不同风浪条件下太湖梅梁湾光合有效辐射的衰减

基于2003年7月12～17日在太湖梅梁湾进行的连续6d原位水下光场观测资料,分析了不同风浪条件下光合有效辐射(PAR)的衰减和真光层深度,探讨了影响水下光合有效辐射的主导因子.结果表明,整个观测期间向下PAR衰减系数为2.63～4.71·m^-1(均值为3.63±0.47·m^-1),对应的真光层深度为0.98～1.75m(均值为1.29±0.18m),显示1.5m以下深度浮游植物、沉水植物基本上无法获取足够的太阳光能进行光合作用.从小风浪到中风浪、大风浪向下PAR衰减系数分别是2.63、3.72和4.37·m^-1,衰减系数分别增加了41%、66%.透明度、PAR衰减系数、真光层深度与悬浮物浓度存在显著性线性相关,并且与悬浮物中无机颗粒物相关性最好,而与叶绿素a、脱镁叶绿素及溶解性有机碳相关性很低.多元逐步线性回归表明,叶绿素a和溶解性有机碳最先被剔除方程,说明在梅梁湾由于风浪扰动引起悬浮物浓度的改变是影响水下光场的主导因素.     

逆转录-聚合酶链反应检测鼠肝炎病毒方法的建立

建立特异、灵敏的逆转录聚合酶链反应（RT－PCR）技术,结合碱性磷酸酶标记的探针杂交检测鼠肝炎病毒（MHV）,采用MHV－3,MHV－A59病毒株感染DBT细胞,37℃培养,待细胞出现病变时收集提取病毒RNA。依据MHV基因序列设计一对高度保守区特异性引物,进行RT－PCR扩增,结果可见147bp的鼠肝炎病毒产物特异扩增带。敏感性实验检测到10pg的鼠肝炎病毒RNA,同时用ELISA方法对照。结果提示应用RT—PCR技术结合探针杂交检测鼠肝炎病毒。具有简便、快速、灵敏等优势。本研究在国内尚未见报道。     

溶藻弧菌Ⅲ型分泌系统分子伴侣护航蛋白VscO的基因克隆及其生物信息学分析

克隆了溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)ZJ03株Ⅲ型分泌系统(T3SS)分子伴侣护航蛋白(Chaperone escort protein)vscO基因,并对其进行生物信息学分析。结果表明,vscO基因全长462 bp,编码153个氨基酸,理论分子量约为18.43 kD,pI值为9.22。细胞定位分析显示vscO基因位于外周质,不存在信号肽,无跨膜区。vscO基因具有转录起始区-35区和-10区,以及翻译识别信号SD序列(Shine-Dalgarno sequence)。该氨基酸序列含有多种活性位点,如蛋白激酶C磷酸化位点等。系统进化树发现溶藻弧菌的VscO蛋白与副溶血弧菌聚为同一亚族。VscO亚基三维结构模型显示其与副溶血弧菌T3SS的YscO蛋白有相似构型。信号通路分析推测VscO位于T3SS的针状样结构上。蛋白网络互作图谱发现VscO与10种T3SS蛋白具有相邻关系。本研究结果将为溶藻弧菌Ⅲ型分泌系统护航机制的研究奠定基础。     

2003—2011年夏季北京城市热景观变化特征

自北京城市总体规划(2004—2020年)以来,城市化快速发展,强烈的人类活动改变了城市的热环境。基于2003年、2007年和2011年夏季同时期的TM遥感卫星影像,采用遥感反演地温的方法,运用RS、GIS以及景观分析工具,对北京城市六环内的热场和热岛变化特征进行了分析。分析结果表明,2003—2011年北京城市六环内的热场分布特征发生了很大变化,2003年城市各环线内的植被覆盖度最低,但是夏季城市的地表辐射亮温分布差异相对较小,热岛特征也并不十分明显,随着城市建设规模扩大和用能的增加,到2011年,尽管城市植被覆盖度提高很快,但城市和城郊的温差达到最大,城市热岛在不断增强,热场向城市中心集聚趋势明显。通过城市热岛等级类型的景观指数分析表明,2011年的高等级的热岛斑块分布范围和强度都明显提高,而且城市五环内高等级的热岛范围基本连成一片。由于城市人类活动的加剧各热岛等级斑块的形状更加复杂。在景观水平上的分析显示,2007年的热景观斑块类型多,在六环内的分布均匀,破碎化程度高,至2011年,景观斑块的蔓延度逐渐下降,低等级的热岛斑块优势度逐渐降低。研究结论可以为城市管理决策部门制定有效的热岛效应缓解措施提供理论依据。     

乳酸堆积和二氯乙酸钠对肝癌细胞凋亡及bax、bcl-2 表达 和caspase-3 活性的影响

目的：探讨乳酸堆积和二氯乙酸钠(DCA)对肝癌细胞(HepG2)凋亡和bax、bcl-2 表达及caspase-3 活性的影响。方法：通过体 外培养HepG2,建立稳定的体外培养模型,配制成终浓度分别为0 mmol/L、1.0 mmol/L、2.0 mmol/L、4.0 mmol/L、8.0 mmol/L的乳 酸培养液以及在不同浓度乳酸组中加入终浓度为10-3mmol/L DCA 培养液与HepG2共同培养,其中以0 mmol/L 乳酸组为对照 组。采用MTT法检测乳酸对HepG2 的抑制率,流式细胞仪检测乳酸和DCA 对HepG2的凋亡百分率,用Real-time PCR法测定 bax 及bcl-2 mRNA的表达,用免疫荧光法检测caspase-3 的活性。结果：乳酸对HepG2 的IC50值为13.6 mol/L,与对照组比较,随 着乳酸浓度的增加,HepG2 凋亡率增加,bax mRNA 表达升高,bcl-2 mRNA 的表达降低,caspase-3活性增加,其中1.0 mmol/L 乳 酸组与对照组比较(P>0.05),2.0 mmol/L,4.0 mmol/L 和8.0 mmol/L乳酸组与对照组比较差异有统计学意义(P<0.05)。加入DCA 后,HepG2 凋亡减少,2.0 mmol/L 乳酸+DCA 组、4.0 mmol/L乳酸+DCA 组、8.0 mmol/L乳酸+DCA 组与同浓度的乳酸组比较, bax mRNA 表达减少（P<0.05）,bcl-2 mRNA 表达增加（P<0.05）,caspase-3 活性减低（P<0.05）。结论：乳酸可诱导HepG2凋亡,且随 着乳酸浓度的增高,HepG2 的凋亡率增加,其机制可能是通过对bcl-2 及bax mRNA 表达的改变以及激活caspase-3 活性而实现, DCA可以降低HepG2 凋亡,对乳酸堆积造成的HepG2凋亡有抑制作用。     

蒙特卡洛算法在水动力水质模型(DYRESM-CAEDYM)参数优选中的应用

针对以往生态动力学模型DYRESM-CAEDYM 在应用中, 多采用手动方法确定参数值时较为费时费力的缺点,引入蒙特卡洛随机抽样算法对模型参数进行自动率定。以广东省大沙河水库为例, 选择率定期为2011 年11 月至2012年2 月, 利用2012 年7 月至2012 年11 月实测水质数据对模型进行验证。结果表明, 在率定阶段模型对水温的模拟结果非常好, 表层和底层温度的均方根误差(RMSE)分别为3.53 ℃和2.00 ℃, 相对误差(RE)值均小于0.15; 模型对溶氧的模拟结果良好, 表层和底层的RMSE 值分别为1.23 mg⋅L−1和1.85 mg⋅L−1, RE 值分别为0.08 和0.20。在验证阶段, 温度表层和底层的RMSE 分别为2.49 ℃和1.67 ℃, RE 值均小于0.1; 溶氧在表层和底层的RMSE 分别为2.15 mg⋅L−1和0.79 mg⋅L−1, RE分别为0.17 和0.11。因此, 经采用蒙特卡洛方法率定后得到的大沙河水库DYRESM-CAEDYM 模型参数值较为可靠。     

用改进的MVR-PCR方法检测河北地区汉族人群D7S21基因座多态性

为研究D7S21基因座在河北汉族人群分布的多态性,应用MVR-PCR ( Minisatellite Variant Repeat-Polymerase Chain Reaction)方法和聚丙烯酰胺梯度凝胶电泳银染法对124名河北汉人无关个体D7S21基因座进行了快速检测,并进行数字编码。每一个体平均得到36个数字编码,未发现任何两个无关个体所有编码相同,两无关个体36个编码相同的概率为3.48×10-18。三种重复单位a型、t型和0型出现的概率分别为：48.5 ％、49.4％和 2.1％。该基因座杂合度为0.9876,非父排除率为0.9746,多态性信息含量为0.9872。研究表明,D7S21基因座在河北汉族人群中具有高度的多态性,聚丙烯酰胺梯度凝胶电泳银染法简便、快速,具有一定的实用价值。 Abstract:To study the polymorphism at D7S21 locus in Hebei Han population,124 unrelated individuals were detected rapidly by Minisatellite Variant Repeat-Polymerase Chain Reaction (MVR-PCR) and polyacrylamide gradient gel electrophoresis followed by silver staining,and digital codes were obtained.About 36 digital codes were obtained from each individual.No two unrelated individuals shared the same codes.The probability of identity in 36 digital codes was 3.48×10-18.The percentage of three repeat units,a-type,t-type and 0-type was 48.5%,49.4% and 2.1% respectively.The heterozygosity (H),excluding probability of paternity（EPP）and polymorphism information content（PIC）were 0.9876,0.9746and 0.9872 respectively.The results suggested that D7S21 locus has highly polymorphism in Hebei Han population.The method-polyacrylamide gradient gel electrophoresis followed by silver staining was simple,rapid and practical.     

人尿道上皮细胞T7噬菌体展示cDNA文库的构建与鉴定

[目的]构建人尿道上皮细胞(SV-HUC-1)T7噬菌体展示c DNA文库,为研究人尿道上皮细胞与生殖道感染病原体的相互作用奠定基础。[方法]用Trizol试剂提取SV-HUC-1细胞总RNA,分离纯化出mRNA,经反转录合成得到其双链c DNA,在双链c DNA末端加上定向的EcoRⅠ/HindⅢ黏性末端,然后收集并纯化200bp以上的双链c DNA片段,连接于T7噬菌体载体,经体外包装后转入BLT5403宿主菌,T7噬菌体展示c DNA文库构建成功。[结果]将文库扩增后,用噬斑试验检测其库容,结果为1.2×106pfu/cm3。用PCR鉴定随机挑取的噬菌斑,计算其重组率达93.75%,且插入片段都大于200bp。[结论]成功构建了SV-HUC-1细胞T7噬菌体展示c DNA文库,为下一步研究泌尿生殖道感染病原体与人尿道上皮细胞的相互作用奠定了前期实验基础。     

土地利用/景观生态学研究中的马尔可夫链统计性质分析

马尔可夫链在土地利用和景观生态学研究中得到了广泛应用,而应用中通常假设土地利用变化为满足马尔可夫性的一阶时齐马尔可夫链,对马尔可夫链的统计性质是否成立却很少进行检验.本文以北京市土地利用变化监测数据为算例,提出了马尔可夫链统计性质的皮尔逊χ² 拟合优度检验方法.检验结果表明,土地利用研究中通常假设的时齐性和马尔可夫性(一阶性)在统计学上并不成立,即北京土地利用演变过程为非时齐的高阶马尔可夫链.相对于马尔可夫统计性质的似然比检验中转移概率大于零的要求,皮尔逊χ²检验对转移概率的要求相对宽松,允许转移概率为零,所以应用的范围较似然比检验更为广泛.     

一类多分子反应微分方程模型的相图

本文对一类多分子反应微分方程模型进行定性分析,在第一象限内的奇点无法具体求出的条件下,讨论了轨线的有界性,分界线的位置关系以及极限环的存在性．