鲍曼不动杆菌临床分离株的耐药性及同源性分析

目的 通过对重庆医科大学附属第二医院近4年临床分离的103株鲍曼不动杆菌的耐药性和同源性分析,了解该院鲍曼不动杆菌的耐药性特点及院内感染流行状况.方法 2008年至2011年间该院临床科室分离的103株鲍曼不动杆菌,进行药敏试验并对耐药性分析;提取细菌基因组DNA,以随机扩增DNA多态性(RAPD)方法进行基因分型.结果 药敏试验结果显示分离出的103株菌呈现出高耐药率及多重耐药率的特点,其中对左氧氟沙星和亚胺培南的耐药性最低,分别为69.9％和57.3％.103株多重耐药鲍曼不动杆菌用RAPD分型共分为16种基因型:A～P,其中A型84株,为主要流行型别;B型3株;C型、G型各2株;其余12型各1株.结论 该院鲍曼不动杆菌具有多重耐药及高耐药率,可能存在以A型鲍曼不动杆菌克隆株传播方式的院内流行,临床上应加强对A型鲍曼不动杆菌的监控,采取有效的措施以预防院内感染的爆发流行.     

鲍曼不动杆菌IRS-PCR基因分型研究

目的 用低频限制性位点聚合酶链反应(IRS-PCR)对鲍曼不动杆菌进行基因分型,分析基因型与鲍曼不动杆菌耐药谱的关系,并初步探讨其在分子流行病学中的作用.方法 随机收集2008年8月至2009年8月临床分离的73株鲍曼不动杆菌,采用K-B法进行药物敏感试验确定鲍曼不动杆菌耐药谱;同时利用IRS-PCR对此73株鲍曼不动杆菌进行基因分型;并分析IRS-PCR分型与鲍曼不动耐药谱的关系;结合IRS-PCR分型结果与73株鲍曼不动杆菌感染病例的临床资料,分析在此时间段鲍曼不动杆菌在我院流行感染的情况.结果 药物敏感试验将73株鲍曼不动杆菌菌株分为A1(19株全耐药型)和A2 ～ A31(54株耐药谱型)31个药敏谱.IRS-PCR法将其分为A～W共23个基因型,其中A、C、B、D和E型为5种优势菌株,分别为14、11、10、8和6株.对比研究发现A1型菌株(15/19)主要集中在基因型A、C、D内,而基因型B包含A15型耐药菌株9株(69.2％),基因型E包含A3型耐药菌株3株(42.9％).A基因型在院内特别是ICU中心引起2次爆发流行,而C和D型主要在呼吸内科引起感染.结论 IRS-PCR基因分型与药敏分型有较高的一致性,且IRS-PCR基因分型在早期发现和预防感染暴发流行方面优于药敏分型.     

ARDRA联合RAPD对不动杆菌基因型鉴定的研究

收集多重耐药的不动杆菌10株,以标准参照株作对照,采用扩增核糖体DNA限制性酶切(ARDRA)DNA指纹技术联合随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对其基因亚型进行分析;以非加权组间平均法(UPG-MA)进行聚类分析。该法可以有效地鉴定不动杆菌基因亚型;并从10株不动杆菌中鉴定出1株琼氏不动杆菌及9株鲍曼不动杆菌。ARDRA联合RAPD基因指纹分型技术有良好的互补性,可准确鉴定不动杆菌基因型。     

鲍曼不动杆菌的基因分型及耐药性分析

目的分析上海某综合性医院不同科室来源的鲍曼不动杆菌菌株的同源性及耐药状况,了解鲍曼不动杆菌院内感染流行情况。方法采用重复序列PCR技术（REP-PCR）,对51株临床分离的鲍曼不动杆菌菌株进行基因分型,并用纸片扩散法进行药敏试验。结果51株鲍曼不动杆菌分为13个基因型,其中A型16株,为主要流行型别;C型、D型各6株;M型有5株;E型、F型和G型各3株;B型、H型和K型各2株;I型、J型、L型各1株。药敏试验结果显示分离出的菌株对常用抗菌药呈现出多重耐药的现象。其中对阿米卡星和亚胺培南的耐药性最低,均为33.3%;对头孢唑啉耐药性最高,为100%。结论鲍曼不动杆菌基因的同源性分析表明,该院存在着以A型鲍曼不动杆菌为主的感染流行,估计该型菌株可能以克隆株的形式播散。鲍曼不动杆菌的耐药性很强,应加强其耐药性监测,合理使用抗菌药物。     

全耐药鲍曼不动杆菌分子分型和分子流行病学调查

重复片段引物PCR和随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对临床分离全耐药不动杆菌分子分型,并进行流行病学调查.从ICU病房感染多重耐药不动杆菌患者的标本分离不动杆菌,碱裂解法提取全基因组,重复片段引物PCR(Rep-PCR)和随机引物扩增(RAPD),对8株临床分离的全耐药菌基因分型,并与生物学分型和质粒分型比较,调查医院流行全耐药菌的基因型.结果显示,8株分离菌经两对重复片段引物分型可分为6种和4种基因型,经随机引物分型为4种和3种基因型,经质粒分型可分为2种基因型,生物学分型归属为1种表型.PCR方法用于全耐药不动杆菌分子分型简便易行,重复性好,适合医院感染流行病学调查,本医院同一部门出现多种基因型,各科室间不存在交叉传染.     

应用DNA指纹图谱技术鉴定整肠生菌株BL63516的研究

目的建立应用DNA指纹图谱技术鉴定微生态制剂——整肠生菌株BL63516的方法,提高菌种鉴别水平。方法应用RAPD（随机扩增多态性）方法,采用50条随机引物对7株地衣芽胞杆菌进行基因组DNA指纹图谱分析,选择多态性好、重复性好、稳定性强的随机引物,对BL63516与其他地衣芽胞杆菌进行区分。结果发现选用引物$87或$88分别对7株地衣芽胞杆菌进行基因组DNA指纹图谱分析,BL63516菌株扩增的DNA片段的大小、数量均与其他地衣芽胞杆菌有明显差异。结论此方法具有可重复性,方便、快速和准确的优势,可用于微生态制剂整肠生菌株的鉴别。     

应用RAPD技术鉴别微生态菌种

目的：建立应用RAPD技术鉴别微生态菌种的方法,提高菌种鉴别水平。方法：应用RAPD（随机扩增多态性）方法,选用5条随机引物,利用PCR方法,对3株长双歧杆菌,3株嗜酸乳杆菌,3株粪肠球菌进行基因组DNA指纹图谱分析。结果：发现不同菌株扩增的DNA片段的大小、数量是有差异的。结论：此方法具有可重复性,方便、快速和准确的优势,可用于微生态制剂生产用菌株的鉴别。     

不同寄主来源白假丝酵母菌多态性与耐药性分析

为研究白色假丝酵母菌的分子多样性情况,探讨RAPD基因多态性与药物敏感性的关系,在获得病菌分离物的基础上,应用经筛选的10条10 bp随机引物,对18株病菌分离物进行RAPD分析,利用UPGMA对结果进行聚类.RAPD扩增的指纹图谱清晰,带型稳定,多态性丰富,可以作为白假丝酵母菌分型方法,18株不同来源的菌株可大致分为6种亲缘关系.药敏结果显示导致出现耐药的机制可能并不相同.所以利用RAPD标记技术在基因水平上对白色假丝酵母菌进行分子分型和鉴定是可行的.     

采用RAPD分析臭鼻克雷伯菌临床菌株的基因型

臭鼻克雷伯菌是重要的条件致病菌 ,常引起老人及婴幼儿重症护理病房的交叉感染及爆发流行 ,对其进行流行病学监测有重要的医学意义。用随机引物聚合酶链式反应 (RAPD)对 37株臭鼻克雷伯菌临床菌株基因组DNA进行分型 ,分析扩增产物的指纹图谱。实验结果表明 ,37株臭鼻克雷伯菌RAPD后可出现不同的指纹图谱 ,根据特异泳带C ,J ,F ,Q的有无 ,可将其分 7型 (I～VII)。RAPD可用于检测臭鼻克雷伯菌基因组DNA的异质性 ,是医院内感染分子流行病学研究的好方法。     

IRS-PCR在鲍曼不动杆菌基因分型研究中的应用

探讨低频限制性位点聚合酶链反应(infrequent-restriction-site polym erase chain site,IRS-PCR)在鲍曼不动杆菌基因分型中的应用。用IRS-PCR分别扩增上海、哈尔滨两地各20株鲍曼不动杆菌DNA稀有限制区旁序列并分型。与RAPD法比较两种基因分型方法的分型率、分辨力、重复性。IRS-PCR可将上海株分13个型别,RAPD分为19个型别,两种方法分型的一致率为60%(12/20);IRS-PCR将哈尔滨株分成19个型别,RAPD分为20个型别,两种方法分型的一致率为90%(18/20)。与RAPD相比,IRS-PCR的条带数多,分辨力强,重复性好。故IRS-PCR可用于鲍曼不动杆菌的分型研究,也是一种有价值的分子流行病学研究工具。     

Combination of ARDRA and RAPD genotyping techniques in identification of Acinetobacter spp. genomic species

A total of 10 non-repetitive multi-drug-resist-ant Acinetobacter strains were collected. With reference to A. calcoaceticus (ATCC23055), A. baumannii (ATCC19606), A. lwoffii (ATCC17986), and A. junii (NCTC5866), DNA fingerprint technique, amplified ribo-somal DNA restriction analysis (ARDRA), and random amplified polymorphism DNA (RAPD) were carried out to identify the genomic species of Acinetobacter spp. The distances between them were calculated by the unweighted pair group method with arithmetic (UPGMA). Genotypes ofAcinetobacter spp. were effectively classified and an A. junii together with nine A. baumannii isolates was genomically identified. The combination of ARDRA and RAPD DNA-fingerprint technique shows high com-plementarity, and could be a useful tool in Acinetobacter genomic species identification.     

鲍曼不动杆菌对碳青霉烯类抗生素的耐药性分析

目的了解鲍曼不动杆菌的耐药情况,并检测耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌的耐药基因,为指导临床合理用药、控制院内感染提供依据。方法利用K-B法检测45株鲍曼不动杆菌临床分离株的耐药情况,通过改良Hodge试验、Carba NP试验和EDTA协同试验对多重耐药鲍曼不动杆菌的碳青霉烯酶进行表型检测,并采用PCR技术检测鲍曼不动杆菌携带OXA-23和NDM-1型耐药基因的情况。结果 45株鲍曼不动杆菌临床分离株中共筛出42株多重耐药菌株;利用改良Hodge试验和Carba NP试验检出36株碳青霉烯酶阳性菌株;采用PCR扩增出OXA-23,未扩增出NDM-1。结论鲍曼不动杆菌耐药情况严重,且耐药基因OXA-23携带率高,治疗时应根据药敏试验结果合理用药。     

300 株鲍曼不动杆菌琼脂稀释法与纸片扩散法药敏检测结果比较

目的:比较琼脂稀释法和纸片扩散法对鲍曼不动杆菌的药敏试验结果。方法:随机挑选的300株鲍曼不动杆菌,检测其标本及科室的分布情况,并采用琼脂稀释法和纸片扩散法检测鲍曼不动杆菌对环丙沙星(CIP)、庆大霉素(CN)、阿米卡星(AK)、头孢他啶(CAZ)、头孢吡肟(FEP)、左氧氟沙星(LEV)、氨苄西林-舒巴坦(SAM)、妥布霉素(TOB)、美洛培南(MEN)、米诺环素(MH)、头孢哌酮-舒巴坦(SCF)11种抗菌药物的敏感性,比较两种检测结果的差异。结果:300株鲍曼不动杆菌主要分布在痰液标本中,共214株,占71.3%,主要来源于ICU 101株(33.7%)及脑外科59株(19.7%)。药敏检测结果显示,两种检测方法所得的SCF和MH的敏感性差异具有统计学意义(P0.05),其他9种抗菌药物的药敏检测结果差异没有统计学意义(P0.05)。结论:琼脂稀释法和纸片扩散法对鲍曼不动杆菌药敏试验结果并不完全一致,临床用药时尤其要注意SCF和MH这两种药物药敏结果的可靠性。     

694株鲍曼不动杆菌的耐药性分析

目的了解大连市友谊医院临床分离的鲍曼不动杆菌的分布及耐药状况,为临床治疗鲍曼不动杆菌感染提供参考。方法对该院2007年至2009年住院患者送检的标本中分离到的694株鲍曼不动杆菌的分布及药敏结果做回顾性分析。结果鲍曼不动杆菌2007年检出112株（7．1％）,2008年检出210（11．3％）株,2009年检出372（14．7％）株;在所有临床送检的标本中,痰标本中的检出率最高,占88．7％;在对13种抗生素的药敏试验中,对美罗培南最为敏感,其次对头孢哌酮／舒巴坦较为敏感。结论鲍曼不动杆菌的检出率逐年增高,耐药率也逐年增高。     

Amplification of a single-locus variable-number direct repeats with restriction fragment length polymorphism (DR-PCR/RFLP) for genetic typing of Acinetobacter baumannii strains

In search of an effective DNA typing technique for Acinetobacter baumannii strains for hospital epidemiology use, the performance and convenience of a new target sequence was evaluated. Using known genomic sequences of Acinetobacter baumannii strains AR 319754 and ATCC 17978, we developed single-locus variable-number direct-repeat analysis using polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (DR-PCR/RFLP) method. A total of 90 Acinetobacter baumannii strains isolated from patients of the Clinical Hospital in Bydgoszcz, Poland, were examined. Initially, all strains were typed using macrorestriction analysis of the chromosomal DNA by pulsed-field gel electrophoresis (REA-PFGE). Digestion of the chromosomal DNA with the ApaI endonuclease and separation of the fragments by PFGE revealed 21 unique types. Application of DR-PCR/RFLP resulted in recognition of 12 clusters. The results showed that the DR-PCR/RFLP method is less discriminatory than REA-PFGE, however, the novel genotyping method can be used as an alternative technique for generating DNA profiles in epidemiological studies of intra-species genetic relatedness of Acinetobacter baumannii strains.     

醋酸钙-鲍曼不动杆菌复合体临床分离株多重PCR分型和感染特征分析

目的在临床微生物实验室建立醋酸钙-鲍曼不动杆菌复合体分型的方法,对相应菌株的药敏情况和临床特征进行分析,为临床准确诊断和有效治疗提供参考依据。方法收集苏州大学附属第一医院2015年10月至2016年1月临床分离的45株醋酸钙-鲍曼不动杆菌复合体菌株,用多重PCR法进行基因分型,用K-B法进行药敏试验,并采用SPSS 17.0软件进行统计分析。结果 45株醋酸钙-鲍曼不动杆菌复合体用多重PCR法鉴定为鲍曼不动杆菌38株,基因3型5株,基因13TU 2株,未鉴定出醋酸钙不动杆菌。标本来源以痰最多(35例),其次为血液标本(6例),脑脊液(2例)。科室分布在神经外科(11例)和ICU(10例)最多,其次是重症医学科(7例)和心胸大外科(6例)。年龄分布以41~60岁(17例)以及61~80岁(15例)两个年龄段最多;性别分布以男性较多(31例),女性较少(14例),而且各个年龄段男性均多于女性。在8种临床常用药物中,对头孢吡肟、哌拉西林、哌拉西林/他唑巴坦、环丙沙星和亚胺培南的耐药率均超过了70.0%,其中哌拉西林的耐药率最高(84.4%),阿米卡星的敏感率最高(51.1%)。结论多重PCR技术能对醋酸钙-鲍曼不动杆菌复合体进行快速基因分型,它成本低、操作简便,适合在临床微生物实验室推广。目前鲍曼不动杆菌引起的感染形势严峻,患者以中老年患者、男性、呼吸道感染、神经外科和ICU科室居多。鲍曼不动杆菌感染大多呈多重耐药甚至泛耐药。推荐临床通过积极治疗原发病,医护人员做好手卫生,加强消毒隔离,根据药敏结果合理选择抗生素等方法尽量减少和延缓耐药菌株的出现。     

346株鲍曼不动杆菌临床分布及耐药率分析

目的了解鲍曼不动杆菌引起医院感染的特点以及对抗菌药物的耐药性的变化趋势。方法应用美国BD公司Phoenix^TM100全自动细菌和药敏系统鉴定仪对所分离的364株鲍曼不动杆菌进行鉴定和药敏试验,并进行统计学分析。结果 346株鲍曼不动杆菌来自痰液、伤口分泌物、中段尿、静脉血及大便,分别占58.96%、30.92%、5.49%、4.34%、0.29%。药敏结果显示鲍曼不动杆菌对多粘菌素和米诺环素敏感性最高,耐药率低于10.4%。结论加强鲍曼不动杆菌的耐药监测,了解其耐药性变迁,可合理指导用药,有效控制鲍曼不动杆菌耐药菌株的产生。     

幽门螺杆菌临床分离株的随机扩增多态性DNA指纹图分析

目的:建立武汉及周边地区幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)感染病人胃内分离的Hp的DNA指纹图谱,并进行数理统计分析,探讨Hp基因型与疾病的相互关系,为临床诊断、防治及致病机制提供理论与实践基础.方法:采取随机扩增多态性DNA指纹法(Random amplified polymorphic DNA,RAPD)对48例病人Hp基因组DNA进行PCR反应,其随机引物为:1290 5'-GTGGATGCGA-3'.反应产物经2%琼脂糖凝胶电泳,成像存盘.用统计分析软件(Statistic analysis software,SAS)对Hp DNA指纹图的相似性以及与疾病的相关性进行分析.结果:每个菌株都有其独特的DNA指纹图,显示其基因的多态性;计算机聚类分析显示:Hp DNA指纹图可分为两大类,其与宿主疾病之间有一定程度的相关性(P＜0.05).结论:(1)RAPD对 Hp DNA扩增结果是稳定、可靠的,是一种较好的分型方法.(2)幽门螺杆菌感染所致疾病可能与其基因型相关.