中国朝鲜族9个STR基因座遗传多态性研究

为丰富中华民族基因数据库,获取中国吉林省特有少数民族--朝鲜族D3S1358、vWA、FGA、TH01、TPOX、CSF1PO、D5S818、D13S317、D7S820等9个STR基因座的群体遗传数据。采用四色荧光标记STR基因扫描技术,检测91个无关个体血液样本。结果共检出81种等位基因,其基因频率分布在0.0055~0.4615之间;共检出196种基因型,其基因型频率分布在0.0110~0.9890之间。9个STR基因座基因型频率观察值与期望值均符合Hardy-Weinberg平衡定律（P＞0.05）。9个基因座的多态信息量PIC（polymorphic information content）分布于0.6863~0.8807之间,杂合度H（heterozygosity）分布于0.6919~0.8809之间,个体识别力DP（discrimination power）分布于0.8301~0.9670之间,非父排除率PPE（probability of paternity exclusion）分布于0.8590~0.9942之间。研究结果可应用于人类群体遗传学及法医学研究等领域。 Genetic Polymorphism of 9 STR loci in Chaoxian National Minority of China GAO Ya1,JIN Tian-bo1,LAI Jiang-hua1,CHEN Teng1,ZHENG Hai-bo1,ZHU Bo-feng1,HU Song-nian2,WANG Jian2,LI Sheng-bin1 1.Forensic Laboratory of Ministry of Health of Xi'an Jiaotong University,710061,Xi'an China; 2.Beijing Huada Genomics Institute( Beijing Airport Industrial Zone B-6),101300,Beijing,China Abstract:In order to enrich the Chinese genetic database,nine polymorphic loci of STR,such as D3S1358,vWA,FGA,TH01,TPOX,CSF1PO,D5S818,D13S317 and D7S820 were studied.Based on STR gene scan marked by fluorescence,91 unrelated Chinese Chaoxian individuals were observed.81 alleles and 196 genotypes were found.The corresponding gene frequency and genotype frequency were 0.0055~0.4615 and 0.0110~0.9890 respectively.The genogypes frequency of nine STR loci was good with the Hardy-Weinberg equilibrium（P＞0.05）.The statistical analysis of nine STR loci showed the following：PIC（polymorphic information content）≥0.6863,H（heterozygosity）≥0.6919,DP（discrimination power）≥0.8301,EPP（probability of paternity exclusion）≥0.8590.The data studied can be used in Chinese population genetic studies and forensic medicine applications. Key words：Chaoxian groups of China;STRs;gene scan;genetic polymorphism     

HPCL2基因表达的选择性剪切分析

2-羟基植烷酸辅酶A裂解酶（2-hydroxypanthyl-CoA lyase,HPCL2）是3-甲基脂肪酸α-氧化途径中的关键酶.采用鸟枪法测序技术,得到了HPCL2基因的基因组序列.结果显示,HPCL2基因组大小为40 829 bp,共有17个外显子,16个内含子.外显子平均大小为116 bp,内含子平均大小为2 429 bp,属于结构紧凑基因.从dbEST数据库中筛选与HPCL2基因的mRNA (GenBank Acc.:AJ131753) 相互重叠表达序列标签(EST)共有213个,分别来自29个不同的组织.将EST与基因组序列进行Blast分析,共检测17个EST具有选择性剪切,其中14例属外显子遗漏（exon skipping）,2例外显子增加 (exon inclusion)和1例剪切位点改变(splicing site shift).外显子遗漏主要发生在5′端的第3到第8个外显子.结果表明,外显子遗漏可能是HPCL2基因选择性剪切的主要形式.     

微生物组测序与分析专家共识

在过去的十几年,微生物组相关研究和应用持续升温。微生物组逐渐成为生命科学、环境科学和医学等领域的研究焦点。与此同时,全球多个国家和组织也都积极发起各自的微生物组计划,进行多方面的布局,力争在这一具有广阔前景的领域获得战略地位。此外,无论是科研还是产业应用已经迎来了研究高潮和投融资热潮,微生物组相关产品和服务也不断出现。然而,行业在快速发展的同时,也存在一些不足。由于微生物组测序和分析相关技术和方法发展迅速,各国研究和应用尚未在技术、方案和数据等标准上达成统一,国内行业参与者对微生物组也存在认识不足,对微生物组相关新方法、新技术、新理论等还未能充分掌握和使用。除此之外,已有的一些标准和指南,内容过于简单,实操性也不足,这不仅给科研数据的整合造成了困难和资源浪费,还给相关企业进行不良竞争、以次充好提供了机会。更重要的是,我国尚缺乏微生物组相关的国家标准,国家微生物组计划仍处于筹备过程。在此背景下,中国生物工程学会、中国科学院微生物研究所于2019年6月至2020年3月,共同设立了“微生物组测序与分析专家共识”专项研究课题。中国生物工程学会组织了微生物组相关领域的27位专家以及来自行业内的30多位专业人员,通过分成4个项目小组、召开4轮研讨会后,最终形成了涵盖从微生物采集与保存、DNA提取与建库、高通量基因测序和数据分析以及质控标准品等全流程的“微生物组测序与分析专家共识”。本专家共识具有较强可参考性和可操作性,不仅能指导国内科研和产业机构规范进行微生物组相关产、学、研,还能为国家相关职能部门提供可参考的技术依据,保障规模型和规范化的企业利益,加强行业自律,避免不规范的企业扰乱市场,最终促进微生物组相关产业的良性发展。     

32株金黄色葡萄球菌分子分型及肠毒素分析

目的对辽宁省内2016-2018年分离出的食源性金黄色葡萄球菌采用脉冲场电泳(PFGE)和肠毒素分型进行分析,为今后公共卫生等领域提供技术保障。方法将32株金黄色葡萄球菌用限制性内切酶SmaI酶切以进行PFGE分析,并用BioNumerics(7.6版本)软件对分离株的指纹图谱进行聚类分析;用PCR方法对菌株进行肠毒素检测。结果 32株食源性金黄色葡萄球菌的PFGE图谱的相似性系数在26.8%~100.0%,经聚类分析得到31个PFGE型别。每株菌均携带1~3种毒力基因,其中每年携带SEH基因最多。结论金黄色葡萄球菌均可以用PFGE和PCR进行分型,都具有较好的分型能力,辨识度高,对菌株有很好的溯源性。     

湖南栎类天然次生林幼树更新特征及影响因子

以湖南典型栎类天然次生林为研究对象,基于51块样地的调查数据,采用k-means聚类分析划分林分类型,研究湖南不同栎类天然次生林幼树更新特征,分析了湖南不同栎类天然次生林幼树更新指标(幼树密度、幼树平均地径、平均高以及平均冠幅)与环境因子、林分因子的相关性,旨在阐明环境因子、林分因子对幼树更新的影响,以期为湖南不同栎类天然次生林的恢复与经营管理提供理论依据。结果表明:(1)利用聚类分析可将研究区内栎类天然次生林划分为5个类型,包括甜槠锥栗混交林(CC)、亮叶水青冈多脉青冈混交林(FC)、石栎樟树混交林(LC)、枹栎甜槠混交林(QC)、青冈栎混交林(CG)。(2)不同类型栎类天然次生林更新幼树优势种分化明显,物种丰富度差异显著(P0.05)。5种不同栎类次生林幼树密度均未超过500株/hm~2,更新情况较差;幼树数量差异显著(P0.05),为亮叶水青冈多脉青冈混交林石栎樟树混交林青冈栎混交林枹栎甜槠混交林甜槠锥栗混交林;生长情况差异显著(P0.05),为青冈栎混交林亮叶水青冈多脉青冈混交林枹栎甜槠混交林甜槠锥栗混交林石栎樟树混交林。(3)相关分析结果显示,不同类型次生林幼树更新的主要影响因子存在差异。甜槠锥栗混交林中幼树密度与腐殖质厚度呈显著负相关(P0.05);幼树平均高与灌木盖度呈显著正相关(P0.05);幼树平均地径与草本盖度、灌木盖度呈显著正相关(P0.05)。亮叶水青冈多脉青冈混交林中幼树密度与海拔、腐殖质厚度、枯落物厚度呈显著正相关(P0.05),与草本盖度呈极显著正相关(P0.01);幼树平均地径与郁闭度呈显著负相关(P0.05);幼树平均高、幼树平均冠幅与坡位呈显著正相关(P0.05)。石栎樟树混交林中幼树密度与坡向、土壤厚度呈显著正相关(P0.05),其余因子对幼树生长无显著影响。枹栎甜槠混交林中幼树密度与郁闭度、乔木密度呈极显著正相关(P0.01),与坡位呈显著负相关(P0.05);幼树平均冠幅与坡度呈显著负相关(P0.05)。青冈栎混交林中幼树平均地径与土壤厚度呈显著正相关(P0.05),与乔木密度呈极显著正相关(P0.01);幼树平均冠幅与灌木盖度呈显著正相关(P0.05)。     

高原红细胞增多症患者红细胞二磷酸甘油酸和氧亲和力变化的探讨

在海拔４３００ｍ地区,对１８名移居汉族、２４名世居藏族和２１名高原红细胞增多症（ＨＡＰＣ）患者测定了２,３—二磷酸甘油酸（２,３—ＤＰＧ）和肺通气功能,并进行了血气分析。结果显示：ＨＡＰＣ患者的全血和红细胞内２,３—ＤＰ６浓度均显著高于健康组,但世居、移居健康组之间无明显差异。ＨＡＰＣ组的红细胞２,３—ＤＰＧ和Ｐｄｏ＿２呈显著负相关（ｒ＝—０．７７１,Ｐ＜０．０１）,而在健康组无显著相关（ｒ＝—０．２６,Ｐ＞０．０５）。ＨＡＰＣ组与健康组相比,ｐＨ、Ｐａｏ＿２和Ｓａｏ＿２降低,Ｐａｃｏ＿２和肺泡动脉氧分压差增高。ＨＡＰＣ病人Ｐ＿（５０）为３．７５±０．６６ｋＰａ,健康组为３．４０±０．１２ｋＰａ（Ｐ＜０．０５）,Ｐ＿（５０）与２,３－ＤＰＧ呈正相关（ｒ＝０．５９２,Ｐ＜０．０５）。ＨＡＰＣ组最大呼气中段流量和５０％肺活量最大呼气量明显低于健康组（Ｐ＜０．０１）。本研究提示：①ＨＡＰＣ患者的低氧血症可能与血中２,３－ＤＰＧ浓度过高有关;②轻度肺功能异常亦可促使红细胞进一步增多。     

无视异绒螨产卵对不同土壤含水量的选择性观察

试验结果表明,除含水量为5％和17.5％的土壤外,无视异绒螨在含水量为7.5％～15％的范围内均可产卵,其中以含水量为12.5％的土壤产卵量最高,与其它土样之间存在着显著性差异。根据聚类分析结果,可将供试的土样分为3个类型,即最适产卵型(土壤含水量为12.5％)、适宜产卵型(土壤水量为7.5％～10％)和不宜产卵型(土壤含水量为5％、15％和17.5％)。     

α-氨基酸的立体有择合成

简述了α－氨基酸立体有择合成中几个代表性方法：消旋氨基酸不对称转化、α,β－脱氢氨基酸不对称氢化、甘氨酸等量体不对称烷化和手性自身再生。引用文献１８篇。     

豌豆卷须肌动蛋白Ⅱ类异型体cDNA克隆的序列分析

分析１５个豌豆卷须肌动蛋白ｃＤＮＡ 克隆的限制性内切酶图谱,发现在豌豆卷须中至少存在三类肌动蛋白异型体,分别命名为Ⅰ类（ＰＥＡｃ Ⅰ）、Ⅱ类（ＰＥＡｃ Ⅱ）和Ⅲ类（ＰＥＡｃ Ⅲ）异型体．三类异型体的克隆数目分别为１０、４和１个,表明三类异型体在豌豆卷须中的表达是不同的,很可能具有组织或发育阶段的特异性．对Ⅱ类异型体的三个ｃＤＮＡ 克隆ＰＥＡｃ３、ＰＥＡｃ９和ＰＥＡｃ１１进行了全序列测定,所测定的序列已被ＧｅｎＢａｎｋ 数据库所接受．测序结果表明,ＰＥＡｃ３、ＰＥＡｃ９和ＰＥＡｃ１１的序列长度分别为１５５０、１６８０和１０９１个核苷酸,其中编码区长１１３４个核苷酸,编码的氨基酸长度为３７７（ＰＥＡｃ１１缺少编码氨基端前９６个氨基酸的核苷酸序列）．三个克隆的核苷酸序列完全相同,差别仅在于３′非翻译区的长度不同,即ｐｏｌｙ（Ａ）的加入位点不同．这说明它们可能是由同一基因转录而来,但转录后的加工过程不同．豌豆卷须中肌动蛋白基因ｐｏｌｙ（Ａ）加入位点的使用,可能与组织或发育的特异性表达有关．此外,豌豆卷须肌动蛋白三类异型体之间的核苷酸序列同源性为８０％ ,氨基酸序列同源性为９４％ ．     

全国农作物病虫害综合治理应用基础学术讨论会

<正> 全国农作物病虫害综合治理应用基础学术讨论会于1990年12月11～15日在南京召开。会议由中国昆虫学会农虫委员会与中国植保学会联合主持召开,参加会议的有来自全国23个省、市、自治区科研、教学及推广等单位的代表共130名及部分来宾,共收到科学论文305篇。