不同季节荷斯坦牛3个微卫星座位与GSH-Px、SOD和Na+/K+-ATP酶活性及日产奶量的关系

选择分别与谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)、超氧化物歧化酶(SOD)和Na⁺/K⁺-ATP酶基因紧密连锁的3个微卫星座位BMS2258、SOD1和BM723, 采用PCR及非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析其在130头荷斯坦牛中的遗传变异, 计算了3个微卫星座位的多态信息含量、有效等位基因数和遗传杂合度, 并利用最小二乘法拟合线性模型初步探索了它们与荷斯坦牛夏、秋季GSH-Px、SOD、Na⁺/K⁺-ATP酶活性及日产奶量的关系。结果表明, 3个微卫星座位与其紧密连锁基因的酶活性及日产奶量均存在显著相关(P<0.05)。BMS2258座位182 bp/164 bp的GSH-Px活性和日产奶量对应的最小二乘均值较高; SOD1座位148 bp/146 bp对应的SOD活性的最小二乘均值较高, 148 bp/148 bp对应的日产奶量最小二乘均值较高; BMS2258座位161 bp/111 bp对应的Na⁺/K⁺-ATP酶活性和日产奶量的最小二乘均值较高, 它们是各自座位上的最有利基因型。     

微卫星标记OarAE101和BM1329承五个绵羊品种中的初步研究

选择与Booroola羊高繁殖力主效基因FecB紧密连锁的两个微卫星标记OarAE101和BM1329,分析其在小尾寒羊、湖羊、夏洛来羊、乌珠穆沁羊、多赛特羊和多赛特公羊×小尾寒羊母羊杂一代中的多态分布情况.结果表明微卫星标记OarAE101在5个绵羊品种中的等位基因数为5或4,BM1329在5个绵羊品种中的等位基因数均为4,OarAE101/BM1329在小尾寒羊、湖羊、夏洛来羊、乌珠穆沁羊、多赛特羊和多赛特公羊×小尾寒羊母羊杂一代中的多态信息含量值分别为0.57/0.54、0.62/0.67、0.61/0.59、0.62/0.66、0.56/0.67和0.62/0.68.小尾寒羊OarAE101基因型为107bp/113bp所对应的产羔数最小二乘平均值显著高于基因型为109bp/109bp和107bp/111bp所对应的最小二乘平均值(P＜0.05),产羔数最小二乘平均值在OarAE101其余基因型之间没有显著差异;OarAE101等位基因107bp与小尾寒羊产羔数有显著正相关,109bp和111bp与小尾寒羊产羔数有显著负相关.小尾寒羊BM1329基因型为146bp/158bp所对应的产羔数最小二乘平均值都显著高于其余3种基因型所对应的最小二乘平均值(P＜0.05),产羔数最小二乘平均值在BM1329其余3种基因型之间没有显著差异;BM1329等位基因146bp与小尾寒羊产羔数有显著正相关,148bp与小尾寒羊产羔数有显著负相关.     

CXCR2基因多态性与奶牛乳房炎和乳品质的关联

采用PCR-SSCP技术研究了荷斯坦牛、西门塔尔牛和通江黄牛3个品种共160头个体CXCR2基因多态性与乳房炎抗性性状和对牛奶品质性状的遗传效应。结果表明: CXCR2基因有3个SNP多态位点, 分别位于序列的第685 bp、777 bp和861 bp位点, 确定了5个等位基因A、B、C、E和F。685 bp位点表现为BC和CC基因型, 777 bp位点表现为AA和AB基因型, 861 bp位点为CC和BC基因型。与奶牛乳房炎敏感性有关的基因型主要是BC、CC和FF, 可能对乳房炎有抗性的是AA、AB和EE基因型。据不同基因型对乳品质的遗传效应分析来看, AA、AB和EE基因型的乳品质性状极显著或显著优于其他基因型。     

兔GHR基因单核苷酸多态性及其与屠宰性状的相关性

摘要: 采用PCR-SSCP技术和DNA测序的方法, 对比利时兔、天府黑兔、齐卡巨型兔、哈尔滨白兔以及加利福尼亚兔5个肉兔品种的生长激素受体(Growth hormone receptor, GHR)基因进行单核苷酸多态性分析。结果发现了2个单核苷酸多态位点, 分别位于外显子10的705(T→C)和810 (C→T)。通过最小二乘分析SNPs及其与屠宰性状的关系发现, 基因型AA和MM所对应的活重、全净膛、屠宰率最小二乘均值都显著低于基因型BB和NN(P<0.05)。但各基因型饲料转化率最小二乘均值差异不显著(P>0.05)。由此可以初步推断, GHR基因是影响兔体重和屠宰率等屠宰性状的主要候选基因。     

FSHβ 基因PCR-SSCP多态性及其与济宁青山羊高繁殖力关系的研究

采用PCR-SSCP技术检测促卵泡素b亚基(follicle-stimulating hormone β, FSHβ)基因5′调控区、外显子1和外显子2在高繁殖力山羊品种(济宁青山羊)和低繁殖力山羊品种(辽宁绒山羊、波尔山羊、安哥拉山羊)中的单核苷酸多态性, 同时研究该基因对济宁青山羊高繁殖力的影响。结果表明: 山羊与绵羊的FSHβ 基因该段核苷酸序列同源性为98%。9对引物中, 只有P9的扩增片段存在多态性。P9的扩增片段在济宁青山羊和辽宁绒山羊中检测到AA、AB和AC 3种基因型; 在波尔山羊中检测到AA、CC和AC 3种基因型; 在安哥拉山羊中检测到AA、BB、CC、AB、AC和BC共6种基因型。测序分析发现BB型与AA型相比在外显子2的第94 bp处有G→A突变, 并引起氨基酸改变(丙氨酸→苏氨酸); CC型与AA型相比在外显子2的第174 bp有一处C→T沉默突变。济宁青山羊AA、AB和AC基因型频率分别为0.686、0.137和0.177。AA基因型济宁青山羊产羔数最小二乘均值比AB基因型的多0.78只(P<0.05), 比AC基因型的多0.64只(P<0.05)。     

秦川牛GHR基因SNPs及其与生长性状关系的研究

利用PCR-SSCP技术研究了136头秦川牛GHR基因第10外显子多态性, 所研究的秦川牛群体GHR基因该座位存在多态性, 发现了A、B、C 3个等位基因, 其基因频率依次为0.5956、0.2905、0.1140, 并且群体处于Hardy-Weinberg平衡状态。对纯合基因型个体进行测序, 测序结果, 该座位存在两个突变位点。通过构建最小二乘线性模型, 分析了生长激素受体基因与生长性状的关系, 表明生长激素受体基因的AB基因型效应在部分生长性状上高于其他基因型, 差异达到显著水平, 提示GHR基因有可能作为秦川牛生长性状的侯选基因。     

荷斯坦牛Nramp1基因遗传多态性及其与乳房炎相关性的研究

利用PCR-SSCP技术检测了344头中国荷斯坦牛Nramp1基因exon 11的基因多态性, 并分析了其不同基因型与乳房炎及产奶量性状的关系。结果表明: 实验群体发现3种基因型AA、AB、BB, 其中A等位基因为优势等位基因, 等位基因频率为0.767, 而B等位基因频率则为0.233。经χ2适合性检验, 群体处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。测序结果显示: 扩增片段分别在200 bp(C/G)和254 bp(T/G)存在碱基突变, 并导致了氨基酸改变, 分别为丙氨酸替换为脯氨酸(Ala356Pro)、亮氨基酸替换为蛋氨酸(Leu374Met)。通过构建最小二乘线性模型, 进行Nramp1基因多态性与产奶量、体细胞评分(SCS)的相关性分析表明, AA型个体的SCS最小二乘均值显著低于BB﹑AB型(P<0.05), 而AA型﹑AB个体的产奶量最小二乘均值显著高于BB型(P<0.01, P<0.05), AA基因型可作为乳房炎抗性的优良基因型。因此, 可将Nramp1作为奶牛乳房炎候选基因应用于分子标记辅助选择育种。     

SSR座位与秦川牛及其杂种牛生长性状的相关性分析

本研究以秦川牛及其与利木赞牛、德国黄牛以及红安格斯牛的杂交F_1代(4月龄)共4个牛群体总计164个个体为研究对象,以体尺性状作为衡量牛生长发育性状的指标,运用最小二乘线性模型,分析了10个SSR座位与生长发育性状的相关性.结果表明,10个多态SSR座位基因型对秦川牛及其杂交后代的生长发育性状效果不一:在ETH225座位,CH基因型(152/172)在4个群体内的体高、十字部高、尻长均显著低于其它基因型;BM1500座位,BC基因型(150/164)在十字部高、胸围、体重指标上高于BD型(150/170);HEL5座位,BD基因型(160/170)、EH基因型(172/180)在多项指标上大于其他基因型;BM2113座位,CG基因型(144/164)在体高、体长、腰角宽、胸围和体重指标上大于CF(144/160)、BF(142/160)基因型;CSSM66座位,BG基因型(183/211)在体高、十字部高、胸围指标高于AE基因型(181/207);HEL9座位BG基因型(158/178)在体高,十字部高、胸围、尻长和体重指标上大于EJ基因型(166/186).本研究的结果旨在为科学评价秦川牛的遗传资源价值和良种选育提供理论依据.     

7个微卫星座位与北京荷斯坦母牛体细胞评分关系的研究

选择与体细胞评分紧密连锁的7个微卫星座位BM1818、BM1258、BM1443、BM1905、BM302、BM4505和CYP21,用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析其在240头北京荷斯坦母牛中的遗传变异。计算了7个微卫星座位的等位基因频率、杂合度、多态信息含量和有效等位基因数,并利用最小二乘法拟合线性模型初步探索了这7个微卫星座位与北京荷斯坦母牛体细胞评分的关系。结果表明：微卫星BM1818座位284bp／284bp、BM1258座位106bp／92bp、BM1443座位166bp／160bp、BM1905座位187bp／187bp、BM302座位142bp／140bp、BM4505座位240bp／236bp和CYP21座位215bp／198bp所对应的体细胞评分最小二乘均值较低,对乳房炎抗性而言它们是各自座位上的最有利基因型;微卫星BM1818座位286bp／286bp、BM1258座位102bp／102bp、BM1443座位170bp／160bp、BM1905座位197bp／195bp、BM302座位154bp／145bp、BM4505座位240bp／238bp和CYP21座位204bp／192bp所对应的体细胞评分最小二乘均值较高,对乳房炎抗性而言它们是各自座位上的最不利基因型。     

小梅山、中梅山及大约克猪的SLA-DQB基因外显子2 PCR-RFLP多态性分析

采用限制性内切核酸酶Rsa I对中国地方猪种小梅山,中梅山及国外猪种大约克SLA－DQB基因外显子2的273bp扩增产物进行多态性分析,小梅山猪酶切后出现两种基因型：246bp/27bp(AA),132bp/84bp/30bp/27bp(BB),中梅山猪中出现4种基因型：246bp/27bp(AA),132bp/84bp/30bp/27bp(BB),132bp/114bp/27bp(CC),246bp/143bp84bp/30bp/27bp(AB),大约克猪中出现5 基因型;246bp/27bp(AA),142bp/84bp/30bp/27bp(BB),132bp/114bp/27bp(CC);246bp/132bp/84bp/30bp/27bp(AB).273bp/246bp/27bp(AD),分析发现,SLA－DQB基因外显子2的11,94和124位碱基表现出多态性并在3个猪种中检测到A,B,C和D4个等位基因,χ^2适应性检验结果表明,小梅山,中梅山及大约克SLA－DQB基因外显子2在Rsa I酶切位点 Hardy-Weinberg平衡状态。     

牛POMC基因多态性及其与南阳牛生长性状的相关分析

为研究阿片黑皮质素前体(POMC)在动物采食和能量平衡调控中发挥重要作用, 文章采用PCR-SSCP结合DNA测序方法, 对秦川牛、南阳牛、郏县红牛、晋南牛、鲁西牛、安格斯牛和荷斯坦奶牛共计480头个体POMC基因的多态性进行研究, 并分析了多态位点与南阳牛生长性状的相关性。结果表明, 牛POMC基因3个位点中, 在3′侧翼区P3位点新发现3个连锁存在的SNP(811845 C>T、811821 T>C和811797 A>G, 与NW_928357对照)。POMC基因3′侧翼区多态位点与南阳牛6月龄体重和0~6月龄平均日增重显著相关, BB型个体显著大于AA型(P<0.05)。     

MyoD基因对肉牛胴体性状影响的分析

用PCR技术克隆到MyoD基因的第二内含子, 采用PCR-SSCP方法研究了3个黄牛品种(鲁西牛、晋喃牛、秦川牛)及4个杂交肉牛(夏洛莱×鲁西牛、安格斯×鲁西牛、利木赞×鲁西牛、西门塔尔×鲁西牛)群体MyoD基因的多态性, 并分析了基因位点多态性与肉牛肉质性状的相关性。实验结果,在国内首次扩增出肉牛MyoD基因的第二内含子的全部序列, 共261 bp。用SSCP方法检测到MyoD基因内含子2有A和B两个等位基因。测序结果表明该座位的多态性是由于内含子二39 bp处C-T的突变和112 bp处C→G的突变造成的。等位基因B在中国地方品种的分布频率高于引进品种的杂交牛群体。c2检验的结果表明, 在该位点的除夏洛莱和安格斯杂交牛外, 其余五个群体(晋南、鲁西、秦川、西门塔尔杂交牛和利木赞杂交牛)均处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P>0.05)。实验群体不同基因型与肉牛的宰前活重、胴体重、净肉重、高档肉重、眼肌面积等性状的影响差异极显著或显著(P<0.01或P<0.05), 并且AA型个体均高于AB型个体。     

绵羊H-FABP基因单核苷酸多态性的研究

以小尾寒羊(48只)、宁夏滩羊(121只)、滩寒杂交羊F1(23只)、无角陶塞特(48只)、萨福克(24只)5个绵羊群体为实验材料, 利用PCR-SSCP和DNA测序技术对心脏型脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因(GenBank登录号: AY157617)外显子2和内含子2部分序列进行单核苷酸多态性(SNPs)检测及遗传多态性分析。结果表明: (1)引物2的PCR扩增产物中存在981(G/A)、1014(A/C)、1019(T/C) 和1058 (-/G ) 4个SNP位点, 表现为AA、BB、CC、AB、AC、BC、AD、CD和BD 9种基因型, 其中AA为优势基因型。经χ2检验后, 除滩羊和萨福克羊外, 其他群体的基因频率和基因型频率均处于Hardy-Weinberg平衡状态。群体遗传多态性分析表明: 宁夏滩羊、小尾寒羊和无角陶塞特羊3个群体中的多态信息含量(PIC)均处于0.25和0.50之间, 为中度多态, 萨福克羊和滩寒杂交羊F1为低度多态(PIC<0.25), 表明脂肪酸结合蛋白基因在不同绵羊品种中具有单核苷酸多态性, 可以进一步作为候选基因来分析其与肌内脂肪含量性状的关联性。(2)引物4的PCR扩增产物中检测到1个SNP多态位点为2407(T/C), 表现为HH、Hh和 hh 3种基因型, 基因型频率大小为HH＞Hh＞hh, 经χ2检验后, 在滩羊和无角陶塞特羊中均为达到Hardy-Weinberg平衡状态, 其多态信息含量均为低度多态(PIC<0.25), 而在小尾寒羊、滩寒杂交羊F1和萨福克羊均没有多态出现。     

山羊GOLA-DQB1基因外显子2多态性与免疫性状的相关分析

利用PCR-RFLP技术, 对莱芜黑山羊、鲁波山羊和波尔山羊3个山羊种群共 175 只个体的GOLA-DQB1基因外显子2进行遗传多态性研究, 并对山羊种群的血液免疫指标的效应进行了分析。结果表明: 3个山羊种群共检测到(AA、BB、CC、AB、AC、BC、DD)7种基因型, GOLA-DQB1基因外显子2的第24、151位的碱基表现出多态性。多数指标品种效应是主要效应。莱芜黑山羊中, BC基因型的淋巴细胞百分比(W-SCR)显著高于AC 、CC基因型(P<0.05), 中性球比例(W-LCR)显著低于CC基因型(P<0.05), 大型白细胞数(W-LCC)低于AC、CC基因型, 但差异不显著(P>0.05)。波尔山羊中, BC基因型的W-LCC低于AA 、AB 、BB基因型, 但差异不显著(P>0.05)。鲁波山羊中, BC 、AC基因型的W-LCC显著低于AA基因型(P<0.05)。揭示GOLA-DQB1基因与血液免疫性状有一定的相关性。     

GDF9 as a candidate gene for prolificacy of Small Tail Han sheep

Growth differentiation factor 9 (GDF9) which controls the fecundity of Belclare, Cambridge, Santa Ines, Moghani, Ghezel and Thoka ewes was studied as a candidate gene for the prolificacy of Small Tail Han sheep. According to the sequence of ovine GDF9 gene, six pairs of primers were designed to detect single nucleotide polymorphisms of two exons of GDF9 gene in both high fecundity breed (Small Tail Han sheep) and low fecundity breed (Dorset sheep) by polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism (PCR-SSCP). Only the products amplified by primers 2-1 and 2-2 displayed polymorphisms. For primer 2-1, three genotypes (AA, AB and BB) were detected in both sheep breeds. Sequencing revealed one silent mutation (G477A) in exon 2 of GDF9 gene in the BB genotype in comparison with the AA, which was known as G3 mutation of GDF9 gene in Belclare and Cambridge ewes. The relationship of least squares means for litter size was AA?>?AB?>?BB in Small Tail Han sheep (P?>?0.05). For primer 2-2, two genotypes (CC and CD) were detected in both sheep breeds. Sequencing revealed one novel single nucleotide mutation (G729T) in exon 2 of GDF9 gene in the CD genotype in comparison with the CC, which resulted in an amino acid change (Gln243His). The ewes with mutation heterozygous genotype CD had 0.77 (P?相似文献   

Effect of genetic variation of CEBPA gene on body measurement and carcass traits of Qinchuan cattle

In our study, genetic variation in coding region of cattle CCAAT enhancer binding protein alpha(namely CEBPA)gene was detected by PCR-RFLP and DNA sequencing methods in 215 individuals from Qinchuan cattle breed. Two haplotypes (A and B) and three observed genotypes (AA, AB, and BB) were detected. The result of DNA sequence showed one mutation by comparisons with NC_007316. The mutation at nt963 (T>G) were located in coding region of the CEBPA gene. Associations between the CEBPA gene genetic variation and the carcass traits were revealed in Qinchuan cattle. Least squares analysis revealed a significant statistical effect of the CEBPA gene different genotypes on slaughter weight and carcass weight in Qinchuan cattle. Individuals with BB genotype showed higher slaughter weight and carcass weight than individuals with AA and AB genotypes. Therefore, these results suggest that the CEBPA gene is a strong candidate gene that affects carcass traits in Qinchuan cattle.