马尾松R2R3-MYB基因特征及进化和表达分析

MYB类转录因子在植物生长发育、代谢、应答生物胁迫和非生物胁迫的响应等生物过程发挥重要作用。为探究马尾松R2R3-MYB基因结构及功能,该研究以转录组数据为研究区域,从中筛选获得了17个马尾松R2R3-MYB基因,利用生物信息学对基因进行理化性质、系统进化树等分析,同时利用荧光定量PCR技术分析基因的组织特异性以及在花发育时期和非生物胁迫下的表达模式。结果表明：(1)17个PmMYBs亚细胞定位于细胞核,均无跨膜结构,且均含有Motif1、Motif2保守基序。系统发育进化树将马尾松PmMYBs划分为9个亚家族,且与火炬松、白云杉等裸子针叶植物关系较近。(2)17个基因均属于组成型表达,但在不同组织的表达量不同;所有基因均参与了花发育和非生物胁迫,不同基因在花发育不同时期的表达存在差异,有7个基因可能参与了雌雄性状转变;大部分基因响应非生物胁迫上调表达,但响应胁迫的时间存在差异;少数基因在胁迫中下调表达,尤其是PmMYB11基因在所有胁迫中均明显下调表达。该研究较系统地分析了马尾松R2R3-MYB基因的结构特征、系统进化及其在花发育时期和非生物胁迫下的表达模式,为深入探究马尾松R2R3...     

一种高效获取基因5′末端的RACE方法

RACE技术是一种快速高效克隆基因5′末端和3′末端的方法,是获取基因全长的主要手段之一,但是RACE技术本身也存在一些缺点。我们在前人改良的RACE技术基础上进一步优化RACE技术,获得了一种操作简单、快速、高效、成本低廉的改良RACE方法,该方法适合于大量基因5′末端的获取,可以在普通实验室推广应用。     

芒果APl同源基因的克隆及其生物信息学分析

我们采用RT-PCR方法克隆了2个APl同源基因全长cDNA,分别命名为MAPl-1(GenBank accession No.FJ529206)和MAPl-2(GenBank accession No.FJ529207).MAPl-1编码247个氨基酸,开放阅读框长度为741 bp,蛋白质分子量为28.54kD,等电点为8.31;MAPl-2编码248个氨基酸,开放阅读框长度为744 bp,蛋白质分子量为28.78 kD,等电点为8.70.同源性分析表明,它们的核苷酸序列与其它木本植物APl同源基因的一致性为72%～81%.实验分析表明,MAPl-1和MAPl-2第1至第61个氨基酸含有一个MADS盒结构域,第88至第178个为K盒结构域;两个基因均定位于细胞核,且功能位点分布存在着不同,推测这两个基因在花器官发育过程中的功能存在差异.蛋白二级结构预测显示,MAPl-1蛋白有12个a-螺旋,4个β折叠区,14个β-转角;而MAPl-2蛋白有11个a-螺旋,5个β折叠区,15个β-转角:其大多数氨基酸具有亲水性.本研究有助于进一步了解芒果的开花分子机理及成花的生物学发育阶段.     

间充质干细胞在造血干细胞移植中的应用

间充质干细胞(MSCs)是一种具有自我更新和多向分化潜能的成体干细胞,存在于骨髓、脂肪组织、脐血及多种胎儿组织.它可分泌多种细胞因子及生长因子,促进造血干细胞(HSC)的增殖与分化.MSCs还具有免疫调节、抗炎和组织修复作用,可减轻移植物抗宿主病(GVHD)及其他移植相关并发症.     

气候变暖对领春木沿海拔分布潜在影响的实验模拟

在神农架山地不同海拔高度进行领春木(Euptelea pleiospermum)种子萌发实验和萌发后实生幼苗的存活状况研究,模拟气候变化对领春木分布的潜在影响.结果显示:(1)林窗内种子萌发率显著高于林下,林下的幼苗全部死亡;(2)在领春木的分布上限(2090 m)和以上区域种子萌发率高,且幼苗死亡率低,在领春木的分布下限(900 m)和以下区域种子萌发率低,且除620 m阳坡林下以外,幼苗均全部死亡;(3)种源对领春木种子萌发率和幼苗死亡率均无显著影响;(4)冬季播种的种子比春季播种种子萌发率低,萌发后幼苗死亡率高.研究结果表明,珍稀植物领春木具备向高海拔地区迁移的潜能,但向高海拔的迁移扩散可能会受到一定的限制;在低海拔区域,领春木幼苗更新受到威胁,但一些小生境可以缓冲气候变暖带来的威胁.     

一株红球菌属细菌LV4在高盐条件下的吡啶降解特性

由微生物介导的吡啶降解技术是解决高盐吡啶环境污染的经济有效方法之一,开发具有吡啶降解性能且能够耐受高盐分的微生物是该类研究的重要前提。本研究从山西太原钢铁公司焦化废水处理厂活性污泥中分离培养了一株耐盐吡啶降解菌,通过菌落形态和16S rDNA基因系统发育分析,鉴定其为红球菌属(Rhodococcus sp.)的细菌。耐盐性实验结果表明,菌株LV4能够在0%–6%盐度范围内生长,并完全降解初始浓度为500 mg/L的吡啶;但当盐度高于4%时,菌株LV4因其生长变缓而导致吡啶完全降解时间明显延长。扫描电镜结果显示,高盐环境会使菌株LV4的菌体细胞分裂变慢,诱导细胞表面分泌更多的颗粒状胞外聚合物(extracellular polymeric substance, EPS)。当盐度不高于4%时菌株LV4主要依靠EPS中蛋白含量的增加来响应高盐环境的冲击。单因素实验优化发现,菌株LV4在盐度为4%的高盐环境中降解吡啶的最佳条件为温度30℃、pH 7.0、转速为120 r/min (DO 10.30 mg/L)。最优条件下菌株LV4对于初始浓度为500 mg/L的吡啶,在经过12 h的适应期后,...     

罗汉松遗传多样性的SCoT分析

采用SCoT分子标记技术对8份罗汉松种质材料进行遗传多样性研究。结果表明,从80条引物中筛选出10条重复性好、条带清晰的引物进行PCR扩增,共产生136条带,其中多态性带122条(占88.97%),8个罗汉松种质间的遗传相似系数范围在0.39～0.80说明罗汉松的遗传多样性丰富。利用UPGMA进行系统的聚类分析显示,将8份罗汉松材料分为2大类;主成分分析结果与聚类分析结果相一致。可见,利用SCoT分子标记可有效的分析罗汉松种质资源的遗传多样性,为罗汉松种质亲缘关系的鉴别和分类提供理论依据。     

龙眼SCoT-PCR反应体系的优化

目标起始密码子多态(start condon tardeted polymorphism,SCoT)分子标记结合了ISSR标记和RAPD标记的优点,具有操作简单、成本低廉、多态性丰富、重复性好、引物设计简单且通用性良好等诸多优点.本实验以石硖龙眼的新鲜叶片为试材,采用单因素试验的方法分别研究模版、引物、rTaqDNA聚合酶、dNTPs、缓冲液(Mg~(2+))及退火温度共6因素各8个水平对龙眼SCoT-PCR扩增结果的影响.结果表明:龙眼SCoT标记的20μL优化反应体系为:10×Buffer Ⅱ(含Mg~(2+))2.0μL、DNA模板30 ng、引物浓度为30 μmol/L、rTaqDNA聚合酶用量为0.45 U、dNTP浓度为4.0 mmol/L.适宜的扩增程序为:94℃预变性4 min;95℃变性50 s,49.5℃退火40 s,72℃复性2 min,36个循环;最后72℃延伸10 min.利用24个龙眼品种验证该反应体系,1.5%琼脂糖电泳检测结果显示,扩增产物在400～2 200 bp之间,不同品种间DNA谱带具有多态性,反应体系具有良好的稳定性和可重复性.     

脂肪酸受体4在食欲调控中的研究进展

食欲调控与人类健康密切相关。脂肪酸受体4(free fatty acid receptor 4,FFA4)具有重要的食欲调控功能,有望成为食欲调控药物的新靶点。中枢激活FFA4能够抑制神经肽Y(neuropeptide Y,NPY)神经元,缓解下丘脑炎症,提高中枢瘦素(leptin)和胰岛素(insulin)等抑食欲因子敏感性,从而发挥抑食欲作用。大量研究表明,FFA4在外周抑制食欲。一方面,FFA4与G_(i/o)蛋白偶联能够抑制腺苷酸环化酶途径,并抑制促食欲因子胃饥饿素(ghrelin)的表达,抑制食欲;另一方面,FFA4与G_(q11)蛋白激活下游的磷脂酰肌醇途径和PI3K/Akt途径,增加抑制食欲因子胰高血糖素样肽1(glucagon-like peptide 1,GLP-1)、胆囊收缩素(cholecystokinin,CCK)的分泌,抑制食欲。就FFA4对食欲调控作一综述,为以FFA4作为靶标开发食欲调控药物提供基础资料。     

增强CT图像纹理参数联合血清CEA、CA724在食管癌术后复发转移中的临床应用价值

摘要 目的：研究增强计算机断层扫描（CT）图像纹理参数联合血清癌胚抗原（CEA）、糖类抗原724（CA724）在食管癌术后复发转移中的临床应用价值。方法：选取2019年6月-2021年7月于我院行手术治疗的86例食管癌患者,术前检测其血清CEA、CA724水平,并行增强CT扫描,将其动、静脉期图像数据行纹理分析,记录均值、中位数、标准差、不均匀度、偏度、峰度、熵值等参数。术后对86例食管癌患者进行12个月随访,根据其是否发生复发转移分为复发转移组（32例）与无复发转移组（54例）,比较两组增强CT图像纹理参数及血清CEA、CA724水平差异;采用受试者工作特征（ROC）曲线分析增强CT图像纹理参数联合血清CEA、CA724对食管癌患者术后复发转移的预测价值。结果：复发转移组动脉期熵值高于无复发转移组（P＜0.05）;复发转移组静脉期不均匀度、熵值均高于无复发转移组（P＜0.05）。复发转移组血清CEA、CA724水平高于无复发转移组（P＜0.05）。ROC曲线显示,血清CEA、CA724联合动脉期熵值及静脉期不均匀度、熵值的曲线下面积（AUC）、敏感度、特异度均较各指标单独应用有明显提升,联合应用的预测效能更高。结论：血清CEA、CA724水平和动脉期熵值及静脉期不均匀度、熵值升高与食管癌患者术后发生复发转移有关,动脉期熵值及静脉期不均匀度、熵值联合血清CEA、CA724在预测食管癌患者术后发生复发转移中的应用价值较高。