实时定量PCR及其在轮状病毒检测中的应用

实时定量PCR(Real-time polymerase chain reaction/quantitative Real-time polymerase chain reaction,Real-time PCR/qPCR)就是在PCR扩增过程中,通过荧光信号对PCR进程进行实时监测。它具有特异性强、灵敏度高、定量准确和快速等优点,在生物医学领域中得到广泛的应用。对实时定量PCR技术的原理和类型,实时定量PCR技术在生物医学领域的应用,尤其在轮状病毒诊断、检测及疫苗研究中的应用及其未来前景进行了综述。     

实时定量PCR发展概述

实时定量聚合酶链反应(real-time quantitative polymerase chain reaction,简称qPCR)是一种通过荧光信号对PCR进程进行实时监测,并对未知模板进行定量分析的一种核酸定量技术,该技术在临床诊断和生命科学等多领域发挥着重要的作用。现就生物制品领域有着重要应用价值的中介探针聚合酶链反应(mediator probe polymerase chain reaction,MP PCR)和数字聚合酶链反应(digital polymerase chain reaction,dPCR)新技术加以介绍,同时也对qPCR技术中的关键因素(如参考基因选择和核酸质量评价)以及qPCR最低限度标准(minimum information for the publication of real-time quantitative PCR,MIQE)指南作一概述。     

实时荧光定量PCR 技术的原理及其应用研究进展

自从1983年Mullis发明聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)以来,PCR技术很快成为科研、临床诊断的热点技术。但是传统PCR技术在应用中一是不能准确定量,二是容易交叉污染,产生假阳性。直到近年来荧光共振能量转移(fluorescence resonance energy transfer,FRET)技术     

PCR论题

《PCR论题:遗传和传染病中聚合酶链反应用法》(PCR topics:usage of polymerase chain reaction in genetic and infectious diseases)由A.Rolfs等人编著,1991年斯普林格出版社出版,258页。聚合酶链反应(PCR)对分子生物学和免疫学的技术发展起到了革命性的作用。该技术可以对所感兴趣的DNA或者基因进行合成复制成复本。因其方法敏感和快速,主要应用在研究     

重组酶聚合酶扩增技术：一种新的核酸扩增策略

重组酶聚合酶扩增 (recombinase polymerase amplification, RPA)是近年来兴起的一种等温核酸扩增技术,它比聚合酶链式反应(polymerase chain reaction, PCR)及其它等温扩增技术更快速、便捷、高效。本文将详细介绍RPA这项新颖的技术,并对其在医疗诊断、农业、食品、生物安全等方面的研究及应用进展进行综述。期望这项技术得到更多的关注,使其发展更加完善,将来在更多的领域充分发挥作用,甚至书写核酸检测历史新篇章。     

微芯片——生命科学领域的新工具

微芯片（有人称其为生物芯片biochip)是用硅、玻璃等材料,经光刻、化学合成等技术微加工而成的、大小1 cm²左右的芯片.它可以用来对生物样品进行分离、制备、预浓缩,还可以作为微反应池进行PCR(polymerase chain reaction)、LCR(ligase chain reaction)等反应.最为吸引人的是,芯片上制成多种不同的DNA阵列,即可用于核酸序列的测定及基因突变检测.对微芯片的制作、作用原理、性能及用途等进行了综述.     

实时荧光定量PCR技术及其在昆虫学研究中的应用

实时荧光定量PCR(real-time fluorescent quantitative polymerase chain reaction, FQ-PCR)是一种利用荧光信号实时监测体外DNA分子PCR复制过程中每个循环的扩增产物,从而实现对DNA模板进行定量分析的技术,具有准确、快速、灵敏、特异等优点,在动植物基因工程、动植物检疫、微生物鉴定与分类、食品安全检测和医学等领域中得到广泛应用。本文对实时荧光定量PCR技术的原理、优缺点及近年来新的荧光探针的原理、类型进行了评述,并对实时荧光定量PCR技术在昆虫学研究中的应用进行了综述。     

多重PCR技术研究进展

多重PCR(Multiplex polymerase chain reaction,MPCR)是指通过一次PCR反应同时对多个靶标进行扩增,结合一定的检测手段对扩增产物进行检测从而实现对多个靶标进行诊断的技术。MPCR具有高效率、高通量、低成本的特性而被深入研究。目前MPCR技术已被广泛应用于科学研究和疾病诊断等领域,文中从MPCR扩增与检测两方面概述了MPCR技术发展及其应用,讨论了MPCR技术的优点及存在的问题,并且提出将反应体系分隔成小液滴或结合管式对流PCR(CapillaryconvectivePCR,CCPCR)技术的方式有望提高固相载体表面的扩增效率,从而开发出扩增效率高、一致性好、体系稳定、检测重数高的多重PCR技术。     

分子生物学技术在肠道菌群研究中的进展

人的肠道中栖息着大量微生物,这些微生物与宿主形成一个相互依赖且相互制约的微生态系统。肠道菌群结构与遗传、饮食、疾病、环境等因素存在千丝万缕的联系,其地位与作用相当于一个后天获得的"器官",对人体的消化、营养吸收、能量供应、脂肪代谢、免疫调节、抗病等诸多方面有不可替代的作用,因此,研究人的肠道菌群具有十分重要的意义和作用。本综述着重论述荧光原位杂交(FISH)、基于聚合酶链式反应的变性梯度凝胶电泳(Polymerase chain reaction denaturing gradient gel electrophoresis,PCR-DGGE)技术、实时荧光定量PCR(Real-time polymerase chain reaction)技术、基因芯片(Gene chip)技术及以焦磷酸测序平台为代表的第二代测序技术等多种分子生物学技术在肠道菌群研究方面的应用,并对未来肠道菌群方面的研究进行展望。     

1109型微电脑自动基因扩增仪

当前,采用分子生物学最新技术——聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)可在生物体外,靠Taq DNA聚合酶的作用,于较短的时间内将目的基因不失真地扩增几十万倍到一百万倍。从而使分析鉴定某些基因片段序列的工作省略了许多复杂的步骤。 应用PCR技术对目的基因进行扩增时,原始的方法是把盛有反应液的样品管用手工在热     

Different DNA methylation patterns detected by the Amplified Methylation Polymorphism Polymerase Chain Reaction (AMP PCR) technique among various cell types of bulls

Background  

The purpose of this study was to apply an arbitrarily primed methylation sensitive polymerase chain reaction (PCR) assay called Amplified Methylation Polymorphism Polymerase Chain Reaction (AMP PCR) to investigate the methylation profiles of somatic and germ cells obtained from Holstein bulls.     

Name that microbe: rapid identification of taxa responsible for individual fragments in fingerprints of microbial community structure

Polymerase chain reaction (PCR)‐based ‘fingerprinting’ methods, such as Terminal restriction fragment length polymorphism, Length Heterogeneity‐Polymerase Chain Reaction (LH‐PCR) and Automated Ribosomal Intergenic Spacer Analysis (ARISA) make possible quantitative studies of microbial community structure and dynamics. Here we outline a strategy for the rapid and cost‐effective isolation of 16S clones corresponding to particular fragment sizes in a fingerprint, based on applying the fingerprinting method to pools of colonies from a clone library. This allows the definitive identification of taxa responsible for the most important bands in the community fingerprint from a full 16S sequence. It offers significant advantages over random selection of clones and removes a significant barrier to the use of these methods.     

研究基因转录的RT-PCR技术

RT-PCR是检测和定量特异性mRNA的高度灵敏技术,被广泛应用于基因转录水平的分析研究,本文探讨RT-PCR方法的发展,应用及潜在问题。     

SSR - PCR反应体系建立与优化的研究概述

SSR标记是基于PCR基础上的一种分子标记,其扩增效果直接影响到SSR分析,近年来从不同方面对SSR - PCR反应体系的建立与优化进行了大量的研究.该文简要介绍SSR - PCR扩增反应体系建立的方法,综述SSR - PCR扩增反应的应用及其近展,并对存在的问题进行探讨,对今后的发展进行展望,以期为从事该方面的研究奠定基础.     

Basics of PCR and related techniques applied in veterinary parasitology

We attempte through the following overall review pertaining to the basics of PCR techniques (Polymerase Chain Reaction), to introduce the main applications used in veterinary parasitology. A major problem restricting the application possibilities of molecular biology techniques is of quantitative nature. Amplification techniques represent a real revolution, for it makes possible the production of tens, even hundreds of nanogrammes of sequences when starting from very small quantities. The PCR technique has dramatically transformed the strategies used so far in molecular biology and subsequently research and medical diagnosis.     

相关序列扩增多态性(SRAP)标记及其应用研究进展

SRAP是一项基于PCR技术的分子标记技术,利用其独特的引物设计对基因组的开放阅读框(ORFs)进行特异扩增,利用个体以及物种的内含子、启动子和间隔序列的不同,产生基于内含子和外显子的SRAP多态性。阐述了SRAP的原理和流程,详细论述了SRAP标记目前在植物遗传多样性、作物品种鉴定、遗传图谱构建等方面的研究进展及应用前景。     

PrimeArray: genome-scale primer design for DNA-microarray construction

PrimeArray is a Windows program that computes oligonuceotide primer pairs for genome-scale gene amplification by the Polymerase Chain Reaction (PCR). The program supports the automated extraction of coding sequences (CDS) from various input-file formats and allows highly automated primer pair-optimization.     

小鼠HMGB1启动子荧光素酶报告基因的构建及功能鉴定

利用PCR技术扩增小鼠高迁移率族蛋白1(HMGB1)基因启动子序列,构建小鼠HMGB1启动子荧光素酶报告基因pGL3-basic-HMGB1.经PCR、酶切及测序鉴定后,用脂质体法将pGL3-basic-HMGB1转入巨噬细胞264.7中,并应用萤光素酶测定系统检测其活性.检测结果显示pGL3-basic-HMGB1具有启动子活性.小鼠HMGB1启动子荧光素酶报告基因pGL3-basic-HMGB1的成功构建,为进一步研究HMGB1提供基本材料.     

人癌细胞内质网分子伴侣Grp94基因近3′端的初步分析

采用PCR及RT－PCR方法结合核酸分子杂交技术,首次确定了与Grp94cDNA2231～2500碱基片段对应的Grp94基因序列上有内含子．含有内含子的扩增片段长约708bP．对三种癌细胞系进行了PCR和RT－PCR反应,电泳结果显示存在差异．研究结果为进一步探讨Grp94基因3'端精细结构及其在正常细胞和肿瘤细胞中表达的改变打下了基础．     

猪瘟病毒E2基因主要抗原区的克隆及原核表达

利用反转录PCR（RT－PCR）和套式PCR（nest Polymerase Chain Reaction,nPCR)技术扩增出当前猪瘟流行毒（广西玉林株,GXYL)一中国猪瘟兔化弱毒（C－株）兔脾组织毒E2基因的主要抗原区,将其克隆到表达载体pPROEX-HTb中,获得重组质粒pPROEX-GXYL和pPROEX-C,经PCR,酶切和序列分析鉴定表明,插入的位置,大小和读码框均正确。SDS－PAGE,检测表明,经重组质业pPROEX-GXYL和pPROEX-C转化,诱导的受体菌能表达E2基因主要抗原区蛋白,Western-blot检测表明,诱导表达的抗原蛋白能与猪瘟阳性血清发生特异性反应。