改性聚二甲基硅氧烷 (iPDMS) 蛋白芯片在肿瘤相关抗原自身抗体筛查中的应用

肿瘤标记的快速筛查是临床早期诊断的难题。利用化学发光蛋白质芯片技术,对低丰度的肿瘤相关抗原的自身抗体进行高灵敏度的筛选,是一种有益的尝试。本研究首先将带烯烃末端的、引发聚合反应的表面引发剂加入到常规聚二甲基硅氧烷材料中,再通过热交联反应固定到聚二甲基硅氧烷的三维结构中,形成改性聚二甲基硅氧烷 (iPDMS)。为了使iPDMS材料具有抗蛋白质非特异性吸附的特性,在活性引发位点处通过表面引发的原子转移自由基聚合反应合成poly(OEGMA) 高分子刷。最后将20种肿瘤相关的抗原利用高通量喷点打印技术打印到芯片的特定区域,并组装成iPDMS芯片的48孔检测微孔板。对临床上常见的8种肿瘤患者血清进行分析,发现VEGFR1和VEGF121自身抗体对常见的8种肿瘤具有检测价值,有望成为肿瘤快速筛查的检测指标。     

纳米金新型基因芯片检测系统的研制及其在临床病原微生物快速检测中的应用

本研究在纳米放大基因芯片检测专利技术的基础上 ,研制纳米金新型基因芯片检测系统 ,从而充分利用纳米金与银反应可将信号放大 10 6倍的优势以取代目前通用的荧光、同位素、酶标等信号报告材料 ,实现芯片技术与纳米技术的有机结合 ,使之具有设备简单 ,技术稳定易于掌握 ,灵敏度高 ,应用范围广等特点。并在此基础上构建针对临床常见致病菌的实用型纳米金基因芯片 ,从而为临床致病性病原微生物的快速、简便、准确诊断探索一条新的途径。试验的主要方法及结果如下 :(1)扩增实验表明 :引物巯基修饰后必须经过TCEP预还原处理 ,才能获得较好的P…     

分枝PEI 修饰的PLGA 纳米粒转染DNA 的研究*

目的:建立基于聚(乳酸-羟基乙酸)纳米粒(PLGA)载DNA的基因转染体系,比较用空白聚(乳酸-羟基乙酸)纳米粒(PLG-A-E)吸附质粒DNA和用分枝PEI修饰后的PLGA纳米粒(PLGA-BPEI)吸附质粒DNA优缺点。方法:用乳化蒸发法制备纳米粒,对纳米粒进行表征研究,包括包封率、Zeta电位、粒径大小、稳定性,用荧光显微镜观察它们对NIH3T3和HEK293细胞的转染效率,用MTT检测对它们细胞的毒性。结果:制备了两种基于PLGA的纳米粒,PLGA-E和PLGA-BPEI粒径大小为200-270nm,zeta电位为0-30mV,在血清和不同的pH值时两者均较稳定,转染效率PLGA-BPEI较PLGA-E高,且释放时间早,但前者较后者对细胞毒性大。结论:这两种基于PLGA纳米粒均能有效转染质粒DNA,它们存在不同的优缺点,应根据不同需要进行选择。     

基于纳米金的显色基因芯片快速检测病原微生物

为构建一种新型的比色芯片,以实现对临床常见感染病原微生物的快速、准确地检测和鉴定.采用纳米金标记巯基修饰的各待检病原微生物的特异性基因片段,与相应的以各待检靶序列的特异性寡核苷酸探针构建成的基因芯片杂交,并通过结合银染反应将杂交信号被放大形成裸眼可见的显色信息来判读检测结果.该芯片技术检测时间短,最低检测值达 100fmol/L.操作方法简单,不需要特殊设备,能部分满足临床检测的通量要求,具有很好的临床应用前景.     

乳腺癌中CELF6的表达水平及其与预后的关系

目的:研究CELF6在乳腺癌组织与正常组织中的表达差异以及其在乳腺癌中的预后意义。方法:采用GEPIA分析乳腺癌组织与正常乳腺组织中CELF6的表达差异,免疫组化检测乳腺癌组织CELF6蛋白的表达。KM-plotter在线分析TCGA数据库中CELF6的表达差异与乳腺癌患者生存预后的关系,CCK8实验分析不同CELF6表达水平对乳腺癌细胞生长增殖的影响。结果:GEPIA在线软件分析结果显示乳腺癌CELF6表达较与正常组织显著降低(P0.001)。免疫组化检测结果显示乳腺癌患者的乳腺癌组织CELF6的阳性表达显著低于癌旁的正常组织。KM-plotter在线分析的生存曲线显示CELF6高表达的乳腺癌患者生存预后显著优于低表达者(P0.001)。CCK8实验显示敲低乳腺癌细胞MDA-MB-231中CELF6的表达,细胞增殖速度显著变快,而过表达CELF6的MDA-MB-231细胞的增殖速度减慢。结论:CELF6可能作为潜在的抑癌基因,在乳腺癌组织中低表达,与乳腺癌患者预后不良有关。     

假互补肽核酸及其分子生物学效应

假互补肽核酸（pseudocomplementary peptide nucleic acids,pcPNAs）是肽核酸（peptide nucleic acids,PNA）的一种衍生物,通过碱基修饰可以使pcPNAs 同时与双链DNA两条链中相应的靶序列结合;而在pcPNAs识别靶序列并结合时,pcPNAs自身两条链间由于空间位阻作用,不会自身互补结合. pcPNAs与DNA、RNA甚 至肽核酸相比具有独特的杂交特性,因此具有非常广泛的分子生物学效应.本文就pcPNAs寡聚体的结构、与核酸杂交的特点及杂交模式,分子生物学效应以及应用等 方面进行介绍.     

VEGF特异的2’-脱氧修饰siRNA能够有效的抑制VEGF的表达和小鼠鼻咽癌异体移植瘤的生长

血管内皮生长因子（vascular endothelial growth factor,VEGF）在肿瘤血管生成中起重要作用,并在多数肿瘤中表达上调,为使用针对VEGF的小干扰RNA（VEGF siRNA）治疗肿瘤提供了重要的作用靶点,然而,不清楚VEGF表达的大幅上调是否会影响VEGF siRNA的干扰效率．本文研究VEGF siRNA能否在VEGF的表达大幅上调的鼻咽癌细胞（CNE）中有效抑制VEGF的表达,并进一步研究VEGF siRNA作为潜在的抗癌制剂的应用方法．为增加siRNA的稳定性,对VEGFsiRNA进行了2’-脱氧（2＇-deoxy）化学修饰,再将修饰后的VEGF siRNA导入经低氧诱导而高表达VEGF的CNE细胞,30h后用ELISA,Western blot结果分析和RT-PCR等方法鉴定其抑制CNE细胞表达VEGF的效果,结果证明VEGF的表达被明显抑制,用化学修饰的VEGF siRNA治疗裸鼠的鼻咽癌移植瘤,将VEGF siRNA与脂质体混合后,注射到肿瘤局部,然后进行超声照射,每周治疗2次,3周以后处死裸鼠、分离肿瘤并测量瘤重．结果显示上述治疗能明显抑制鼻咽癌移植瘤的生长．     

肽核酸探针技术及其在微生物检测中的应用

肽核酸(Peptide Nucleic Acid,PNA)是近十几年发展起来的以中性酰胺键为骨架的脱氧核糖核酸 (Deoxyribonucleic Acid,DNA)类似物,它能够与DNA和RNA特异性地结合从而可以制备PNA探针.与 DNA探针相比,其杂交的稳定性和特异性增加且能在低盐浓度下进行杂交.因此它能够大大提高微生物学检测和医疗诊断的效率和灵敏度.PNA独特的生化属性已逐渐为世人所瞩目,PNA探针技术也得到了迅速发展,尤其是其在微生物检测领域中的应用.     

基于CRISPR/Cas9技术构建CELF6基因敲除细胞系并探讨CELF6与p53基因的关系

目的:构建CELF6基因敲除细胞系并探讨CELF6与p53基因之间的关系。方法:CRISPR/Cas9双载体慢病毒系统通过两个慢病毒载体分别向细胞中导入Cas9蛋白和sg RNA序列表达框,从而实现对CELF6基因的敲除。通过Surveyor(错配酶法)检测sg RNA活性并利用Western blot(蛋白质免疫印迹)检测CELF6的敲除效率。进一步利用CCK-8试剂盒检测敲除CELF6和过表达CELF6对细胞增殖的影响。利用公开可用的癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析CELF6在多种肿瘤组织中的表达情况。结果:CELF6基因敲除的HCT116细胞系成功构建。Western blot检测发现CELF6基因敲除的细胞系中p53、p-RB蛋白的表达水平显著下调,而CELF6过表达的细胞中p53、p-RB蛋白的表达水平明显上调。CCK-8实验结果显示敲除CELF6基因后,细胞增殖活性显著增强;而过表达CELF6后,细胞的增殖活性受到明显抑制。生物信息学分析发现CELF6在结肠癌、胶质母细胞瘤、子宫内膜癌、肾嫌色细胞癌、乳腺癌、甲状腺癌等肿瘤组织中显著低表达。结论:推测CELF6是一种新的潜在肿瘤抑制基因,其可能在肿瘤的发生、发展过程中发挥重要作用。     

错配修复系统hMSH2基因IVS12（-6）T〉C多态及饮食习惯与结直肠癌的易感性

目的：研究江苏省结直肠癌发病与hMSH2基因IVS12（-6）T〉C多态及饮食习惯的相关性。方法：对江苏省金坛、泰兴和淮安地区近2年来新发结直肠癌患者共计108例以及配对180例健康体检者的饮食等生活习惯因素进行调查,提取外周血DNA,应用PCR-DHPLC和DNA序列分析的方法,采用病例对照研究结合现场收集的流行病学资料统计分hMSH2基因IVS12（-6）T〉C与结直肠癌发病的关系。结果：hMSH2基因IVS12（-6）T〉C在家族性结直肠癌患者中检出率较高,且与散发性结直肠癌病例之间差异有统计学意义（P〈0.05）,在喜食油炸和腌渍食物组,hMSH2基因IVS12（-6）T〉CC突变与正常人群之间也存在明显的统计学差异（P〈0.05）。结论：hMSH2基因IVS12（-6）T〉C突变,通过遗传性和后天获得性等多重因素影响,使得该突变的携带者有更高的结直肠癌发病风险。