| 黄瓜花叶病毒山东株(CMV-SD)RNA2全长cDNA克隆的构建及全序列分析 |
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| 引用本文： | 张国华,许燕,蔡文启,方荣祥.黄瓜花叶病毒山东株(CMV-SD)RNA2全长cDNA克隆的构建及全序列分析[J].微生物学报,1999(1). |
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| 作者姓名： | 张国华 许燕 蔡文启 方荣祥 |
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| 作者单位： | 中国科学院微生物研究所植物生物技术开放实验室 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金,“863”资助项目 |
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| 摘 要： | 分别利用５’ＲＡＣＥ和３’ＲＡＣＥ确定了ＣＭＶＳＤＲＮＡ２的５’和３’末端序列，在此基础上，利用ＲＴＰＣＲ得到了ＲＮＡ２的５’端一半的ｃＤＮＡ克隆ｐＣ２５和３’端一半的ｃＤＮＡ克隆ｐＣ２３，并通过拼接构建了ＲＮＡ２全长ｃＤＮＡ克隆ｐＣ２Ｆ。通过对ｐＣ２５和ｐＣ２３进行序列测定，得到了ＲＮＡ２的全序列。序列分析结果表明ＣＭＶＳＤＲＮＡ２由３０４８ｎｔ组成，其中存在２个部分重叠的阅读框ＯＲＦ１（７９～２６５２ｎｔ）和ＯＲＦ２（２４１４～２７４６ｎｔ），分别编码８５８ａａ的２ａ蛋白和１１１ａａ的２ｂ蛋白，并在２ａ蛋白的序列中发现了动植物病毒复制酶所特有的两个保守序列。该株系ＲＮＡ２核苷酸序列与分属ＣＭＶＩ亚组的Ｆｎｙ株系和ＩＩ亚组的Ｑ株系ＲＮＡ２的核苷酸序列同源性分别为９１７％和７５６％；２ａ蛋白的氨基酸序列同源性分别为９３８％和６７７％，２ｂ蛋白的氨基酸序列同源性分别为８３０％和５１３％。同源性比较的结果表明ＳＤ株系属于ＣＭＶＩ亚组。
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| 关 键 词： | 黄瓜花叶病毒山东株，RNA2，全长cDNA克隆，序列分析 |
CONSTRUCTION OF FULL LENGTH cDNA CLONE AND COMPLETE NUCLEOTIDE SEQUENCE OF RNA2 OF CUCUMBER MOSAIC VIRUS SD STRAIN * |
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| Zhang Guohua\ Xu Yan\ Cai Wenqi\ Fang Rongxiang.CONSTRUCTION OF FULL LENGTH cDNA CLONE AND COMPLETE NUCLEOTIDE SEQUENCE OF RNA2 OF CUCUMBER MOSAIC VIRUS SD STRAIN *[J].Acta Microbiologica Sinica,1999(1). |
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| Authors: | Zhang Guohua\ Xu Yan\ Cai Wenqi\ Fang Rongxiang |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Cucumber mosaic virus SD strain RNA2 Full length cDNA Nucleotide sequence |
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