非酒精性脂肪性肝病

非酒精性脂肪性肝病(NALFD)是近年来愈来愈多被认知的肝相关联疾病之一。在北美及欧洲NAFLD已成为严重影响公共健康的课题。美国胃肠病学会(AGA)[1]和美国肝病学会(AASLD)[2]提出了临床诊断及治疗标准,现综述如下。NALFD的概念和命名1概念:脂肪肝分酒精性和非酒精性两类。人类发现肥胖的个体随肝内发生大泡性肝脂肪变(Macrovesicularhepaticsteatosis)并伴炎症性改变,继而发展并走向纤维化已有数十年,然而为多数学者所忽视,未被视为独立性疾病,直至近年来方认识此病。这种病人肝组织学检查呈现有与酒精性肝炎难以区别的变化,如大…     

基因组二代测序数据的自动化分析流程

二代测序技术的发展对测序数据的处理分析提出了很高的要求。目前二代测序数据分析软件很多, 但是绝大多数软件仅能完成单一的分析功能(例如：仅进行序列比对或变异读取或功能注释等), 如何能正确高效地选择整合这些软件已成为迫切需求。文章设计了一套基于perl语言和SGE资源管理的自动化处理流程来分析Illumina平台基因组测序数据。该流程以测序原始序列数据作为输入, 调用业界标准的数据处理软件(如：BWA, Samtools, GATK, ANNOVAR等), 最终生成带有相应功能注释、便于研究者进一步分析的变异位点列表。该流程通过自动化并行脚本控制流程的高效运行, 一站式输出分析结果和报告, 简化了数据分析过程中的人工操作, 大大提高了运行效率。用户只需填写配置文件或使用图形界面输入即可完成全部操作。该工作为广大研究者分析二代测序数据提供了便利的途径。     

低氮对金色奥杜藻色素-蛋白复合物特性及全细胞蛋白表达的影响

采用SDS-PAGE圆盘电泳分离技术, 研究两种氮浓度下17.6 mmol•L1 (高氮组)、5.87 mmol•L1 (低氮组)金色奥杜藻色素蛋白复合物的变化规律。结果表明, 从两种氮浓度所培养的金色奥杜藻细胞光合膜上, 均可分离得到6种色素蛋白复合物条带, 按照迁移速率从小到大依次为CPⅠa、CPⅠ、CPa1、CPa2、LHCP1、LHCP2。与高氮组相比, 低氮下电泳分离的复合物条带颜色明显变浅, 尤其CPⅠ、CPa1、CPa2三条带仅隐约可见。低温荧光发射光谱显示CPa1的荧光发射主峰也较高氮组蓝移10 nm左右,说明低氮主要影响光系统Ⅱ。双向电泳和质谱分析结果表明, 氮浓度降低后藻细胞中有6种蛋白表达下调, 3种蛋白表达上调, 这些差异蛋主要白涉及光合作用、氮素吸收、碳同化、能量转换等生理过程, 大多与维持叶绿体功能有关。     

沈北新区不同土地利用类型土壤磷酸酶活性特征及其影响因素分析

采用均匀网格布点法采集沈阳市沈北新区不同土地利用类型101个表层(0—20 cm)土壤样品, 测定了土壤磷酸酶活性、土壤理化性质和土壤细菌群落组成, 分析了不同利用类型土壤磷酸酶活性变化特征及其与土壤理化性质、土壤细菌优势菌群之间的关系。土壤酶活力测定结果表明, 沈北新区不同利用类型土壤磷酸酶活性由高到低依次为: 城市绿地>旱田>天然林地>水田; 相关分析结果表明, 土壤磷酸酶活性与土壤pH值、含水量、粘粒、粉粒、总磷呈极显著负相关关系, 与砂粒呈极显著正相关关系, 上述土壤理化性质是影响土壤磷酸酶活性的主要因素; 冗余分析结果表明, 疣微菌门(Verrucomicrobia)、放线菌门(Actinobacteria)和酸杆菌门(Acidobacteria)对土壤磷酸酶活性影响较大, 其菌群丰度主要受土壤pH、含水量和总磷的调控, 且其随土壤pH、含水量和总磷的变化特征与土壤磷酸酶活性变化趋势相一致, 提示这些菌群可能是土壤磷酸酶的重要来源。     

一种用于基因芯片可靠的RNA线性扩增技术

基因芯片是大规模表达谱分析的有力工具 ,有助于阐明疾病发生的分子机制及发现新的诊治靶标。但常规方法需要大量RNA ,每张芯片需要 5 0～ 2 0 0 μg总RNA ,2～ 5 μgmRNA。许多珍贵难得样本都不能满足这一要求 ,成为限制芯片广泛应用的瓶颈。结合模板转移效应 ,优化了基于T7的RNA线性扩增技术 ,可从 3μg以下总RNA得到足量的反义RNA ,克服了这一难题。同一RNA样本的自身比较试验结果显示反义RNA标记的芯片与总RNA、mRNA标记的芯片假阳性率相似。同一对RNA样本的表达谱分析也显示反义RNA标记的芯片与总RNA、mRNA标记的芯片无明显差异。     

应用寡核苷酸芯片并行检测CYP1A和GSTM1基因多态性

利用寡核苷酸芯片检测方法分析CYP1A单核苷酸多态性(SNP)和GSTM1缺失与否,实验结果证明了寡核苷酸芯片技术可并行、准确、高效地检测基因的单核苷酸多态性和其他类型的基因多态型,可为疾病遗传易感性及单体型的研究提供强有力的研究工具。采用该寡核苷酸芯片,检测了84份正常人的血液DNA样本,其中GSTMl基因缺失率达到47．6％,接近报道数值。统计分析发现,CYP1A m1-m2的3种基因型组合TT-AG、TT-GG和TC-GG的发生频率都为0,而根据实验得到的m1和m2各自基因型数据计算,它们的发生频率应是11．4％、2．6％和3．1％,所以推测在所检测的样本中没有T(m1位点)和G(m2位点)的连锁组合,即m1和m2位点的组合只有3种单体型：T-A、C-A和C-G,其发生频率分别是69．6％、7．7％和22．6％。     

结核分枝杆菌感染诱导的人巨噬细胞细胞因子及其调控基因的差异表达谱

研究人巨噬细胞细胞因子在抗结核分枝杆菌感染免疫中的作用。利用表达谱芯片技术研究细菌感染后,宿主巨噬细胞基因表达情况,在全局表达谱分析基础上,重点分析细胞因子及相关基因的表达,并比较无毒株和临床分离有毒株在诱导细胞因子及其调控基因表达方面的差异。结果显示细菌感染影响较多细胞因子及其调控基因的表达,如IFN、TNF、TGF、IL系列及其受体、NFkappa B和TLR受体等;首次报道IL19参与了抗结核分枝杆菌感染免疫。被临床株感染影响的细胞因子较无毒株广泛和丰富。细胞因子及相关基因参与了宿主细胞对感染细菌的免疫应答,有关细胞因子及相关基因在抗结核免疫中的作用有待进一步研究。     

贺兰山东坡典型植物群落多样性垂直分布特征与土壤因子的关系

深入探究山地生态系统植物群落多样性与关键土壤因子的关系及土壤因子在植物群落构建与多样性维持中的重要作用是区域生物多样性保护和生态系统服务功能综合提升的基础。本文采用冗余分析（Redundancy analysis,RDA）和相关分析揭示了贺兰山东坡典型植物群落多样性垂直分布格局与土壤因子的关系。结果表明：（1）贺兰山东坡植物群落多样性具有明显的垂直分布格局,针阔叶混交林植物物种组成最为丰富,中域效应明显;不同层次植物多样性随海拔升高变化趋势不一致且各自在不同海拔间差异显著（P<0.05）,植物多样性大体表现为草本层 > 灌木层 > 乔木层。（2）研究区土壤因子沿海拔梯度变化趋势不同,均存在显著差异（P<0.05）,其中土壤含水量（SM）、有机碳（SOC）和全氮（TN）含量空间变异性较大;高山灌丛草甸土壤养分含量最高,高海拔区土壤P限制高。（3）9个土壤因子解释了研究区总体植物多样性89.68%的生态信息,与植物多样性具有较强的相关性,影响不同层次植物多样性垂直分异的关键土壤因子略有不同。综上,土壤有机碳、pH、碳磷比、含水量是影响贺兰山东坡植物多样性空间分布的主要驱动因子。     

小麦雪霉叶枯病菌侵染过程的细胞学研究

采用电镜技术研究了小麦雪霉叶枯病菌(Gerlachia nivalis)侵染过程的细胞学特征。电镜观察发现,分生孢子萌发产生的芽管由孢子细胞壁内层延伸而成;病菌侵入寄主体内后,胞间菌丝先在寄主细胞间扩展,随后胞间菌丝侵入坏死的寄主细胞,形成胞内菌丝;胞间菌丝和胞内菌丝在形态结构上无明显差异。在病菌扩展过程中,寄主细胞发生了一系列的病理变化,并最终坏死消解,寄主细胞的变化可能与病菌分泌的毒素有关。     

磷对藻类生长及污水净化的影响

在室内模拟氧化槽中比较研究了污水中不同磷含量及氮磷比例对藻类生长及污水净化的影响。原污水中氮含量均为20mg/L,磷含量分别为1.25、2.50、5、10mg/L,结果发现原污水中的N/P为20/2.5时,藻类净生产量最高,污水净化效果最好。