系统发育谱构建方法研究

随着后基因组时代的到来,系统发育谱方法作为一种非同源性的功能注释方法,已经被成功的应用到基因组功能预测、蛋白质相互作用预测等一些重要领域的研究中去。本文阐述了系统发育谱法的基本原理,详细地介绍了现有的几种系统发育谱的构建方法,并提出了利用ortholog来构建基因的系统发育谱的思想。     

克隆鸭乙型肝炎病毒DNA双体体内转染的研究

用一种含头尾相连DHBVDNA双体的质粒体内转染2日龄芙蓉鸭,大多数鸭（86％）产生了短暂病毒血症。血清DHBs／preSAg和DHBVDNA于转染后第9天出现,第12～14天达峰值,第28天时多数转阴;少数鸭的病毒血症可持续50天以上。转染鸭肝组织中也检测到复制中间型DHBVDNA的存在。用转染鸭病毒血症期的血清作磷钨酸负染电镜观察,找到了完整的DHBV病毒颗粒,并且用此血清腹腔注射1日龄鸭,60％的鸭被感染成功,证明体内转染后有生物活性的DHBV病毒颗粒的产生。该研究方法的建立．对于研究DHBV变异株．DHBV基因结构与功能的关系等,均有一定理论意义及应用价值。     

细菌L型败血症快速诊断法的临床研究

１９８５年６月至１９９３年６月,我们先后开展了光镜,电子显微镜与酶联免疫法快速诊断细菌Ｌ型败血症。光镜与电镜临床应用２２６例,以细菌Ｌ型培养作对照研究,准确度为９６．０％。酶联免疫法经６０例对照分析,准确度达到９６．７％。发现细菌Ｌ型常具有粘附在红细胞上和侵入红细胞内的特点。所以重点在红细胞上查菌,改进了检验方法,提高了阳性率和准确度。     

子宫肌瘤复发的相关因素分析

目的:探讨子宫肌瘤剔除术后复发的相关因素,为临床降低复发率提供科学依据和有效途径.方法:收集2002年1月至2010年12月北京市怀柔区第一医院妇科门诊收治的445例子宫肌瘤剔除术患者的临床资料及子宫肌瘤术后复发随访情况,对相关因素进行单因素和多因素logistic分析.结果:随访的445例患者复发94例,复发率为21.12％,复发距手术时间6～96个月,平均(38.5±12.8)个月.年龄、BMI、肌瘤数目、肌瘤大小、肌瘤部位、既往分娩史、术后用药与肌瘤复发显著相关,其中年龄、BMI、肌瘤数目是子宫肌瘤复发的独立危险因素,术后妊娠是子宫肌瘤复发的保护因素.结论:年龄、BMI、肌瘤数目是子宫肌瘤复发的独立危险因素,术后妊娠是保护因素.     

I/St和A/Sn小鼠对抗结核分枝杆菌感染能力的差异:表现于肺和肺外巨噬细胞表型

结核分枝杆菌(TB)的动物模型被证实是宿主免疫系统与分枝杆菌相互作用、宿主对1B感染的抗性和易感性遗传调控的非常重要手段。现已发现小鼠基因组中的几个遗传位点控制着小鼠经1B感染后出现复杂表型的变化,如存活时间、体重和肺部病毒变化等方面。小鼠I／St和A／Sn是近交系,它们对TB的感染却出现不同的反应。I／St小鼠反应     

035严重急性呼吸道综合征冠状病毒S蛋白可介导病毒进入肝癌细胞系

本文作者利用重组带有严重急性呼吸道综合征冠状病毒(SARS-CoV)S蛋白的慢病毒属假病毒颗粒,研究了SAILS-COV的嗜性及介导的病毒感染。首先用瞬时转染,SARS-CoV的S蛋白可以在转染细胞表面表达,随后用S蛋白的表达质粒和缺少env基因但带有报告基因的HIV质粒共转染293T细胞,     

酵母蛋白质相互作用与基因表达谱和亚细胞定位的相关性

研究酵母（yeast）蛋白质相互作用与基因表达谱和蛋白质亚细胞定位的关系.首先,构建了蛋白质相互作用正样本集、负样本集、随机组对负样本集和混合样本集.然后,对于4个数据集中的所有蛋白质对,通过比较它们的基于距离的基因共表达的分布以及它们中具有已知亚细胞定位的蛋白质对的共定位出现率,实现了这些高通量数据的交叉量化分析.结果揭示,与非相互作用蛋白质对相比,相互作用蛋白质对的基因表达谱具有较高的相似性;相互作用蛋白质对更倾向于具有相同的亚细胞定位.结果还揭示出这些蛋白质特征相关的总体趋势.     

Z曲线在基因组中应用的研究与展望

随着后基因组时代的到来,大规模分子数据的处理和分析的需求变得越来越重要,生物数据的处理方法也层出不穷。这里介绍了一种新的表示DNA序列的模型-Z曲线,并详细的介绍了它的数学原理、和它在识别基因、基因起始位点以及识别Isochore结构上的应用,最后展望了Z曲线在识别TFBS上的应用。     

031高效抗反转录治疗使人类免疫缺陷病毒 -丙型肝炎病毒双重感染者病死率高于单纯人类免疫缺陷病毒感染

高效抗反转录治疗（HAART）使人类免疫缺陷病毒（HIV）感染者的病死率大大降低,但对于同时感染丙型肝炎病毒（HCV）的患者,其治疗效果需要进一步评价。HIV感染者合并感染HCV的比例很高,为10％～40％,主要是因为HIV与HCV有共同的传播途径,如吸毒或接受不洁血制品。HCV有较长的潜伏期,所以HIV患者在接受HAART的早期可能没有考虑到肝脏疾病。