Applied Biology,2020,39(4):1588-1594. |
| |
| Authors: | Huang Yueyue Feng Jihua Liu Ke Mou Jin Guo Yaru |
| |
| Institution: | (School of Electrical and Information Technology,Yunnan University of Nationalities,Kunming,650500) |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Hi-C data Three-dimensional analysis of chromosome Chromatin interaction |
| 本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录！ |
|
