植物病原棒形细菌的RAPD分析

采用RAPD分析技术对萎蔫短小杆菌落葵致病变种（Curtobacterium flaccumfaciens pv. basellae pv. Nov.）和萎蔫短小杆菌糖甜菜致病变种（Curtobacterium flaccumfaciens pv. beticola pv. Nov.）及植物病原棒形细菌4个属的15个菌株进行分类研究：从50条随机引物中筛选出20条,共产生225条带,多态性条带占804%。遗传相似矩阵及UPGMA聚类分析,表明这两个新致病变种与萎蔫短小杆菌属亲缘关系近,最小相似系数为0.6511;与其他属细菌亲缘关系较远;结合前人研究结果对植物病原棒形细菌新近提出的分类地位的改变进行了探讨。     

植物病原棒形细菌的分类研究进展

植物病原棒形细菌从棒杆菌属中独立出来之后,对于其中各菌分类地位的确立一直有较多争议。近年来已分别归入棒形杆菌属（Clavibacter）、短小杆菌属（Curtobacterium）、节杆菌属（Arthrobacter）、红球菌属（Rhodococcus）和拉氏杆菌属（Rathayibacter）5个属中。但此后又有人提出有些属中仍有异质性。这些分类上的变化主要是由于分类手段逐渐由传统的形态学分类方法向分子生物学方法和多相分类法过度。新的方法还在不断的完善之中。此外,植物病原棒形细菌分类系统的完善还有赖于植物病理学和微生物学家等多学科科学家的合作。     

山西运城盐湖放线菌区系研究

从山西运城盐湖分离到中、高温嗜碱或耐碱放线菌120株,对其进行了分类鉴定。根据形态和分类特征（细胞壁化学成分）,分别归入拟诺卡氏菌属（Nocardiopsis）、诺卡氏菌科（Nocediaceae）、小多孢菌属（Micromonospora）、马杜拉放线菌属（Actinomadura）及链霉菌属（Streptomyces）,并将链霉菌归入了11个类群。     

海水养殖场沉积物中硝酸盐还原菌种群分析

通过对福建省沿海海水养殖场沉积物中参与氮循环的各生理群细菌数量分析 ,发现氨化和硝酸盐还原细菌是优势生理菌群 ,同时 ,表层泥样中的硝酸盐还原菌数量明显高于深层泥样。从该环境中分离获得 106株细菌 ,其中 58株具有硝酸盐还原能力 ,初步鉴定表明它们主要为芽孢杆菌属 (Bacillus)、盐芽孢杆菌属 (Halobacillus)、短芽孢杆菌属 (Brevibacil lus)、动性球菌属 (Planococcus)和动性杆菌属 (Plano     

利用高通量测序技术对水稻秸秆中、低温降解菌系的比较分析

采用Illumina MiSeq高通量测序技术,对中、低温（中温25 ℃、低温10 ℃）富集驯化所得水稻秸秆降解菌系进行测序;采用生物信息学方法对中、低温秸秆降解菌系群落生物多样性进行分析。结果表明,测序质控后获得601 489条16S rDNA序列,平均长度273 bp,经Silval 132数据库比对,中温降解菌系包括18个门,172个属,302个OTU,其中优势菌属为弓形杆菌属（Arcobacter）、拟杆菌属（Bacteroides）、屠场杆菌属（Macellibacteroides）、假单胞菌属（Pseudomonas）和梭形杆菌属（Lysinibacillus）;低温降解菌系包括16个门,169个属,280个OTU,其中优势菌属为弓形杆菌属、屠场杆菌属、拟杆菌属、丛毛单胞属（Comamonas）和假单胞菌属。温度对降解菌系中优势菌门的相对丰度无显著影响,中、低温秸秆降解菌系主要菌属相对丰度差异显著。     

倒棒孢属和疣丝孢属的各两个种

本文报告了倒梓孢属(Prathigada)和疣丝孢属(Stcnella)的各两个种。前一属的两个种是鱼木倒棒孢[Prathtgada cratevac(Syd) Subram.],是新记录和苦木倒棒孢[Frathigadapicrtsmae (Togashi et Katsuki) comb. Nov.],是新组合;后一属的两个种是刀豆疣丝孢[Sten-ella canavaliae (H．＆ P．Sydow)Deighton],和鱼尾葵疣丝孢(Stcnvlla caryotae sp. Nov.),是新种。对上述两个属的四个种均作了描述和附图,鱼尾葵疣丝孢新种并有拉丁文描述;文中将鱼木属(Crataeva)植物上倒棒抱属两个种[Prathigada crataevae (Syd) Subram和Prathigada puniabcnsts(Subram．)Subram．]以及我国海南岛产的这个菌的形态进行了比较,结果三菌之间的形态虽略有差异,但我们认为可能是种内的变异范围,遂将Prathtgada puniabensds作为倒棒孢属模式种,鱼术倒棒孢(Prathigada crataevae)的异名。     

环状糊精葡糖基转移酶产生菌——碱杆菌的分类研究

自土壤中分离到两类能在碱性培养基中生长并产生环状糊精葡糖基转移酶的细菌。经鉴定,一类属芽孢杆菌,另一类为无芽孢的杆状细菌《伯杰氏鉴定细菌学手册》(第八版)和现有其他分类文献均未见其分类位置,拟订为新属碱杆菌属(Alcalibacterium gen. Nov.)和新种产环糊精碱杆菌(Alcalibacterium cyclodextrtmogenes sp. Nov.)。     

秦岭的锈菌(续Ⅰ)

全文分3次连载,共报告了采自秦岭林区的锈菌34属228种。其中有6个新种：槭锈孢锈（Aecidiumaceris）、糙苏鞘锈（Coleosporiumphlomidis）、秦岭栅锈（Melampsoratsinlingensis）、荩草生柄锈（Pncciniaarthraxonicola）、冠毛草柄锈（Pncciniastephanachnes）和头状杜鹃夏孢锈（Uredorhododendri-capiati）;中国新记录锈菌13种：米诺锈孢锈（Aecidiumminoense）北极栅锈（Melampsoraarctica）、紫藤赭痴锈（Ochropsorakraunhiae）、青篱竹柄锈（Pucciniaarundinariae）、高大柄锈（Pucciniaexelsa）、哈氏柄锈（PucciniakawakamiensisKakishima）、大泽柄锈（Pucciniaohsawaensis）、极细柄锈（Pucciniapraegracilis）、美丽柄锈（Pucciniapulchella）、毡毛柄锈（Pucciniavelutina）和帚菊夏孢锈（Uredopertyae）。文中列出了所有这些锈菌的…     

免培养法对一热泉细菌多样性的初步研究

应用免培养法（Cultureindependent）对云南腾冲热海大滚锅高温热泉中细菌的多样性进行初步的分析。经过克隆筛选,测定了5个克隆的16S rDNA插入片段的近全序列,系统发育分析的结果表明,它们分属于Bacillus、Hydrogenobacter和Pseudomonas,有一个克隆尚难确定其分类地位,它属于Thermodesulfobacteriaceae科,介于Geothermbacterium属和Thermodesulfobacteria属之间。经PCR扩增出上述5个克隆16S rDNA插入序列中及环境样品总DNA中的16S rDNA V8高变区约600bp片段,进行变性梯度电泳（DGGE）。所得电泳图谱和5个序列的系统发育树不仅表明该高温热泉存在着丰富的细菌多样性,还显示了它们是该高温热泉中细菌的优势物种。     

棒杆菌属的两个新种

从我国海南岛崖城温泉土壤中分离到482株耐高温的氧化烃细菌。选用三种油品及三个发酵时间进行了摇瓶试验,从中筛选出脱蜡效果较好的两株菌—F76(ASI 1504)及 F761(AS 1.505),能将中质润滑油凝固点从26℃下降到一37℃。这两株菌为革兰氏阳性、非致病性无芽孢杆菌。根据其性状属于棒杆菌属,而又有别于该属中腐生性的已知种,因此认为是两个新种,定名为嗜热棒杆菌(Corynebacterium theromophilum nov. sp.)和脱蜡棒杆菌(Coryne-bacterium deparaffinicum nov. sp.)。     

南极长城站地区土壤微生物生态作用的初步探讨

从南极长城站附近联合采样13个,并进行了土壤微生物的数量统计与种类鉴定。氨化细菌的菌量为10⁴～10⁶cells／g,共7个属：微球菌属（Micrococcus）,葡萄球菌属（Staphylococcus）,假单胞菌属（Pseudomonas）,芽孢杆菌属（Bacillus）,产碱菌属（Alcaligenes）,黄杆菌属（Flavobacterium）,节杆菌属（Arthrobacter）;固氮细菌菌量为10⁵～10⁷cells／g,仅一个固氮菌属（Azotobacter）;硝化细菌一般为10⁴cells／g,分属两个属：硝化杆菌属（Nitrobacter）,硝化球菌属（Nitrococcus）;真菌为10³cells／g,分属5个属：青霉菌属（Penicillium）,金孢霉菌属（Chrysosporium）,枝孢霉菌属（Cladosporium）,曲霉菌属（As-pergillus）,散囊菌属（Eurotium）,反硝化菌为 10²～10⁴cells／g,分属 3个属：假单胞菌属（Pseudomonas）,微球菌属（Micrococcus）,芽孢杆菌属（Bacillus）;放线菌分属3个属：链霉菌属（Streptomyces）,小单孢菌属（Micromonospora）,和诺卡氏菌属（Nocardia）。联采样品12℃培养的出现率主要类群是：假单胞菌属（42％）,芽孢杆菌属（35％）,微球菌属（31％）,节杆菌属（27％）,青霉菌属（58％）,枝孢霉菌属（54％）,硝化杆菌属（81％）,固氮菌属（88％）,反硝化细菌中主要是假单胞菌属（58％）,芽孢杆菌属（38％）。文中还讨论了微生物菌量与土壤总碳、总氮的相关性及其在该地区氮循环中的生态学作用。     

中国齿裂菌属研究Ⅱ.

我国齿裂菌属的4个分类单元,其中包括2个新种：生于青冈［Cyclobalanopsisglauca（Thnb.）Oerst.］上的青冈齿裂菌（Occomycesce=yclobalanopsisY.R.Lin＆Z.Z.Lisp.nov．）和生于香叶树（LinderacommunisHemsl.）上的福建齿裂菌（C.fujianensisY.R.Lin＆C.T.Xiangsp.nov．）。为新种提供了拉丁文和汉文描述及形态图。模式标本存放在安徽农业大学森林保护教研室（AAUFP）。     

新疆青海中度嗜盐放线菌生物多样性初步研究

从我国新疆、青海等地采集数份盐碱土样或泥样,采用淀粉-酪素琼脂培养基、甘油天门冬酰胺琼脂培养基、土壤浸汁琼脂培养基分别从中分离到8株、32株中度嗜盐放线菌菌株。经形态、生理学特性与全细胞壁氨基酸组分分析结果比较,选取其中的14株进行16S rDNA序列分析。就物种多样性而言,新疆、青海分离到中度嗜盐放线菌分布至少有3个科,5个属。其中有拟诺卡氏菌科（Nocardiopsaceae）的拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis)和链单孢菌属（Streptomonospora）;假诺卡氏菌科(Pseudonocardiaceae)的普氏菌属(Prauserella)和糖单孢菌属(Saccharomonospora);链霉菌科(Streptomycetaceae)的链霉菌属(Streptomyces)。就地区分布来讲,新疆分离到的中度嗜盐放线菌种类要远高于青海。     

四种外生菌根真菌产生植物激素的研究

在纯培养条件下,利用HPLC法,分别测定了四种外生菌根培养液和菌丝体中的五种植物激素含量。检测结果,除没有脱落酸（ABA）外,玉米素（Z）、玉米素核苷（ZR）、赤霉素（GA3）、吲哚乙酸（IAA）,均有一定含量。培养液中激素含量远高于菌丝体中的含量,GA3在各种激素中含量最高。从培养液中的激素总量看,Suillus属的两个种Suillusgrevillei和Suillusbovinus高于另外两个种Rhizopngonluteolus和Piso     

叶酸调控对高尿酸血症大鼠肠道微生物的影响

探究叶酸对高尿酸血症大鼠肠道微生物的影响,为治疗高尿酸血症提供新思路。将SPF 级雄性大鼠分为空白对照组、模型组和叶酸组,采集大鼠的粪便样本,采用16S rRNA高通量测序技术分析肠道微生物的多样性、群落组成以及结构的变化。研究结果显示,Alpha多样性和Beta多样性分析表明,空白对照组、模型组和叶酸组大鼠粪便中微生物多样性和群落组成存在明显差异,其中模型组大鼠粪便微生物具有较高的物种丰度和种群差异性。对门分类水平上的物种丰度分析发现,微生物种群主要由厚壁菌门（Firmicutes）和拟杆菌门（Bacteroidetes）组成;对属分类水平上的物种丰度分析发现,微生物种群由乳杆菌属（Lactobacillus）、Muribaculaceae、拟杆菌属（Bacteroides）、柯林斯菌属（Collinsella）、梭菌属（Clostridium）、罗姆布茨菌（Romboutsia）、劳特氏菌属（Blautia）和毛螺菌科NK4A136群（Lachnospiraceae NK4A136_group）等菌属组成,与空白对照组相比,模型组中Muribaculaceae和柯林斯菌属的丰度显著升高,乳杆菌属、梭菌属、罗姆布茨菌和毛螺菌科的丰度显著下降;叶酸组中Muribaculaceae、拟杆菌属、柯林斯菌属和劳特氏菌属的丰度显著升高,梭菌属、罗姆布茨菌和毛螺菌科的丰度显著下降。研究探索了叶酸干预调控高尿酸血症大鼠肠道微生物的变化,为治疗高尿酸血症提供参考。     

转化三硝基甲苯(a-TNT)的细菌及其应用

从长期被TNT粉尘及废水污染的土壤及生活污永中,分离筛选出93株好氧、厌氧及兼性好氧细菌。它们能将浓度为100一130毫克／升的TNT 90％以上转化。其中部分菌株能利用TNT作为生长的唯一碳源和氮源。我们对47株好氧及兼性好氧细菌进行了鉴定,分别属于柠檬杆菌属(Citrobacter)、芽孢杆菌属(Bacillus)、肠杆菌属(Enterobacter)、克氏杆菌属(Klebsiella)、埃希氏杆菌属(Escherichia)和假单胞葭属(Pseudomon~)。各属选一代表菌株进行培养试验,考察它们转化TNT的生理条件及转化rNT的速度。从其中选出10株菌应用于TNT废水生化处理小型试验,取得较好效果。出水的TNT、BOD、COD等项指标均低于国家的排放标准。     

以形态、细胞壁和醌化学组份鉴别放线菌的属

将经典的形态分类法与化学分类法(细胞壁与醌的化学分析)相结合,对从我国不同地区分离到的22株放线菌进行了分类鉴定。它们分别属于类诺卡氏菌属(Nocardioides)、拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis)、小多孢菌属(Micropolyspora)、马杜拉放线菌属(Actinomadura)、游动放线菌属(Actinoplanes)和小单孢菌属(Micromonospora)等6个属,13个种。     

药用植物刺山柑不同部位细菌群落结构及其多样性

【目的】研究传统药用植物刺山柑（Capparis spinosa L.）不同部位细菌群落结构、物种组成和多样性特征,为药用植物微生物资源的开发及微生物与宿主互作提供理论依据。【方法】本研究以刺山柑地上部植物组织（果实、茎）和地下部土壤（根际土壤、非根际土壤）为研究材料,采用高通量测序技术分析刺山柑不同部位细菌的16S rRNA基因多样性,比较其细菌群落结构和物种组成特征。【结果】刺山柑4种样本共获得的3 649个操作分类单元（operational taxonomic unit,OTU）,属于34门、88纲、248目、464科和1 051属。土壤样本的细菌多样性大于植物组织,细菌群落多样性以根际土壤、非根际土壤、茎和果实的顺序逐渐降低,果实内生细菌群落多样性始终最低,显著低于根际土壤。不同部位相对丰度较高的细菌门如下：植物组织中以变形菌门为主,根际土壤中为变形菌门和放线菌门,非根际土中为厚壁菌门和放线菌门。无色杆菌属（Achromobacter）、欧文氏菌属（Erwinia）、肠球菌属（Enterococcus）、微小杆菌属（Exiguobacterium）、乳杆菌属（Lactobacillus）和克雷伯氏菌属（Klebsiella）主要存在于刺山柑植物组织中。游动球菌属（Planomicrobium）、库克菌属（Kocuria）、类芽孢杆菌属（Paenibacillus）、链霉菌属（Streptomyces）、微枝形杆菌属（Microvirga）和节杆菌属（Arthrobacter）主要分布于土壤中。β多样性分析结果表明,刺山柑植物组织和土壤的细菌群落结构具有显著差异,同类型样本的细菌群落结构相似。【结论】刺山柑土壤样本中细菌群落的多样性和丰富度均高于植物组织,刺山柑不同部位的细菌群落组成不同。本研究对刺山柑不同部位细菌群落结构进行了初步分析,鉴定了各部位细菌群落中的核心菌群,为以后挖掘刺山柑的功能研究和利用提供了准确的微生物信息。     

原迷孔菌属在中国的首次报道

首次报道了产于中国的原迷孔菌属（新拟）Protodaedalea Imaz.。对本属所处的分类位置进行了探讨,认为本属与Elmerina 接近故置之于Aporpiaceae中较为合适。该属为一个东亚特有属。     

一个具两型子囊的齿裂菌属新种

生于蒙古栎（Ｑｕｅｒｃｕｓ　ｍｏｎｇｏｌｉｃａ）和波罗栎（Ｑ．Ｄｅｎｔａｔａ）上的齿裂菌属一新种,即异襄齿裂菌（Ｃｏｃｃｏｍｙｃｅｓｄｉｍｏｒｐｈｕｓ）。该种因子囊同时以两种状态存在而明显区别于齿裂菌属其它成员。主、副模式标本保藏于安徽农业大学森林保护教研室（ＡＡＵＦＰ）。