长角血蜱产卵量分布的函数分析

目的研究硬蜱产卵分布的规律,积累硬蜱生物学基础资料.方法 从西藏易贡采集长角血蜱,在自然室温玻璃管常规饲养,逐日记录产卵量,得到观察数据实际分布情况,利用SPSS13.0统计软件对样本数据进行分析,并拟合其分布函数.结果 长角血蜱产卵分布服从指数分布.     

一个植物乳杆菌新质粒的序列分析与归类

[目的]分离鉴定植物乳杆菌PC518的质粒并分析滚环复制p C194家族复制起点特征。[方法]从植物乳杆菌PC518中提取质粒,HindⅢ单酶切后克隆测序,然后用反向PCR方法验证质粒序列的完整性。使用DNAMAN V6. 0软件和MEGA X软件对43个p C194家族质粒的复制起点序列和复制蛋白进行比对分析。[结果]分离得到一个3 325 bp的新质粒p LP325。43个p C194家族质粒复制起点中:24个在nick上、下游均有反向重复序列,12个只在nick上游有反向重复序列,4个只在下游有反向重复序列。复制蛋白的聚类与复制起点中反向重复序列的位置是对应的。[结论]p LP325的复制方式推定为滚环复制,属于p C194家族。p C194家族复制起点的bind以反向重复序列为特征,位于nick上游或下游。     

新型冠状病毒进化与变异

本文分析了新型冠状病毒(SARS-CoV-2,新冠病毒)的进化来源及刺突蛋白(spike protein, S)基因的突变情况。从GenBank数据库中下载相关病毒全基因组序列及S基因序列,运用DNAMAN 9.0、MEGAX等生物信息学软件,进行多序列比对,构建系统进化树,并统计S基因位点突变情况。分析结果提示,新冠病毒不可能来源于已知的6种人冠状病毒,相较于穿山甲,新冠病毒来源于蝙蝠的可能性更大。S基因的突变率应该和新冠病毒的流行时间及感染人数密切相关。未来,类似于SARS、MERS和新冠病毒这样由动物传播至人的冠状病毒可能还会出现,其流行趋势将取决于其致病性和变异性。     

植物乳杆菌PC518质粒pLP224的发现以及pMV158家族质粒的保守性和多样性分析

【背景】植物乳杆菌含有丰富的天然质粒,分析这些质粒的序列特征有利于分析质粒所携带的遗传信息。【目的】分析从植物乳杆菌PC518分离的新质粒pLP224,聚类分析其所属家族质粒的保守性与多样性。【方法】提取植物乳杆菌PC518的质粒,酶切后构建质粒DNA文库,测序和BLAST鉴定文库中的新序列;通过反向PCR完成质粒全序列测定,注释新质粒;使用进化树软件MEGA X构建质粒的Rep蛋白进化树,并分析结合序列的变化。【结果】从植物乳杆菌PC518分离出一个质粒pLP224,大小为1 766 bp,其中(G+C)mol%含量为41.39%,与已知质粒的最大序列相似性为86.85%。推定其复制方式为滚环复制,属于pMV158家族成员。17个pMV158家族质粒的Rep蛋白分析表明：pMV158家族质粒的Rep蛋白进化距离越近,其dso位点的结合序列相似性越高,进化距离越远则其序列相似性越低。【结论】 pLP224是pMV158家族的新成员。pMV158家族质粒在dso位点的切开序列上保守,在结合序列上多样。其Rep蛋白随结合序列变化而不同。这种差异有利于pMV158家族不同成员在同一宿主的共存,是家族成员持续存在并稳定进化的基础。     

设计乳杆菌特异性引物并运用菌落PCR技术快速检出和鉴定四川泡菜中的乳杆菌

乳杆菌(Lactobacillus)是益生菌, 也是当前的研究热点之一。研究泡菜等样品中的乳杆菌需要快速的检出方法。根据已完成全基因组测序的14种乳杆菌的16S rDNA序列, 设计一对乳杆菌特异性引物。PCR检测结果表明该引物对乳杆菌和明串珠菌能扩增出800 bp的片段, 对表皮葡萄球菌、乳酸乳球菌和枯草芽胞杆菌却没有扩增条带, 具有一定的乳杆菌特异性。结合MRS乳杆菌半选择培养基和革兰氏染色, 运用菌落PCR技术, 可以快速高效地检出四川泡菜中的乳杆菌。再通过对PCR扩增片段测序, 可以将乳杆菌鉴定到种。从16份四川泡菜样品中检出了15株乳杆菌, 其中14株被鉴定为植物乳杆菌, 1株需进一步鉴定才能确定种。该方法可以检出乳杆菌新种。     

益生菌对宿主心理健康及脑功能的积极影响及其机制

肠道中的益生菌不仅对胃肠道发挥着益生作用,而且还调节着体内的激素水平和炎症平衡。通过免疫、内分泌和迷走神经途径,益生菌与大脑形成一个称之为脑—肠轴的反馈回路,深刻影响着大脑的认知功能及人体的情绪反应,促进宿主的心理健康。     

S-层蛋白质的功能和应用

400多种古细菌和细菌有S-层蛋白质,该蛋白质能在菌体表面自装配为规则晶格的单分子表面层(S-层),与菌体以非共价方式连接。S-层作为菌体面对环境的最外层屏障,具有保护、分子筛、维持菌体形状、细胞识别和黏附、毒力因子等功能,是菌体适应周围环境的重要结构。随着遗传、结构、装配和功能等方面研究的逐渐深入,人们意识到了S-层蛋白质潜在的应用价值。其基因的可操作性,独特的自装配特性及其单分子晶体层的结构都很有应用前景,目前已经应用在异源蛋白质的分泌性表达、表面展示和纳米科技等方面。     

新课程医学免疫与病原实验学的教学体会

医学免疫与病原实验学综合了医学微生物学、医学免疫学和医学寄生虫学的实验,独立为一门新课程。课程内容按照基本实验、综合实验和设计性实验三级设置。设计性实验没有给定题目,要求学生自己拟题。学生必须综合三门课程的理论知识和基本实验技术,设计并完成设计性实验。本课程的教学能达到培养学生基本操作技能、创新思维能力和全面素质的目的。进一步完善后,值得向各医学专业推广。     

嗜酸乳酸杆菌ATCC 4356菌株异源二聚体b-半乳糖苷酶的克隆表达

嗜酸乳酸杆菌(Lactobacillus acidophilus)的异源二聚体β-半乳糖苷酶属于糖苷水解酶2家族,由两个部分重叠、协同翻译的基因编码(lacL和lacM).[目的]克隆表达该酶并测定其酶学特性.[方法]参照已全基因组测序的嗜酸乳酸杆菌NCFM菌株,以嗜酸乳酸杆菌ATCC4356菌株基因组为模板,将lacL的RBS到lacM的终止子之间的序列(2834 bp)克隆到pQE31质粒上,并电转化JM109菌株.以下列步骤纯化表达产物:硫酸铵分级沉淀、阴离子交换、亲和层析和凝胶排阻层析.以凝胶排阻层析测定纯化酶的天然分子量,以邻硝基苯基半乳糖为底物测定其酶学特性.[结果]实现了该酶在JM109菌株中的可溶性表达.其氨基酸序列有一处不同于嗜酸乳酸杆菌NCFM菌株,即其大亚基(LacL)的第512位氨基酸不是组氨酸而是精氨酸.纯化酶比活力为226 U/mg蛋白,天然分子量为96.3±4.6 kDa,最适pH为7,最适温度为49℃,Km和Vmax值分别是:2.18±0.12 mmol/L,273±5 U/mg蛋白.     

大熊猫肠道正常菌群降解纤维素的机制

大熊猫的主食竹类粗纤维含量很高,而大熊猫自身的消化系统不能降解纤维素。现已从大熊猫的肠道正常菌群中鉴定出涵盖7个菌门的22种菌,相关的研究证明大熊猫的肠道正常菌群能降解纤维素。大熊猫肠道中的假单胞菌产生的漆酶能对竹纤维中的木质素进行氧化,使纤维素得以暴露,梭菌属、淀粉芽胞杆菌等产生的纤维素酶将其降解成大熊猫可利用的糖类。其具体机制有待进一步研究。