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全长cDNA的获得—RACE及其他方法进展 总被引:10,自引:0,他引:10
全长cDNA的获得是基因克隆的重要内容,也是基因组研究的重要内容之一。cDNA末端快速扩增技术(RACE)是获得全长cDNA的主要辅助手段之一,本文对RACE技术的原理、改进和近几年发展起来的新型RACE(包括RNA连接酶介导的RACE、oligo-capping等)作了综述。同时,对用干全长CDNA克隆的其他技术,如引物载体法、固相支持物法作了介绍。 相似文献
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根据西伯利亚蓼茎抑制消减文库(SSH)中获得的多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(polygalacturonase inhibiting proteins,PGIP) 的EST序列,采用RACE技术在西伯利亚蓼消减库(SSH)成功克隆了PGIP蛋白基因的cDNA序列.该基因开放读码框为1 020 bp,编码339个氨基酸, 具有1段24个残基的保守亮氨酸结构域.序列分析表明,该基因具有N端信号肽,具有PGIPs家族共有的典型保守区域,属PGIPs家族基因,命名为PsPGIP,GenBank登录号为ACD01043.荧光定量PCR分析表明,PsPGIP在西伯利亚蓼叶、茎、地下茎等器官中均有分布.在3% NaHCO3诱导表达中,该基因在叶中表达明显受盐胁迫的诱导.推测该基因在抵御盐胁迫伤害中起到了重要的作用. 相似文献
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一步3’RACE快速构建鸡MnSOD全长cDNA克隆Rapid 总被引:1,自引:0,他引:1
本研究尝试将触减 PCR与3’ cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术进行结合,仅用一条特异性引物和一条通用引物,成功地实现了从3’末端cDNA库对鸡含锰超氧化物歧化酶(manganese-containing superoxide dismutase,MnSOD)全长cDNA的一步3’RACE快速构建。与常规使用的末端PCR或亚克隆方法相比,该法具有快速、省时、经济和特异性好的优点。Abstract: RACE(rapid amplification of cDNA ends) is a popular technique to rapidly obtain the full-length cDNA. After obtaining the 3’cDNA and 5’cDNA fragments with a overlapped region by 3’RACE and 5’RACE, the full-length cDNA could be generated by end-to-end PCR or subcloning. In this study, 3’RACE combined with touch-down PCR was successfully used for the rapid construction of full-length MnSOD cDNA of chickens. Compared with the conventional end-to-end PCR or subcloning, this method, called one-step 3’RACE, is fast, economical and highly specific. It especially fits the rapid construction of full-length cDNA by RACE method. 相似文献
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cDNA末端快速扩增技术及其应用* 总被引:9,自引:0,他引:9
摘要:cDNA末端快速扩增(RACE)技术是一种快速获得cDNA的3′和5'端的方法。本文从RACE的原理出发,指出其技术本身存在的优缺点,阐述了RACE操作中须注意和不容忽视的技术要点,并对前人对RACE技术所做的改进加以总结,最后对RACE技术的应用前景给予了展望。Abstract: Rapid amplification of cDNA end (RACE) technique is a method of which the 3’ and 5’ fragments of cDNA can be rapidly obtained. In this review, the advantages and shortcomings RACE manipulation were pointed out and some important technical points in RACE protocols in the previous literatures were summarized. 相似文献
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RACE技术研究进展与展望 总被引:3,自引:1,他引:2
近年来,RACE(rapid amplification of cDNA ends)技术,即cDNA末端快速扩增技术,是一种快速扩增cDNA的5′和3′末端的有效方法,在扩增全长cDNA方面得到了广泛的应用。综述了RACE技术的研究进展,总结了优化RACE技术几个关键环节。最后展望了RACE技术的发展。 相似文献
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棉花类LRR抗病蛋白(GhLRR-RL)基因的克隆及表达分析 总被引:8,自引:2,他引:6
从棉花胚株的cDNA-AFLP片段中,选取一个与拟南芥类LRR抗病原因(LRR-RL)序列相似的片段,用RACE方法延伸其3′和5′未知序列,得到一个棉花类LRR抗病蛋白的全长cDNA序列(GenBank登录号:AY040532)。该cDNA长1259bp,包含一个987bp的开放阅读框,具有Poly(A)加尾信号。推测蛋白质包含329个氨基酸,其中大部分是LRR区,其序列符合膜外LRR的共有序列LXXLXXLXXLXLXXNXGXIPXX。序列和结构比例分析表明:该棉花LRR-RL蛋白与拟南芥的两个类LRR抗病蛋白高度同源,而与植物的其他LRR蛋白结构不同,推测LRR-RL蛋白属于一类新的LRR蛋白。斑点杂交和3′RACE扩增表明,棉花LRR-RL基因具有组成性表达的特点。 相似文献