云南松苗木生长与生物量的相关性及通径分析

为了解云南松苗木生长对生物量的影响程度和相对重要性,以采自云南省昆明市宜良县禄丰村林场种子培育的2年生云南松苗木为材料,对苗高、地径、主根长、侧根长、针叶长和侧根数6个生长性状及各组分生物量进行测定,运用相关性分析和逐步回归分析剔除了对生物量影响不大的性状,在此基础上采用通径分析方法研究了云南松苗木生长性状指标与生物量指标间的关系。结果表明：云南松苗木生长性状和生物量之间均呈现极显著的正相关关系。各生长性状对生物量均有直接或间接的正向效应,直接影响云南松苗木生物量的优势因素为地径和苗高,针叶长、侧根长和主根长对生物量的影响也起正向效应。各生长性状对生物量的直接效应均较大,而通过其他性状的间接效应均较小,其中侧根长通过其他性状对生物量产生的间接影响最大。依据相关性分析和通径分析,建立了云南松各组分生物量与生长性状之间的数学模型,可用于云南松苗期生物量的估测。     

云南松SSR-PCR反应体系的建立与优化

为了建立适宜云南松SSR-PCR的反应体系和扩增程序,利用近缘种火炬松的引物,采用正交设计L16(45)对云南松SSR-PCR反应体系的5因素(Taq酶、Mg2+、模板DNA、dNTP、引物)在4个水平上进行优化,筛选出各反应因素的最佳水平,建立了适于云南松的SSR反应体系.在10μL的反应体系中,模板DNA的用量为30.0 ng,Taq DNA聚合酶的用量为1.0 U,Mg2+的浓度为2.0 mmol/L,dNTPs浓度为0.4 mmol/L,引物的浓度为0.2 μmol/L.扩增程序为:94℃预变性4 min;94℃变性45 s,48℃退火30 s,72℃延伸30 s,30个循环;72℃延长10 min,4℃保存.最后利用1个居群对该体系进行稳定性验证,结果可用于云南松SSR标记的研究.     

SSR - PCR反应体系建立与优化的研究概述

SSR标记是基于PCR基础上的一种分子标记,其扩增效果直接影响到SSR分析,近年来从不同方面对SSR - PCR反应体系的建立与优化进行了大量的研究.该文简要介绍SSR - PCR扩增反应体系建立的方法,综述SSR - PCR扩增反应的应用及其近展,并对存在的问题进行探讨,对今后的发展进行展望,以期为从事该方面的研究奠定基础.     

长爪栘[木衣]叶绿体基因组特征系统发育及密码子偏好性分析

长爪栘[木衣](Docynia longiunguis Q. Luo&J. L. Liu)是我国特有的栘[木衣]属植物,具有较高的食药用价值。对其叶绿体基因组进行分析,有助于阐明栘[木衣]属内的系统发育关系,为长爪栘[木衣]资源的开发利用及进一步研究奠定基础。结合其近缘种云南栘[木衣]叶绿体基因组数据,在进行全序列比对后,对其系统发育、密码子偏好性等进行分析。长爪栘[木衣]叶绿体基因组序列总长为158914bp(GenBank登录号为MW367027),总GC含量为36.7%,其中大的单拷贝区(large single-copy, LSC)长度为87 020 bp,小的单拷贝区(small single-copy, SSC)长度为19 156 bp,反向重复区(inverted repeats, IRs)长度为26 369 bp。共注释了102个功能性基因,包括72个蛋白编码基因、26个编码tRNA基因和4个编码rRNA基因。构建系统发育树的最佳模型为TVM+F+R2。系统发育分析结果表明,长爪栘[木衣]与栘[木衣](Docynia indica (Wall.) Dcne.)聚为一支,栘[木衣]属物种与苹果属(Malus)聚为一支。对长爪栘[木衣]及近缘种叶绿体基因组序列进行比对分析,trnY (GUA)-psbD、ndhC-trnV (UAC)、accD-psaI、psbZ-trnFM (CAU)和ndhF-trnL等区域的变异较大,核酸多样性分析则表明有11处Pi值>0.01的高变区域,且都位于LSC区及SSC区。除长爪栘[木衣]外,其他序列中均有trnH基因位于IRs/LSC区交界处且都没有越过边界。密码子偏好分析显示,长爪栘[木衣]叶绿体基因中异亮氨酸的密码子编码数量最多,达到了1 205个。长爪栘[木衣]与山荆子(Malusbaccata(L.)Borkh.)、三叶海棠(Malussieboldii(Regel)Rehd.)、湖北海棠(Malus hupehensis (Pamp.) Rehd.)及木瓜(Chaenomeles sinensis (Thouin) Koehne)的亲缘关系最近;其叶绿体基因密码子更偏好于使用A/T结尾;长爪栘[木衣]叶绿体基因组与其他蔷薇科植物叶绿体基因组在4个边界区域基因分布显示出较大差异,与同属的云南栘[木衣]及栘[木衣]叶绿体基因组差异相对较小。长爪栘[木衣]叶绿体基因组的组装注释、系统发育分析及序列比对分析,为该物种的资源鉴定、开发和利用提供了理论依据。     

云南野生珍稀油料树种琴叶风吹楠资源调查

采用走访和实地调查相结合的方法对云南野生琴叶风吹楠进行资源调查.结果表明:琴叶风吹楠在云南分布于热带雨林内水热条件较好地段,由于生境破坏,种群数量锐减,仅在分布区边缘的沟谷和低洼地呈斑块状分布,种群数量小;琴叶风吹楠现存植株开花结实和种子萌发正常,而且苗木生长良好.生境破坏是导致种群数量锐减的主要原因之一.建议加强原境...     

琴叶风吹楠(肉豆蔻科)分类学位置再研究

琴叶风吹楠(Horsfieldia pandurifolia Hu)自1963年命名发表以来,其分类学位置一直存在争议。本文以中国野生肉豆蔻科(Myristicaceae)11个种为材料,从形态学、油脂化学和分子遗传学方面对琴叶风吹楠分类学位置进行研究。结果表明,琴叶风吹楠与H.macrocoma ssp. prainii的形态特征高度一致,与中国风吹楠属其它类群,以及红光树属和肉豆蔻属植物在形态学和油脂化学方面存在决定性差别,在分子遗传学方面存在较大差异。支持将H.pandurifolia并入H.macrocoma ssp. prainii,以H.macrocoma为模式种建立Endocomia属,琴叶风吹楠的学名变更为Endocomia macrocoma(Miq.) de Wilde ssp. prainii(King) de Wilde。     

云南松基因组微卫星富集文库的构建

采用磁珠富集法构建云南松微卫星富集文库。云南松基因组DNA经RsaⅠ酶切,与特定接头连接,再用接头特异引物进行PCR扩增。连接扩增产物与用生物素标记的(AG)12、(AT)12、(CG)12、(GT)12、(ACG)12、(ACT)12和(CCA)8探针杂交,通过链霉亲和素偶联的磁珠捕捉含接头和微卫星序列的片段并扩增,将获得的片段连接到pMD-19T载体上,转化至大肠杆菌JM109感受态细胞中,成功构建了云南松微卫星富集文库。通过PCR检测从文库中筛选阳性克隆,在383富集阳性菌落中获得阳性克隆257个,经测序分析,在获得的159条序列中,有143条含有SSR,其中完美型占65.73%,非完美型占23.78%,混合型占10.49%。结果表明,磁珠富集法构建云南松基因组微卫星文库高效、可行的,文库的构建为微卫星位点的分离、遗传多样性的分析等奠定基础。     

云南松种质资源遗传多样性研究概况

云南松是西南地区造林的先锋树种,对其遗传多样性的研究也较多,为了更好地利用这一优良的林木资源,本文从形态、染色体、生理生化和DNA水平对云南松种质资源多样性的研究进行了综述,并对今后云南松种质资源遗传基础研究工作进行展望,旨在为推动云南松种质资源收集、保存、合理利用和开发提供参考。     

珍稀油料树种琴叶风吹楠果实和种子形态变异

以云南野生琴叶风吹楠(Horsfieldia pandurifolia)为材料,对39株树的果实和种子的形态进行变异分析。结果表明,果实和种子形态指标株间变异大,株内变异小。单株间果实表现出从卵圆形至长椭圆形的变异,果长4~7 cm,先端圆钝至锐尖,基部不同程度偏斜,与文献记录差异较大;单株间种子形态表现出从卵形、长卵形至细长形或近锥形的变异。单株平均种长变幅为25.05~35.66 mm,种宽为13.30~19.62 mm,长宽比为1.47~2.32,单因素方差分析表明此3个性状单株间差异极显著(p<0.01)。灰白色种皮具褐色斑块,种脐和胚位于种子基部,种子先端突尖或具短喙是稳定的性状,有重要的分类学价值。