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运用mRNA差异显示技术对AA肉鸡和北京油鸡脂肪组织基因的差异表达进行研究,从分子遗传学角度分析导致两品种脂肪组织差异表达的原因,对了解性状形成的遗传基础和调控机理是十分必要的。通过反Northern杂交验证共筛选出脂肪组织差异表达基因10条,经与GenBank数据库进行相似性比对,XF1 与已知基因有较高同源性,该基因是人类cDNA全长开放阅读框(ORF)的一段; XF2、YF1、YF2及YF4经与nr数据库进行同源性比对,均可找到同源性较高的基因,但功能未知;XF4 与克隆人类胎盘CL0BA010ZF08基因的一段cDNA序列同源性为83%;YF3与预测原鸡MLL5 (LOC417712)基因有一定的同源性,目前尚无功能报道;XF5和YF5 与原鸡高迁移率族蛋白(HMGN3)有较高同源性;XF3 在nr库中未找到同源序列,确定为新发现的EST,提交数据库获得GenBank登录号(Accession number: EU594549)。为进一步研究北京油鸡与AA肉鸡脂肪组织差异基因的功能与脂肪发育的关系奠定基础。 相似文献
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中度嗜盐菌DTY1的鉴定及其耐盐机制的初步分析 总被引:7,自引:0,他引:7
中度嗜盐菌DTY的鉴定及其耐盐机制的初步分析 《微生物学报》2006,46(6):956-960
菌株DTY1分离自山西省五寨县柠条种植区盐碱土壤,可在0~1·2mol/LNaCl的浓度培养基上生长,最适生长温度32℃,最适pH7~10。通过形态观察,生理生化测定与16SrDNA序列分析,将该菌株鉴定为嗜碱芽孢杆菌(Bacillusalcalophilus)。高压液相色谱分析,DTY1菌株在常规LB培养液中能够产生1·40mg/g四氢嘧啶,且在最适盐浓度条件下,盐浓度越高单位干重菌体所产生的四氢嘧啶含量越高。通过PCR介导的方法从DTY1的基因组文库中克隆到四氢嘧啶合成基因ectB。该基因长度为1284bp,编码427个氨基酸的肽链。此肽链与B.haloduransC-125(BAB04638)中二氨基丁酸氨基转移酶同源性达81%。ectB基因可能存在典型的σ70启动子,而且在启动子间有一段明显的23bp的回文序列。 相似文献
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不同单细胞全基因组扩增方法的比较及MALBAC在辅助生殖中的应用 总被引:1,自引:0,他引:1
单细胞全基因组扩增(whole genome amplification, WGA)是指在单细胞水平对全基因组进行扩增的新技术,其原理是将分离的单个细胞的微量全基因组DNA进行扩增,获得高覆盖率的完整的基因组后进行高通量测序,用于揭示细胞异质性。目前,WGA方法主要包括引物延伸预扩增(primer extension preamplification PCR, PEP-PCR)、简并寡核苷酸引物PCR (degenerate oligonucleotide primed PCR, DOP-PCR)、多重置换扩增(multiple displacement amplification, MDA)、多次退火环状循环扩增(multiple annealing and looping-based amplification cycles, MALBAC)等。本文对不同的单细胞WGA方法的原理及应用情况分别进行了阐述,并对其扩增效率进行评价和比较,包括基因组覆盖度、均一性、重现性、SNV (single-nucleotide variants)和CNV (copy number variants)检测力等。综合对比不同单细胞WGA方法后发现,MALBAC的扩增均一性最高、等位基因脱扣率最低、重现性最好,且对于CNV和SNV的检测效果最好。本文还阐述了MALBAC技术在人类单精子减数重组、非整倍体分析以及人类卵细胞基因组研究中的应用。 相似文献
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【背景】鸽新城疫是由鸽Ⅰ型副黏病毒(pigeon paramyxovirus type Ⅰ,PPMV-1)感染引起的危害最严重的疫病之一,至今尚无有效的防控制剂。【目的】分析鸽新城疫病毒BJ-C株的基因组信息及系统发育关系,为鸽新城疫的防控提供科学依据。【方法】设计首尾重叠的6对特异性引物,利用分段扩增的方法,以鸽新城疫病毒BJ-C株基因组cDNA为模板,分别扩增、测序后进行全基因组序列拼接。以NCBI数据库中发布的新城疫病毒序列为参考,针对鸽新城疫病毒BJ-C株的基因组、F基因建立系统发育树。【结果】鸽新城疫病毒BJ-C株的基因组全长为15192nt。基于全基因组的系统发育分析发现其与PPMV-1/BJ-01/CH株的系统发育关系最近,核苷酸相似性为99.96%,氨基酸相似性高达100%,属于同一个分支,而与LaSota疫苗株等其他新城疫毒株的亲缘关系相对较远。基于F基因序列的系统发育树分析发现BJ-C株F基因与我国的BJP2013株同属一个分支。ClassⅡ类Ⅵ亚型F基因高变区序列(47-420nt)比对结果显示,安徽株Pigeon/Anhui/2369/2012、广东株Pigeon/Guangdong/GZ288/2013、北京株BJP13、浙江株Pigeon/Zhejiang/2036/2012及比利时株PPMV-1/Belgium/11-09620/2011等与BJ-C毒株处于同一个分支,同属Ⅵb亚型。【结论】本研究获得了鸽新城疫病毒BJ-C株全基因组序列,分析了其系统发育关系,确定其属于ClassⅡ类Ⅵb型,为后续防控产品的开发提供了理论依据。 相似文献
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哺乳动物的生殖功能受体内状态和外部环境综合作用的影响,这种综合作用通过错综复杂的神经内分泌系统最终汇集于促性腺激素释放激素(GnRH)系统从而影响下丘脑-垂体-性腺(HPG)轴的状态。神经激肽B(NKB)目前被认为是除kisspeptin外,调控GnRH脉冲分泌的又一关键因子。大量研究证实,NKB能够影响GnRH和促黄体激素(LH)的分泌,进而影响青春期的启动和生殖功能。然而,NKB对LH分泌的影响是刺激作用还是抑制作用尚存在争论。此外,NKB如何作用于GnRH神经元的信号通路尚不清楚,性激素是否参与这一生理过程,是目前的研究热点问题之一。本文就NKB及其受体的分布、神经网络结构、NKB对GnRH脉冲发生器的作用进行了系统的阐述,并针对目前尚待解决的一些问题进行了探讨。 相似文献
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猫麻疹病毒(Felinemorbillivirus,FeMV或FmoPV)是副黏病毒科(Paramyxoviridae)麻疹病毒属(Morbillivirus)中新发现的病毒,通常在患有泌尿系统疾病的家猫尿液中检出,且在世界范围内分布广泛,但FeMV和肾脏疾病之间的联系存在争议。此外,该病毒的组织嗜性、致病过程以及吸附入侵宿主细胞的机制也尚未明晰,但与同属的其他麻疹病毒具有一定共同特征,如信号淋巴细胞激活分子家族成员1(Signalling lymphocyte activation molecule family member 1, SLAMF1)可提高宿主细胞对FeMV的敏感性。本文从FeMV的发现出发,总结了FeMV病原学、流行病学以及致病特点,并归纳讨论了其与肾小管间质肾炎(Tubulointerstitial nephritis, TIN)的潜在联系,以期为深入揭示FeMV致病机制提供一定的参考。 相似文献