柳蚕卵黄原蛋白cDNA的克隆及序列分析

经RT-PCR和RACE合成了柳蚕卵黄原蛋白(Vg)cDNA,经序列分析其长度为5701个碱基,由一个ORF组成,编码了1 774个氨基酸。氨基酸序列中有2个保守的多聚丝氨酸区域。并推测氨基酸序列中有8个天冬酰胺连接的糖基化位点(N-linked glycosylation sites)。与樟蚕、天蚕、柞蚕、野桑蚕、家蚕、樗蚕、蓖麻蚕的VgcDNA序列比对后发现有很高的同源性,分别为83.1%、81.1%、81.0%、64.7%、64.6%、79.7%、79.2%,同其它昆虫Vg cDNA序列也具有很高的同源性。根据7种蚕(家蚕、天蚕、柞蚕、蓖麻蚕、樟蚕、野桑蚕、樗蚕)VgcDNA序列建立了系统发生树。     

芹菜(Apium graveolens L.)叶细胞质5SrRNA的序列测定

应用Gupta等和Tanaka等建立的RNA序列双向直读技术,并辅以部分酶解法、化学法等,测定了芹菜叶细胞质的5SrRNA的全序列:与菠菜和蕃茄细胞质已知5SrRNA序列进行了比较,发现它们之间在序列上有高度的保守性。     

蓖麻蚕脑激素作用的研究

蓖麻蚕(Philosamia cynthia,ricini)原产印度,是多化性的昆虫,在一生任何阶段中都不滞育,因此在生产实践上,解决蓖麻蚕越冬是一个重要的问题。一种野生的樗蚕(Philo-samia cynthia walkeri)和蓖麻蚕的血缘很近,是同一种中的不同亚种,但以蛹越冬。在阐明昆虫以蛹态滞育的生理机制上,有Williams(1946,1947,1952)在一种大型的天蚕蛾(Platysamia cecropia)的试验。他发现 P cccropia的蛹态滞育是由脑激素停止分泌所引起的。福田(1958)在蓖麻蚕和樗蚕的蛹脑移植试验上,证实了蓖麻蚕的多化性和樗蚕的     

杂交蚕后代的5S rRNA一级结构

本文用化学降解和核糖核酸酶降解凝胶电泳直读法,测定了广西蚕业指导所用人工授精方法获得的蓖麻蚕(Philosamia cynthia ricini♂)和家蚕(Bombyx mori ♀,)的杂交第六代个体(具有花斑)的5SrRNA的一级结构。以同法测定了其母本家蚕5S rRNA的一级结构。结果见到两者一样,说明杂交蚕的 5S rRNA基因来自母本。它们的结构与Komiya等(1981)测定的未知品种家蚕5S rRNA有二个核苷酸的差别。     

基于18S rRNA和线粒体16S rRNA基因序列的柳蚕进化分析

为探讨柳蚕Actias selene Hübner与鳞翅目昆虫的系统发育关系,本研究利用PCR扩增获得了柳蚕核糖体18S rRNA和线粒体16S rRNA基因的部分序列,长度分别为391bp和428bp。并采用邻近距离法(NJ)、最大简约法(MP)、类平均聚类法(UPGMA)构建系统进化树。结果表明,柳蚕线粒体16SrRNA基因序列与大蚕蛾科昆虫的16SrRNA基因序列均表现出偏好于碱基AT的倾向。柳蚕与所研究的其它蚕类的遗传距离介于0.016至0.140之间,其中与温带柞蚕Antheraea roylii的遗传距离最小,与野桑蚕Bombyx mandarina的遗传距离最大。而基于鳞翅目昆虫18S rRNA基因部分序列的进化分析显示,柳蚕与柞蚕Antheraea pernyi之间的遗传距离最小(0.010),与蓖麻蚕Samia ricini的遗传距离最大(0.017)。     

樗蚕与柳蚕

由于蓖蔴蚕与柞蚕推广饲养,要适应当地的气候与饲料的条件,才能成功,如果能找到和它们相近的种类进行杂交试验,以提高其生活力,便有着重要的意义。樗蚕与蓖蔴蚕杂交,已经中国科学院试验成功;柳蚕经华东工学院试验,其蚕茧可供纺织用,但柳蚕比柞蚕丝量少,品质差,如能把柞蚕与其相近的柳蚕杂交,来提高柞蚕的生活力,却是很有价值的。     

利用纳米孔测序鉴定蓖麻蚕病害

蓖麻蚕Samia ricini为大蚕蛾科樗蚕属的绢丝与食用的非滞育型经济昆虫,且是少数可以室内大量圈养的绢丝昆虫,全年可累代饲养.在蓖麻蚕室内大批量圈养的生产过程可能遭受毁灭性病害的侵害,包括蓖麻蚕微粒子病、脓病、软化病等,且随着累代对病原物的不停积累蚕病会呈现愈发严重的趋势,病原愈发难以清除.因此,对蚕病的监测是防控蚕病爆发的重要手段之一.掌上纳米孔测序仪MinION是一款便携式高通量测序平台,便于实地进行DNA测序并对病原物进行检测.本文通过MinION测序仪对蓖麻蚕病蚕DNA进行测序,并对未知病原物DNA序列进行分析,探讨了利用MinION测序仪鉴定蓖麻蚕病原的可行性,对蚕病的监测提供了保障.     

大黄鱼16SrRNA和18SrRNA基因的测定与序列分析

利用多对引物,扩增并测定出大黄鱼16SrRNA基因和18SrRNA基因的部分序列,其长度分别为1202bp和1275bp,16SrRNA基因序列的GC含量为46．12％,18SrRNA基因的Gc含量为53．oo％。将大黄鱼16SrRNA基因序列与GenBank中15种硬骨鱼类的同源序列结合,同时将其18SrRNA基因序列与GenBank中9种脊索动物的同源序列相结合,运用软件获得各自序列间差异百分比,转换和颠换数值等信息。基于这两种基因序列,利用NJ法和BI法,分别构建16种硬骨鱼类和10种脊索动物的分子系统树。18SrRNA构建的系统树包括三大支,一支为哺乳类、鸟类和爬行类共6个物种,一支为两栖类的1个物种,另一支为2种硬骨鱼类。16SrRNA构建的系统树显示大黄鱼所在的石首鱼科与鲈科和盖刺鱼科亲缘关系较近。此外还讨论了这两个基因的序列特征。     

仙人掌丛枝病植原体CWB1株系16SrRNA基因克隆及序列分析

对表现丛枝症状的仙人掌植株总DNA进行植原体 1 6SrRNA基因PCR扩增 ,得到一条约 1 5kb的特异片段 ,表明植株中有植原体存在 ,将此植原体株系命名为CWB1。把此特异片段与pGEM Teasy载体连接并转化到大肠杆菌JM1 0 9感受态细胞中 ,通过PCR鉴定、限制性内切酶 (EcoRI)酶切分析及核苷酸序列分析 ,均表明克隆成功。序列分析结果显示 ,此株系的 1 6SrRNA基因全长 1 489个碱基 ,与属于植原体 1 6SrⅡ C亚组的Fababeanphyllody植原体同源率最高 ,为 99 7%。通过 1 6SrRNA基因核酸序列同源性比较 ,认为该株系属于 1 6SrⅡ C亚组 ,基本确定了其分类地位。     

向日葵rRNA基因克隆及其染色体定位研究

该研究以内葵杂3号三交种为材料,采用同源序列法克隆了5SrRNA和18SrRNA基因并进行了序列测定,测得片段长度分别为515bp和1808bp。以5SrRNA、18SrRNA和45SrRNA基因为探针,分别与内葵杂3号三交种染色体进行荧光原位杂交（FISH）分析。结果表明：45SrRNA和18SrRNA基因均得到3对杂交信号且位点分布相同,分别位于第3对和第10对染色体及第2对随体染色体的短臂末端;5SrRNA基因的信号位点共有2对,分布在第7对和第10对染色体短臂端部。     

蓖麻蚕卵黄原蛋白cDNA的克隆及序列分析

本文论述了蓖麻蚕卵黄原蛋白cDNA迅速克隆化的方法,SDS－PAGE鉴定的蓖麻蚕卵黄原蛋白由大小二个亚基构成,求出的分子量大亚基为180kDa,小亚基为45kDa,从解析的蓖麻蚕卵黄原蛋白氨基酸序列推算的分子量大亚基为161．06kDa,小亚基为40．53kDa,如果考虑到翻译后的修饰,这与SDS－PAGE求出的分子量是吻合的。蓖麻蚕卵黄原蛋白cDNA是由5788pb构成,一个ORF为5337个碱基,编码了1779个氨基酸。在信号肽的15个氨基酸残基中,有12个是硫水性氨基酸残基。这与其他昆虫卵黄原蛋白信号肽区域的硫水性分析是一致的。蓖麻蚕卵黄原蛋白N-linked glycosylation site的分布与家蚕、柞蚕和天蚕不同,3处N-linked glycosylation site存在于大亚基里,2处地多聚丝氨酸区域上流的小亚基里。另外,我们发现在所解析的柞蚕、天蚕的蓖麻蚕卵黄原蛋白氨基酸序列的C－末端区域里DGQR、GICG功能部位及其后的6个半胱氨酸都完好地保存。     

The nucleotide sequence of 5.8S rRNA from the posterior silk gland of the silkworm Philosamia cynthia ricini.

The nucleotide sequence of 5.8S rRNA from the Chinese silkworm Philosamia cynthia ricini has been determined by gel sequencing and mobility shift methods. The complete primary structure is (sequence in text). This is one of the largest known 5.8S rRNAs. As compared to Bombyx 5.8S rRNA, it is two nucleotides longer; two nucleotides near the 5'end and two nucleotides near the 3'end are different, and psi 61 of the Bombyx RNA sequence is an unmodified U in Philosamia RNA. The secondary structure of Philosamia 5.8S rRNA may differ from the Bombyx RNA structure by three additional base pairs at the 5'/3' ends.     

5S RNA sequence from the Philosamia silkworm: evidence for variable evolutionary rates in insect 5S RNA.

The primary structure of 5S RNA isolated from the posterior silkgland of Philosamia cynthia ricini was determined using three in vitro labelling techniques. The derived sequence consists of 119 nucleotides and can be folded into the secondary structure model proposed for eukaryotic 5S RNAs. This 5S RNA differs from the Bombyx mori molecule in 9 positions and from the Drosophila melanogaster sequence in 14 positions. The comparison of evolutionary rates in insect 5S RNA with inferred rates in other eukaryotic phyla leads to the conclusion that 5S RNA evolution is not constant in different eukaryotic branches, a condition which must be taken into account in phylogenetic tree constructions.     

蓖麻蚕后部丝腺体丙氨酸-tRNA和甘氨酸-tRNA同功受体相对含量的变化

用氨基酸选择性地保护相应的tRNA同功受体,使其3′端羟基不被过碘酸氧化,去氨酰化后用³²pCp标记、双向聚丙烯酰胺凝胶电泳分离的方法,分析了蓖麻蚕后部丝腺体tRNA^Ala和tRNA^Gly同功受体相对含量的变化。从5龄期24小时到85小时,这两种tRNA同功受体的数目和电泳相对位置没有明显变化,tRNA^Ala主要分为四个同功受体,tRNA^Gly主要为三个。tRNA^Ala同功受体的相对含量有变化,其中tRNA₃^Ala增加10%,tRNA₂^Ala下降11%,tRNA^Gly同功受体的相对含量无明显变化。     

Comparative genetic diversity and genetic structure of three Chinese silkworm species Bombyx mori L. (Lepidoptera: Bombycidae), Antheraea pernyi Guérin-Meneville and Samia cynthia ricini Donovan (Lepidoptera: Saturniidae)

The genetic diversity and genetic structure of three Chinese silkworm species Bombyx mori L., Antheraea pernyi Guérin-Meneville and Samia cynthia ricini Donovan were comparatively assessed based on RAPD markers. At the species level, A. pernyi and B. mori showed high levels of genetic diversity, whereas S. cynthia ricini showed low level of genetic diversity. However, at the strain level, A. pernyi had relatively highest genetic diversity and B. mori had lowest genetic diversity. Analysis of molecular variance (AMOVA) suggested that 60% and 72% of genetic variation resided within strains in A. pernyi and S. cynthia ricini, respectively, whereas only 16% of genetic variation occurred within strains in B. mori. In UPGMA dendrogram, individuals of A. pernyi and B. mori formed the strain-specific genetic clades, whereas those of S. cynthia ricini were distributed in a mixed way. The implications of these results for the conservation and utilization in breeding programs of three silkworm species are discussed.     

一种预测单链RNA分子二级结构的计算机算法

本文给出了一个利用已知能量数据构成具有最小自由能的单链RNA分子二级结构的计算机算法,并给出了此算法的可行性证明和应用实例。     

注射大肠杆菌或超声波诱导家蚕及蓖麻蚕产生抗菌物质的比较研究

本文报道:1.蓖麻蚕hilosamia cynthia ricini、家蚕Bombyx mori及柞蚕Antheraea pernyi注射大肠杆菌Escherichia coli或超声波处理均能诱导血淋巴产生抗菌物质。同一蚕种诱导产物相同,不同蚕种间差异明显。2.家蚕不同发育阶段的个体诱导产生的抗菌物质基本相同;不同性别的家蚕蛹的诱导产物的相对量有差异;不同品种家蚕蛹对诱导的应答潜伏期也不尽相同。3.注射聚肌胞核苷酸(PolyI:C)诱导家蚕血淋巴产生一种明显地不同于其它诱导源诱导的抗菌物质,此物质在酸性聚丙烯酰胺凝胶电泳中泳动速度较快。 本研究的所有结果均表明,诱导绢丝昆虫产生抗菌物质的诱导源是非专一性的,即诱导源与诱导产物之间无对应的关系。     

20-羟基蜕皮酮对蓖麻蚕蛹体液免疫的调节作用(英)

本研究指出20—羟基蜕皮酮(20-OHE)参加蓖麻蚕蛹对大肠杆菌的体液免疫反应。20-OHE的作用方式是多方面的,包括提高血淋巴蛋白质含量,产生抗菌蛋白,增加溶菌酶活性,和激活原酚氧化酶系统。这表明多个免疫控制系统参与蓖麻蚕蛹体液免疫反应的可能性。     

胰凝乳蛋白酶抑制剂在蓖麻蚕主要组织中的分布及血液中的含量和活性

【目的】蓖麻蚕Samia cynthia ricini 属于鳞翅目昆虫,其体内存在的胰凝乳蛋白酶抑制剂（chymotrypsin inhibitor, CI）对蓖麻蚕的正常生长发育和自身防御能力有重要的作用。获得蓖麻蚕的CI种类分布信息,以及研究各种CI的功能,可以为鳞翅目害虫的生物防治提供理论依据。【方法】本实验通过非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳（native-PAGE）和CI活性染色技术,对18个蓖麻蚕品系的主要组织器官中胰凝乳蛋白酶抑制剂的多态性分布进行了调查,并对各品系血液中的蛋白含量和CI活性进行了测定。【结果】在pH 8.6电泳下,各品系血液中共检测到7条CI活性带,在pH 4.0电泳下,各品系血液中可检测到3条CI活性带;血液中的CI含量从5龄第3天幼虫期到化蛹当天一直维持着很高的含量;头、体壁和脂肪体中的CI都不如血液中的CI含量高,而丝腺中未检测到任何CI。【结论】与家蚕 Bombyx mori 血液中的含量相比,蓖麻蚕血液中的CI含量更高,CI种类多态性分布不仅体现在不同品系的同一组织,还体现在同一品系的不同组织。     

Studies on the sites expressing evolutionary changes in the structure of eukaryotic 5S ribosomal RNA

Summary We have determined the complete sequences of 5S rRNAs from a lamprey (Lampetra reissneri), a lancelet (Branchiostoma belcheri), silkworms (Philosamia cynthia ricini, Bombyx mori, Antheraea pernyi), and a silkworm hybrid (artificially fertilized hybrid species ofPhilosamia cynthia ricini x Bombyx mori ), as well as those of cotton seeds (Gossypium hirsutum L.). Having compared more than 170 eukaryotic 5S rRNAs of which seven sequences have been determined by our group as mentioned above, we have found that the evolutionary sites that exist at special locations in these structures are closely related to the evolution of eukaryotes. The changes proceed step by step in an orderly way, i.e., the change in nucleotide residues of the evolutionary sites depends on the order of the evolution of the species and shows group-specific patterns.