中国绒山羊遗传多样性现状和系统发生关系的微卫星分析

为了调查中国绒山羊遗传资源现状,作者应用联合国粮农组织和国际家畜研究所推荐的19对微卫星引物并结合荧光PCR技术,对9个中国地方产绒山羊群体和1个西非山羊品种进行了遗传多样性检测。14个微卫星座位在10个山羊群体中显示为高度多态,可作为山羊遗传多样性分析的有效标记。多态信息含量和遗传杂合度等数据表明:目前中国地方产绒山羊群体的遗传多样性较为丰富,并且大部分保种场较好地保存了这些地方资源。采用非加权配对算术平均法构建的聚类图和采用主成分分析法得到的散点图均显示,中国山羊与西非山羊为不同的2类;中国产绒山羊中河谷山羊、河西绒山羊与其他山羊的遗传距离较远;其他山羊又大致分为2类:一类由辽宁绒山羊、新疆山羊、柴达木山羊、陕北山羊组成,另一类由内蒙古绒山羊组成。此研究结果为开展我国地方绒山羊种质特性研究及资源保护和利用提供了科学依据。     

边际多样性方法在中国猪种保护资金分配中的应用

农业动物种质资源面临着严重危机,有必要构建一个科学、有效的保护方案,合理分配有限的资金,以期保护最大的多样性。本文应用边际多样性方法,以中国18个地方猪种为例,通过对灭绝概率、现实多样性、边际多样性和保护潜力的分析,应用3种模型分析了未来群体期望多样性变化趋势,并提出了相应的资金优化配置方案。在文中所涉及的模型中,加性模型(ModelA)被评定为资金优化配置的最佳模型;共有10个品种获得保护资金,其中杭猪获得最高比例(16%)的保护资金;其次为赣中南花猪(万安猪)、嵊县花猪,各获得14%;阳新猪、乐平猪各获得11%;五指山猪、玉山乌猪、赣中南花猪(冠朝猪)、清平猪、武夷黑猪和嘉兴黑猪分别获得10%、9%、9%、2%、2%和2%的保护资金。结果表明,分配保护资金需综合考虑群体的受威胁程度、群体遗传多样性和经济重要性等。     

牛、绵羊角的遗传定位及遗传机制研究进展

角属于动物颅骨附属物,为反刍动物所特有。牛(Bos taurus)、绵羊(Ovis aries)角的表型包括野生型两角表型、人工驯化的无角表型、畸形角等多种。牛和绵羊是阐明角的质量性状和数量性状之间的关系以及质量性状的多基因调控机制等方面的理想动物模型。近年来,对角性状研究不断深入,在阐明新器官起源进化、自然选择、性别选择和人工选择对角表型的影响等方面取得了一系列进展。本文详细介绍了角的研究概况、多角表型遗传定位、无角位点基因遗传定位和畸形角等,并对目前牛和绵羊角的遗传机制及存在的问题进行了分析,以期为反刍动物角性状和其他特异性性状遗传机制研究提供参考。     

应用微卫星标记分析23个中国地方马种的遗传多样性

为了调查中国马种的群体遗传分化与遗传结构状况, 本研究应用FAO和ISAG推荐的25对微卫星引物, 结合荧光标记PCR分析技术, 对中国23个马群体和1个英纯血马群体进行了分子遗传学研究。结果表明: 中国地方马群体的遗传多样性比较丰富, 23个中国马群体的等位基因数、多态信息含量和遗传杂合度等都高于英国纯血马。根据群体遗传距离构建的系统进化树, 能够清晰地将英纯血马从中国马中独立出来, 同时可将中国马群体分成不同的支, 基本上与其地理分布格局相符。我们用MVSP软件进行群体遗传分化分析可见, 前三个主成分的三维散点图可以明显地把英纯血马从所有群体中独立出来, 并把中国的马群体分成几个相对独立的支。进一步分析第一、二主成分的二维散点图, 可将中国的马群体分化成南方支系、藏马支系、新疆和青海支系、内蒙古支系及东北支系等5个部分。根据Structure软件分析, 推测中国马群体含有5个潜在的支系, 基本上代表了我国现在主要家马来源的基础遗传支系。这些信息可以为我国现有马种类型的划分与马种资源遗传多样性的保护提供科学依据。     

应激诱导对体外培养早期胚胎细胞凋亡的影响

细胞凋亡是早期胚胎清除由于自身或外界环境影响产生的不良细胞的主要途径之一。体外培养的早期胚胎易受一些环境及外源刺激,如氧化剂、机械刺激、重金属和生物类的毒素等产生一系列的刺激性反应,包括细胞转导路径,基因的表达和蛋白的合成,细胞的分裂增殖及凋亡,甚至是坏死;维生素E,维生素C,金属硫蛋白对细胞的凋亡起抑制作用。从凋亡的分子机制进行深入研究,利于从根本上改变胚胎质量,提高囊胚率和附植率。     

绵羊H-FABP基因单核苷酸多态性的研究

以小尾寒羊(48只)、宁夏滩羊(121只)、滩寒杂交羊F1(23只)、无角陶塞特(48只)、萨福克(24只)5个绵羊群体为实验材料, 利用PCR-SSCP和DNA测序技术对心脏型脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因(GenBank登录号: AY157617)外显子2和内含子2部分序列进行单核苷酸多态性(SNPs)检测及遗传多态性分析。结果表明: (1)引物2的PCR扩增产物中存在981(G/A)、1014(A/C)、1019(T/C) 和1058 (-/G ) 4个SNP位点, 表现为AA、BB、CC、AB、AC、BC、AD、CD和BD 9种基因型, 其中AA为优势基因型。经χ2检验后, 除滩羊和萨福克羊外, 其他群体的基因频率和基因型频率均处于Hardy-Weinberg平衡状态。群体遗传多态性分析表明: 宁夏滩羊、小尾寒羊和无角陶塞特羊3个群体中的多态信息含量(PIC)均处于0.25和0.50之间, 为中度多态, 萨福克羊和滩寒杂交羊F1为低度多态(PIC<0.25), 表明脂肪酸结合蛋白基因在不同绵羊品种中具有单核苷酸多态性, 可以进一步作为候选基因来分析其与肌内脂肪含量性状的关联性。(2)引物4的PCR扩增产物中检测到1个SNP多态位点为2407(T/C), 表现为HH、Hh和 hh 3种基因型, 基因型频率大小为HH＞Hh＞hh, 经χ2检验后, 在滩羊和无角陶塞特羊中均为达到Hardy-Weinberg平衡状态, 其多态信息含量均为低度多态(PIC<0.25), 而在小尾寒羊、滩寒杂交羊F1和萨福克羊均没有多态出现。     

新疆阿勒泰地区图瓦人与邻近人群遗传关系初探

在中国新疆阿勒泰地区哈纳斯景区内, 生活着一个特殊的人群—— 新疆图瓦人。他们在50年代初期第一次民族识别过程中被认定为蒙古族, 但他们自认为与蒙古人具有不同的历史渊源。为了探讨新疆图瓦人的族源问题和阐明其与邻近人群的遗传学关系, 文章采集了新疆阿勒泰地区150份男性图瓦人样本, 对其Y染色体非重组区的14个标记位点进行了分型, 构建了11种单倍型群。结果显示, 新疆图瓦人具有高频率的K^*-M9 和Q^*-M242单倍型群, 这两个单倍型群在俄罗斯图瓦人中也具有较高的频率, 而在蒙古人群和哈萨克人群中的频率则较低。主成分分析和多维尺度分析均显示新疆图瓦人与蒙古人和哈萨克人遗传上相隔较远。系统分子进化分析也表明新疆图瓦人位于与周围人群相隔较远的分化枝上。依据这些结果, 文章认为新疆图瓦人是与邻近人群如蒙古人和哈萨克人有较大遗传差异的人群。     

绵羊不同发育阶段背最长肌组织中可变剪接的鉴定与分析

可变剪接(Alternative splicing,AS)是动植物体内蛋白质多样性和遗传多样性的重要调控机制。为鉴定和分析绵羊不同发育阶段背最长肌组织中可变剪接,对多浪绵羊妊娠90日龄胎儿(F90)、出生后30日龄羔羊(L30)和成年3岁羊(A3Y)的背最长肌组织进行转录组测序,利用rMATS软件鉴定样品中的可变剪接事件和差异剪接基因(Differential splicing gene,DSG),并对DSG进行GO和KEGG功能富集分析。结果表明,绵羊背最长肌组织在F90、L30和A3Y时期分别鉴定出13 923、11 959和12 164个可变剪接事件,其中外显子跳跃(Skipped exons,SE)的比例最高,约为70.69%,5'端可变剪接位点(Alternative 5'splice sites,A5SS)、3'端可变剪接位点(Alternative 3'splice sites,A3SS)、互斥外显子(Mutually exclusive exons,MXE)和内含子保留(Retained introns,RI)的比例分别约为7.28%、11.18%、5.96%和4.84%。在F90_vs_L30、F90_vs_A3Y和L30_vs_A3Y比较组中分别鉴定到2 545、2 689和1 701个显著的差异剪接基因(P0.05)。GO和KEGG功能富集分析显示,差异剪接基因显著富集到横纹肌发育、肌肉结构发育、肌细胞分化、肌膜、胰岛素信号通路、Wnt信号通路、MAPK信号通路等与肌肉发育密切相关的通路上。上述结果表明可变剪接在背最长肌发育中发挥重要作用。     

11个绵羊品种MSTN基因非翻译区的变异

利用PCR-RFLP技术对特克塞尔羊、夏洛莱羊、小尾寒羊、蒙古羊、乌珠穆沁羊、阿勒泰羊、呼伦贝尔羊、塔什库尔干羊、多浪羊、湖羊和岗巴羊11个品种的345个个体的肌肉生长抑制素(Myostatin, MSTN)基因非翻译区(UTR)的变异进行了多态性分析。结果表明大小为271 bp和1 003 bp的扩增片段经限制性内切酶MboⅡ和BsaⅠ酶切后表现多态, 经卡方检验所有品种在该基因座位均处于平衡状态(P>0.05), 3种基因型在11个绵羊品种中的分布差异极显著(P<0.01)。通过限制性内切酶HpyCH4Ⅳ 酶切实验, 证明我国9个地方绵羊品种不存在特克塞尔绵羊中发现的导致肌肉发达的SNP位点, 并在3′UTR区发现了个别碱基突变位点能够形成miRNA作用的靶基序, 测序表明3′UTR区的突变频率较高。