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SNP分型前的PAGE检测 总被引:2,自引:0,他引:2
目的:探讨单核苷酸多态性(single nucleotide polymmphism,SNP)分型前聚丙烯酰胺凝胶电泳(polyaerylamide gel electro—phoresis,PAGE)的作用。方法:对3个DNA片段(DAOA基因的片段E1和E2、RGS4基因的片段S4)的PCR产物先用PAGE分析,然后用变性高效液相色谱(denaturing high performance liquid chromatography,DHPLC)分型,并比对结果。结果:PAGE能将片段E1、E2和S4中同一位点的SNP杂合子样本和纯合子样本区分开来,还能进一步将片段S4中SNP位点的2种不同纯合子样本区分开来。结论:PAGE能提高SNP的检测效率,而且具有成本低,操作简便的特点。 相似文献
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PCR-SSP技术对广东汉族人HLA-DR基因分型 总被引:13,自引:0,他引:13
探索具有高分辨率、高特异性和简捷快速的方法对HLA-DR基因分型,为临床器官移植配型和疾病相关性分析提供实用的方法和基础资料.利用DR1~DRw18序列特异性的19组引物及1对内参照引物进行PCR扩增即PCR-SSP对HLA-DR进行基因分型,扩增产物经琼脂糖凝胶电泳,溴乙锭染色,在紫外光下观察分型结果.每个被检个体的DR型别可由特异引物扩增出现的电泳谱带直接判断.双盲检测22例的结果100%正确.在102例中国广东地区汉族人中,DR9和DR2的基因频率最高,分别为0.2205和0.1912,DR10为最低(0.0098).与用PCR-SSO方法分型获得的结果比较,基因型别分布基本一致,但一些等位基因的频率有差异,表明HLA-DR基因频率的分布在不同地区、不同种族的人群间存在着差异.PCR-SSP法分辨率和特异性虽不及PCR-SSO法但比血清学方法精细,分型的全过程只需2~4h能满足临床器官移植配型的要求.基因频率调查结果为器官移植配型和疾病相关性分析提供了基础资料. 相似文献
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第三届粤港生化学术交流会简报第三届粤港生化学术交流会于1995年6月9日到11日在珠海召开。会议收到各省市生化工作者的论文120多篇。出席会议的正式代表102名,其中香港代表20名。大会请有关专家作了“可分解淀粉的酵母工程菌的构建研究”、“植物生长中... 相似文献
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中国维吾尔族人群MSY1(DYF155S1)基因座多态性及其结构特点 总被引:2,自引:0,他引:2
应用荧光标记MVR-PCR、Amp-FLP与DNA序列分析技术等检测106例中国维吾尔族人群无关男性个体血纱样品,揭示了中国维吾尔族人群Y特异的小卫星MSY1 (DYF155S1)基因座5′和3′端多态性及其基因结构特点。DYF155S1基因座的多态性表现为3个方面:(1)长度多态性;(2)5′端多态性;(3)3′端多态性。106例无关个体共检出37个不同长度的片段,5′端检出68个类型,3′端检出23个类型。综合这3方面多态性,106例个体间没有相同,其基因多样性(h)超过0.9999。DNA序列分析发现该基因座5′端表现有7种模块结构,3′端有2种模块结构。DYF155S2片段缺失率约为4.7%。MVR-PCR、Amp-FLP与DNA序列分析技术结合起来可以更充分地揭示人群Y染色体特异的小卫星MSY1(DYF155S1)基因座多态性,并提出命名方式,从而为人类遗传学及法医学研究提供了有用的方法和基础资料。
Abstract:The study is to reveal the diversity and gene structure of 5′ and 3′ end of DYF155S1 locus in Y-chromosome minisatellite among Chinese Uygur population.Fluorescent MVR-PCR(minisatellite variant repeat by PCR),Amp-FLP(Amplified fragment length polymorphism) and DNA sequencing methods were used repectively to detect 106 unrelated males among Chinese Uygur population.The polymorphisms of DYF155S1 locus could be revealed in three aspects:(1) polymorphic length:the sizes of amplified fragments ranged from 1405 to 2505bp.There are 37 types found among the 106 unrelated males.(2) polymorphism at 5′ end of DYF155S1 locus,68 types found among the 106 unrelated males.(3) polymorphism at 3′ end of DYF155S1 locus,23 types found among the 106 unrelated males.In combination of these three aspects of polymorphism,none of the 106 unrelated males tested had the same allele,and the gene diversity(h) was over 0.9999.Seven and two types of modular structure were founded in the 5′ and 3′ end of DYF155S1 locus,respectively,by DNA sequencing.The alleles at DYF155S2 locus showed yes/no dimorphism and the rate of deletion was 4.7%.The polymorphisms of DYF155S1 locus were fully revealed by using combination of MVR-PCR, Amp-FLP and DNA sequencing methods, and we suggested the nomenclature for alleles of MVR loci.These methods are useful tools and provide basic data for the study of human genetics and forensic medicine. 相似文献
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7个Y-STR基因座荧光标记复合分型及在中国汉族群体中遗传多态性的研究 总被引:1,自引:0,他引:1
建立了FAM(蓝色荧光)标记的DYS456、DYS464a/b/c/d和DYS527a/b和JOE(绿色荧光)标记的DYS531、DYS709、DYS448和DYS522 7个Y染色体STR基因座(相当于11个位点)复合扩增分型体系。利用ABI3100遗传分析仪调查中国广东汉族151例和河南106例汉族无关男性个体的遗传多态性分布, 并探讨在法医学中的应用价值。结果显示, 此方法能作出正确分型的最低基因组DNA量为0.02 ng; 在女性成份为男性成份150倍的混合DNA样本(总DNA量为160 ng)中能正确检出全部7个Y-STR基因座的基因型。 广东和河南2个汉族男性群体中, 观察到的单体型分别有150、105种, 其中仅观察到1次的单体型分别有149、104种, 单体型多样性(HD)分别为0.999912、0.999820; 这组Y-STR单体型在两个群体中的分布差异有统计学显著意义(秩和检验: P<0.001)。此7个Y-STR基因座多态性分析适用于法医学实践和人类进化的研究。 相似文献
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用荧光标记MVR-PCR方法研究中国汉族人群DYF155S1基因座多态性 总被引:7,自引:0,他引:7
建立简便、实用的DYF155S1基因座基因分型的银染和荧光标记半自动分析方法,对中国汉族155个无关男性个体血样本DNA进行分型,两种方法分型结果一致。155人共检出66种等位基因,有38个等位基因仅出现1次。根据图谱中第一条DNA片段及DNA条带数从小至大命名,频率最高的为18和22号等位基因,其第一条DNA片段大小为180bp,DNA条带数为连续的16和17个,频率均为0.065。这一位点的基因多样性(h)为0.9789。155人中有25人表现为连续DNA谱带中有1个或2个DNA条带的丢失(mull repeat),序列分析证明丢失的DNA条带位置对应于3型核心序列。结果表明,本文建立的分析方法能很好地揭示DYF155S1基因座5′端多态性,是目前仅作1次PCR能获得个体Y染色体多态信息较高的技术。用本方法建立的中国汉族人群DYF155S1基因座等位基因频率资料,为群体遗传学研究及法医学应用提供了基础资料。 相似文献