扬子鳄与密河鳄基因组DNA的复性动力学和组织结构的研究

通过DNA复性动力学的分析,测定了扬子鳄和密河鳄基因组的组织结构,两者的复性曲线非常相象,高度重复DNA含量很少,而中度重复DNA序列各占基因组的30％左右。中度重复序列部分能再分成三个组分,虽然每个组分的序列复杂性和拷贝数有差别,但每部分的总复杂性是相似的。我们已测得扬子鳄基因组的单拷贝序列为3.68×10’bp,基因组为5.65×10’bp;密河鳄基因组的单拷贝序列为3.67×10’bp,基因组为5.24×10’bp。根据基因组的组织结构的分析,在分子水平上表明两种鳄鱼是亲缘关系十分相近的种。     

扬子鳄的起源

介绍了现存鳄彼此间的亲缘关系、扬子鳄起源的时间和地点。主要结论可归纳如下：①现存鳄类在科、属、种分类上都存在不同意见;②扬子鳄与密河鳄被分在同一属内,但两者之间的亲缘关系存在争议,两者在形态、生化、细胞、分子生物学上差异很大;③Stell认为扬子鳄在中新世开始出现,作者认为它可能起源于渐新世或中新世早期;④Stell认为分布于北美的汤氏鳄（A.thomsoni)可能是扬子鳄的祖先类型,而另一些学者认为扬子鳄起源于亚洲的可能性更大些。     

扬子鳄的保护遗传学研究进展

保护遗传学是主要研究与灭绝风险相关的遗传因素以及如何利用遗传学管理方法降低物种灭绝风险的科学,是保护生物学和分子遗传学的交叉学科.近几十年来,遗传学研究在生物多样性保护的理论和实践中发挥着越来越重要的作用.本文回顾了AFLP、mtDNA D-loop、RAPD、微卫星DNA、MHC等DNA分子标记技术在扬子鳄的样品采集、生物多样性、个体鉴定、繁殖管理、野外放归等保护遗传学方面研究所取得的一些进展.对扬子鳄保护的工作提出了建议:重建扬子鳄的谱系;加大对扬子鳄的放归力度;加强饲养种群之间的基因交流;借鉴密河鳄的管理经验.     

从1 2S rRNA基因序列探讨8种鳄类的系统学关系

测得扬子鳄（Alligator sinensis）和暹罗鳄（Crocodylus siamensis）,的mtDNA12SrRNA基因片段的部分序列,与GenBank中的2种鳄及文献中4种鳄的12SrRNA基因相应片段,经比对后构建系统树。其结果显示,现存鳄类为单系起源,可划分为3个科,即：鳄科、食鱼鳄科和假食鱼鳄科。食鱼鳄与假食鱼鳄亲缘关系较近,支持将假食鱼鳄作为食鱼鳄科的一个属,与以形态学为基础的研究结果不同。在钝吻鳄科中,扬子鳄与凯门鳄亲缘关系较远,而与密西西比鳄的亲缘关系虽较近,但它们的确存在很多差异。两者12SrRNA基因序列差异达12．12％,碱基的颠换数为9。在基于碱基转换和颠换的NJ系统树及仅基于碱基颠换的NJ系统树中,前者支持扬子鳄与密河鳄间的亲缘关系较近,而后者支持扬子鳄与凯门鳄间的亲缘关系较近,说明扬子鳄与密河鳄间亲缘关系是值得研究的问题。因本文仅根据12SrRNA基因部分序列来进行分析的,尚需进一步研究。     

人工驯养下扬子鳄的生长规律

研究结果表明扬子鳄在饲养条件下的生长具有一定的规律性。饲养群体中,5龄以前的鳄生长速率较快,其中在2龄前生长速率最快,在5龄至7龄间生长速率明显减慢;鳄体长与体重之间呈正相关,两者在体长小于50cm时呈直线相关,体长大于50cm时呈曲线相关。不同性别的扬子鳄年生长状况不同,从5龄开始雌雄鳄体重出现显著差异,雄鳄重于雌鳄;从6龄开始雌雄鳄在体长方面的生长速率出现差异,雄鳄生长明显快于雌鳄;达到10龄后,雌雄鳄在体长和体重方面的增长均明显减慢,达到15龄时两者的体形已相差悬殊,雄性大于雌性。由von Berta-lanffy生长模型分析,雌鳄达到25龄而雄鳄达到35龄后,各自的体长几乎停止生长,雌鳄平均最大体长为173cm,雄鳄平均最大体长为219cm。在人工越冬下,除第一次越冬外,扬子鳄在越冬室内的冬眠中体况无明显变化,体能明显消耗出现在户外冬眠过程中。本研究为扬子鳄的科学化饲养提供理论依据。     

几种鳄分子系统发生的探讨

百年来关于扬子鳄的分类学位置存在着很多争议,本测得扬子鳄、暹罗鳄和湾鳄的mtDNA ND4和Cytb基因,并从GenBank中获得密西西比鳄和海龟的DN4基因和Cytb基因相应片段。用Clustal X1.8进行对位排列,以海龟为外群构建分子进化系统树。结果显示,在鳄类动物中,扬子鳄与密西西比鳄的亲缘关系最近,两ND4基因序列碱基差异的20．68％,而Cytb基因序列碱基差异为14．43％,但扬子鳄与密西西相比与鳄的分类问题仍将有待进一步探讨。     

评介《扬子鳄》一书

由安徽师范大学陈璧辉等同志编著的《扬子鳄》专著,最近已由安徽科学技术出版社出版,它是作者对我国特产濒危物种扬子鳄进行近十年研究工作的总结。全书约26万字,附有插图159幅、生态彩色照片4版,包括绪论、形态学、生态学和人工饲养与繁殖等四章。绪论一章对扬子鳄的分类地位和系统进化作了简介;概述了从三千多年前至1984年国内外对扬子鳄的研究历史、分布、数量及历史变迁;介绍了有关鳄类形态学、染色体、某些蛋白质和抗体差异性的研究进展,并综合各家观点对世界上现存的21种鳄类的亲缘关系进行了讨论,提出有关系谱图解。     

中国扬子鳄（Aligator sinensis）物种资源现状

１９９４年８～９月,对安徽扬子鳄国家级自然保护区扬子鳄资源进行了抽样调查,见到有鳄活动痕迹的洞口１０４个,用光点计数法实见鳄７７条,访问法计数为２５３条,由此分析保护区内有鳄６６７～７４０条,其种群年龄锥体为上宽下窄,反映出扬子鳄在野外生存形势严峻。该年,安徽省扬子鳄繁殖研究中心存鳄４３７６条,其中种鳄２４８条,孵化幼鳄１５４２条,其它不等龄鳄２５８６条,种群年龄锥体为上窄下宽,是一个迅速增长的种群,生存形势良好     

中国扬子鳄(Alligator sinensis)物种资源现状

1994年8～9月,对安徽扬子鳄国家级自然保护区扬子鳄资源进行了抽样调查,见到有鳄活动痕迹的洞口104个,用光点计数法实见鳄77条,访问法计数为253条,由此分析保护区内有鳄667～740条,其种群年龄锥体为上宽下窄,反映出扬子鳄在野外生存形势严峻。该年,安徽省扬子鳄繁殖研究中心存鳄4376条,其中种鳄248条,孵化幼鳄1542条,其它不等龄鳄2586条,种群年龄锥体为上窄下宽,是一个迅速增长的种群,生存形势良好。     

基于BDNF和NT-3基因部分序列探讨爬行动物系统发生中的若干问题及扬子鳄分类地位

通过两个核基因NT-3基因(约740 bp)和BDNF基因部分序列(约720 bp)的分析,对爬行动物的系统发生关系中鳄类与鸟类和哺乳类系统发生关系、龟类在爬行动物系统发生中的位置以及扬子鳄属的划分等问题进行探讨.结果表明,在NT-3基因序列中,有307个位点存在变异(约为总位点数的47.3%),BDNF基因序列有256个变异位点(约为38.79%);构建的分子系统树显示,NT-3和BDNF基因以及两序列合并数据后所得系统树的拓扑结构均支持鳄类和鸟类聚为一支构成姐妹群,鳄类与蜥蜴类尽管在形态上非常相似,但它们的亲缘关系仍然较远;同时支持把龟鳖类作为鳄类和鸟类支系的姐妹群,支持把蜥蜴类(有鳞类)放在爬行类系统发生树的基部,而不是龟鳖类作为现代爬行类中最基部的1支.对扬子鳄分类地位的研究结果支持在现存的鳄类中扬子鳄与密西西比鳄的亲缘关系较近的结论.     

扬子鳄:中国的也是世界的

扬子鳄是目前我国现存的唯一特产鳄种,被列为国家Ⅰ级重点保护野生动物,世界自然保护联盟(IUCN)更是将扬子鳄列为全球23种鳄鱼中最濒危的鳄类。扬子鳄有着顽强的生命力,曾与恐龙共同生活过一亿多年并延续至今便是最好的明证。但是,自20世纪中叶以来,随着人类活动影响的逐渐加剧,其种群数量和分布地域呈急速锐减的态势。扬子鳄.这一珍贵的孑遗物种徘徊在了灭绝的边缘。1980年,在精心饲养条件下,扬子鳄产下了中国第一批幼鳄,成为人工饲养条件下繁殖成功的先例。1982年安徽省扬子鳄     

麝,獐,麂和鹿间线粒体DNA的差异及其系统进化研究

用PCR技术和序列测定方法从线粒体DNA上得到367bp的细胞色素b基因片段序列。分析得出,麝与獐、麂和鹿的遗传差异在12．53％～14．44％之间,处在科间变化范围之内,在分子水平上进一步表明麝应作为一独立科;獐、麂和虎间序列的平均差异为10．28％,属于业科间的差异,与形态研究结果一致。麝、獐、麂和鹿的系统进化中,麝约在600万年前与鹿科分歧,而鹿科的三个亚科是在350～500万年开始分歧;麝、獐、麂和鹿共同组成一单系群．在600万年前具有一共同祖先。     

人工条件下越冬扬子鳄的繁殖

2003年11月~2004年9月在安徽省扬子鳄繁殖研究中心,观察了人工养殖的成年扬子鳄(Alligatorsinensis)在饲养池和模拟自然生态环境的繁殖区中越冬后的繁殖行为。结果表明,在与扬子鳄自然洞穴的温度和水分条件相似但其他条件相差很大的人工环境中冬眠的扬子鳄具有繁殖能力。越冬后,这些鳄只能在具备其栖息地环境特点的场地成功繁殖,但不能在不具备这种环境特点的场地成功繁殖。本研究拓展了扬子鳄的人工繁殖技术,为扬子鳄人工繁殖场地的兴建提供参考资料。     

守护龙脉

扬子鳄在分类上属于鳄目鼍属。鳄类是现存爬行动物中与恐龙亲缘关系最为密切的动物类群,它们在漫长的2亿多年的演化道路上．凭借自己的机智勇敢、高度适应环境和尽力抚养后代的本领．顺利通过生存竞争中一个个要塞险关存活至今．故扬子鳄又有“活化石”的美称。作为古代爬行动物的孓遗类群．对鳄类进行科学研究．分析它们对环境变化的动态适应机制,以及通过它们了解中生代恐龙灭绝之谜等．均具有明显的科学价值。     

几种鳄分子系统发生的探讨

百年来关于扬子鳄的分类学位置存在着很多争议,本文测得扬子鳄、暹罗鳄和湾鳄的mtDNAND4和Cytb基因,并从GenBank中获得密西西比鳄和海龟的ND4基因和Cytb基因相应片段.用ClustalX1.8进行对位排列,以海龟为外群构建分子进化系统树.结果显示:在鳄类动物中,扬子鳄与密西西比鳄的亲缘关系最近,两者ND4基因序列碱基差异为20.68%,而Cytb基因序列碱基差异为14.43%;但扬子鳄与密西西比与鳄的分类问题仍将有待进一步探讨。 Abstract:A portion of mitochondrial ND4 and cytochrome b gene of 3 species of erocodilian was sequenced.Additional homologous sequences of Alligator mississippinisis from GenBank were aligned together and compared with Cheloniamydas.The phylogenetic trees were reconstructed with the neighbor-joining (NJ) algorithm.Alligator sinensis ismore related to Alligator mississippinesis than others though the diversity of their mitochondrial ND4 gene reached 20.68% while Cyt b gene 14.43%.It needs further study to determine the phylogenetic relationships of Alligatorsinensis and Alligator mississi ppinisis.     

野放前候选扬子鳄泄殖腔的细菌鉴定

扬子鳄(Alligator sinensis)是中国濒危的物种,野生鳄种群已濒临灭绝。通过放归工程,将挑选饲养鳄放养到野外去扩大野生种群。本文的研究目的是通过检测扬子鳄的健康状况为扬子鳄的筛选提供依据。从 25 条准备进行野放的扬子鳄泄殖腔中筛选出 13 种形态不同的菌株。应用细菌学和分子生物学方法,鉴定它们分别属于 6个属的 8 个种和一个未分类的菌;从扬子鳄生活的水体中筛选出 8 种形态不同的菌株,鉴定它们分别属于 1 个属的 4 个种。经分析,除了未分类的菌之外,从扬子鳄泄殖腔中分离得到的菌株都是非致病性的且不同于扬子鳄生活水体中分离的菌株,因此可以认为这些扬子鳄是健康的,可以野放。由于从标记为 AS12 的扬子鳄体内分离到一个分类地位尚未确定的菌,对它的生理生化特征进行了检测,但这种菌的致病性方面特征尚不清楚,建议不考虑野放标记为 AS12 的扬子鳄个体。     

活化石——扬子鳄

世界上的鳄类有二十五种左右,著名的有恒河鳄、短鼻鳄、澳鳄、西鳄、暹罗鳄、古巴鳄、眼镜鳄以及尖鼻鳄。生活在我国的只有一种——扬子鳄。它的分布又仅仅限于安徽、江苏、浙江三省部分地区的河流里。扬子鳄是一种极古老的爬行动物,它生存至今已有二亿多年的历史了。扬子鳄的全身被厚厚的一层角质骨板所包裹,平时喜欢栖息于湖泊沼泽的滩地,或丘陵山洞的乱草蓬蒿中的潮湿地带。它的行动往往给人以假象——行动迟钝;有人形容鳄鱼行进时,不用身体贴地向前爬行,而是踉跄蹒跚、四足伸张,身体浮起、尾拖于地……可是扬子鳄一旦碰到敌害或看到食物,会立即将粗大的尾巴用力左右甩动,这样,它不但在水中     

分子钟及其存在的问题

有关分子钟的理论是目前分子进化研究中的热点问题之一。虽然分子钟假说自提出之后对其合理性的怀疑一直存在 ,但目前分子钟在分子系统发育关系重建中有着越来越广泛而深入的应用 ;为了帮助人们消除对分子钟的误解及了解应用中可能存在的问题 ,本文简述了分子钟的概念、对分子钟假说合理性的挑战、引起分子异速进化的原因、如何建立正确的分子钟以及如何在系统关系重建时合理地应用这个概念的一些简要原则     

扬子鳄研究进展

早在３０００年前,我国的甲骨文字就有关于扬子鳄的记载,但直到１８７９年才由福韦尔（Ｆａｕｖｅｌ）命名为Ａｌｉｇａｔｏｒｓｉｎｅｎｓｉｓ而公诸于世。有关扬于鳄的研究,开始于２０世纪７０年代,８０年代和９０年代先后在扬子鳄生态学、组织学、胚胎学等方面取得...     

野放前候选扬子鳄泄殖腔的细菌鉴定(英文）

扬子鳄(Alligator sinensis)是中国濒危的物种,野生鳄种群已濒临灭绝。通过放归工程,将挑选饲养鳄放养到野外去扩大野生种群。本文的研究目的是通过检测扬子鳄的健康状况为扬子鳄的筛选提供依据。从25条准备进行野放的扬子鳄泄殖腔中筛选出13种形态不同的菌株。应用细菌学和分子生物学方法,鉴定它们分别属于6个属的8个种和一个未分类的菌;从扬子鳄生活的水体中筛选出8种形态不同的菌株,鉴定它们分别属于1个属的4个种。经分析,除了未分类的菌之外,从扬子鳄泄殖腔中分离得到的菌株都是非致病性的且不同于扬子鳄生活水体中分离的菌株,因此可以认为这些扬子鳄是健康的,可以野放。由于从标记为AS12的扬子鳄体内分离到一个分类地位尚未确定的菌,对它的生理生化特征进行了检测,但这种菌的致病性方面特征尚不清楚,建议不考虑野放标记为AS12的扬子鳄个体。