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桃不同类群的遗传多样性及其遗传结构的RAPD分析 总被引:10,自引:0,他引:10
采用RAPD技术,利用从200个随机引物筛选的22个十碱基引物对桃10个类群180个样品的DNA进行扩增,得到180个位点。通过对所得的数据统计分析,在类群的遗传多样度上表现为:黄肉桃类>蜜桃类>蟠桃类>红叶桃类>硬肉桃类>碧桃类>水蜜桃类>油桃类>寿星桃类>垂枝桃类。在180个位点中检验出多样度范围在0.4以上的位点分布在桃总群体中的有37个,而在桃类群间的则有13个。聚类分析的结果是:桃食用栽培品种的类群聚为一组;其它非食用桃类群各为一组。对桃类群的遗传多样性及其结构分析,为桃的品种资源保存和利用提供分子生物学依据。 相似文献
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利用8个随机引物对来自海南、广东和广西的114个柱花草胶孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides)的菌株进行了随机扩增多态性DNA(RAPD)分析, 扩增谱带大小0.2-3.0 kb。8个随机引物中以CW38114扩增的谱带重现性和稳定性最好, 共扩增出786条谱带, 其中多态性谱带558条。供试菌株扩增图谱在260-650 bp处有3条明显的共同特征谱带, 在650-3 000 bp之间的谱带显示较大的多态性差异。聚类结果表明: 供试菌株主要分为四大遗传类型, 其中第I类和第III类有两个亚类; 三省区的菌株遗传多态性丰富程度依次为海南>广西>广东, 并表现出地区性分布差异。研究结果还表明柱花草炭疽菌株表现出一定程度的专化寄生性。 相似文献
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利用8个随机引物对来自海南、广东和广西的114个柱花草胶孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides)的菌株进行了随机扩增多态性DNA(RAPD)分析,扩增谱带大小0.2-3.0kb。8个随机引物中以CW38114扩增的谱带重现性和稳定性最好,共扩增出786条谱带,其中多态性谱带558条。供试菌株扩增图谱在260-650bp处有3条明显的共同特征谱带,在650—3000bp之间的谱带显示较大的多态性差异。聚类结果表明:供试菌株主要分为四大遗传类型。其中第Ⅰ类和第Ⅲ类有两个亚类;三省区的菌株遗传多态性丰富程度依次为海南〉广西〉广东,并表现出地区性分布差异。研究结果还表明柱花草炭疽菌株表现出一定程度的专化寄生性。 相似文献
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以45个硬肉桃品种为试材,利用25对位于桃遗传参考图谱上8个连锁群的SSR引物进行了硬肉桃种质资源遗传多样性研究。结果表明:25对SSR引物共获得152个扩增位点,其中多态性位点146个,多态性高达96.05%,Nei′s遗传多样性指数(He)为0.2283,Shannon信息指数(H0)为0.3609。长江流域桃区的硬肉桃品种群体具有最高的Nei′s遗传多样性指数(0.2211)和Shannon信息指数(0.3476),其次为华南亚热带桃区和云贵高原桃区,最低的为华北平原桃区。UPGMA聚类分析结果虽然体现出一定的生态区划特征,但不完全与地理起源相吻合,不同生态区的硬肉桃品种存在一定的交叉;长江流域桃区和云贵高原桃区的硬肉桃品种亲缘关系较近,其次为华南亚热带桃区,最远的为华北平原桃区。本研究鉴定结果更倾向于认为长江流域的硬肉桃可能来源于北方硬肉桃群体,还可能来源于云贵高原生态区和华南亚热带生态区的硬肉桃群体。 相似文献
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克隆植物蛇莓基株的分子鉴定 总被引:1,自引:1,他引:0
采用随机扩增序列区间(ISSR)分子标记技术对蛇莓基株进行鉴定,结果表明6个ISSR引物在22个分株中共扩增出62个条带,每个引物扩增的条带数为4~16条,平均每个引物扩增的条带数为10.3条。采用6种引物对22个克隆分株的DNA扩增共产生28种带谱类型,其中有9种带谱为特异性带谱。综合分析这些带谱,确知这22个克隆分株分属16个基株。由带型可知,通过6个引物中的4种引物就可以把所有的基株鉴定出来,表明ISSR技术在分子水平上鉴定蛇莓的克隆基株是一种行之有效的方法。同时每个引物扩增出来的条带的多态性比例也比较高,平均达到90.3%。 相似文献
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水蜜桃种质资源的RAPD分析 总被引:2,自引:0,他引:2
利用RAPD技术,采用从200个随机引物中筛选的22个随机引物对48个水蜜桃品种的基因组I)NA进行扩增。通过180个扩增位点谱带的聚类,分析供试水蜜桃的系统发育;并运用特殊谱带,建立了水蜜桃的分子检索表;提出了重点保存的水蜜桃种质有冈山白、Spring time、Rebin、白凤、霞晖2号、早艳、奉化玉露。 相似文献
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高粱抗丝黑穗病基因的RAPD初步分析 总被引:1,自引:0,他引:1
目的:对高粱抗丝黑穗病的基因进行分析。方法:以高粱2381恢复系(抗病)、矮四恢复系(感病)、7050B保持系(抗病)、TX622B保持系(感病)为材料,采用CTAB提取DNA的方法提取高粱基因组DNA,然后应用RAPD分子标记技术对DNA进行多态性扩增。结果:初步建立了高粱丝黑穗病的RAPD反应体系;从RAPD反应中所用的48个随机引物中筛选出28个适宜引物,其余20个引物没有扩增出谱带,被淘汰;共扩增出114条谱带,其中引物OPM-05300和OPM-13450扩增出了差异谱带,分别命名为OPM-05300和OPM-13450。结论:在该反应体系下找到了高粱抗丝黑穗病抗感品种间基因组差异的两条差异谱带。 相似文献
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The role of random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers in detecting intra-clonal genetic variability in vegetatively propagated UPASI-9 clone of tea (Camellia sinensis) was studied. Twenty five decamer primers were used, of which three did not amplify, three gave single bands and the rest of nineteen primers generated upto twelve bands (an average of 6.3 bands per primer). Twenty one primers exhibiting amplified products gave monomorphic banding patterns. Only one primer (OPE-17) gave a unique extra band of similar size in four plants. 相似文献
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利用ISSR标记,对来源于中国7个省(市)的44个扁蓿豆居群的亲缘关系进行了分析。从80条ISSR引物中筛选出多态性强、重复性好的16条引物,对44个扁蓿豆居群基因组DNA进行扩增,共扩增出133条谱带,平均每个引物扩增出8.31条带,其中多态性带115条,多态性位点百分率为87.08%。扁蓿豆种质间遗传相似系数变化范围在0.436~0.908之间。利用UPGMA聚类分析,44个扁蓿豆居群被划分为8个类群,与地理来源有较高的相关性。 相似文献
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用分子标记技术分析不同生态型芦苇的遗传多样性 总被引:9,自引:0,他引:9
用分子标记技术对河西走廊4种不同生态型芦苇进行了遗传多态性分子标记分析。从30条ISSR引物和45条RAPD引物中分别筛选出适合4种不同生态型芦苇分析的9条和13条引物,前者共扩增出99条带,多态性位点数为51;后者共扩增出195条带,多态性位点数为87。两种分子标记分析所得的遗传相似系数呈显著正相关(r=0.845,P<0.05)。4种生态型芦苇表现出由水生芦苇经盐渍芦苇向沙丘芦苇逐渐演化的趋势。 相似文献
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Random amplification of polymorphic DNA (RAPD) is widely used to detect polymorphisms in many organisms. Individual (or strain) specific amplified bands are generated with single or pairs of primers in PCR reactions and can serve as genetic markers. We have used this method to generate a large number of reproducible bands with single primers, random and retroviral related, on 92 human DNA samples. Theoretically, RAPD PCR presents a logical approach for assessing variability among individuals. We used ten retroviral related primers (12, 20 and 22 bp) and eight random primers (10 bp) to assess individual differences in the context of testing the retroviral hypothesis for schizophrenia. Three pairs of discordant monozygotic twins, four pairs of discordant full sibs and 53 schizophrenic individuals with 25 of their unrelated matched controls were analyzed. Ten of these primers resulted in a total of approx. 850 amplified bands (65-110 bands per primer). Almost all of these bands were identical among each individual analyzed. However, the results are inconclusive with respect to the retroviral hypothesis for schizophrenia. The general lack of RAPD polymorphism in this study may argue for mechanisms other than rearrangements such as inversions, associated with the evolution of the human genome. 相似文献
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香蕉33个品种的RAPD研究 总被引:14,自引:0,他引:14
利用RAPD技术对香蕉(Musa nana Lour.)33个品种的遗传变异进行了研究,从249个随机引物中筛选出18个有效引物,用它们共扩增出192条DNA带,其中183条为多态性带,占95.31%,平均每个引物扩增的DNA带数为10.67条,利用18个有效引物扩增的192条DNA带对香蕉33个品种间的亲缘关系进行UPGMA聚类分析,计算出33个品种间的平均遗传距离为0.3412。在此基础上建立了香蕉33个品种的DNA分子系统树状图。该系统将香蕉33个品种划归A,B,C和D4个群,其中A群20个品种,B群5个品种,C群2个品种,D群6个品种;A群又可以分为3个亚群。对香蕉遗传多样性分子基础进行了探讨。 相似文献