3D医学图像中标志点的自动识别与定位

目的:探索建立一种新的自动识别标志点的方法.方法:本方法主要分成三步:首先,根据标志点的灰度特征在3D图像上搜索标志点,并得到候选点;然后,计算出搜索到的候选点区域的亮度重心,并作为该点的位置坐标;最后,根据标志点大小、相互间位置关系以及标志点周围区域像素的灰度变化等特征,筛选出真正的标志点.结果:利用该算法对三维理想模型和真实CT重建模型上的标志点进行识别,实验的结果表明该算法能准确识别出这两种模型上的标志点,平均误差均小于2个象素.结论:该方法能快速准确地识别出3D医学图像中的标志点,它不需要人为干预,且不受标志点形状的影响.     

利用P1、F1、P2、F2和F2:3家系五世代联合分离分析的拓展

在王建康等[3]的基础上拓展了利用P1、F1、P2、F2和F2：3家系5群体的2对主基因（B）和2对主基因 多基因（E）2类模型,为使拓展模型成为可能并提高分布参数估计值的精度,用IECM算法估计样本似然函数分布参数,通过重新分析3个大豆杂交组合抗豆秆黑潜蝇主茎虫量遗传资料证实了通过孟德尔氏遗传分析法所获得的结果,并得到存在多基因的统计学依据。     

基于Flexible ICA的睡眠EEG及EOG中心电伪差的消除

提出了一种采用自适应非线性函数的ICA学习算法,Flexible ICA算法,并将其应用于睡眠EEG自动分期的前期预处理中,用于消除采集到的各通道信号中的心电伪差.实验结果证明,Flexible ICA算法能够快速有效的消除各通道的心电伪差,为后期的睡眠EEG自动分期打下了良好的基础.     

隐马尔可夫模型-改进的预测蛋白质二级结构方法

引入蛋白质二级结构预测的新方法：隐马尔可夫模型,其中将蛋白质的二级结构分成三类：H(指α-螺旋),E(β-折叠)及O(包括转角,卷曲及其结构)．该方法属于统计方法,但考虑了相邻氮基酸之间的相互作用(体现在状态传输概率)．通过模型的改进及参数的确定后,我们编制了程序HMMPS．用它来预测蛋白质二级结构,具有很高的准确度．其中关于H,F和O的准确率分别达到80．1％．72.0％和63．2％这表明．我们的方法是较为可靠的。     

隐半马氏模型在3'剪接位点识别中的应用

新近的基因识别软件比先前的软件有着显著的提高,但是在外显子水平上的敏感性和特异性仍然不十分令人满意.这是因为已有软件对于剪接位点,翻译起始等生物信号位点的识别还不够有效.如果能够分别提高这些生物信号位点的识别效果,就能够提高整体的基因识别效率.隐半马氏模型能够很好地刻画3'剪接位点(acceptor)的结构.据此开发的一套对acceptor进行识别的算法在Burset/Guigo的数据集上经过检验,获得了比已有算法更好的识别率.该模型的成功还使得我们对剪接点上游的分支位点和嘧啶富含区的概貌有了一定的认识,加深了人们对于acceptor的结构和剪接过程的理解.     

隐半马氏模型在 3′剪接位点识别中的应用(英文)

新近的基因识别软件比先前的软件有着显著的提高 ,但是在外显子水平上的敏感性和特异性仍然不十分令人满意 .这是因为已有软件对于剪接位点 ,翻译起始等生物信号位点的识别还不够有效 .如果能够分别提高这些生物信号位点的识别效果 ,就能够提高整体的基因识别效率 .隐半马氏模型能够很好地刻画 3′剪接位点 (acceptor)的结构 .据此开发的一套对acceptor进行识别的算法在Burset/Guigo的数据集上经过检验 ,获得了比已有算法更好的识别率 .该模型的成功还使得我们对剪接点上游的分支位点和嘧啶富含区的概貌有了一定的认识 ,加深了人们对于acceptor的结构和剪接过程的理解     

城市病诊断与城市生态系统健康评价

在总结国内外城市病现象和病因的基础上,提出了城市生态系统健康的五大功能,即承载力、支持力、吸引力、延续力和发展力,概括为CSAED模型,分析了与此相对应的限制城市功能的瓶颈因子,将城市病的各项病征与城市功能相联系,并以此为基本框架,构建了城市病诊断和城市生态系统健康的评价体系.基于城市生态系统的发展目标,将梯度型隶属度函数、改进均方差法、加权欧氏距离算法等进行综合集成,建立了一套便于推广比较的城市生态系统健康评价模型算法.以北京市为案例,进行了城市病的单因子诊断和城市生态系统健康评价,计算了北京市1999～2005年的城市生态系统健康指数,并分析了北京市发生城市病的原因、城市病所处的阶段等.研究对于我国城市病诊断与解决,以及城市生态系统健康评价具有重要参考意义.     

景观生态安全格局的算法改进与应用

景观安全格局是一种有效的生物保护途径, 其构建应以生物运动的生态过程为基础。本文基于最小累积阻力模型, 运用效用公式法对景观安全格局中的缓冲区识别方法进行探索, 运用梯度算法对生态廊道(源间联结和辐射道)的识别方法进行了改进。结果表明, 在缓冲边界外的低阻力区且与源有一定距离但适合目标保护物种生存的生境孤岛可作为源的潜在区, 缓冲区边界内的高阻力区且与源距离较近但不适合目标保护物种生存的区域则可划分为生态修复区, 在生态廊道上与高阻力点交叉部分可识别为生态修复关键点。以武陵源风景名胜区为例, 构建了以猕猴(Macaca mulatta)为目标保护物种的景观安全格局, 建立了以4个离散分布的猕猴栖息地为源及其3个潜在区为补充的核心保护区域, 划定了多条辐射道和源间联结以改善栖息地之间的连通性, 并识别出了多个生态修复关键点。本文对景观安全格局中缓冲区和生态廊道的识别方法进行了改进, 在武陵源风景名胜区猕猴保护中的运用也具有生物保护上的实践价值。     

利用家系群体鉴定数量性状多基因的存在

通过重复试验方差分析获得误差方差以探索只利用B、：2和B2：2或F2：3家系世代鉴定多基因存在的方法,混合分布参数的估计采用IECM算法,以油菜株高B1：2和B2：2家系平均数资料和千粒重F2：3家系平均数资料为例阐明该方法。     

构建微生物分子分类系统进化树的快速运算法与数据结构

本文介绍了构建系统进化树的NJ方法（NeighborJoiningMethod）所涉及的算法与数据结构。文中给出了基于数据复用性的算法改进,获得了快速算法──FNJ算法,从而将算法的时间复杂度由（N⁵）降低为（N³）;并给出了自动绘制进化分枝图的算法。