中国维吾尔族人群MSY1(DYF155S1)基因座多态性及其结构特点

应用荧光标记MVR-PCR、Amp-FLP与DNA序列分析技术等检测106例中国维吾尔族人群无关男性个体血纱样品,揭示了中国维吾尔族人群Y特异的小卫星MSY1 (DYF155S1)基因座5′和3′端多态性及其基因结构特点。DYF155S1基因座的多态性表现为3个方面：（1）长度多态性;（2）5′端多态性;（3）3′端多态性。106例无关个体共检出37个不同长度的片段,5′端检出68个类型,3′端检出23个类型。综合这3方面多态性,106例个体间没有相同,其基因多样性（h）超过0.9999。DNA序列分析发现该基因座5′端表现有7种模块结构,3′端有2种模块结构。DYF155S2片段缺失率约为4.7%。MVR-PCR、Amp-FLP与DNA序列分析技术结合起来可以更充分地揭示人群Y染色体特异的小卫星MSY1（DYF155S1）基因座多态性,并提出命名方式,从而为人类遗传学及法医学研究提供了有用的方法和基础资料。 Abstract:The study is to reveal the diversity and gene structure of 5′ and 3′ end of DYF155S1 locus in Y-chromosome minisatellite among Chinese Uygur population.Fluorescent MVR-PCR（minisatellite variant repeat by PCR）,Amp-FLP(Amplified fragment length polymorphism) and DNA sequencing methods were used repectively to detect 106 unrelated males among Chinese Uygur population.The polymorphisms of DYF155S1 locus could be revealed in three aspects:(1) polymorphic length:the sizes of amplified fragments ranged from 1405 to 2505bp.There are 37 types found among the 106 unrelated males.(2) polymorphism at 5′ end of DYF155S1 locus,68 types found among the 106 unrelated males.(3) polymorphism at 3′ end of DYF155S1 locus,23 types found among the 106 unrelated males.In combination of these three aspects of polymorphism,none of the 106 unrelated males tested had the same allele,and the gene diversity(h) was over 0.9999.Seven and two types of modular structure were founded in the 5′ and 3′ end of DYF155S1 locus,respectively,by DNA sequencing.The alleles at DYF155S2 locus showed yes/no dimorphism and the rate of deletion was 4.7%.The polymorphisms of DYF155S1 locus were fully revealed by using combination of MVR-PCR, Amp-FLP and DNA sequencing methods, and we suggested the nomenclature for alleles of MVR loci.These methods are useful tools and provide basic data for the study of human genetics and forensic medicine.     

用荧光标记MVR-PCR方法研究中国汉族人群DYF155S1基因座多态性

建立简便、实用的DYF155S1基因座基因分型的银染和荧光标记半自动分析方法,对中国汉族155个无关男性个体血样本DNA进行分型,两种方法分型结果一致。155人共检出66种等位基因,有38个等位基因仅出现1次。根据图谱中第一条DNA片段及DNA条带数从小至大命名,频率最高的为18和22号等位基因,其第一条DNA片段大小为180bp,DNA条带数为连续的16和17个,频率均为0.065。这一位点的基因多样性（h）为0.9789。155人中有25人表现为连续DNA谱带中有1个或2个DNA条带的丢失（mull repeat）,序列分析证明丢失的DNA条带位置对应于3型核心序列。结果表明,本文建立的分析方法能很好地揭示DYF155S1基因座5′端多态性,是目前仅作1次PCR能获得个体Y染色体多态信息较高的技术。用本方法建立的中国汉族人群DYF155S1基因座等位基因频率资料,为群体遗传学研究及法医学应用提供了基础资料。     

广州汉族人群D12S391和D11S554基因座序列变异

为研究高度变异的sTR基因座核心序列结构,对广州汉族人群突变率较高的D12S391和D11S554基因座等位基因进行了序列分析。结果显示D12S391基因座核心序列结构为(AGAT)8～17(AGAC)6～10(AGAT)0～1,其较小片段等位基因(15～18)仅表现为第1个重复单位(AGAT)数目的变异,而较大片段等位基因(19～27),可表现为第2或第3个重复单位数目的变异。发现有4种新的等位基因,分别命名为22″、23″、24′″和27。D11S554基因座核心序列结构更复杂,有5种核心序列,其中3种具有相同的基本结构(AAAGG)(AAAG)4(AAAGG)2～3,(AAAG)13～19。其大片段等位基因(219～249)核心序列结构中,既有四核苷酸重复,还有五核苷酸重复,以及单个硷基的变异、硷基插入或缺失。两基因座均存在序列异质性。结果表明D12S391和D11S554基因座属复杂重复类型,为其准确分型增加了难度,首先需建立相应群体的等位基因分型标准物。     

血痕Chelex 100抽提DNA用于人类TNF-α基因启动子区SNP分型

建立快速、简便的血样本采集及DNA抽提方法,可用于大规模的分子流行病学调查及群体遗传学研究。采用无菌纱布为载体取血,Chelex100快速抽提DNA,用TaqMan MGB探针对人类TNF-α基因启动子区-857（C／T）位点进行SNP分型。344份血样均得到明确的分型结果,获得的荧光信号强,本底低。深圳地区汉族群体-857位点基因型频率分别为：cc为0.78,ct为0.21,tt为0.01。血痕Chelex100抽提DNA为大规模血样本的采集,DNA的抽提提供了有效的手段。     

氯仿对非洲绿猴肾细胞损伤机理的研究

目的　实验研究氯仿染毒 2 4h对非洲绿猴肾细胞的损伤及其机理。方法　运用显微荧光术测定了非洲绿猴肾细胞 (Vero细胞 )内活性氧 (ROS)含量及游离Ca2 + 浓度 ,同时 ,测定Vero细胞培养上清液乳酸脱氢酶(LDH)活力用于检查Vero细胞受损情况。结果　接触浓度为 4 0mmol L氯仿的Vero细胞内ROS含量及游离Ca2 +浓度与对照组比较无显著性差异 (P >0 0 5 ) ,同时 ,表示Vero细胞受损指标 (LDH活力 )也无显著性差异 (P >0 0 5 ) ;而接触浓度为 8 0mmol L、12 0mmol L氯仿的Vero细胞内ROS含量显著高于对照组 (P <0 0 1) ,其Vero细胞受损也显著增加 (P <0 0 5、P <0 0 1)。结论　较高浓度的氯仿能损伤Vero细胞 ,其损伤的可能途径是通过提高Vero细胞内ROS含量     

基于流式细胞技术SARS-CoV-2假病毒中和试验方法的建立

严重急性呼吸综合征冠状病毒2 (Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2)是新型冠状病毒肺炎感染（Coronavirus disease 2019, COVID-19）的致病病毒。面对此类高传播风险及高致病性病毒，常采用复制缺陷型假病毒替代活病毒用于疫苗及药物的抗病毒活性评估。本研究旨在建立了一种基于流式细胞技术（Flow cytometry, FCM）的高通量中和试验方法。使用HIV-1慢病毒骨架蛋白包装系统，将psPAX2、pLVXeGFP、SARS-CoV-2 S三质粒共转染HEK293T细胞，包装一种带增强型绿色荧光蛋白（Enhanced green fluorescent protein, eGFP）的假病毒。通过优化S蛋白密码子序列、采用S蛋白C-端氨基酸（Amino acids, AA）截短和包装时间的优化，确定了假病毒包装最适条件。包装假病毒的滴定采用293T-hACE2细胞作为感染靶细胞，经流式细胞仪测定eGFP荧光细胞比率即为感染假病毒细胞比率。采用包装的野生型（Wild type, WT...