CYP1A1、CYP1B1、NET、DAT1单个和联合基因型与汉族人群乳腺癌易感性的研究（英文）

乳腺癌是最常见的女性癌症,其发生是遗传因素和环境因素相互作用的结果。因此,我们就CYP1A1MspⅠ(m1多态)、CYP1B1 Leu432Val、NET T-182C、DAT1-VNTR等基因多态性对新疆汉族人群乳腺癌易感性的研究进行探讨。在以144例乳腺癌患者和120例正常对照组为研究对象的病例-对照研究中,发现CYP1A1MspⅠ位点CC基因型、C等位基因(OR=3.32,95%CI:1.24~8.86;OR=1.58,95%CI:1.09~2.31)和高风险联合基因型CYP1A1 MspⅠ与CYP1B1 Leu432Val,CYP1A1 MspⅠ与DAT1-VNTR,CYP1B1 Leu432Val与DAT1-VNTR(OR=2.43,95%CI:1.23~4.78;OR=4.53,95%CI:1.26~16.27;OR=2.98,95%CI:1.10~8.06)与乳腺癌风险增加有关。CYP1B1、NET和DAT1基因多态性与乳腺癌易感性无关。这些研究结果表明,CYP1A1 MspⅠ多态性和CYP1A1、CYP1B1、DAT1高风险联合基因型能增加新疆汉族人群患乳腺癌的风险。     

上海交通大学附属第一人民医院中心实验室

目的：研究内蒙古地区汉族非吸烟人群和吸烟人群中,细胞色素P4501A1（cytochromc P4501A1,CYP1A1）基因MspI酶切位点多态性与慢性重度牙周炎（chronic severe periodontitis,CP）易感性的关系。方法：对50例CP患者和51例正常对照者按吸烟情况进行分组。用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术（PCR-RFLP）,检测研究人群中CYP1A1基因3’端MspI酶切位点的3种基因型（A,B,C）的分布频率。结果：不考虑吸烟情况下,MspI基因型C在病例组和对照组中各占20％和13．7％,基因型A在两组中分别占42％和47．1％,基因型B在两组中分别占38％和39．2％,各基因型在两组间比较差异无显著性（P〉0．05）。但在吸烟组MspI C型者患慢性重度牙周是的危险性（OR）是其他基因型的5倍（95％可信限：1．34218．62）。结论：MspI C型可能是吸烟者慢性重度牙周炎易感性的遗传标志。     

粘蛋白MUC1 568A/G SNP与辽宁地区人群胃癌遗传易感性的关系

为了探讨粘蛋白(MUC1)基因568位点A/G单核苷酸多态性与胃癌遗传易感性的关系, 采用序列特异性引物-聚合酶链反应(Sequence specific primers PCR, PCR-SSPs)检测来自辽宁地区人群138例胃癌患者及与其配比的131例对照个体MUC1 568 位点A/G多态性, 以ELISA法检测血清H. pylori IgG抗体。结果显示:(1)对照人群MUC1基因568位点AA、AG、GG 3种基因型分布频率分别为73.3%、22.1%、4.6%; (2)胃癌组MUC1 AA基因型携带频率显著高于正常对照组(P=0.03), 携带MUC1 AA基因型个体胃癌的发病风险增高到1.92倍; (3)以MUC1 AG+GG基因型并血清幽门螺杆菌(H. pylori)IgG抗体阴性的个体为对照, AG+GG基因型并H. pylori IgG抗体阳性个体、AA基因型并H. pylori IgG抗体阴性个体、AA基因型并H. pylori IgG抗体阳性个体胃癌患病风险增高, 但3组各组间差异均无统计学意义(P>0.05)。说明MUC1基因568位点A/G多态与胃癌的遗传易感性相关; MUC1 A/G基因多态性和H. pylori感染在胃癌发生发展过程未见交互作用。     

胆固醇7α-羟化酶基因 A-204C单核苷酸多态性及其与血浆血脂的关联

为探讨胆固醇7α-羟化酶基因(CYP7A1)多态性与中国四川汉族人群的分布及其与冠状动脉粥样硬化性心脏病(coronary heart disease,CHD)易感性的关系,对183例CHD患者和101例对照用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法(PCR-RFLP)进行CYP7A1基因A-204C基因座Eco31I酶切多态性分析。结果可见CYP7A1基因A-204C多态基因座等位基因C、A频率在CHD组和正常对照组分别为0.840、0.160和0.822、0.178,基因频率分布符合Hardy-Weiberg平衡定律。CYP7A1基因A-204C多态基因座基因型频率,等位基因A、C频率在CHD患者组和正常对照组间比较差异无显著性(P>0.05),但冠心病患者组中AA,AC,CC3种基因型之间总胆固醇(TC)的差异具有显著性(P<0.05),AA基因型患者的高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)和低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)水平较AC,CC基因型患者显著降低(P<0.05);而对照组中CC,CA基因型个体间总胆固醇(TC)水平差异有显著性(P<0.05)。中国汉族与白种人CYP7A1基因A-204C多态基因座等位基因频率比较,两者差异具有显著性(P<0.01)。提示CYP7A1基因A-204C多态基因座多态性与CHD无相关性,但与总胆固醇存在较密切的关联(P相似文献   

ABCG2基因rs2231142位点多态性与汉族女性痛风的相关性(英文)

目的:ABCG2基因第5外显子区单核苷酸多态性位点rs2231142与中国汉族男性痛风密切相关,基于痛风易感基因存在性别差异的考虑,本研究旨在探讨该单核苷酸多态性位点与中国汉族女性人群痛风易感性之间的相关性。方法:选取185例女性痛风患者和311例女性正常对照者,提取外周血基因组DNA,采用聚合酶链式反应(PCR技术),特异性扩增ABCG2基因所需要的目的片段并测序,比较痛风组和正常对照组的基因型频率及等位基因频率分布情况。结果:rs2231142位点的CC、CA、AA基因型频率在两组间存在显著差异(x2=16.519,P0.001),且痛风组中A等位基因频率显著高于正常对照组(分别为42.2%和29.3%,P0.001,OR 1.76[95%CI:1.35-2.31])。结论:ABCG2基因第五外显子区rs2231142(C/A)位点的单核苷酸多态性与中国汉族女性人群痛风易感性密切相关,携带A等位基因的汉族女性人群有更高的痛风患病率。ABCG2基因首次被证实为中国汉族女性人群的痛风致病易感基因。     

TGF-beta1 基因rs200482214 位点多态性与黑龙江省汉族人群慢性牙周炎的相关性研究

目的:探讨转移生长因子β1(transforminggrowth factor beta-l,TGF-β1)位点rs200482214基因多态性与黑龙江省汉族人群慢性牙周炎的易感性的相关性。方法:选取2012年3月至2013年7月在哈尔滨医科大学附属口腔医院牙周科就诊的135例轻、中、重度慢性牙周炎汉族患者(牙周炎组)和108例汉族健康对照者(健康对照组)作为研究对象,基因组DNA来自口腔颊粘膜拭子,采用多重单碱基延伸SNP分型技术(Multiplex SNaPshot technique)对所有受试者TGF-β1基因rs200482214位点进行检测,比较两组间此位点基因型分布和等位基因频率的差异。结果:(1)TGF-β1基因rs200482214位点各基因型(GG、GA、AA)分布均符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律(P>0.05);(2)TGF-β1基因rs200482214位点GG、GA、AA在牙周炎组和健康对照组的分布频率分别为61.5%、30.4%、8.1%和63.0%、28.7%、8.3%,两组人群基因型分布频率差异无统计学意义(P>0.05);等位基因G、A在牙周炎组和健康对照组分布频率分别为76.7%、23.3%和77.3%、22.7%,两组人群的等位基因分布频率差异亦无统计学意义(P>0.05)。结论:TGF-β1位点rs200482214基因多态性与黑龙江省汉族人群慢性牙周炎的易感性不具有相关性。     

TGF-β1基因rs200482214位点多态性与黑龙江省汉族人群慢性牙周炎的相关性研究

目的:探讨转移生长因子β1(transforminggrowth factor beta-l,TGF-β1)位点rs200482214基因多态性与黑龙江省汉族人群慢性牙周炎的易感性的相关性。方法:选取2012年3月至2013年7月在哈尔滨医科大学附属口腔医院牙周科就诊的135例轻、中、重度慢性牙周炎汉族患者(牙周炎组)和108例汉族健康对照者(健康对照组)作为研究对象,基因组DNA来自口腔颊粘膜拭子,采用多重单碱基延伸SNP分型技术(Multiplex SNaPshot technique)对所有受试者TGF-β1基因rs200482214位点进行检测,比较两组间此位点基因型分布和等位基因频率的差异。结果:(1)TGF-β1基因rs200482214位点各基因型(GG、GA、AA)分布均符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律(P0.05);(2)TGF-β1基因rs200482214位点GG、GA、AA在牙周炎组和健康对照组的分布频率分别为61.5%、30.4%、8.1%和63.0%、28.7%、8.3%,两组人群基因型分布频率差异无统计学意义(P0.05);等位基因G、A在牙周炎组和健康对照组分布频率分别为76.7%、23.3%和77.3%、22.7%,两组人群的等位基因分布频率差异亦无统计学意义(P0.05)。结论:TGF-β1位点rs200482214基因多态性与黑龙江省汉族人群慢性牙周炎的易感性不具有相关性。     

在中国汉族人群中，以家系传递分析肿瘤坏死因子a-308A/G单核苷酸多 态性与抽动秽语综合征

目的:探讨在中国汉族人群中,肿瘤坏死因子a(TNF-alpha,TNF-a)基因启动子区-308A/G单核苷酸多态性与抽动秽语综合征(Tourette syndrome,TS)的遗传易感性。方法:91例TS患者及其父母组成的核心家系成员经聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction-restriction fragment lengthpolymor phism,PCR-RFLP)方法进行基因分型,评估所有研究对象的TNF-a-308A/G位点的等位基因频率和基因型频率的分布,进行传递不平衡检验(transmission disequilibrium test,TDT),单体型相对风险(haplotype-based haplotyp erelativerisk,HHRR),单体型风险(haplotype relative riskHRR)的研究。结果:TS患者及其父母的等位基因分布经Hardy-Weinberg(H-W)平衡检验显示符合遗传平衡法则。(x2<3.84;P>0.05)TDT、HHRR和HRR研究结果显示该多态性位点的等位基因频率和基因型频率均不存在传递不平衡。结论:我们的数据表明肿瘤坏死因子a启动子区-308A/G单核苷酸多态性位点不是中国汉族人群TS的易感基因位点。     

ABCG2基因rs2231142位点多态性与汉族女性痛风的相关性

目的：ABCG2基因第5外显子区单核苷酸多态性位点rs2231142与中国汉族男性痛风密切相关,基于痛风易感基因存在性别差异的考虑,本研究旨在探讨该单核苷酸多态性位点与中国汉族女性人群痛风易感性之间的相关性。方法：选取185例女性痛风患者和311例女性正常对照者,提取外周血基因组DNA,采用聚合酶链式反应（PCR技术）,特异性扩增ABCG2基因所需要的目的片段并测序,比较痛风组和正常对照组的基因型频率及等位基因频率分布情况。结果：rs2231142位点的CC、CA、AA基因型频率在两组间存在显著差异（x2=16.519,P〈0.001）,且痛风组中A等位基因频率显著高于正常对照组（分别为42.2%和29.3%,P〈0.001,OR 1.76[95%CI：1.35-2.31]）。结论：ABCG2基因第五外显子区rs2231142（C/A）位点的单核苷酸多态性与中国汉族女性人群痛风易感性密切相关,携带A等位基因的汉族女性人群有更高的痛风患病率。ABCG2基因首次被证实为中国汉族女性人群的痛风致病易感基因。     

中国湖南人群GSTM1和GSTT1基因多态性与肺癌易感性关系的研究

应用病例-对照分析研究(对照组205例,肺癌病例组104例),抽提静脉血基因组DNA,采用PCR及多重PCR方法,检测谷胱甘肽转移酶GSTM1和GSTT1单独及联合缺失基因型的遗传多态性在中国湖南人群中肺癌患者和正常人群体中的分布,探讨这些多态性基因型与肺癌易感性的关系.结果显示GSTM1-/-基因型在湖南地区居民肺癌群体和正常对照人群中的频率分别为62.5%和46.3%(P<0.05);肺癌患者组GSTT1-/-基因型的频率(66.3%)显著高于正常对照组(42.4%)(P<0.05).GSTM1-/-和GSTT1-/-联合基因型在肺癌组和正常对照组中的频率分别为41.3%和22.4%(P<0.05).SPSS11.5软件统计学分析表明,这些基因型在肺癌患者组和正常对照组人群中的发生频率具有显著性差异.由此可知GSTM1基因缺失和GSTT1基因缺失分别与肺癌的易感性相关;GSTM1和GSTT1基因联合缺失与肺癌的发生和发展呈现显著正相关.     

达菲药物对H1N1病毒作用研究

甲型H1N1病毒在全世界范围内爆发,引起人们广泛关注,而目前疫苗和新的药物正处于研发阶段,与此同时该病毒神经氨酸酶蛋白序列不断被报道。达菲作为治疗H1N1病毒的药物被患者广泛使用。通过同源性建模的方法比较神经氨酸酶的变异情况,从而预测达菲药物对变异前后的作用效果评价。通过AUTODOCK计算结合能,发现达菲药物与神经氨酸酶的结合能维持在2.4～4.2 kJ/mol范围内,动力学常数最高值达到18.2 mM。证明达菲药物对抑制病毒进入寄主细胞有明显效果。     

NPC1L1:固醇脂质吸收的关键蛋白质

NPC1L1是最近发现的一种与NPC1同源的蛋白质。在体内的分布有物种差异性,其亚细胞定位存在很大争议。近些年发现NPC1L1在固醇类脂质代谢途径中起着重要作用,是肠道吸收固醇类脂质尤其是胆固醇的关键蛋白质,这项新发现使得人们对固醇类脂质的吸收机制有了了解。高胆固醇血症是心血管系统疾病的一个高危因子,因此,对NPC1L1的研究具有重大的实际意义,正逐渐成为研究的热点。     

Association of SULT1A1 and UGT1A1 polymorphisms with breast cancer risk and phenotypes in Russian women

Estrogens are critical for breast cancer initiation and development. Sulfotransferase 1A1 (SULT1A1) and UDP-glucuronosyltransferase 1A1 (UGT1A1) conjugate and inactivate both estrogens and their metabolites, thus preventing estrogen-mediated mitosis and mutagenesis. SULT1A1 and UGT1A1 are both polymorphic, and different alleles encode functionally different allozymes. We hypothesize that low-activity alleles SULT1A1*2 and UGT1A1*28 are associated with higher risk for breast cancer and more severe breast tumor phenotypes. We performed a case-control study, which included 119 women of Russian ancestry with breast cancer and 121 age-matched Russian female controls. We used PCR followed by pyrosequencing to determine the SULT1A1 and UGT1A1 genotypes. Allele UGT1A1*28 was present at a higher frequency than the wild-type UGT1A1*1 allele in breast cancer patients as compared to controls (P = 0.002, OR = 1.79, CI 1.23–2.63). Consistently, the frequency of genotypes that contain allele UGT1A1*28 in the homozygous or the heterozygous state was greater in breast cancer patients as compared with the frequency of the wild-type UGT1A1*1/*1 genotype (P = 0.003, OR = 4.00, CI 1.49–11.11 and P = 0.014, OR = 2.04, CI 1.14–3.57, respectively). Individuals carrying allele UGT1A1*28 in the homo-or heterozygous state had larger breast tumors (>2 cm) as compared to the group with high-activity genotypes (P = 0.011, IR = 3.44, CI 1.42–8.36). No association was observed between any of the SULT1A1 genotypes and breast cancer risk or phenotypes. Our data suggest that UGT1A1, but not SULT1A1, genotypes are important for breast cancer risk and phenotype in Russian women. Published in Russian in Molekulyarnaya Biologiya, 2006, Vol. 40, No. 2, pp. 263–270. The article was translated by the authors.     

Isolation and Characterization of Ubiquitin-activating Enzyme E1-domain Containing 1, UBE1DC1

Ubiquitin and other ubiquitin-like proteins play important roles in post-translational modification. They are phylogenetically well-conserved in eukaryotes. Activated by other proteins, ubiquitin and ubiquitin-like proteins can covalently modify target proteins. The enzymes responsible for the activation of this modification have been known to include UBA1, SAE2, UBA3, SAE1 and ULA1. Here we report a new ubiquitin activating enzyme like cDNA, named ubiquitin activating enzyme E1-domain containing 1 (UBE1DC1), whose cDNA is 2654 base pairs in length and contains an open reading frame encoding 404 amino acids. The UBE1DC1 gene consists of 12 exons and is located at human chromosome 3q22. The result of RT-PCR showed that UBE1DC1 is expressed in most of human tissues. These two authors contributed equally to this paper. The nucleotide sequence reported in this paper has been submitted to GenBank under accession number AY253672.     

Upregulation of MAPKAPK5-AS1, PXN-AS1 and URB1-AS1 lncRNAs in non-functioning pituitary adenoma

Long non-coding RNAs (lncRNAs) have been shown to be dysregulated in a variety of malignant and non-malignant lesions including non-functioning pituitary adenomas (NFPAs). In the current experimental study, we have selected six lncRNAs, namely MAPKAPK5-AS1, NUTM2B-AS1, ST7-AS1, LIFR-AS1, PXN-AS1 and URB1-AS1 to assess their expression in a cohort of Iranian patients with NFPA. MAPKAPK5-AS1, PXN-AS1 and URB1-AS1 were shown to be over-expressed in NFPA tissues compared with control samples (Expression ratios (95% CI) = 10 (3.94–25.36), 11.22 (4.3–28.8) and 9.33 (4.12–21.12); p values < 0.0001, respectively). The depicted ROC curves showed the AUC values of 0.73, 0.80 and 0.73 for MAPKAPK5-AS1, PXN-AS1 and URB1-AS1, respectively. Relative expression level of PXN-AS1 was associated with tumour subtype (p value = 0.49). Besides, relative expression levels of MAPKAPK5-AS1 and LIFR-AS1 were associated with gender of patients (p values = 0.043 and 0.01, respectively). Cumulatively, the current study indicates the possible role of MAPKAPK5-AS1, PXN-AS1 and URB1-AS1 lncRNAs in the pathogenesis of NFPAs.     

细胞色素P450 1A1和1B1靶向抗肿瘤前药研究进展

细胞色素P450（CYP）能催化各种内源性及外源性化合物的代谢,与多种肿瘤发生有关。其中CYP1A1参与多种前致癌物和致突变物的代谢活化,CYP1B1被认为在许多人癌细胞中特异性表达,参与药物的氧化代谢和前药的活化。CYP1A1和181已成为靶向抗肿瘤前药研究的新靶点。相继有大量相关研究报道,本文就近年来文献报道的CYP1A1和1B1靶向抗肿瘤前药研究进展。