两种泥鳅RAPD标记遗传稳定性分析

用从20个随机引物中筛选出的7个引物对泥鳅（Misgurnus anguillicaudatus）和大鳞副泥鳅（Paramisgurnus dabryanus）及其自交与杂交子代进行了RAPD遗传稳定性分析。结果表明,RAPD谱带主要呈孟德尔式遗传,该类带纹明亮稳定,在泥鳅子代中占99．11％;在大鳞副泥鳅子代中占100％;在杂交子代中占99．36％。也存在非孟德尔式遗传谱带,该类带纹较暗、稳定性差,在泥鳅子代中为0．89％;在杂交子代中为0．64％;在大鳞副泥鳅中未见此类带纹。实验结果说明RAPD谱带具有很高的遗传稳定性。     

大鳞副泥鳅5个野生群体的遗传多样性分析

利用微卫星分子标记分析了天津地区于桥水库、大黄堡湿地、七里海湿地、团泊水库和潮白新河5个野生大鳞副泥鳅群体的遗传多样性。5个群体在12个微卫星位点共检测到98个等位基因,平均等位基因数为8.500;有效等位基因数为2.713;平均观测杂合度为0.526;平均期望杂合度为0.544。5个群体间的遗传分化指数介于0.021~0.106之间,平均遗传分化指数为0.059,属中低水平的遗传分化。AMOVA分析结果显示,在总的变异中,94.1%的遗传变异来自群体内,5.90%的遗传变异来自于群体间。根据Nei’s遗传距离所绘制的系统树显示,于桥水库、团泊水库、七里海湿地和大黄堡湿地4个群体的遗传距离相对较小聚为一支,潮白新河群体单独为一支。遗传瓶颈效应分析表明,该5个群体近期未经受遗传瓶颈效应,处于突变-漂移平衡。总体来看,天津地区5个野生大鳞副泥鳅群体的遗传多样性较高,可作为品种选育的基础群体。     

利用SSR标记分析玉米轮回选择群体的遗传多样性

利用SSR标记技术分析了玉米基础群体DC0及其选择两轮后的群体HSC2和MSC2以及基础群体XFC0和其选择一轮后的群体XFC1的遗传多样性。结果表明：49对引物在5个玉米群体中共扩增出185个等位位点,每个SSR座位的等位基因数目为1～7个,平均为3．8个;基础群体多态性位点总数和多态性位点比例比其改良群体的略高;DC0、HSC2和MSC2 3个群体的基因平均杂合度相似,XFC0与XFC1的基因平均杂合度相似;基础群体与改良群体的平均遗传距离也相似;累加各引物扩增的基因型种类,改良群体的基因型种类偏少,但这些差异均不显著。以上结果说明轮回选择的基础群体与其改良后群体的遗传变异相似,轮回选择可以保持群体的遗传变异范围,改变群体的遗传组成,增加群体内个体间的异质性。     

中国泥鳅属和副泥鳅属鱼类的分类整理

根据形态学特征及线粒体Cyt b和COⅠ基因对我国泥鳅属(Misgurnus)和副泥鳅属(Paramisgurnus)鱼类进行了分类整理。结果表明: 泥鳅属和副泥鳅属鱼类在鳞焦大小, 须长及基枕骨末端愈合程度等特征上存在差异。基于联合基因分析, 泥鳅属和副泥鳅属属间遗传距离(15.2%—17.5%)接近于泥鳅属种间遗传距离(10.7%—18.4%); 分子系统树显示我国泥鳅属鱼类未构成单系, 副泥鳅属嵌套分布于泥鳅属中; 北方泥鳅(Misgurnus bipartitus)和泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)亲缘关系近, 其次是大鳞副泥鳅(Paramisgurnus dabryanus), 黑龙江泥鳅(Misgurnus mohoity)位于系统树的基部。结合形态特征与分子数据, 副泥鳅属应作为泥鳅属同属异名, 大鳞副泥鳅应归入泥鳅属; 北方泥鳅曾为黑龙江泥鳅的同物异名, 与黑龙江泥鳅存在明显的形态差异, 且两者亲缘关系较泥鳅远, 北方泥鳅为有效种。     

草鱼和鲤群体遗传变异的RAPD指纹分析

利用随机扩增多态ＤＮＡ技术对革鱼,兴国红鲤,野鲤的种群内,种群间以及种间的遗传变异亏待进行了定量分析。结果表明;草鱼与鲤的ＲＡＰＤ指纹图谱带型差异显著,草鱼与红鲤和鲤种间的平均带纹相似系数分别为０．２５８３和０．２３９４,遗传距离分别达到０．９３６２和１．２２７７。     

PCR扩增泥鳅和大鳞副泥鳅SRY盒基因

以特异扩增人ＳＲＹ基因保守区的一对引物,研究了泥鳅和大鳞副泥鳅基因组中ＳＲＹ盒基因的扩增。结果表明,该引物可以在泥鳅中扩增出四条带,其长度分别为２００,５５０、９４０和１０００ｂｐ。在大鳞副泥鳞中扩增出三条带,大小为２００,５５０和９００ｂｐ。经Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交显示出二者的阳性带为２００和５５０ｂｐ。阳性带在雌雄个体间和两个物种间无差异。     

人工诱导泥鳅与大鳞副泥鳅雄核发育单倍体子代的RAPD分析

用３０个经过筛选的随机引物对３组泥鳅雄核发育单倍体、２组大鳞副尼鳅雄核发育单倍体及其相应亲本进行了ＲＡＰＤ分析。结果表明,雄核发育倍体子代与其父本的ＲＡＰＤ谱带相似率为９７．０％－９７．８％,与母本相似率为３０．３％－５９．５％,子代中的非亲本谱眩为０－０．０２９,极少母本特异谱带。这一结果说明雄性发育鱼类单倍体的遗传信息主要来自父本,且存在着个体差异,雄核发育子代存在ＤＮＡ变异和母本ＤＮＡ非特异带,但并非其必要条件。     

应用RAPD技术分析奥利亚罗非鱼和尼罗罗非鱼的基因多态性

以随机扩增多态DNA技术(RAPD）分析了奥利亚罗非鱼和尼罗罗非鱼两个养殖群体的群体内及群体间遗传关系,并探讨了该技术在种群鉴定中的应用。RAPD引物筛选结果表明,所测试的20个随机引物中(Table 1),除一个引物未扩增出任何片段外,其余19个引物均扩增出1～11个大小不等的片段,长度大部分在500—3000bp之间,共扩增出220个片段,平均每个引物产生55个片段。两群体间共有片段70条,大部分引物的扩增产物具有种间多态性,种群间相似系数为0.727。以筛选的引物对两种群不同个体(Fig．1,Table 2)及种群混合样品(Fig.2,Table 3)进行RAPD分析。结果表明,不同引物在扩增图谱上表现很大差异：奥利亚罗非鱼不同个体间表现为一致的扩增图谱,种内相似系数达1000,显示了其种群内遗传变异的缺乏;尼罗罗非鱼种内相似系数为0．827,个体间存在不同程度的多态性;两个种群间的相似系数分别为0．767和0.742,表明种间有较高的同源性,遗传距离为0．235,略低于国外的报道．此外,两个养殖群体间的扩增图谱比较也暗示了遗传渐渗现象的存在。实验表明,RAPD标记可以作为一种可靠的遗传标记,用于不同鱼类种群的鉴定,RAPD分析方法是一种快速,简便且行之有鼓的鉴定鱼类种群的方法。     

南四湖泥鳅和大鳞副泥鳅随机扩增多态DNA分析初报

采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对南四湖的泥鳅（Misgurnus anguillicaudatus）和大鳞副泥鳅（Paramisgurnus dabryanus）进行了初步分析。共用10个10bp的OPG组寡核苷酸片段作为引物,筛选出结果好的5个引物,从泥鳅4个体基因组DNA中扩增出142个片段,共有片段12个,特有片段5个;从大鳞副泥鳅3个体基因组DNA中扩增出101个片段,共有片段18个,特有片段5个,在总扩增出的243个片段中,共有片段仅4个。所有扩增片段大小介于0.2-3kb之间。用PoPGen32软件计算出个体间的遗传距离,依此进行UPGMA聚类得到的分子系统树与形态分类学的结果一致,这7个体被聚成2大类,正对应着形态学的2个种：泥鳅和大鳞副泥鳅。     

花鲈群体的遗传变异

采用水平淀粉凝胶电泳技术对花鲈群体的遗传结构进行了研究 ,共检测了中国沿海花鲈 14 6尾和 40尾日本东京湾花鲈。其群体的多态位点比例为 0 2 667— 0 53 3 3 ,观测杂合度和预期杂合度分别为 0 0 2 11— 0 0 515和0 0 3 98— 0 0 797。中日花鲈在LDH ,GPI 1 ,GPI 2 基因位点上的等位基因接近完全置换。中国花鲈各群体之间的根井遗传距离为 0 0 0 0 4— 0 0 0 11,平均值约为 0 0 0 80 ;而中日花鲈间的根井遗传距离为 0 1870— 0 1954,平均值为 0 192 6。以上结果表明中国花鲈群体间遗传变异很小 ,中日花鲈间遗传变异远大于中国花鲈群体间的遗传距离。     

小毛茛居群的遗传分化及其与空间隔离的相关性

采用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,对分布于华中地区的11个小毛茛（Ranunculus ternatus）居群的遗传分化进行了检测。对8个酶系统17个酶位点上的分析结果表明,该种各居群 的各项遗传多样性指标处于一个相对较低的水平：多态位点比率（P）为0～53.0%,平均每位点等位基因数（A）为1～1.647,平均预期杂合度（H_e）和观察杂合度（H_o）分别为0～0.108和0～0.102。居群间遗传一致度甚高（I＝0.9754～0.9991）。根据Nei′s遗传距离所作出的聚类分析表明,豫南信阳地区3个居群与湖北省武汉地区8 个居群之间关系较远。而在武汉地区,长江以北的居群及长江以南的部分居群分别相聚在一 起。用GPS定位方法得到居群间空间距离并据此聚类,结果显示了该种的遗传分化与地理因 素 的相关性,并推测出长江的隔离作用加强了两岸居群间的遗传分化。同时发现一个生于独特 生境的居群在表型和遗传结构上都已与其他邻近居群有了很大分异,由于该居群在所检测的 酶位点上均无特有等位基因出现,作者认为不宜将其作为新种或新变种处理。     

GENETIC FINGERPRINT-INFERRED POPULATION SUBDIVISION AND SPATIAL GENETIC TESTS FOR ISOLATION BY DISTANCE AND ADAPTATION IN THE COASTAL PLANT LIMONIUM CAROLINIANUM

This paper examines two wild populations of Limonium carolinianum for population genetic subdivision and spatial patterns of genetic variation in an attempt to simultaneously test for both the action of local adaptation to tidal gradients and isolation by distance (IBD). A VNTR (variable number of tandem repeats) genetic “fingerprinting” marker was used to infer relatedness among mapped plants in two populations. Band sharing within and between populations estimated F'_ST, an approximate measure of F_ST. Regression models were used to analyze the relationship between band sharing and spatial separation in tidal elevation and horizontal distance, as well as the relationship of fecundity differences with band sharing and spatial distance. Populations differed in band size frequency distributions and mean number of bands per profile and, therefore, likely differed in effective population size. F'_ST was estimated at 0.0678 and was significantly greater than F'_ST among randomly constructed subpopulations. Band sharing decreased 0.13% per meter in one population but showed no significant relation to distance in the other. In the population with significant IBD band sharing increased with increasingly different tidal elevation, contrary to an adaptive hypothesis, possibly due to directional gene flow or drift. Deme sizes were approximately 25 meters and greater than 100 meters, spanning larger areas than the entire environmental gradient. Fecundity differences were not associated with spatial parameters or band sharing. Unequal potential maternal fecundity measured as variance in number of seeds per maternal family was a significant source of genetic sampling variance. The VNTR marker employed is capable of detecting adaptation as identity by descent in ecological time and is an appropriate method for estimating the net evolutionary fate of polygenic traits. The results show that the net balance between selection along an environmental gradient and the effects of IBD and unequal maternal fecundity favor genetic differentiation by random processes in populations of Limonium.     

长江中上游两个鲢群体遗传变异的微卫星分析

对长江中上游2个鲢群体使用39个微卫星标记进行了遗传多样性分析, 计算并统计了平均观测等位基因数、平均有效等位基因数、多态信息含量、遗传杂合度、Hardy-Weinberg平衡偏离指数、遗传相似系数、遗传距离等遗传参数。结果表明: 万州鲢和监利鲢群体所检测微卫星位点的平均观测等位基因数分别为6.128和4.974; 平均有效等位基因数分别为4.107和3.395; 多态位点百分率分别为100和94.87; 39个微卫星标记共有等位基因259个, 173个等位基因为两群体所共有; 多态微卫星位点的PIC在0.077~0.865之间变动,平均为0.617; 两群体所检测位点平均观测杂合度为0.834和0.775, 平均期望杂合度为0.713和0.623; 两个群体间的遗传相似系数为0.618, 群体间的遗传距离为0.482。结果显示长江中上游两个鲢群体间存在显著遗传分化, 应隶属于不同的种群。     

我国中华按蚊群体分子遗传多态研究

利用RAPD-PCR技术研究了采自我国9省10个代表点的中华按蚊Anopheles sinensis自然群体的遗传多态现象,根据23个RAPD等位基因位点进行了分析。结果显示：①多态位点比例为68.2%～86.4%,期望平均杂合度为0.249～0.348,说明中华按蚊群体具广泛的遗传多态现象;②利用3种方法计算Fst和θ,平均值为0.069～0.111,相应的迁移率Nm为2.0～3.4,表明基因流水平较低;③中华按蚊各自然群体间的遗传一致性达0.8795～0.9973,平均遗传距离为0.041±0.033,属种内变异范围。聚类分析显示,群体间遗传距离与地理位置无对应关系。     

利用17个微卫星标记分析鳙鱼的遗传多样性

选用本实验室克隆的17个鳙鱼微卫星分子标记分析四川泸州和江西鄱阳湖的两个种群鳙鱼的遗传多样性及种质特性,计算和统计了杂合度、多态信息含量（PIC）、有效等位基因数、等位基因频率、遗传距离、遗传相似系数、Hardy-Weinberg平衡偏离指数等方面内容。结果表明：选择使用17个微卫星标记,其中有4个为单态标记,13个为多态标记。江西和四川鳙鱼群体每个微卫星位点的平均等位基因数分别为3.325及3.882,平均有效等位基因数分别为3.531及2.676,多态位点百分率分别为82.4及70.5, 17个微卫星标记共有等位基因71个,多态微卫星位点的PIC在0.114~0.960之间变动,平均为0.417 ,两群体位点平均观测杂合度为0.385和0.452,平均期望杂合度为0.360和0.422,两个群体间的遗传相似系数为0.897,群体间的遗传距离为0.109。     

Escape from predators and genetic variance in birds

Predation is a common cause of death in numerous organisms, and a host of antipredator defences have evolved. Such defences often have a genetic background as shown by significant heritability and microevolutionary responses towards weaker defences in the absence of predators. Flight initiation distance (FID) is the distance at which an individual animal takes flight when approached by a human, and hence, it reflects the life‐history compromise between risk of predation and the benefits of foraging. Here, we analysed FID in 128 species of birds in relation to three measures of genetic variation, band sharing coefficient for minisatellites, observed heterozygosity and inbreeding coefficient for microsatellites in order to test whether FID was positively correlated with genetic variation. We found consistently shorter FID for a given body size in the presence of high band sharing coefficients, low heterozygosity and high inbreeding coefficients in phylogenetic analyses after controlling statistically for potentially confounding variables. These findings imply that antipredator behaviour is related to genetic variance. We predict that many threatened species with low genetic variability will show reduced antipredator behaviour and that subsequent predator‐induced reductions in abundance may contribute to unfavourable population trends for such species.     

性选择、配偶外父亲身份确认程度、遗传变异性和保护

岛屿动物中的性选择强度不高,其原因可能是由于岛屿种群的遗传变异性水平较低。本文作者检验了鸟类岛屿种群是否具有较低的遗传变异性、性选择强度大的种群是否具有较高的突变输入率（rate of mutational input),在鸟类岛屿种群中是否具有较低的性选择强度（可以根据配偶外父亲身份的频率来估计）。小卫星共有谱带系数（minisatellite band sharing coefficient)可确定无亲源关系个体之间的遗传变异性,对与遗传变异性有关的雄性个体的父亲（paternity)进行了成对比较以检验如下假说：在具有较多遗传变异的种群中,雌性个体更经常地进行配偶外交配。在小卫星谱带系数较低的鸟类种群中,配偶外父亲的频次较高。对岛屿和大陆鸟类进行的第二个比较分析表明：岛屿种群中的配偶外父亲频次较低,遗传变异性也较低,其部分原因在于突变输入（mutational input)减少。上述发现表明：（1）父亲确认程度（parternity)随遗传变异性的数量而增加;（2）在遗传变异性较大的种群中,突变率较高,性选择的程度更激烈;（3）岛屿种群中性选择的强度一般比大陆种群弱。这对于理解遗传变异性的空间变异、理解岛屿种群和其它隔离种群的保护问题有重要启示。     

基于AFLP分子标记技术的黑花韭与多星韭遗传多样性与亲缘关系分析

采用AFLP分子标记技术分析了分布在滇中、滇西、滇西北的3个黑花韭居群、3个二倍体多星韭居群和6个四倍体多星韭居群的遗传多样性与亲缘关系.结果表明,12个居群在DNA水平上已发生明显分化.居群间的基因分化系数(GST)为0.444.由GST计算的居群间基因流(Nm)为0.625,表明居群间部分基因流动受阻.12个居群间...     

RAPD分析在绢丝昆虫亲缘关系研究中的应用I.蓖麻蚕品种间的遗传差异

用RAPD技术对蓖麻蚕基因组DNA进行多态性研究,分析了5个蓖麻蚕品种间的遗传差异。结果表明,所采用的40个随机引物中,有27个引物扩增谱带清晰且重复性较好,扩增总片段数达243个,单个引物的扩增片段数在4～17之间,平均为9条,片段大小在0.33～3.0kb之间。不同蓖麻蚕品种间的遗传距离(D)在0.0683～0.1603之间,根据D值,由UPGMA聚类分析软件绘制了它们的聚类分子树。 Abstract：Random amplified Polymorphic DNA (RAPD) was used to analyze the genetic diversity among eri sickworm. The genetic variance of five erisickworm was studied. The result showed that: 27 of 40 arbitrary primers could amplify clearly with repeatable bands.243 fragments were obtained.Each primer gave 4～17 bands and the average was 9.The length of the band was 0.33～3.0kb. The genetic distance (D) value between different breeds of Eri Silkworm was 0.0683～0.1603. The D value was used to construct a dendrogram by UPGMA.