真核转录抑制因子调控机制的研究进展

转录调控是分子生物学领域的研究热点,其中转录抑制因子通过与特异蛋白因子或染色体部位结合来阻碍基因的活化,对转录进行负调控。按照作用距离或抑制作用的直接与间接性来划分其调控机制,是过去比较主流的分类标准。但人们逐渐发现,许多转录抑制因子很难用这种标准进行确切的分类,于是又提出了一种新的、更加科学的分类方法：按照抑制作用是通过与基本转录复合物直接结合来发挥作用,通过转录激活因子间的相互作用来实现,还是通过改变染色体结构来完成,将转录抑制因子分为三类。     

组蛋白如何阻抑基因的转录

组蛋白是基因转录的抑制者，其作用方式是在ＴＡＴＡ单元处形成核粒并阻止转录因子固定在ＤＮＡ上。基因起动时，上游激活处的激活子蛋白使组蛋白脱离ＴＡＴＡ单元，使基本转录因子装配在ＴＡＴＡ单元，从而产生基本水平的转录。     

一类新型转录因子家族：信号转导剂和转录激活剂

信号转导剂和转录激活剂（ＳＴＡＴ）是近三四年才发现的一类新型转录因子家族。许多配体,尤其是细胞因子,能使ＳＴＡＴ的酪氨酶磷酸化而激活。激活的ＳＴＡＴ蛋白能形成同二聚体和异二聚体,进入细胞核内结合ＤＮＡ序列,调节多个基因表达。这些既在胞浆里起信号转导作用又在胞核内起激活转录作用的双功能蛋白质的发现,为细胞因子信号转导路通研究揭开了新的一页。     

植物Dof转录因子及其生物学功能

Dof(DNA binding with one finger)蛋白是植物特有的一类转录因子,包含一个C2-C2锌指,其N-末端保守的Dof结构域是既与DNA又和蛋白相互作用的双重功能域。在过去10多年的研究中,Dof蛋白在多种单子叶和双子叶植物中被分离。Dof蛋白作为转录的激活子或抑制子在植物的生长和发育中发挥重要作用。就Dof转录因子及其生物学功能的进展进行了综述。     

转录调节位点和转录因子数据库介绍

转录水平的调控是基因表达最重要的调控水平之一,对转录调节位点和转录因子的研究具有重要意义：介绍了DBTSS、JASPAR、PRODORIC和TRRD等相关数据库及其特征、内容和使用。     

大肠杆菌murB和birA基因的转录通读现象

在对应用限制性显示 PCR技术构建的大肠杆菌 poly(A)化mRNA的cDNA文库鉴定中 ,发现了一克隆的基因片段同时跨越了murB和birA基因的部分序列 ,提示这 2个基因存在转录通读现象 ,设计引物 ,利用逆转录后的产物为模板 ,进行了验证。结果表明murB和birA基因存在转录通读现象。     

植物形态发生中转录因子及其应用

本文简要介绍了转录因子的概念和植物形态发生中的有关转录因子的分类和作用，最后讨论了转嫌因子在改造植物性状方面的应用并展望了转录因子可能将成为重要的生物技术手段。     

c-Myc功能及其下游靶点

c-Myc是一个在进化上较为保守的,具有b/HLH/LZ结构的转录调节因子,它可以与Max形成异源二聚体通过结合于启动子区的E盒结构对基因进行转录激活调控,也可以通过其他方式对基因进行正负调节,参与调控了细胞的增殖、分化、生长、凋亡、细胞周期进程、细胞内生物大分子的代谢以及细胞的恶性转化。近期,研究者通过采用微阵列芯片、生物信息学技术、染色质免疫沉淀(ChIP)、基因表达系列分析(SAGE)等高通量研究的新技术对c-Myc下游靶点进行研究,这对于揭示c-Myc结构与功能之间的关系具有重要的生物学意义。     

组蛋白与hAMFR基因启动子的结合对体外转录活性的影响

采用从鸡血红细胞中分离纯化的组蛋白,从ＨｅＬａ细胞核中萃取的含有ＲＮＡ聚合酶Ⅱ和多种Ⅱ类基因转录因子的可溶性抽提物,以及从非洲爪蟾卵细胞核中撮以的萃取物热处理物上清用于核小体构建,以含有人自泌移动因子受体基因启动子序列的ＤＮＡ片段为模板进行体外转录实验,结果表明,组蛋白和转录因子在ｈＡＭＦＲ基因启动子序列上的竞争性结合对转录活性具有重要的影响作用,在启动子区域预先构建的核小体能够抑制转录活性;     

DNA甲基化的3种可能转录抑制机制

尽管ＤＮＡ甲基化能抑制转录这一观点早已为人所知 ,但其精确的机制还不完全清楚[1] 。到目前为止 ,有 3种可能的机制被用来解释甲基化的转录抑制过程。第一种机制是ＤＮＡ甲基化直接干扰特异转录因子与各自启动子的识别位置结合[2 ] 。几种转录因子 ,如ＡＰ 2、Ｃ Ｍｙｃ/Ｍｙｎ、ＣＡＲＥＢ、Ｅ2Ｆ和ＮＦ κＢ ,能识别含ＣｐＧ残基的序列 ,当ＣｐＧ残基上的Ｃ被甲基化后 ,结合作用即被抑制 (图 1 )。相反 ,其他一些转录因子 (如ＳＰ1和ＣＴＦ)对结合位置上的甲基化不敏感 ,还有许多因子在ＤＮＡ上的结合位点上不含ＣｐＧ二核苷酸 ,ＤＮＡ…     

真核基因转录与染色质修饰机制及转录因子间的关系

真核基因的表达调控是当前分子生物学研究领域的前沿科学,其中的发展日新月异,涉及面广,从染色质结构的改变到转录因子间的相互作用形成了一个复杂的网络关系,各因素之间的协调作用是真核生物体内基因表达调控的关键所在。     

黏着素与基因表达调控

黏着素(cohesin)是一种多亚基蛋白复合体,在进化上相当保守。在真核生物细胞中,黏着素主要功能是将复制产生的姐妹染色单体连接在一起,直到细胞分裂的后期,黏着素亚基Scc1水解最终导致染色单体的分离。但是最近研究表明,黏着素在基因表达、染色质结构变化和发育调节等方面也起着非常重要的作用,并且发现黏着素对基因的调节作用与其对染色体的黏着功能无关。在酵母中,黏着素最初定位于其装载蛋白Scc2的DNA结合位点上,但是在细胞周期的G2期,黏着素聚集于转录汇集区之间进而调控转录终止。在果蝇染色体上,黏着素与装载蛋白Scc2的同源物Nipped-B共定位,其作用是阻抑增强子和启动子的远距离接触。而在哺乳动物中,黏着素与CTCF隔离子蛋白共定位,并以依赖于CTCF的方式调控转录。本文概述了黏着素在不同真核生物染色体上的定位与分布,并对其在基因表达调控中的功能机制及其研究现状进行了重点阐述。     

真核基因转录激活的多位点协同调控

真核基因的转录激活具有协同性的特征,表现为多个转录调控位点的共同作用效果大于每个位点单独作用之和,受多个位点调控的基因转录呈S型曲线.多个激活蛋白之间的相互作用、激活蛋白与各DNA位点的协同结合以及激活蛋白与转录机器的协同作用,三种途径都对协同性转录激活行为产生影响.协同性转录激活的本质是多个结合在调控位点上的激活蛋白之间直接或间接的相互作用.多位点的协同转录调控机制有助于理解生物的多种调控过程和建立基因调控网络.     

一种新的转录因子--EPAS1

ＥＰＡＳ１是一种近年来被发现的转录蛋白,主要存在于内皮细胞内。ＥＰＡＳ１能与芳香烃受体核转移蛋白（ＡＲＮＴ）一起形成异二聚体,调节一系列基因的转录和表达,维持机体正常的生长和发育。     

c—fos原癌基因的研究进展

目前,原癌基因的正常生理功能愈来愈引起重视。ｃ－ｆｏｓ原癌基因属瞬息基因,其编码的产物位于核内并具有转录因子的特异结构。参与基因的表达调控。本综述了ｃ－ｆｏｓ原癌基因的结构特点、生物功能,尤其是在基因表达调控中的进展。     

真核普通转录因子

三类真核ＲＮＡ聚合酶分别选择性地转录细胞核基因,其转录特异并不决定于ＲＮＡ聚合酶本身,而是取决于被转录基的启动子元件及能识别并结合这些元件的普通转录因子,它们与ＲＮＡ聚合酶相互作用,在启动子区组装成转录起始复合物,从而起动转灵,已知的三类普遍转寻因子中,大多数为相应ＲＮＡ聚合酶所专用,只有少数因子中的个别亚基是三类酶所通用。本简述这三类普通转录因子的结构,性质及其在转录中的功能。     

转录因子YY1的作用机制

转录因子Ｙｉｎ Ｙａｎｇ 1 (ＹＹ1 ,又称ＮＦ Ｅ1、δ、ＵＣＲＢＰ、ＣＦ1 )是锌指类转录因子ＧＬ1 Ｋｒ櫣ｐｐｌ家族中的一员 ,广泛地存在于人、鼠、非洲爪蟾中[1、2 ] 。ＹＹ1蛋白含有 41 4个氨基酸残基 ,分子量为 6 5ｋＤ。在靠近Ｎ 末端处有一个酸性区域 ,紧接着是连续 1 2个组氨酸的序列和一段富含Ｇｌｙ和Ａｌａ的区域 ,在Ｃ 末端含有与ＲＥＸ 1蛋白相似序列的Ｃ2 Ｈ2 锌指结构。ＹＹ1因子最初是作为腺伴随病毒(ＡＡＶ)的Ｐ5 启动子和免疫球蛋白 (Ｉｇ)ｋ3′增强子的阻抑因子分离到的 ,后来又相继证实ｃ ｆｏｓ、ｃ ｍｙｃ、ｓｕｒ…     

逆转录现象的发现及其意义

现代遗传学已经证明,I）NA是生物遗传的主要物质基础。生物体的遗传特征是以遗传密码的形式编码在＊＊A分子上,表现为特定的核音酸排列顺序,并且通过DNA的复制,把遗传信息由亲代传递给予代。在后代的个体发育中,遗传信息由DNA转录给RNA,然后通过mRNA翻译合成特异的蛋白质以执行各种生命功能,从而使后代表现出与亲代相似的遗传性状。这就是本世纪SO年代末所确定的蛋白质合成的“中心法则”。“中心法则”确定后,人们发现并不是所有RNA都是在DNA模板上复制的。许多病毒并没有DNA,只有单链的RNA作为遗传物质。当这些病毒…