自探共研的教学模式在《生物技术概论》本科教学中的应用

通过对生物技术专业学生《生物技术概论》课程"自探共研"课堂教学模式的探索,我们改革了传统课堂教学模式,指导学生在自主学习的基础上进行自主探究与合作研讨。通过营造全新的课堂模式,确立了学生的主体地位,提高了课堂的教学效率,更有利于学生系统地掌握知识、培养技能、形成创新意识,实现了高等教育中创新人才的培养目标。     

三种花蓟马触角感器的超微结构

采用扫描电子显微镜对花蓟马Frankliniella intonsa (Trybom)、 禾花蓟马F. tenuicornis (Uzel) 和西花蓟马F. occidentalis (Pergande) 3种国内危害严重的农业害虫的两性成虫触角感器超微结构进行观察和比较, 旨在明确3种花蓟马两性成虫触角上的感器类型、 数量、 分布及超微形态特征, 明晰3种花蓟马触角感器差异, 进而补充蓟马感器详细资料、 完善蓟马形态学研究。结果表明： 3种花蓟马两性成虫触角上均有8种感器类型, 即Böhm氏鬃毛、 钟形感器、 毛形感器、 刺形感器、 锥形感器、 腔锥形感器、 腔形感器和特殊结构感器。触角各节上感器的分布和数量并不均匀。分析结果显示, 各类感器在触角上的分布相对稳定, 具有一定规律; 近缘种间和同种两性间触角感器的形态及分布无明显差异。     

NELDA：基于网络嵌入的lncRNA-疾病关联关系预测

目的 长非编码RNA（lncRNAs）参与多种重要的生物学过程并与各种人类疾病密切相关,因此,lncRNA-疾病关联预测研究有助于疾病的诊断、治疗和在分子水平理解人类疾病的发生发展机制。目前,大多数lncRNA-疾病关联预测方法倾向于浅层整合lncRNA和疾病的相关信息,忽略网络拓扑结构中的深层嵌入特征;另外通过随机选取lncRNA-疾病非关联对构建负样本训练集合,影响预测方法的鲁棒性。方法 本文提出一种基于网络嵌入的NELDA方法,预测潜在的lncRNA-疾病关联关系。NELDA首先利用lncRNA 表达谱、疾病本体论和已知的lncRNA-疾病关联关系,构建lncRNA相似性网络、疾病相似性网络和lncRNA-疾病关联网络。然后,通过设计4个深度自编码器分别从lncRNA/疾病的相似性网络、lncRNA-疾病关联网络学习lncRNA和疾病的低维网络嵌入特征。串联lncRNA和疾病的相似性网络嵌入特征及lncRNA和疾病的关联网络嵌入特征,分别输入两个支持向量机分类器预测lncRNA-疾病关联。最后,采用加权融合策略融合两个支持向量机分类器的预测结果,给出lncRNA-疾病关联关系的最终预测结果。另外,根据已知的lncRNA-疾病关联对和疾病语义相似性,设计一种负样本选取策略构建可信度相对较高的lncRNA-疾病非关联对样本集,用以改善分类器的鲁棒性,该策略通过设计一种打分函数为每对lncRNA-疾病进行打分,选取得分较低的lncRNA-疾病对作为lncRNA-疾病非关联对样本（即负样本）。结果 十折交叉验证实验结果表明：NELDA能够有效预测lncRNA-疾病关联关系,其AUC达到0.982 7,比现有LDASR和 LDNFSGB方法分别提高了0.062 7和0.020 7。另外,负样本选取策略与决策级加权融合策略能够有效改善NELDA预测性能。胃癌和乳腺癌案例研究中,29/40（72.5%）预测的与胃癌和乳腺癌关联lncRNAs,在近期文献和公共数据库中能够发现相关的支撑证据。结论 这些实验结果表明,NELDA是一种有效的lncRNA-疾病关联关系预测方法,具有挖掘潜在lncRNA-疾病关联关系的能力。     

十五肽 BPC-157通过 p38 MAPK 信号通路途径调节人脐静脉内皮细胞的功能

目的:初步探究十五肽 BPC-157调节人脐静脉内皮细胞(HUVEC)功能的信号通路作用机制.方法:首先利用生物芯片筛选 BPC-157参与激活的细胞信号转导通路途径,进而通过 real-time PCR 证实 BPC-157对候选信号通路中相关基的 mRNA 表达水平的影响,最后采用 Western 印迹观察 BPC-157对候选信号通路中相关蛋白的磷酸化水平影响.结果:10μg/mL BPC-157作用 HUVEC 24 h 后,信号转导通路发现者芯片结果显示,与18条信号转导通路相关的96个关键基中分别有4个基的 mRNA 表达水平上调和下调,其中与 MAPK 信号通路相关的3个关键基 c-Fos、c-Jun 和 Egr-1的 mRNA 表达水平显著性上调;低剂量 BPC-157(1μg/mL)作用 HUVEC 12 h 后,能够促进早期即刻基 c-Fos、c-Jun 和 Egr-1的 mRNA 表达水平;10μg/mL BPC-157作用 HUVEC 30 min 后,可明显促进 ERK1/2、p38蛋白磷酸化.结论:BPC-157可能通过活化 MAPK 信号转导通路途径后,激活下游早期即刻基转录,启动靶基的表达,从而发挥促进 HUVEC 增殖、迁移等功能.     

GFE-1多肽与重组人肿瘤坏死因子α融合蛋白的构建及其体外活性和体内分布研究

目的:构建 GFE-1多肽与重组人肿瘤坏死子α(rmhTNF-α)融合蛋白(GFE-1-rmhTNF),研究该融合蛋白的体外活性和体内分布.方法:利用基工程方法,将人工合成的编码 GFE-1的寡核苷酸片段连接在 rmhTNF-α序列的3'端,转入大肠杆菌中诱导表达,采用 Q-Sepharose FF 离子层析柱和 SP-Sepharose FF 阳离子层析柱纯化蛋白,SDS-PAGE 和 Western 印迹鉴定,测定该融合蛋白的体外活性,观察其在小鼠体内的分布情况.结果:构建了融合蛋白 GFE-1-rmhTNF,并在大肠杆菌中获得高效表达.体外活性实验显示,GFE-1-rmhTNF 对 L929细胞有明显的杀伤活性;体内分布实验证实,GFE-1-rmhTNF 在小鼠肺组织的富集高肝肾组织.结论:构建了融合蛋白 GFE-1-rmhTNF,可显著杀伤 L929细胞并特异性富集小鼠肺组织.     

畸精子症病人的睾丸特异性表达基因SPEM1筛查分析

目的:探讨睾丸特异性表达基因SPEM1突变与畸精子症患者之间的关系.方法:收集从2005年4月至2007年3月临床上不明原因的畸精症患者113份外周血标本以及100份正常生育能力男子的外周血标本,抽提其DNA.然后采用PCR技术、变性高效液相色谱技术(DHPLC)以及测序等手段对全部DNA样本进行该基因的突变筛查.结果:在畸精症患者中发现1个新的未见报道的多态性位点;尚未发现有基因突变或微缺失.结论:SPEM1基因突变或缺失不是引起本组畸精子症病人的主要致病基因.该基因在对畸精子症所致不育的诊断价值尚需进一步研究.     

人生长分化因子15的原核表达、纯化与多克隆抗体制备

目的:原核表达并纯化、鉴定人生长分化因子15(GDF-15),制备其多克隆抗体。方法:从人结肠癌细胞系HT29的cDNA扩增出GDF-15基因片段并插入pET-32a(+)原核表达载体,转化大肠杆菌BL21,IPTG诱导表达重组GDF-15,用镍亲和柱纯化,SDS-PAGE、Western印迹鉴定重组蛋白。用纯化的重组GDF-15免疫BALB/c小鼠制备多克隆抗体,鉴定并检测其效价。结果:制备了pET-32a(+)-GDF-15表达载体;经IPTG诱导重组蛋白表达后,采用Ni亲和柱纯化蛋白,并经SDS-PAGE和免疫印迹鉴定;免疫BALB/c小鼠后获得了GDF-15多克隆抗体,ELISA检测抗体效价为1∶100000,并应用于肿瘤细胞的GDF-15检测中。结论:用基因工程和免疫学方法制备了重组人GDF-15及其多克隆抗体,为后续的分子机制和靶向治疗研究奠定了基础。