太白山土壤淡色丝孢真菌群落多样性及生态位

从秦岭太白山南、北坡采集的40个土壤样品中分离纯化得到土壤淡色丝孢真菌16属,利用物种丰富度、Shannon-Wiener多样性指数、均匀度、生态位宽度及生态位重叠等指标对太白山南、北坡不同林带土壤淡色丝孢真菌的群落结构进行了研究.结果表明：土壤淡色丝孢菌各物种在南、北坡各林带中的分布具有明显的环境梯度格局.海拔和植物林带类型是决定太白山土壤淡色丝孢菌分布的主要因素.淡色丝孢真菌物种丰富度和多样性指数随着海拔的升高呈明显降低的趋势;群落的均匀度随海拔的升高呈一定的升高趋势,但规律不明显.对淡色丝孢菌各物种的生态位研究结果表明,太白山南、北坡青霉属、曲霉属、轮枝孢属、拟青霉属、枝顶孢属等物种生态位宽度值较大,与其他各属的生态位重叠较高,说明上述各属真菌在太白山南、北坡分布较广泛.而单端孢属、粘帚霉属、绿僵菌属的生态位宽度较窄,与其他各属的生态位重叠较小,说明这些属的真菌分布受海拔高度及植被类型的影响较大,仅在某些特殊林带中出现.     

上海城市公园苔藓植物多样性分布格局及其环境影响因子

城市公园的生物多样性十分丰富,在生物多样性保护方面具有重要价值。苔藓植物是公园生物多样性的重要组成成分,但因其体型小、难以鉴定等,容易被人们所忽略,因此对其多样性的研究和保护也相对薄弱。本文基于文献资料和生态调查数据,整合上海市中心城区和郊区共35个样点的苔藓植物名录,应用聚类分析对公园进行分组,比较了市区和郊区两个区域的苔藓植物相似性;采用典范对应分析(CCA)及层次分割的方法,定量研究环境因子与城市公园苔藓植物多样性分布格局的关系。结果表明, 35个公园共有苔藓植物34科74属164种,包括苔类7科8属9种、藓类27科66属155种,其中有12种中国特有种和4种近危种。根据聚类分析结果, 35个公园可划分为两组,主要与人口密度、与市中心距离、与主干道距离及公园面积等因素有关。市区和郊区两个区域的科、属、种的Jaccard相似性系数分别为0.94、0.89和0.30,表明两个区域的物种组成各有特点。层次分割结果显示,环境因子对城市公园苔藓植物多样性分布格局的解释率从高到低分别为人口密度、公园年龄、与市中心距离、与主干道距离、森林覆盖率、湖泊覆盖率及公园面积。整体上,上海城市公园苔藓植...     

内蒙古荒漠沙柳AM真菌物种多样性

分别于2009年5月、8月和10月在内蒙古黑城子、正蓝旗和元上都3个样地采集沙柳(Salix psammophila)根围0-50 cm土层土样,研究了AM真菌群落组成及其生态分布特点.在分离的4属37种AM真菌中,球囊霉属(Glomus)23种,无梗囊霉属(Acaulospora)10种,这两属是3样地共同优势属;盾巨孢囊霉属(Scutellospora)3种,仅分布在黑城子和正蓝旗样地;巨孢囊霉属(Gigaspora)1种,仪分布在正蓝旗样地;网状球囊霉(G.reticulatum)是3样地共同优势种.AM真菌种丰度、均匀度指数、Shannon多样性指数、Simpson多样性指数大小依次是正蓝旗>黑城子>元上都;元上都样地的AM真菌组成与其他样地差异显著;8月和10月的AM真菌种丰度、Shannon多样性指数显著高于5月.随土壤碱解N含量提高,AM真菌种丰度、均匀度指数、物种多样性指数先升后降.结果提示,在评估荒漠环境沙柳和AM真菌共生关系时,AM真菌生态分布和丰富度是十分有用的指标.     

蒜头果的内生真菌多样性分析

蒜头果为我国特有单种属植物,其果实富含神经酸,是一种很有开发前景的野生植物资源。为了解蒜头果中内生真菌的种类及分布情况,本研究对生长于裸露石灰岩山地和石灰岩林地两种生境的蒜头果分别取样,利用传统分离方法对蒜头果的根、树皮及叶组织中的内生真菌进行分离纯化,并依据形态学特征和r DNA-ITS序列对菌种进行鉴定。所有样品共分离获得112株内生真菌,分别属于10个属,其中紫霉属(Purpureocillium)、酵母样菌属(Acaromyces)、木霉属(Trichoderma)、淡紫紫孢菌(Purpureocillium lilacinum)为优势菌种。分析显示内生真菌在不同部位差异明显,根中内生真菌分布最为普遍,两种生境条件下分离率都为100%,对比之下树皮分离率分别为56.7%和63.3%,叶的都为26.7%。不同生境对蒜头果内生真菌具有明显影响,在裸露石灰岩山地根、树皮、叶的多样性指数分别为0.756、1.518和0.662,石灰岩林地分别为1.412、1.439和0.974。在两种生境条件下,树皮的真菌多样性相似,根和叶的多样性都表现出石灰岩林地高于裸露石灰岩山地。     

太白山北坡小型兽类物种多样性垂直分布格局北大核心CSCD

物种多样性沿海拔梯度的垂直分布格局一直是生物多样性研究的热点问题,其中最为普遍的分布模式为中峰格局。为了解太白山北坡小型兽类物种组成和物种多样性垂直分布格局,本研究于2020和2021年两年的6至9月采用样线法、铗日法和陷阱法对太白山北坡小型兽类物种进行调查。在海拔780~3767.2 m之间,以200 m为梯度,设置采集样点15个,累计布置4150铗次,陷阱105个,样线8条。共记录小型兽类4目7科12属21种148只,阔叶林中的小型兽类物种多样性普遍高于针叶林,物种多样性在中海拔地区栓皮栎(Quercus variabilis)林、锐齿槲栎(Q.aliena)林最高,高海拔地区秦岭冷杉(Abies fargesii)林最低。小型兽类物种多样性垂直分布格局为左偏倚中峰格局,物种多样性在1500~2300 m海拔段内出现峰值。这种分布格局和林型中小型兽类东洋界与古北界、特有种与非特有种在太白山地区交汇有关,太白山北坡南北纵列的山脉-沟谷地貌为南北物种扩散和迁移提供了有利条件,在沟谷内气候和地理特征相似,形成了规律的林型垂直带谱,这使得小型兽类物种多样性垂直分布也具有相似的特点。     

高黎贡山不同土地利用方式对土壤 微生物数量和多样性的影响

测定了高黎贡山不同利用方式土壤中微生物的数量、小型真菌的多样性和属的分布,分析了上述指标在不同利用方式土壤中的分布与人为干扰和环境因素之间的相互关系。结果表明微生物数量和真菌的多样性在不同利用方式土壤中的分布是,原生林(次生林(幼杉木纯林;耕作通常使条件更有利于土壤微生物生长繁殖,成熟人工纯林和旱地的土壤微生物数量及真菌多样性均较高;在五类利用方式中,土壤微生物数量及真菌多样性以原生林最高,荒地最低。     

山地物种海拔分布对气候变化响应的研究进展

过去1个世纪以来, 全球气候变化显著并已成为全球生物多样性面临的重要威胁之一。如何利用有限的资源最有效地保护生物多样性已成为亟待解决的最重要科学问题之一。山地因其具有较高的生境异质性、气候多样性和较低的人类活动干扰, 已成为最重要的生物多样性避难所, 也具有较高的生态服务价值, 在生物多样性保护中扮演着重要角色。但山地更容易受到气候变化的影响, 山地地区较为剧烈的气候变化将对山地生态系统的稳定性及其多样性造成严重威胁。理解山地物种海拔分布对气候变化的响应和潜在机理, 以及气候变化带来的物种海拔分布变化的负面效应, 将为全球气候变化背景下的山地生物多样性保护提供参考依据。本文综述了全球山地地区的气候变化情况, 总结了物种海拔迁移的研究进展, 重点讨论了山地物种分布最适海拔、海拔上下限和海拔分布范围变化的研究进展及不足, 比较了不同地区和不同类群物种海拔迁移的差异性, 以及物种对气候变化响应的滞后性。从生物及非生物因素等多个角度概括了物种海拔迁移响应气候变化的潜在机理, 评估并总结了气候变化引起的物种海拔分布所产生的负面效应, 主要对物种向上迁移对高海拔地区物种多样性的影响、物种迁移带来的分布区改变导致的物种灭绝风险以及物种海拔分布变化导致的种间相互作用改变等方面进行全面探讨。最后, 展望了未来在此领域研究中应注意的问题, 提出了在未来气候变化下山地生物多样性保护需要采取的措施, 强调应重点关注对气候变化较为敏感的类群及生物多样性区域, 加强中国山地物种对气候变化响应的监测网络建设和研究力度, 重点加强监测气候变化对动植物互作关系的影响。     

巴卡小寨混农林系统农业生物多样性管理与评价

大量研究资料表明 ,混农林业是适宜热带山地社区持续发展的农业生产模式之一。本文以云南省西双版纳傣族自治州基诺族乡巴卡小寨为调查田野点 ,应用人类学、户级水平农业生物多样性评价和访谈等调查方法。设置以橡胶、水果树、薪炭林为主的三种混农林业实践类型共 2 4个样方 ,分别属 1 8位农户。文章主要探讨不同类型混农林业实践在市场经济影响下对农业生物多样性的影响及两者与传统生活方式的互动等     

中国江西龙虎山崖顶植物根中深色有隔内生菌多样性

为探明丹霞地貌区崖顶植物深色有隔内生真菌（dark septate endophyte,DSE）多样性、群落组成以及生态分布规律。本文以江西龙虎山崖顶常见植物刺柏、马尾松、青冈栎、檵木、乌饭树、鸭跖草、苦槠、辣木树和香附子9种植物的根为研究对象,采用经典的组织分离方法分离DSE真菌,结合形态学特征和分子生物学数据研究丹霞地貌区崖顶常见植物DSE真菌多样性。结果表明：从9种植物根部990个组织块中,共分离纯化出404株菌株,经鉴定隶属于45个分类单元。其中,青霉属Penicillium、拟内孢霉属Endomycopsis、曲霉属Aspergillus、头囊霉属Ascocybe为优势属群,属种组成在不同植物中存在差异,且内生真菌属的数目与植物优势度极显著正相关（P<0.01）。9种植物深色有隔内生真菌（DSE）总分离率在0.51%-13.33%之间;各植物DSE Shannon指数在0.0743-1.0400之间,与植物优势度极显著正相关（P<0.01）,差异明显;Simpson指数较高（均值>0.7）且Pielou指数较低（均值<0.4）表明DSE真菌在不同植物分布不均匀;相似性指数普遍不高,在0.071-0.467之间。本研究初步揭示了丹霞地貌区崖顶深色有隔内生真菌的分布及多样性情况,为进一步探讨内生真菌在丹霞地貌等特殊生境的生态功能提供参考。     

白及根部内生真菌多样性研究

白及是地生兰科多年生草本植物,是常见的中草药之一。白及根是白及植株吸收养分和水分的主要场所,开展其根部内生真菌的群落组成及多样性分析,对了解云南原生境白及与根部内生真菌间的共生关系具有重要意义。本研究采用形态学和ITS rDNA分子系统发育分析相结合的方法进行菌株鉴定。结果表明,3个采样点的白及根部分离到可培养内生真菌32株,包括9个目、13个科、16个属。其中木霉属Trichoderma、镰刀菌属Fusarium、拟盘多毛孢属Pestalotiopsis为优势类群,分别占总物种数的21.88%、18.75%、9.38%;中碳垫菌属Nemania、丛赤壳属Nectria、炭角菌属Xylaria、紫霉属Purpureocillium、刺盘孢属Colletotrichum、黑孢子菌属Nigrospora、Biscogniauxia、腐质霉属Humicola、脉孢菌属Neurospora、拟茎点霉属Phomopsis、植物腐霉Phytopythium、毛霉属Mucor、伞状霉属Umbelopsis为常见内生真菌类群。α多样性指数分析表明：各采样点的白及根部内生真菌物种多样性最高的是昆明市水源保护区采样点（D=0.799,H’=1.698）,保山市龙陵县采样点物种多样性最低（D=0.787,H’=1.580）。β多样性分析采样点之间的Jaccard（0.912-0.993）、Bray-Curtis（0.838-0.986）和UniFrac（加权0.618-0.631;不加权0.770-0.799）距离,结果表明3个采样点之间的内生真菌群落组成存在差异。3个采样点的不同地理环境和土壤类型给白及提供了不同的生境条件,是影响白及根部内生真菌物种丰度和群落组成差异的主要因素之一。     

五种水螅基因组DNA的RAPD多态性研究

利用RAPD技术对水螅科2属5种水螅进行了基因组DNA多态性研究.80个随机引物筛选出18个引物,共扩增出303个清晰稳定的DNA片段,分子量在0.3～3.0kb之间.以UPGMA聚类法构建树状图,阐明水螅属种的分类关系:大庆水螅Hydra daqingensis、北京水螅H.beijingensis和强壮水螅H.robusta 3种分成两组并聚在一起;不同属的漠河水螅H.mohensis和绿水螅Chlorohydra sp.聚为一支;由此2属5种水螅分为两个支系.     

Taxonomic and phylogenetic relationships among the genera of the True Citrus Fruit Trees Group (Aurantioideae,Rutaceae) based on AFLP markers

Fifty-nine genotypes representing six genera of the True Citrus Fruit Trees Group (Aurantioideae, Rutaceae) were analyzed using AFLP technique to study their taxonomic and phylogenetic relationships. Fifteen primer combinations (out of 64 screened) were selected based on the polymorphism and quality of the bands produced by the primer and used in the present study. A total of 312 bands were obtained, of which 305 (97.8%) were polymorphic. The UPGMA tree of all genotypes was constructed based on the AFLP data using PAUP* beta version 4.0b8 software. Our AFLP molecular tree clearly confirms that the True Citrus Fruit Trees Group is monophyletic and supports the division of the group into genera mainly based on morphological characters, except that the genus Fortunella was nested within the genus Citrus cluster (as a monophyletic sub-branch). The subdivision of the genus Citrus into subgen. Papeda and subgen. Eucitrus as suggested by W. T. Swingle based on morphological characters and the point of view that C. medica, C. grandis and C. reticulata are the three basic species of the subgen. Eucitrus were also supported by our molecular data. In addition, contrary to the expectation based on morphological data, however, our molecular data demonstrated that C. ichangensis is more closely related to C. junos of the subgen. Eucitrus than to the C. hystrix of the subgen. Papeda. Furthermore, our study provided the first evidence that C. mangshanensis is basal to all the loose-skin citrus types. Finally, the taxonomic and phylogenetic relationships among the six genera and the important genotypes of the genus Citrus were dis-cussed in detail.     

从12S rRNA基因序列探讨中国10种壁虎的系统关系

对肌肉样品采用SDS／蛋白酶K裂解,酚－氯仿抽提和乙醇沉淀提取总DNA,用线粒体12SrDNA通用引物扩增,用银染测序和ABI Prism 310型遗传分析仪测定了Gekko japonicus,G.swinhonis,G.hokouensis,G.gecko,Cyrtopodion elongatus,C.russowi,Teratoscincus roborowskii,Hemidactylus bowringii.,H.frenatus和Gehyra mutilata 10种壁虎的线粒体12SrRNA基因片段的序列,对位排列后的序列长421bp,含201个变异位点,属间核苷酸变异范围为0．228－0．282,属内是0．005－0．263。重建的分子系统树将10种壁虎聚为三支：第1支是大壁虎和截趾虎,第2支由壁虎属其余的3个种构成一个单系;第三支由基余3个属的5个种组成,研究结果表明：截趾虎与壁虎属4物种亲缘关系较近;吐鲁番沙虎和弯脚虎属2物种,晰虎属2物种之间的亲缘关系较近,支持Russell(1976)关于弯脚虎属与晰虎属间进化关系的研究结果而不支持Kluge(1987)将沙虎属另立亚科的系统发生假说;铅山壁虎与无蹼壁虎最先聚为姐妹群,再与多疣壁相聚组成一个单系。     

Molecular phylogeny of plethodonine salamanders and hylid frogs: statistical analysis of protein comparisons.

The bootstrapping method of determining confidence in the topology of phylogenetic trees has been applied to electrophoretic protein data for two groups of amphibians: salamanders of two North American genera (Aneides and Plethodon) of the tribe Plethodontini and Holarctic hylid frogs. Some current methods of phylogenetic reconstruction for electrophoretic protein data have been evaluated by comparing the trees obtained from molecular data sets with available morphological data. Molecular data on the phylogenetic relationships of Aneides and Plethodon, data obtained from electrophoretic and immunological studies, indicate that Aneides probably was derived from western Plethodon subsequent to the separation of eastern and western Plethodon. Thus Plethodon very likely is a paraphyletic genus. The extremely low rate of morphological evolution in Plethodon compared with that in Aneides causes difficulty in indicating their evolutionary relationships taxonomically because there are no synapomorphic morphological characters that define either eastern or western Plethodon, whereas there are several for the genus Aneides. Thus molecular data alone probably indicate the evolutionary relationships of the species in these genera. Highton and Larson's (1979) arrangement of species of Plethodon into eight species groups is supported. The topologies of the unweighted pair-group method using arithmetic means (UPGMA) and distance Wagner trees were compared with independent morphological and molecular data on the relationships of the 28 plethodonine species. It was found that UPGMA trees indicate relationships that are more in agreement with other information than are those provided by distance Wagner trees. The use of the bootstrap technique indicates that the topologies of UPGMA trees are better supported statistically than are the topologies of distance Wagner trees. Moreover, different addition criteria produce a variety of distance Wagner trees with different topologies, each with several groupings that are not supported statistically. It is concluded that considerable caution should be used in interpreting the topology of distance Wagner trees. Very similar results were obtained with a second data set on 30 taxa of Holarctic hylid frogs. Trees obtained by the neighbor-joining method are more in agreement with UPGMA phenograms and other data, so this method of phylogenetic reconstruction may be useful to systematists not willing to assume constant rates of evolution.(ABSTRACT TRUNCATED AT 400 WORDS)     

七种蟋蟀基因组DNA的RAPD多态性研究（直翅目：蟋蟀总科）

应用10种随机引物,对西北地区常见的3属7种蟋蟀进行RAPD多态性检测,共筛选出2种引物S142,S8可以对7个种扩增出清晰稳定的多态性片段,多态性片段共计58条,相对分子质量在320bp-2400bp之间。应用UPGMA（非加权配对算术平均法）对多态性片段进行聚类分析,构建树状图,推测系统发生关系。每一种蟋蟀均先各自聚为一类,棺头蟋属与油葫芦属间的遗传距离最小,亲缘关系最近,斗蟋属4个种间的亲缘关系较为复杂,明显分为2个支系,与传统分类并不一致。     

部分小檗科植物的RAPD 分析

利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术分析了部分小檗科(Berberidaceae)5 个属6 种植物:猫儿刺(Berberis julianae Schneid.), 日本绿叶小檗(Berberis thunbergii DC.), 阔叶十大功劳(Mahonia bealei (Fo rt.)Carr.), 南天竹(Nandina domestica Thunb.), 淫羊藿(Epimedium sagittatum(S.et Z.)Maxim.)和八角莲(Dysosma versipellis (Hance)M.Cheng.)。经筛选Sangon 公司的60 个引物, 其中29 个引物的谱带清晰并呈多态性。采用UPGMA 法对求出的遗传距离进行聚类分析, 结果显示:在小檗科内建立十大功劳属(Mahonia)和南天竹属(Nandina)是合理的。     

节丛孢属rDNA ITS区RFLPs分析

利用PCR朢FLP方法对捕食线虫真菌节丛孢属进行了系统发育研究。以ITS1和ITS4为引物对该属10种12个菌株的核糖体DNA转录间区（ITS）进行了PCR扩增,4种内切酶（AluI、HaeIII、HpaII、TaqI）酶切。结果表明该属的ITS区长度没有明显差异,其长度范围在658～705之间,酶切图谱能体现不同种间的多态性,根据4种内切酶酶切结果,利用UPGMA法构建的节丛孢属分子系统树,基本体现了属内不同种间的亲缘关系,从分子水平证明了节丛孢属形态分类上的合理性,同时对该属属征的扩大提出疑议。     

Rhizosphere micro-organisms in relation to the apple replant problem

Summary One of the factors giving rise to soil sickness in apple orchards is the rhizosphere microflora. The composition of the microbial coenosis in the rhizosphere changes with increasing age of the apple trees. An increase in the counts of micromycetes and actinomycetes and a decrease in bacterial counts was found in agreement with the decreasing pH of the rhizosphere soil. The presence of fluorescent pseudomonads in the rhizosphere of old apple trees was rare, but the planting of apple seedling into sick soil induced their proliferation. The relative proportion of individual genera of micromycetes changed according to the tree age; fungi of the genus Mucor were more often found in the rhizosphere of younger trees than in that of older ones while fungi of the genus Penicillium had an opposite trend. Biological tests showed that Penicillium fungi form the majority of the phytotoxic microflora. The amount of phytotoxic micromycetes was higher in ‘sick’ soil as compared with control soil in which apple trees had not been grown for at least 15 years. Higher numbers of phytotoxic micromycetes were isolated also from the rhizosphere of apple seedlings grown in ‘sick’ soil as compared with those growing in control soil. An increase in the amount of phytotoxic micromycetes in apple tree rhizosphere could be induced by mere addition of 5% (w/w) ‘sick’ soil to the soil in which apple trees were grown for the first time. By adding sterilized ‘sick’ soil, the amount of phytotoxic micromycetes in the apple seedling rhizosphere was not affected. Increased numbers of phytotoxic micromycetes affected negatively the growth of apple trees and the morphology of apple tree roots. This demonstrated the possibility of transfer of a factor participating in the etiology of soil sickness in apple orchards.     

RAPD分析与ITS序列分析在拟茎点霉分类鉴定上的应用

采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术和核糖体RNA基因(rDNA)转录间隔区(ITS)序列分析对22种拟茎点霉共34个菌株进行了系统发育研究。RAPD分析构建的UPGMA聚类图所反映的种间、种内关系与形态学分类结果基本一致,可以清楚地将分自7科寄主植物上的不同的种分别区分开来,但分自同科或同属寄主植物上的不同的种并不具有相近的亲缘关系。ITS序列分析结果不支持将Phomopsis mangiferae Ahmad和P. cytosporella Penz. et Sacc. 合并为同一个种的观点,同时还显示出P. mangiferae与P. psidii de Camara的亲缘关系非常近, 可能是异名同物;而为害木棉叶的拟茎点霉与杨梅枝枯病菌P. myricae Y.J.Huang et P.K.Chi之间的碱基差异亦属于种下不同菌株间的正常差别范围,很可能就是同一个种。对相同的供试菌株两技术所反映的亲缘关系趋势相同,表明两技术用于拟茎点霉的亲缘关系分析和种类鉴定均是可行的。     

RAPD分析与ITS序列分析在拟茎点霉分类鉴定上的应用*

采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术和核糖体RNA基因(rDNA)转录间隔区(ITS)序列分析对22种拟茎点霉共34个菌株进行了系统发育研究。RAPD分析构建的UPGMA聚类图所反映的种间、种内关系与形态学分类结果基本一致,可以清楚地将分自7科寄主植物上的不同的种分别区分开来,但分自同科或同属寄主植物上的不同的种并不具有相近的亲缘关系。ITS序列分析结果不支持将Phomopsis mangiferae Ahmad和P. cytosporella Penz. et Sacc. 合并为同一个种的观点,同时还显示出P. mangiferae与P. psidii de Camara的亲缘关系非常近, 可能是异名同物;而为害木棉叶的拟茎点霉与杨梅枝枯病菌P. myricae Y.J.Huang et P.K.Chi之间的碱基差异亦属于种下不同菌株间的正常差别范围,很可能就是同一个种。对相同的供试菌株两技术所反映的亲缘关系趋势相同,表明两技术用于拟茎点霉的亲缘关系分析和种类鉴定均是可行的。