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相似文献
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1.
水稻脂质转移蛋白基因的分离和分析   总被引:3,自引:0,他引:3  
用水稻脂质转移蛋白(lipidtransferprotein,LTP)的cDNA(pFDRSC110)为探针,从水稻(OryzasativaL.sp.indica)“广陆矮4号”基因文库中筛选出LTP基因,完成了1.8kb长片段的序列测定。该基因编码一个121个氨基酸组成的肽,编码区中间有一个90bp的内含子,基因的调控区除有2个TATAbox和polyA加工信号外,还存在多个回文序列和逆向重复序列。该基因编码的蛋白质N端是由28个氨基酸组成的信号肽,同源性比较表明它具有典型的植物LTP特征。  相似文献   

2.
从籼稻(OryzasativaL.spp.indica)“窄叶青”中克隆到了1个重复序列(pOs139)。经分子杂交证明,pOs139为一稻属内AA基因组特异的串联重复序列。序列分析表明,pOs139以355bp为一重复单位。以pOs139为探针对29份中国普通野生稻和43份中国栽培稻的基因组DNA进行的分子杂交表明,籼、粳亚种之间具有明显的差异,籼稻杂交带数明显多于粳稻,普通野生稻与籼稻相似,具有较多的杂交带数。拷贝数测定结果表明,pOs139在普通野生稻和籼稻中丰度均较高,在粳稻中丰度较低。结合pOs139的Southern杂交结果和以前的RAPD结果,认为籼稻和粳稻共同起源于普通野生稻。  相似文献   

3.
一个新的水稻MADS—box基因的克隆及表达分析   总被引:2,自引:0,他引:2  
根据MADS-box基因保守区结构,设计简并性引物,利用3'RACE从水稻(Oryza sativa L.)中克隆了1个新的水稻MADS-box基因的cDNA片段,同时利用5&RACE获得了全长cDnA命名为FDRMADSS。序列分析表明,该cDNA全长1406bp,开放阅读框共编码233个到,具有典型的植物MADS-box基因的结构。推测的氨基酸序列与拟南芥的MADS-box基因,AGL14同  相似文献   

4.
分别利用5’RACE和3’RACE确定了CMVSDRNA2的5’和3’末端序列,在此基础上,利用RTPCR得到了RNA2的5’端一半的cDNA克隆pC25和3’端一半的cDNA克隆pC23,并通过拼接构建了RNA2全长cDNA克隆pC2F。通过对pC25和pC23进行序列测定,得到了RNA2的全序列。序列分析结果表明CMVSDRNA2由3048nt组成,其中存在2个部分重叠的阅读框ORF1(79~2652nt)和ORF2(2414~2746nt),分别编码858aa的2a蛋白和111aa的2b蛋白,并在2a蛋白的序列中发现了动植物病毒复制酶所特有的两个保守序列。该株系RNA2核苷酸序列与分属CMVI亚组的Fny株系和II亚组的Q株系RNA2的核苷酸序列同源性分别为917%和756%;2a蛋白的氨基酸序列同源性分别为938%和677%,2b蛋白的氨基酸序列同源性分别为830%和513%。同源性比较的结果表明SD株系属于CMVI亚组。  相似文献   

5.
以甜菜坏死黄脉病毒(BNYVV)内蒙分离物的总RNA为模板,通过反转录-PCR扩增获得BNYVVRNA3全长cDNA。将其克隆到pGEM-7Zf(+)上,得到重组质粒pGBY56。序列分析结果表明,内蒙分离物RNA3基因组全长为1775nt,其中包含3个开放阅读框架,分别编码25kD蛋白、4.6kD蛋白和一种由59个氨基酸组成的N蛋白。与法国F2分离物、德国G1分离物和日本S分离物相比,其核苷酸序列的同源性分别为96.4%、96.8%和97.3%。将25kD蛋白编码基因克隆到pJW2上,构建了该基因的原核表达载体。SDS-PAGE和Westernbloting分析结果表明,25kD蛋白基因在E.coliBL21(DE3)中经温度(42℃)诱导后,可特异地表达25kD蛋白  相似文献   

6.
从豌豆(Pisum sativum L.)中提取总RNA, 逆转录出cDNA 第一条链后, 以大麦钙调蛋白结构基因两端的寡聚核苷酸为引物, 用PCR方法合成豌豆钙调蛋白基因, 克隆到Blue-script 载体上并测定其全序列。结果与已知的苜蓿(Medicago sativa L.)、水稻(Oryza sativaL.)、大麦(Hordeum vulgare L.)、电鳗(Electrophoridae)、根瘤(Aspergillus nidulans)、酵母(Saccharomycescerevisiae) 钙调蛋白基因相比,同源性较高(91.3% —60.8% ),其不同部分则常常是C和T相替换。进一步分析发现,上述七种来源的钙调蛋白基因之间,常有某些核苷酸替换方式占优势,它们对于氨基酸密码子的使用也各有偏爱  相似文献   

7.
采用末端终止法对蓝藻类颤藻科Oscilatoriasp.rDNA16S-23S基因间隔区进行了序列测定,获得了Oscilatoriasp.rDNA基因间隔区427个核苷酸,其中包含1个异亮氨酸tRNA基因(tRNAIle)。并通过计算机联网从国际分子生物学数据弹库中获取颤藻科其它种的rDNA基因间隔区序列,通过比较分析,从分子水平对颤藻科Oscilatoriaceae属间的某些分类学问题进行了讨论,并根据序列中核苷酸差异值探讨了颤藻科属间界定的分子标准。提出了rDNA基因间隔区是良好的分子标记,可用于“赤潮”或“水华”蓝藻专一性核酸分子探针的研制  相似文献   

8.
以赤霉素(GA)处理后的G2豌豆为材料,构建了一个2.0×106的cDNA文库,用随机筛选法从该cDNA文库中得到一个完整的cDNA.其中1115bp全序列分析表明,它编码了豌豆5S核糖体RNA(5SribosomalRNA,5SrRNA),基因内部存在着与核糖体蛋白L5及5SrRNA结合蛋白(5SrRNABindingProtein)同源的区段,这些同源区段是蛋白与RNA结合的位点.基因内部还存在着大量的重复序列.  相似文献   

9.
用PCR 方法从芝田硫化叶菌中扩增了编码一种新酶,即麦芽寡糖基海藻糖合酶( MTSase) 的基因,扩增的2-2kb DNA 插入到原核表达载体pBV220 中,构建成重组质粒pSBGT1 。pSBGT1 中MTSase 基因在大肠杆菌中得到表达。SDSPAGE 分析表达产物MTSase蛋白的分子量约为74kDa ,同核苷酸序列测定所推导的值相符。表达产物占细胞总蛋白约4-4 % 。pSBGT1 产生的重组酶作用于淀粉部分水解物,使DE 值降低,得到非还原糖或低还原糖。  相似文献   

10.
本文报道人疱疹病豢-6型(HHV-6)pSTY28DNA片段的序列测定。应用分子克隆、缺损突变体(Dcletionmutant)制备和序列测定等技术,完成了3.9kbHHV-6pSTY28DNA片段的全序列测定。经DNASIS核酸蛋白软件分析,该片段含有两个开读框架(ORF)核糖核苷酸还原酶(RIR)ORF有2414个核苷酸,可编码805个氨基酸;P41蛋白由1100个核苷酸组成。与其他疱疹病毒作氨基酸同源性比较,HHV-6RiR与人巨细胞病毒(HCMV)有高度同源性,最适记分(Optimizedscore)达459。实验结果支持Esftathiou提出的论点,HHV-6属于β-疱疹病毒。  相似文献   

11.
大豆Kunitz型胰蛋白酶抑制剂属于丝氨酸蛋白酶抑制剂,具有抗虫特性。从未成熟的大豆(GlycinemaxL.)子叶中提取总RNA,然后反转录成单链cDNA,以此为模板,用PCR方法扩增出大豆Kunitz型胰蛋白酶抑制剂基因,并克隆到pBluescriptKS(+)的SmaⅠ位点上。序列分析表明:克隆片段大小为663bp,包含了基因完整的编码序列。编码多肽由217个氨基酸组成,其中包括N端25个氨基酸组成的信号肽序列,181个氨基酸组成的成熟蛋白序列和C端11个氨基酸组成的液泡定位信号序列。构建了此基因的一系列植物表达载体,用于烟草(NicotianatabacumL.)、水稻(OryzasativaL.)、棉花(GosypiumhirsutumL.)等作物的转化。利用棉铃虫(HeliothisarmigeraHubner)对经PCRSouthern杂交验证获得的转基因烟草进行了抗虫测试,结果表明,转基因烟草和对照烟草相比,具有明显的抗虫能力。  相似文献   

12.
已经从melanoma细胞系中成功地获得了人组织型纤溶酶原激活剂(t-PA)cDNA,在此基础上用双脱氧终止法测定了t-PAcDNA编码区全序列及3′非编码区部分序列,并发现与Pennica等发表的t-PAcDNA序列相比,有两处差异,其一是第1725位核苷酸残基为C而非A,并使此处序列与Pennica序列相比新产生一个StyI切点,但由于差异发生在密码子第三位,没有引起编码的氨基酸变化;其二是第1777位核苷酸残基(终止密码子后第4位核苷酸残基)为T而非G,使与终止密码子相隔3个核苷酸残基处产生了一个新的TGA,与Pennica序列相比此处的BstNI切点也消失了。  相似文献   

13.
采用末端终止法对蓝藻类颤藻科Oscillatoria sp.rDNA 16S-23S基因间隔区进行了序列测定,获得了Oscillatoria sp.rDNA基因间隔区427个核苷酸,其中包含1个异亮氨酸tRNA基因。并通过计算机联网从国际分子生物学数据弹库中获取颤藻科其它种的rDNA基因间隔区序列,通过比较分析,从分子水平对颤藻科Oscillatoriaceae属间的某些分类学问题进行了讨论,并根  相似文献   

14.
以菠菜(Spinacia oleracea L.)为材料,取幼叶分离mRNA,反转录合成cDNA,以cDNA第一链为模板,通过PCR扩增,获得菠菜磷酸丙糖转移蛋白(Triose phosphate translocator,TPT)cDHA目的片段。对其进行序列分析,结果表明,分离的目的片段核苷酸序列与文献报道相比同源率为99.9%,只不1个碱基发生改变。将得到的菠菜tpt cDNA与CaMV35  相似文献   

15.
大鼠脑谷氨酸脱羧酶基因的cDNA克隆及序列分析   总被引:4,自引:0,他引:4  
胰岛β-细胞自身抗原蛋白之一是脑中谷氨酸脱羧酶(Glutamicaciddecarboxylase,GAD,EC4.1.1.15)同源物,以双链cDNA为模权,用PCR方法快速克隆了Wistar大鼠脑GAD基因的cDNA将此包括编码593个氨基酸的全长DNA片段重组入pUC质粒并用双脱的氧末端终止法测定了全部序列,证明其全长为1779bp,经比较发现Wistar大鼠脑与Russell报导的大鼠脑G  相似文献   

16.
利用生物体中编码亚单位核糖核酸RNA(smallsubunitribosomal RNA,SSUrRNA)的DNA序列为引物,经PCR法扩增到CAR-bacillus的大约1.5kb的SSUrRNA序列,采用HindⅡ、HinfⅠ、EcoT14,HaeⅢ和xhoⅠ等5种限制性内切酶进行酶切电泳分析,同时比较了来源于小鼠的CBM株及来源于大鼠的CBR株,未发现两者有差异。  相似文献   

17.
胰岛β-细胞自身抗原蛋白之一是脑中谷氨酸脱羧酶(Glutamicaciddecarboxylase,GAD,EC4.1.1.15)同源物。以双链cDNA为模板,用PCR方法快速克隆了Wistar大鼠脑GAD基因的cDNA,将此包括编码593个氨基酸的全长DNA片段重组入pUC质粒并用双脱氧末端终止法测定了全部序列,证明其全长为1779bp.经比较发现Wistar大鼠脑与Russell报导的大鼠脑GAD基因序列,有一处碱基的差别,但并不涉及氨基酸的改变。同时还对用PCR扩增长片段DNA进行了方法学上的探讨。  相似文献   

18.
由含有BHBV-1(BovineHerpesVirus-1)前早期基因的基因组片段亚克隆BICPO(BHV-1InfectedCellProteinO)的DNA序列至表达载体pSVK3,构建质粒pSV2.9。将该质粒与pBLTR-Luc共转染小牛肺细胞,检测转染细胞裂解物的荧光素酶活性,BICPO的表达产物可以显著地激活BIVLTR启动子控制下的荧光素酶基因的表达。根据pSV2.9与含有BIVLTR不同区段缺失的质粒pD-319-Luc、pD-115-Luc、pD-52-Luc共转染小牛肺细胞的实验结果,推测BIVLTR-319位上游区的DNA序列影响BICPO基因产物对BIVLTR表达的激活作用。  相似文献   

19.
稻胚凝集素基因的克隆,序列分析及表达   总被引:1,自引:0,他引:1  
以水稻基因组DNA为模板,以特异引物经聚合酶链式反应方法扩增出稻胚凝集素基因并克隆到E.coli质粒pBluescriptSK(+)的SmaⅠ位点。序列分析表明,克隆到的基因片段大小为781bp,没有内含子,编码1条长227个氨基酸、分子量约23kD的肽链,其中N-端28个氨基酸是信号肽。与报道的稻胚凝集素cDNA序列进行顺序同源性比较,发现它们之间有很高的同源性(99.74%),其编码区第167  相似文献   

20.
水稻乙醛脱氢酶基因的克隆及其在不育系中的表达   总被引:2,自引:0,他引:2  
从水稻中分离了乙醛脱氢酶基因(Osaldh)的全长cDNA,序列分析显示Osaldh cDNA含有一个完整的编码549个氨基酸的开放阅读框,其编码蛋白OSALDH的N端为预期的线粒体前导肽,中部具有醛类脱氢酶基因家族的酶催化活性中心,OSALDH与玉米、烟草、人类的线粒体乙醛脱氢酶同源性分别高达87%、77%、59%。Norhern分析显示,幼根中Osaldh的表达水平高于幼苗,幼穗,不育品种幼重  相似文献   

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