三种四膜虫全基因组N6-甲基腺嘌呤比较研究

为了揭示N6-甲基腺嘌呤(6mA)在近缘物种间的分布规律和物种进化过程中的变化, 研究在分离2种四膜虫(Tetrahymena malaccensis和Tetrahymena pyriformi)大核的基础上, 利用三代测序技术绘制了其全基因组单碱基分辨率6mA图谱, 结合公共数据库中已有的模式种Tetrahymena thermophila数据, 开展了3种四膜虫比较6mA甲基化组分析, 发现: (1)3种四膜虫6mA甲基化位点分布特征类似, 包括呈约200 bp周期性分布和具有保守AT基序; (2)6mA主要分布于基因的5′端, 在种间直系同源基因上的分布模式具有区域近似性, 但在单碱基水平不完全保守; (3)在种内近期复制的并系同源基因中, 6mA分布在单碱基水平具有较高的保守性; (4)结合3种四膜虫的分化时间, 估算出了四膜虫中6mA动态变化过程, 6mA位点建立的速度大约为每Mb每百万年69.9—226个位点。     

两种性比类群的雄性黄山短尾猴繁殖行为和攻击行为比较

有效性比（operational sex ratio, OSR）是指性成熟雄性数量与发情雌性数量的比值,可作为测量性选择强度的指标。本文对两种有效性比的黄山短尾猴(Macaca thibetana)鱼鳞坑YA1群和YA2群成年雄性在交配期（2007年8—12月）内的繁殖行为和攻击行为进行研究,采用目标动物取样法、随机取样法和连续记录法记录行为,探讨有效性比对雄性黄山短尾猴交配竞争的影响。研究期间,YA1群的有效性比为0.4:1,YA2群的有效性比为0.9:1,YA2群的有效性比大于YA1群。在繁殖行为上,高顺位成年雄性的性检查、做鬼脸、性追赶和交配行为在两群间均存在显著差异,YA1群高于YA2群（P＜0.01）;中等顺位成年雄性的性检查、做鬼脸、性追赶在两群间均存在显著差异,YA1群高于YA2群（P＜0.01）,交配行为在两群间存在显著差异,YA1群高于YA2群（P＜0.05）;低顺位成年雄性在两群间不存在显著差异。在攻击行为上,高顺位成年雄性在两群间存在显著差异,YA2群高于YA1群（P＜0.01）;中等顺位成年雄性在两群间存在显著差异,YA2群高于YA1群（P＜0.05）;YA1群低顺位成年雄性攻击行为发生频次为零。结果表明,雄雌有效性比越大,雄性黄山短尾猴的交配机会越少,繁殖行为发生频次下降,竞争压力增大,攻击行为频次上升,因此YA2群成年雄性交配竞争强度高于YA1群。本研究结果支持性选择理论中有效性比对交配竞争作用的预测。     

基于宏基因组的保安湖浮游动物多样性研究

研究于2019年春、夏、秋、冬四季对保安湖进行了水样采集, 基于宏基因组测序, 在优化物种鉴定和丰度计算方法的基础上, 考察了保安湖浮游动物的多样性、群落结构及其影响因素。共鉴定到浮游动物OTU 374种, 其中原生动物282个; 枝角类45个; 桡足类26个; 轮虫21个。从季节来看, 夏、秋季保安湖的浮游动物多样性高; 从湖区来看, 肖四海和主湖区浮游动物多样性高。季节因素对保安湖浮游动物群落结构的影响高于湖区影响。保安湖营养状态为中营养型, 水体温度、叶绿素a是影响保安湖浮游动物群落结构的主要环境因子, 不同类群与环境因子相关性不同, 总体可分为5类。其中原生动物优势类群为混合营养的纤毛虫和丝足虫, 同硝氮、化学需氧量、温度有明显的相关性, 而枝角类和桡足类同环境因子的关系较为相似, 与溶氧、叶绿素a、正磷酸盐存在明显相关。研究利用宏基因组方法对保安湖浮游动物多样性开展了研究, 为从浮游动物这一角度来理解保安湖这一江湖阻隔型湖泊的生物多样性的变化提供了支撑。