中国特有种四合木种群遗传多样性的RAPD分析

采用随机扩增多态性 DNA(RAPD)技术检测了西鄂尔多斯高原特有种四合木种群 5个斑块的遗传多样性。2 2个扩增引物产生 1 1 6条带 ,Shannon信息指数和 Nei指数对 RAPD数据的分析表明 :四合木种群存在较高的遗传多样性 ,其中千里山斑块的遗传多样性和多态位点比例较高 ,石嘴山斑块的最低。遗传多样性的 86.5 %存在于斑块内 ,斑块间的遗传变异为 1 3 .5 %。遗传距离与地理距离无直接相关关系。这些结果说明 ,遗传多样性反映了四合木种群基因组 DNA存在较高的变异性 ;同时各斑块间存在一定的基因流 ,四合木各斑块可看成是处于同一种群的半隔离状态 (meta-种群 ) ,对四合木应注意保护遗传多样性丰富的 meta-种群。     

北京东灵山辽东栎种群DNA多样性的研究

在同工酶研究基础上,利用随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）及ＤＮＡ扩增指纹（ＤＡＦ）方法,从生态学观点分析了北京东灵山区辽东栎（ＱｕｅｒｃｕｓｌｉａｏｔｕｎｇｅｎｓｉｓＫｏｉｄｚ．）种群的遗传结构和多样性。对１２个引物扩增产生的２０５个产物（部分）,经Ｓｈａｎｎｏｎ信息指数分析,结果表明：辽东栎种群内部存在丰富的遗传变异,中央种群的遗传多样性高于边缘种群的遗传多样性。总遗传多样性的９５％发生在种群内,只有５％发生在种群间。两种群在个别位点上存在差异。不同年龄组辽东栎的分析结果表明：人为干扰对辽东栎的遗传结构有一定影响。     

北京东灵山辽东栎群落DNA多样性的研究

在同工酶研究基础上,利用随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）及ＤＮＡ扩增指纹（ＤＡＦ）方法,从生态学观点分析了北京东灵山区辽东栎（Ｑｕｅｒｃｕｓ ｌｉａｏｔｕｎｇｅｎｓｉｓ Ｋｏｄｄｚ．）种群的遗传和多样性。对１２个引物扩增产生的２０５个产物（部分）经,Ｓｈａｎｎｏｎ信息指数分析,结果表明：辽东栎群群内部存在丰富的遗传变异,中央种群的遗传多样性高于边缘种群的遗传多样性。总遗传多样性的９５％发生在种群内     

烟草黑胫病菌株亲缘关系的RAPD分析

从２２０个ＲＡＰＤ（ＲａｎｄｏｍＡｍｐｌｉｆｉｅｄＰｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃ　ＤＮＡｓ）随机引物中所选出的多态扩增性强的２１个引物对来源不同的刀个烟草黑胫病菌株进行全基因组ＤＮＡ遗传多样性分析和指纹构建。选用引物对受试菌株进行ＲＡＰＤ－ＰＣＲ扩增,共产生２４３条ＤＮＡ标记图带,其中１９１条为多态性图带,多态检测率为７８．６％。利用ＵＰＧＭＡ（ＵｎｗｅｉｇｔｈｔｅＰａｉｒ－ｇｒｏｕｐ　ＭｅｔｈｏｄＷｉｔｈＡｒｉｔｈｍｅｔｉｃ　Ａｖｅｒａｇｅ）软件对受试菌株间的遗传距离进行聚类分析构建系统树状图,受试对个菌株被划分为５个遗传聚类组即（Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ）。结果证明供试菌株具有丰富的遗传多样性,虽各自的遗传背景差异显著,但其亲缘关系相近,遗传聚类组的划分与菌株的地理来源未有明显的相关性。     

应用RAPD技术分析奥利亚罗非鱼和尼罗罗非鱼的基因多态性(英文)

以随机扩增多态ＤＮＡ技术（ＲＡＰＤ）分析了奥利亚罗非鱼和尼罗罗非鱼两个养殖群体的群体内及群体间遗传关系,并探讨了该技术在种群鉴定中的应用。ＲＡＰＤ引物筛选结果表明,所测试的２０个随机引物中（Ｔａｂｌｅ　１）,除一个引物未扩增出任何片段外,其余１９个引物均扩增出１～１１个大小不等的片段,长度大部分在５００～３０００ｂｐ之间,共扩增出２２０个片段,平均每个引物产生５．５个片段。两群体间共有片段７０条,大部分引物的扩增产物具有种间多态性,种群间相似系数为０．７２７。以筛选的引物对两种群不同个体（Ｆｉｇ．１,Ｔａｂｌｅ２）及种群混合样品（Ｆｉｇ．２,Ｔａｂｌｅ３）进行ＲＡＰＤ分析。结果表明,不同引物在扩增图谱上表现很大差异。奥利亚罗非鱼不同个体间表现为一致的扩增图谱,种内相似系数达１０００,显示了其种群内遗传变异的缺乏;尼罗罗非鱼种内相似系数为０．８２７,个体间存在不同程度的多态性;两个种群间的相似系数分别为０．７６７和０．７４２,表明种间有较高的同源性,遗传距离为０．２３５,略低于国外的报道、此外,两个养殖群体间的扩增图谱比较也暗示了遗传渐渗现象的存在。实验表明,ＲＡＰＤ标记可以作为一种可靠的遗传标记,用于不同鱼     

毛乌素沙地柠条群体分子生态学 初步研究：RAPD证据

毛乌素沙地柠条群体是一个杂种带。为了进一步阐明分子变异和基因流与生境或生态过渡带的联系,应用ＲＡＰＤ标记开展了柠条群体的分子生态学研究。根据ＲＡＰＤ数据利用Ｓｈａｎｎｏｎ信息指数估计了６个柠条群体的遗传多样性,发现大部分的分子变异存在于柠条群体之内（８２．４％）,只有少部分的分子变异存在于群体之间（１７．６％）。又利用Ｎｅｉ指数统计了ＲＡＰＤ数据,也证实了大部分的遗传变异存在于群体之内。柠条锦鸡儿群体与中间锦鸡儿群体的遗传分化系数和遗传距离都很小。以上结果都肯定了柠条群体间和种间的基因流动。无论是从多态位点比率还是群体的遗传多样性来看,硬梁和硬梁覆沙群体是最小的,滩地覆沙群体则具有较高的水平。某些ＲＡＰＤ扩增片段的频率在柠条群体间有规律的变化也许具有着特殊的生态学意义,更可能是中性突变的随机固定。根据以上研究可以得出下列结论：①通过比较Ｓｈａｎｎｏｎ指数和Ｎｅｉ指数的统计结果,可以认为,对于异交植物来讲,Ｓｈａｎｎｏｎ指数在统计ＲＡＰＤ数据方面有用。②毛乌素沙地柠条群体之间存在着强大的基因流,物种的杂交性与生态过渡性一致     

香菇自然群体中个体间的空间分布及其遗传联系*

应用体细胞不亲和性反应、交配型因子分析和基因组ＤＮＡ的ＲＡＰＤ分析,研究了一个分布于方圆约１ｋｍ的６根倒木上的１８个香菇野生菌株间的遗传差异。结果表明,该群体大多数菌株间配对（８０．４％）体细胞不亲和,而同一倒木菌株间配对的体细胞亲和率达 ６２．５％。不同倒木菌株间未发现体细胞亲和的配对。该群体存在 １１个特异的Ａ因子和７个特异的Ｂ因子。同一倒木的菌株有的交配型因子相同,有的则不同。不同倒木的菌株大多数交配型因子不同,未发现交配型因子完全相同的菌株。ＲＡＰＤ分析显示,体细胞亲和的菌株,交配型因子完全相同的菌株,在基于ＤＮＡ相似系数的遗传相关聚类中,首先聚为小类。总起来看,在自然群体中,香菇个体间的遗传差异与其空间分布之间存在一定的联系,随着空间距离的增大,菌株间的异质性相应增高。     

大豆灰斑病菌生理小种的RAPD标记

运用随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲａｎｄｏｍａｍｐｌｉｆｉｅｄｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃＤＮＡ,ＲＡＰＤ）技术对发生于中国东北的大豆灰斑病菌（Ｃｅｒｃｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍｓｏｊｉｍｕｍ）的１０个生理小种进行基因组ＤＮＡ多态性分析,用１３个１０－核苷酸随机引物获得了１１１个ＲＡＰＤ标记,其中８６．５％具有多态性,通过聚类分析确定了供试小种间的亲缘关系,试验证明,ＲＡＰＤ技术分析大豆灰斑病菌遗传传变异可提供大量     

冬虫夏草的随机扩增多态DNA及其遗传分化

本文对来自青藏高原３个区域５个具有代表性地方的１３个冬虫夏草样本进行随机扩增多态ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）分析。１９个随机引物获得的ＲＡＰＤ谱带清晰并呈现多态,单个引物获得的ＲＡＰＤ片段数在３￣１０个之间。该１９个引物在每个样本中扩增的ＲＡＰＤ片段总数平均约为６５个。基于遗传距离分析,受试的１３个冬虫夏草样本中,来自同一地方的样本间遗传差异甚微,同一区域不同地方的样本间遗传差异较大,不同区域的样本间遗传差     

不同经济类型高粱的RAPD分析

对四种不同经济类型高粱采用ＤＮＡ随机扩增多态技术（ＲＡＰＤ）进行了比较研究。１８种引物扩增后共得到５４个ＲＡＰＤ标记,其中２３个标记在进行４种高粱成对比较时呈多态。根据计算出的遗传距离值可以发现虽然不同种高粱之间差异虽然较小,但仍具有丰富的遗传多样性。     

松嫩草原羊草种群遗传分化的研究

通过等位酶技术,综合分析了松嫩原理１１个羊草种群的遗传多样性及遗传分化指标,深入剖析了灰绿型和黄绿型两种叶色类型羊草种群之间的遗传差异：两类种群在等位基因频率、非平衡位点和Ａ、Ｐ、Ｈe及固定指数Ｆ上明显不同,两类种群间有极明显的遗传分化。黄绿型种群的Ａ、Ｐ、Ｈe皆低于灰绿型;黄绿型Ｆ＜０,灰绿型Ｆ＞０,这种差异主要表现在ＤＩＡ－１、ＰＧＭ、ＳＫＤ和ＡＣＰ等位点上;两类种群间的遗传分化主要发生在ＡＤＨ、ＤＩＡ－２和ＰＧＭ等位点上。种群间的遗传距离与地理距离之间没有相关。     

基于ISSR分子标记的孑遗濒危植物四合木遗传结构分析

为阐明中国西北干旱区单属种孑遗濒危植物四合木(Tetraena mongolica)种群间的遗传分化和基因流。利用6个不同地理分布的四合木种群作为试验材料,从30条UBC引物中筛选出6条引物,并且对ISSR扩增反应体系和扩增程序进行了合理的优化,6个引物扩增出370个条带,多态性条带占71%。分析结果如下:①Nei’s基因多样性指数(He)为0. 316 8,Shannon’s多态性信息指数(I)为0. 458 6。表明四合木在不同种源间的遗传多样性水平差异较小;②群体多态性位点百分率在70. 00%~83. 33%,Nei’s基因多样性指数范围0. 286 5~0. 350 8,Shannon’s多态性信息指数在0. 423 6~0. 504 9。6个群体间的遗传分化系数Gst为0. 125 3,表明群体间具有一定程度的遗传分化;③6个种群的基因流(Nm)为3. 491 5>1,说明6个种群间存在一定的基因流,可以防止遗传漂变引起的遗传分化;④通过聚类分析,将6个不同地理种群的四合木分为3类,千里沟种群、伊克布拉格种群和巴拉贡种群先聚成第一大类,再与磴口—桃司兔种群聚成第二大类,而四合木自然保护区种群和甘德尔山种群则组成第大三类,这说明距离因素是影响四合木种群间遗传分化的主要原因,但不同生境条件也对四合木种群的遗传分化产生了影响。     

RAPD应用于遗传多样性和系统学研究中的问题

在研究银杉（Ｃａｔｈａｙａ ａｒｇｙｒｏｐｈｙｌｌａ）的遗传多样性时,对ＲＡＰＤ 产物的影响因素进行了大量的实验探索,结果表明：逐级纯化的ＤＮＡ 模板的ＲＡＰＤ结果一致, 因而模板制备过程中的很多纯化步骤是不必要的; ＲＮＡ 对扩增产物无影响; 模板浓度在一个相当大的范围内不影响扩增结果; 从干叶和鲜叶中提取的ＤＮＡ 可获得一致的扩增产物; 从而证明ＲＡＰＤ 产物具有很好的重复性。进而讨论了ＲＡＰＤ产物分析及数据分析中的一些问题。通过对升麻属（Ｃｉｍ ｉｃｉｆｕｇａ） ５ 种、类叶升麻（Ａｃｔａｅａ ａｓｉａｔｉｃａ）及松潘乌头（Ａｃｏｎｉｔｕｍ ｓｕｎｇｐａｎｅｎｓｅ）的ＲＡＰＤ 结果分析,认为ＲＡＰＤ 方法可用于种间乃至近缘属间的系统学研究, 但有一定的局限性     

中国大陆若干群体的黑果蝇的线粒体DNA多态性研究

本文研究了果蝇Ｄ．ｖｉｒｉｌｉｓ种群Ｄ．ｖｉｒｉｌｉｓ线粒体ＤＮＡ（ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌＤＮＡ,ｍｔＤＮＡ）的多态性。用９种限制性内切酶ＸｂａⅠ,ＥｃｏＲⅠ,ＰｓｔⅠ,ＨｉｎｄⅢ,ＢｇｌⅡ,ＳａｃⅠ,ＳｃａⅠ,ＥｃｏＲＶ和ＰｕｖⅡ,对青岛、南京、上海、宁波与泉州５个Ｄ．ｖｉｒｉｌｉｓ群体的ｍｔＤＮＡ进行了限制性片段长度多态性（ｒｅｓｔｒｉｃｔｉｏｎｆｒａｇｍｅｎｔｓｌｅｎｇｔｈｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ,ＲＦＬＰ）的研究。在５群体中,发现５种不同的酶切图谱,它们彼此之间的遗传差异π为０．４６％－１．７６％,群体内遗传差异πｉｊ为０．００％－０．３３％,群体间的差异ｄｘｙ,为０．００％－０．８２％。分布于中国大陆的Ｄ．ｖｉｒｉｌｉｓ的群体间遗传差异在总遗传差异中所占比例γｓｔ值为２４．６２％。我们发现,Ｄ．ｖｉｒｉｌｉｓ的栖息环境对ｍｔＤＮＡ的遗传变异有十分明显的影响,而不同地理纬度的群体之间其遗传距离并无倾群（ｃｌｉｎｅ）表现。     

烟草黑胫病菌株亲缘关系的RAPD分析

从２２０个ＲＡＰＤ（Ｒａｎｄｏｍ Ａｍｐｌｉｆｉｅｄ Ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃ ＤＮＡｓ）随机引物中所选出的多态扩增性强的２１个引物对来源不同的３３个烟草黑胫病菌株进行全基因组ＤＮＡ遗传多样性分析和指纹构建。选用引物对受试菌株进行ＲＡＰＤ－ＰＣＲ扩增,共产生２４３条ＤＮＡ标记图带,其中１９１条为多态性图带,多态检测率为７８．６％。利用ＵＰＧＭＡ（Ｕｎｗｅｉｇｔｈｔｅｄ Ｐａｉｒ－ｇｒｏｕｐ Ｍｅｔｈ     

草鱼和鲤群体遗传变异的RAPD指纹分析

利用随机扩增多态ＤＮＡ技术对革鱼,兴国红鲤,野鲤的种群内,种群间以及种间的遗传变异亏待进行了定量分析。结果表明;草鱼与鲤的ＲＡＰＤ指纹图谱带型差异显著,草鱼与红鲤和鲤种间的平均带纹相似系数分别为０．２５８３和０．２３９４,遗传距离分别达到０．９３６２和１．２２７７。     

毛乌素沙地柠条群体分子生态学初步研究:RAPD证据

毛乌素沙地柠条群体是一个杂种带,为了进一步阐明分子变异和基因流与生境或生态过渡带的联系,应用ＲＡＰＤ标记开展了柠条群体的分子生态学研究。根据ＲＡＰＤ数据利用Ｓｈａｎｎｏｎ信息指数估计了６个柠条群体的遗传多样性,发现大部分的分子变异存在于柠条群体之内（８２．４％）,只有少部分的分子变异存在于群体之间（１７．６％）,又利用ｅｉ指数统计了ＲＡＰＤ数据,也证实了大部分的遗传变异存在于群体之间,柠条锦鸡儿群     

中国紫花苜蓿地方品种随机扩增多态DNA的研究

运用ＲＡＰＤ技术,对１１个样本紫花苜蓿（Ｍｅｄｉｃａｇｏ ｓａｔｉｖａ）的遗传多样性进行了研究。计算了１１个样本之间的遗传相似度和遗传距离,并进行了聚类分析,探讨了它们之间的亲缘关系。结果如下：１．用４３个随机引物对紫花苜蓿的１１个样本的核ＤＮＡ进行了ＲＡＰＤ扩增,共检出４４０条扩增片段,多态性片段３３１条,占７０．６８％。反映了１１个样本之间的遗传变异;２．４３个随机引物对１１个样本扩增出２～１     

巴马小型猪群体遗传结构的随机扩增多态DNA分析

目的分析巴马小型猪的群体遗传结构。方法应用经过筛选的 ３１条引物对巴马小型猪个体基因组ＤＮＡ进行ＲＡＰＤ扩增,利用从ｉｎｔｅｒｎｅｔ网上下载的软件ＲＡＰＤ ｉｓｔａｎｃｅ Ｐａｃｋａｇｅ ｖｅｒ－ｓｉｏｎ１．０４软件对实验结果进行分析,计算不同个体间的相似系数。结果经ＲＡＰＤ反应,共扩增出２７５条带,其中多态性带８５条,多态性带频率在０～６６．７％之间,平均为２７．７％。不同个体猪拥有的ＲＡＰＤ条带具有差异,但拥有相同条带个体猪比率较高。该群体猪的相似系数（Ｆ）为０．９２８（０．７８～０．９７）,平均等位基因频率（ｑ）为０．７３２,最低平均杂合率（Ｈ）为０．２８６。结论巴马小型猪个体具有较好的遗传一致性和遗传稳定性。     

RAPD应用于蕈菌研究中的条件优化探讨

在进行鹅膏菌属蕈菌遗传多样性的ＲＡＰＤ分析时,对ＲＡＰＤ分析过程中的ＤＮＡ提取方法、ＤＮＡ纯度、模板ＤＮＡ和ｄＮＴＰ浓度、循环次数、ＤＮＡ不同来源等影响因素进行了大量的实验探索,结果表明：ＤＮＡ不同提取方法具有相同的扩增产物,ＤＮＡ模板中的ＲＮＡ对扩增产物无影响,模板浓度在一个相当大的范围内（５０～４００μｇ）不影响扩增结果．ｄＮＴＰ浓度达０．７５ｍｍｏｌ／Ｌ时无带谱出现,引物浓度达１μｍｏｌ／Ｌ时出现非特异性带谱,从菌丝体和子实体中提取的ＤＮＡ可获得一致的扩增产物．扩增循环４０～４５周期条件下扩增效果较好,本实验证明了ＲＡＰＤ产物具有很好的重复性,建立了适合蕈菌ＲＡＰＤ分析的ＰＣＲ程序及条件,为ＲＡＰＤ应用于蕈菌的遗传研究打下了良好的基础．