| 微生物组测序与分析专家共识 |
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| 引用本文： | 段云峰,王升跃,陈禹保,杨瑞馥,李后开,朱怀球,童贻刚,杜文斌,付钰,胡松年,王军,辛玉华,赵方庆,鲍一明,张雯,李娟,曾明,牛海涛,周欣,李岩,崔生辉,袁静,李俊桦,王加义,刘东来,倪铭,孙青,邓晔,朱宝利.微生物组测序与分析专家共识[J].生物工程学报,2020,36(12):2516-2524. |
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| 作者姓名： | 段云峰 王升跃 陈禹保 杨瑞馥 李后开 朱怀球 童贻刚 杜文斌 付钰 胡松年 王军 辛玉华 赵方庆 鲍一明 张雯 李娟 曾明 牛海涛 周欣 李岩 崔生辉 袁静 李俊桦 王加义 刘东来 倪铭 孙青 邓晔 朱宝利 |
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| 作者单位： | 1 中国科学院微生物研究所，北京 100101;2 中国科学院北京基因组研究所，北京 100101;3 中国食品药品检定研究院-疫苗室，北京 102629;4 北京市计算中心，北京 100094;5 中国食品药品检定研究院 食品化妆品检验检测中心，北京 102629;6 中国科学院生态环境研究中心，北京 100085;7 上海中医药大学，上海 201210;8 华大基因研究院，广东 深圳 518083;9 中国科学院生物物理研究所，北京 100101;10 中国食品药品检定研究院，北京 102629;11 中国人民解放军军事科学院 军事医学研究院，北京 100850;12 北京协和医学院医学实验动物研究所，北京 100021;13 北京化工大学，北京 100029;14 上海交通大学医学院附属瑞金医院国家转化医学中心，上海 200025;15 中国人民解放军军事医学科学院 微生物流行病研究所，北京 100012;16 首都医科大学儿科研究所，北京 100020;17 中国疾病控制预防中心 传染病研究所，北京 102206;18 中国科学院北京生命科学研究院，北京 100101;19 中国农业大学，北京 100083;20 北京大学，北京 100871 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划重点专项项目 (No. 2018YFC1603903) 资助。 |
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| 摘 要： | 在过去的十几年，微生物组相关研究和应用持续升温。微生物组逐渐成为生命科学、环境科学和医学等领域的研究焦点。与此同时，全球多个国家和组织也都积极发起各自的微生物组计划，进行多方面的布局，力争在这一具有广阔前景的领域获得战略地位。此外，无论是科研还是产业应用已经迎来了研究高潮和投融资热潮，微生物组相关产品和服务也不断出现。然而，行业在快速发展的同时，也存在一些不足。由于微生物组测序和分析相关技术和方法发展迅速，各国研究和应用尚未在技术、方案和数据等标准上达成统一，国内行业参与者对微生物组也存在认识不足，对微生物组相关新方法、新技术、新理论等还未能充分掌握和使用。除此之外，已有的一些标准和指南，内容过于简单，实操性也不足，这不仅给科研数据的整合造成了困难和资源浪费，还给相关企业进行不良竞争、以次充好提供了机会。更重要的是，我国尚缺乏微生物组相关的国家标准，国家微生物组计划仍处于筹备过程。在此背景下，中国生物工程学会、中国科学院微生物研究所于2019年6月至2020年3月，共同设立了“微生物组测序与分析专家共识”专项研究课题。中国生物工程学会组织了微生物组相关领域的27位专家以及来自行业内的30多位专业人员，通过分成4个项目小组、召开4轮研讨会后，最终形成了涵盖从微生物采集与保存、DNA提取与建库、高通量基因测序和数据分析以及质控标准品等全流程的“微生物组测序与分析专家共识”。本专家共识具有较强可参考性和可操作性，不仅能指导国内科研和产业机构规范进行微生物组相关产、学、研，还能为国家相关职能部门提供可参考的技术依据，保障规模型和规范化的企业利益，加强行业自律，避免不规范的企业扰乱市场，最终促进微生物组相关产业的良性发展。
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| 关 键 词： | 微生物组，高通量基因测序，专家共识，国家标准，微生物组计划 |
| 收稿时间： | 2020/6/26 0:00:00 |
Expert consensus on microbiome sequencing and analysis |
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| Yunfeng Duan,Shengyue Wang,Yubao Chen,Ruifu Yang,Houkai Li,Huaiqiu Zhu,Yigang Tong,Wenbin Du,Yu Fu,Songnian Hu,Jun Wang,Yuhua Xin,Fangqing Zhao,Yiming Bao,Wen Zhang,Juan Li,Ming Zeng,Haitao Niu,Xin Zhou,Yan Li,Shenghui Cui,Jing Yuan,Junhua Li,Jiayi Wang,Donglai Liu,Ming Ni,Qing Sun,Ye Deng,Baoli Zhu.Expert consensus on microbiome sequencing and analysis[J].Chinese Journal of Biotechnology,2020,36(12):2516-2524. |
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| Authors: | Yunfeng Duan Shengyue Wang Yubao Chen Ruifu Yang Houkai Li Huaiqiu Zhu Yigang Tong Wenbin Du Yu Fu Songnian Hu Jun Wang Yuhua Xin Fangqing Zhao Yiming Bao Wen Zhang Juan Li Ming Zeng Haitao Niu Xin Zhou Yan Li Shenghui Cui Jing Yuan Junhua Li Jiayi Wang Donglai Liu Ming Ni Qing Sun Ye Deng Baoli Zhu |
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| Institution: | 1 Institute of Microbiology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China;2 Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China;3 China Institute of Food and Drug Control-Vaccine Room, Beijing 102629, China;4 Beijing Computing Center, Beijing 100094, China;5 Food and Cosmetic Inspection and Testing Center, China Institute of Food and Drug Control, Beijing 102629, China;6 Research Center for Ecological Environment, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100085, China;7 Shanghai University of Traditional Chinese Medicine, Shanghai 201210, China;8 BGI Gene Research Institute, Shenzhen 518083, Guangdong, China;9 Institute of Biophysics, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China;10 China Institute of Food and Drug Control, Beijing 102629, China;11 Academy of Military Medical Sciences, Chinese Academy of Military Sciences, Beijing 100850, China;12 Institute of Medical Laboratory Animals, Peking Union Medical College, Beijing 100021, China;13 Beijing University of Chemical Technology, Beijing 100029, China;14 National Center for Translational Medicine, Ruijin Hospital, Shanghai Jiaotong University School of Medicine, Shanghai 200025, China;15 Institute of Microbiology and Epidemiology, Chinese Academy of Military Medical Sciences, Beijing 100012, China;16 Institute of Pediatrics, Capital Medical University, Beijing 100020, China;17 Institute of Infectious Diseases, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing 102206, China;18 Beijing Institutes of Biological Sciences, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China;19 China Agricultural University, Beijing 100083, China;20 Peking University, Beijing 100871, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | microbiome high-throughput gene sequencing expert consensus national standards microbiome project |
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