Ripley′s指数的一个新变形——G（d）

在对Ripley′s指数的物理背景进行分析的基础上提出了一个新的变形——G（d）指数。原始Ripley′s指数K（d）是一个半径为d（d为尺度）的圆的面积估计量,是有量纲的,且K（d）随着d的增大迅速增大,应用起来不太方便。Ripley′s指数的变形L（d）将K（d）换算成d的估计量,再减去d,使得L（d）在随机分布的假定下有数学期望0,这使得L（d）的应用比K（d）要方便。但L（d）还是一个具有长度单位的量,其上下包迹线呈明显的喇叭形状,对于应用还不是十分方便。提出的G（d）指数是一个比值,无量纲,数学期望也是0。文章给出了4个例子,这些例子说明,它保持了L（d）指数区分分布类型的能力,同时具有稳定这个良好特性,到了一定尺度以后,上下包迹线趋向常数。进一步分析得知,这些常数与单位面积的个体密度相关,呈对数关系,其相关系数r2达到0.9左右。这样在实际应用中,包迹线只要模拟到稳定点即可,余下部分可通过回归公式计算,从而节省计算工作量。     

Ripley''s指数的一个新变形——G(d)

在对Ripley's指数的物理背景进行分析的基础上提出了一个新的变形--G(d)指数.原始Ripley's指数K(d)是一个半径为d(d为尺度)的圆的面积估计量,是有量纲的,且K(d)随着d的增大迅速增大,应用起来不太方便.Ripley's指数的变形L(d)将K(d)换算成d的估计量,再减去d,使得L(d)在随机分布的假定下有数学期望0,这使得L(d)的应用比K(d)要方便.但L(d)还是一个具有长度单位的量,其上下包迹线呈明显的喇叭形状,对于应用还不是十分方便.提出的G(d)指数是一个比值,无量纲,数学期望也是0.文章给出了4个例子,这些例子说明,它保持了L(d)指数区分分布类型的能力,同时具有稳定这个良好特性,到了一定尺度以后,上下包迹线趋向常数.进一步分析得知,这些常数与单位面积的个体密度相关,呈对数关系,其相关系数r2达到0.9左右.这样在实际应用中,包迹线只要模拟到稳定点即可,余下部分可通过回归公式计算,从而节省计算工作量.     

天山云杉种群空间格局与动态

天山云杉(Picea schrenkiana)林是天山林区的重要针叶林。研究调查了两块分别代表天山云杉不同演替阶段的标准地,应用Ripley’s K系数法研究了天山云杉种群空间格局与动态。结果表明：天山云杉是聚集型种群,天山云杉活立木、枯死木、天山桦(Betula tianschanica Rupr．)和天山柳(Salix tianschanica Rgl．)的空间格局均为聚集型;天山云杉枯死木的聚集强度大于天山云杉活立木的聚集强度;天山桦和天山柳的聚集强度大于天山云杉枯死木的聚集强度;天山桦和天山柳的空间格局随种群所处的演替阶段不同而不同,增长型种群在所有尺度上其空间格局都为聚集型,在大于70m尺度上表现为均匀格局,而天山云杉成熟林中的天山桦和天山柳只在小尺度(0～40m)上表现为聚集。随着天山云杉的生长,其聚集强度逐渐减小,聚集半径不断增大。从50a以下天山云杉到50～100a的天山云杉其聚集强度急速减小,这有利于天山云杉幼树获得足够的资源,是天山云杉幼树的一种生存策略或适应机制。150a以上天山云杉的聚集强度增加,这是由于天山云杉生长到150a左右时开始出现成熟后死亡,形成林窗有利于天山云杉林的更新。研究还对Ripley’s K系数法和频次检验法进行了比较,Ripley’s K系数法能够分析各种尺度下的种群空间格局,且不受样方大小的影响,结果清楚、直观。     

宁夏沙湖4种干旱区群落中主要植物种间关系的格局分析

格局分析是研究群落结构、种群特征、种内种间关系以及生物与环境间相互作用的重要手段。应用Ripley’s K函数的双变量点格局分析技术, 对宁夏沙湖4种干旱区群落中主要植物种间的空间关联关系进行了研究; 同时, 根据关联物种间相对位置的规则性, 基于Ripley’s K函数, 提出一种用于检测种间格局控制关系的技术方法。研究结果表明: 1) 沙枣(Elaeagnus angustifolia)-芨芨草(Achnatherum splendens)、芨芨草-苦豆子(Sophora alopecuroides)、白刺(Nitraria tangutorum)-芨芨草3个群落中, 主要物种间在个体大小、根系特点和生态习性等方面存在较大的差异, 并分别在一定的尺度范围内存在正关联关系; 而在物种生态需求和形态大小等方面相对一致的红砂(Reaumuria soongorica)-盐爪爪(Kalidium foliatum)群落中, 红砂和盐爪爪之间在整个观测尺度内(0~15 m)存在负关联关系。2) 格局控制分析表明, 在主要物种间存在空间正关联关系的3个群落中, 均检测出主要物种间在一定尺度范围内存在格局控制关系, 其中格局控制种一般个体较大、生境改造能力较强; 而在主要物种生活型相似的红砂-盐爪爪群落中, 未检测到主要物种间的格局控制关系。     

荷叶中紫云英苷和牛血清白蛋白相互作用的光谱学研究

本文采用荧光光谱法、紫外光谱法研究在生理条件(pH=7.4)下荷叶中紫云英苷(AST)与牛血清白蛋白(BSA)的相互作用。结果表明AST可与BSA结合并通过静态猝灭作用机制对BSA内源性荧光进行猝灭。在温度为298K及308K时,测得其猝灭速率常数(Kq)分别为4.31×1013L/mol/s和3.72×1013L/mol/s;结合常数(Kd)分别为2.009×105L/mol和0.927×105L/mol;结合位点数(n)分别为0.943和0.893。依据298K时测定的反应自由能变(△G0=-30.25kJ/mol),反应焓变(△H0=-59.02kJ/mol)及反应熵变(△S0=-96.54J/mol/K),结果发现AST与BSA间的结合反应可自发进行且其作用力主要表现为氢键和范德华力。此外,根据Frster非辐射能量转移理论得到AST与BSA之间的结合距离(r)为4.13nm,表明非辐射能量可从BSA转移至AST。     

中国森林遥感Rao′s Q指数时空演变

明确宏观森林植物多样性时空分布格局,对于评估森林生态工程效果以及有效开展区域生物多样性保护工作具有重要意义。遥感生物多样性研究能够弥补原位观测在时空连续性方面的不足,研究旨在为区域尺度生物多样性研究引入一种新方法——遥感Rao′s Q指数。结果表明：基于归一化植被指数(NDVI)计算的Rao′s Q指数与收集的物种丰富度在空间分布上基本一致,且两者的数值拟合通过极显著检验(R²=0.66,P<0.001),Rao′s Q指数随物种丰富度增加而增加,适用于表征宏观尺度跨气候带地区的森林植物多样性。2000—2017年间,中国森林的Rao′s Q指数时空分布基本一致,整体呈南高北低的态势;不同时段中均以降低为主,降低面积占总面积的44.23%—54.08%,武夷山-南岭一带增高特征凸显,而2010—2017年也表现出降低特征,该区域森林植物多样性本底丰富,应加强管控力度,阻止降低热点区扩散。引入遥感Rao′s Q指数有效表征区域森林植物多样性分布特征,可为区域生态质量评估提供一种新的监测指标,进而为森林植物多样性保护及区域生态质量改善相关政策制定提供支撑。     

华南海岸英罗港红树植物木榄种群结构的空间异质性

采用位置指数(CE)、分异指数(TC和TH)、Shannon-Wiener多样性指数(D)以及Ripley的K-方程,探讨了华南海岸英罗港树植物木榄种群的分布格局、胸转和树高分异以及冠层结构方面的空间异质性.多数种群呈现随机分布,其个体胸转和树高的分异程度较低;页少数种群呈现集群分布,其个体胸围和树高的分异程度明显.采用地理信息(GIS)对冠层和空隙斑块进行了多种水平垂直尺度的分析,冠层与空隙斑块之间的镶嵌格局因种群而异,这种可基于树冠抽影用Shannon-wiener多样性指数时行定量描述.冠层结构的窨异质性阻碍空间尺度而变化,但这种变化在一定尺度范围内保持相对的稳定.迷一尺度范围可作为木榄红树森更新或生态管理单位的参考尺度.     

刺槐不同居群遗传多样性的ISSR分析

利用ISSR标记对全国10个刺槐居群子代100个个体的遗传多样性进行了比较分析,从65个随机引物中筛选出10个多态性引物进行扩增,共检测到91个位点,多态位点数(AP)为85,多态位点百分率(P)为93.41%.刺槐在种级水平的遗传多样性参数略高于居群水平,多态位点百分率(P)分别为95.60%、69.01%,Shannon′s信息指数(I)分别为0.6145、0.3733,Nei′s基因多样性指数(H)分别为0.4337、0.2514.居群间的遗传分化指数Gst、Nei′s基因多样性指数和Shannon′s信息指数统计结果,均显示出中国刺槐居群内遗传多样性大于居群间遗传多样性.利用PopGen32软件对10个居群进行聚类分析可知,10个刺槐群体可分为三大类,亲缘关系和地理分布呈一定的相关性,但没有形成明显的地理变异模式.     

山西省东南部地区胃癌患者肠道菌群分布的配对病例对照研究

目的观察胃癌患者肠道菌群的变化,为研究其发病机制和治疗措施提供依据。方法按照1∶1配对原则(年龄、性别、民族、居住地等)在长治某医院根据胃镜检查结果分别选取尚未进行过治疗的10例胃癌患者(胃癌组)和10例健康人群(对照组),面对面调查填写基本信息表,留取粪便样本,采用微生物16S rDNA扩增子测定技术检测粪便菌群,使用QIIME2(2019.4)、R脚本等软件分析人群肠道菌群结构。结果胃癌组与对照组之间,肠道菌群多样性Chao1指数、Shannon指数、Simpson指数、Faith′s PD指数、Pielou′s evenness指数、Observed_species指数和Good′s coverage指数差异均无统计学意义(均P0.05),但距离矩阵与PCoA分析显示2组菌群分布差异存在统计学意义(P0.05)。在门水平上,2组粪便菌群都集中在厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门和变形菌门四类菌门上,胃癌组的变形菌门、梭杆菌门、互养菌门的丰度较对照组明显增加,差异有统计学意义(均P0.05)。在属水平上,胃癌组的乳杆菌属、克雷伯菌属、脱硫弧菌属、瘤胃球菌属的丰度较对照组明显增加,差异有统计学意义(均P0.05)。胃癌组瘤胃球菌科、Gemmiger和毛螺菌属的丰度较对照组明显减少,差异有统计学意义(均P0.05)。结论胃癌患者肠道菌群物种多样性和属的丰度发生了改变。     

trnK基因5′端内含子区序列在榆科(广义)系统发育研究中的应用

本文测定了广义榆科 Ulmaceae s．l．及其近缘类群的trn K基因5′端内含子区序列。在尝试利用该内含子区进行榆科系统发育研究的同时,探讨了其在植物系统学研究中的应用前景。利用PAUP软件进行的系统发育分析仅得到1棵最简约树。该简约树的树长为665步,其一致性指数(CI)和保持性指数(RI)分别为0.7714和0.7965。分析结果表明：广义榆科为多系群;狭义榆科Ulmaceae s．str．为荨麻目rticales其他类群的姊妹群;大麻科Cannabacea嵌在朴科Celtidacea中,即朴科为一并系群;系统位置有争议的2个属——白颜树属Gironniera和糙叶树属 Aphananthe与朴科类群聚为一支。本研究还表明trnK基因5′端内含子区序列分析在植物较低分类等级(如近缘属间,属下种间)的系统发育研究中具有很好的应用前景。     

从感染黄瓜花叶病毒的烟草叶筛选抗病毒细胞突变体

用绿岛法从感染CMV的普通烟草(G140)叶筛选到抗病毒细胞突变体R~CMV2、6,其当代无性系群体病情指数较对照降低41.5-45.2%。 Abstract:The 2 CMV-resistant-cell mutants,RCMV-2、6,were selected by using the method of culturing dark green island from CMV infected tobacco(N.tabacum cv G140)leaves.The disease in dex of RCMV-2、6′s was decreased by 41.5~45.2% in comparison with that of the control(G140).     

从感染黄瓜花叶病毒的烟草叶筛选抗病毒细胞突变体

用绿岛法从感染CMV的普通烟草(G140)叶筛选到抗病毒细胞突变体R~CMV2、6,其当代无性系群体病情指数较对照降低41.5-45.2%。 Abstract:The 2 CMV-resistant-cell mutants,RCMV-2、6,were selected by using the method of culturing dark green island from CMV infected tobacco(N.tabacum cv G140)leaves.The disease in dex of RCMV-2、6′s was decreased by 41.5~45.2% in comparison with that of the control(G140).     

小麦丛矮病毒糖蛋白(G蛋白)的研究

应用SDS-聚丙烯酰胺电泳可以从小麦丛矮病毒中分离出5种结构蛋白。经过碘酸—Schiff′s试剂染色证明,其中分子量为66K的是糖蛋白,是组成病毒外膜突起的G蛋白。应用不同的植物凝集素对完整病毒进行凝集反应试验证实,只有ConA凝集素对病毒有凝集作用,葡萄糖有抑止凝集的作用。G蛋白氨基酸组成分析证明,酸性氨基酸的含量较高。用同位素~(125)I标记的G蛋白和N蛋白的双向图谱表明,植物弹状病毒的结构蛋白之间无共同的肽段。说明植物弹状病毒和动物弹状病毒一样,其蛋白也是由同一病毒基因组的不同片段转录和翻译产生的。     

多叶重楼遗传多样性的ISSR分析

采用ISSR分子标记对多叶重楼种下3个变种的8个居群共208份样品的遗传多样性进行了分析。l4条引物共检测到251个清晰的扩增位点,其中多态位点235个。在物种水平上,多态位点百分率(PPB)达93.63%,Nei′s基因多样性指数(HE)为0.2204、Shannon′s信息指数(HO)为0.3532。在居群水平上,多态位点百分率(PPB)为50.45%,Nei′s基因多样性指数(HE)为0.1405,Shannon′s信息指数(HO)为0.2194,这些均表明多叶重楼的遗传多样性水平较高。此外,还用NTSYS软件对样品进行了UPGMA聚类分析,结果显示滇重楼的6个居群聚为一支,滇重楼与狭叶重楼有较近的亲缘关系,而与长药隔重楼之间的遗传分化较大。本研究提出了合理保护重楼植物资源的若干措施,为进一步开展滇重楼优质种质引种驯化,实现种质资源多样性的合理保护和可持续利用提供参考。     

RAPD引物数量对施式巴鲵遗传多样性评估结果的影响

应用RAPD技术对神农架施式巴鲵居群内24个个体进行了遗传多样性分析,探讨引物数量对遗传多样性分析结果 的影响,结果表明:遗传多样性分析准确度与引物数量有关,引物数增加到30左右时,PPB(Percentageofpolymorphicbands)、 Shannon信息指数(Shannon′sinformationindex)、Nei′s遗传多样性指数(Nei′sgenediversity)变化趋于稳定。标准误分析表明, 引物数增加到25左右时,再增加引物,标准误变化很小。若要客观反映出个体之间的遗传变异关系,引物数应在25以上,多 态位点数应在250以上。     

西双版纳地区流苏石斛遗传多样性的ISSR 分析

采用ISSR 分子标记技术, 对西双版纳分布的兰科濒危植物流苏石斛( Dendrobium fimbriatum) 5 个居群共114 个个体的遗传多样性进行了研究。从100 条引物中筛选出了12 条用于扩增, 共检测到117 个位点, 其中105 个为多态位点。分析结果表明, 流苏石斛居群水平遗传多样性较低。在物种水平上, 流苏石斛多态位点百分率PPB 为89 .74% , Nei′s 基因多样性指数H 为0 . 3227 , Shannon′s 多样性信息指数Hsp 为0 . 4779 ; 在居群水平上, 各个居群的多态位点百分率PPB 差异较大( 6.84% ～ 39.32% ) , 平均值为23.93% , Nei′s 基因多样性指数H 为0 . 0871 , 各个居群的Shannon′s 多样性信息指数Ho 平均为0.1290。AMOVA 分析的结果显示, 流苏石斛的遗传变异大多数存在于居群间, 占总遗传变异的74 . 79%。基于Nei′s遗传多样性分析得出的居群间遗传分化系数Gst = 0 . 7443。各居群间的Nei′s 遗传一致度( I) 范围为0 . 5882～0 . 8331。Mantel 检测发现, 居群间的遗传距离和地理距离之间无显著的正相关关系( r= 0.2419, P=0.2416) 。鉴于流苏石斛的遗传多样性现状和居群遗传结构, 我们建议对流苏石斛居群所有个体实施及时的就地保护, 同时建立迁地保护居群, 促进基因交流。     

长春花悬浮培养细胞对天麻素的生物转化

应用长春花 (Catharanthusroseus (L .)G .Don)悬浮细胞培养体系对天麻素进行了生物转化反应研究。经过8d培养形成一个转化产物 ,应用光谱方法鉴定转化产物的结构为对羟基苯甲醇 ,为天麻素水解后形成的甙元。     

长春花悬浮培养细胞对天麻素的生物转化

应用长春花(Catharanthus roseus (L.) G. Don)悬浮细胞培养体系对天麻素进行了生物转化反应研究.经过8 d培养形成一个转化产物,应用光谱方法鉴定转化产物的结构为对羟基苯甲醇,为天麻素水解后形成的甙元.     

IL-8受体拮抗剂G31P拮抗小鼠旋毛虫感染的实验研究

目的通过检测感染旋毛虫的小鼠膈肌中IL-8受体CXCR1/2的表达以及肌肉组织纤维化程度,探讨G31P对旋毛虫囊包形成的影响以及防治效果。方法 30只雌性BALB/c小鼠随机分成三组:阳性模型对照组(n=12,皮下注射生理盐水),G31P治疗组(n=12,皮下注射G31P)和阴性正常对照组(n=6,皮下注射生理盐水)。阳性模型对照组与G31P治疗组小鼠应用口饲法感染旋毛虫囊包,(100±5)个/只,于感染后第10天皮下注射G31P(500μg/kg),1次/2d,连续14d,阳性对照组和阴性对照组分别皮下注射等量生理盐水。感染24d后无菌解剖小鼠,收取膈肌组织,用于HE染色和免疫组化分析。结果与阳性模型对照组相比,G31P治疗组旋毛虫囊包数量明显减少(P0.01),而且囊包大多形成不完整、纤维化程度轻。炎症因子受体CXCR1和CXCR2的表达均显著低于模型组(P0.01)。结论 G31P具有下调膈肌组织中炎症因子IL-8受体CXCR1和CXCR2表达的作用,从而拮抗旋毛虫囊包纤维化的形成,并对旋毛虫幼虫虫体结构的完整性产生一定的影响。     

鹤科鸟类鸣声特征的演化

本文在分析鹤科(Gruidae)鸟类鸣声特征的基础上,结合其分子系统树,重建了鸣声特征的演化,并检验了体重与鸣声特征及鸣声特征之间在演化上的相关性。同时比较了体重与鸣声特征在物种间的关系。演化支上各物种体重的变化与鸣声时长特征的变化存在显著的关联(对数线性模型,似然比=9.69,P=0.002;Cohen′s d=1.48):体重的增加伴随着鸣声时长的增加。鸣声特征之间在演化上没有显著的关联(对数线性模型,似然比≤0.15,P≥0.701;Cohen′s d≤0.17)。在物种间鸣声时长与体重存在显著的正相关(Pearson相关分析,r=0.54,P=0.048;Cohen′s d=1.27);鸣声的主频特征与体重存在显著的负相关(Pearson相关分析,r=﹣0.56,P=0.036;Cohen′s d=1.37)。本文以鹤科鸟类鸣声为例,分析了非鸣禽鸟类鸣声特征的演化,及影响鸣声特征的因素。