新型平均势函数在蛋白质反向折叠中的应用

利用蛋白质主链的极性分数及主链二面角为参量,构建了一种基于蛋白质结构数据库的势函数。将该势函数应用于蛋白质反向折叠研究中,发现该函数可成功地将蛋白质分子的天然构象从构建的构象库中识别出来;将一目标序列与构象库的每一可能的构象匹配,并用该势函数计算相应的能量,结果表明对绝大多数蛋白质分子来说,天然的构象的能量值总是最低。此外,该函数还将一些序列相似性较低,而结构相似性较高的蛋白质分子识别出来。我们认     

蛋白质全新设计的现状和展望

对蛋白质全新设计的方法、设计原则、迄今为止取得的成就和存在的问题及目前面临的困难进行了综述.     

猪胰蛋白酶自溶活性产物—绿豆胰蛋白酶抑制剂复合物的初步晶体学研究

本文报道了猪胰蛋白酶自溶活性产物——绿豆胰蛋白酶抑制剂复合物的晶体生长及晶体学参数的测定。晶体衍射分辨率为2.8A,四方晶系,空间群I422,晶胞参数为a=b=121.6A,c=113.6A,V=1.680×10~6A~3,每个结晶学不对称单位中含一个复合物分子。     

银胶中三螺旋RNA poly（rU）．poly（rA）．poly（rU）的付立叶表面增强拉曼光谱研究

采用近红外付立叶拉曼光谱研究了三螺旋ＲＮＡ（ｒＵ）．ｐｏｌｙ（ｒＡ）．ｐｏｌｙ（ｒＵ）在溶液中的构象和在银胶中的表面增强拉曼散行为。结果表明在溶液中,该三螺旋ＲＮＡ分子中以Ｗａｔｓｏｎ－Ｃｒｉｃｋ碱基酸对的两条链处于Ａ－构型,而第二条嘧啶链处于Ｃ２’－ｅｎｄｏ／ａｎｔｉ构象。在银胶中,该三螺旋ＲＮＡ的表面增强拦曼效应明显。与溶液状态下相比,８３５和８１９ｃｍ＾－１谱带的出现暗示该三螺旋ＲＮＡ吸附到     

银胶中三螺旋RNA poly（rU）．poly（rA）．poly（rU）的付立叶表面增强拉曼光谱研究

采用近红外付上叶拉曼光谱研究了三螺旋ＲＮＡ（ｒＵ）．ｐｏｌｙ（ｒＡ）．ｐｏｌｙ（ｒＵ）在溶液中的构象和在银胶中的表面增强拉曼散射行为。结果表明在溶液中,该三螺旋ＲＮＡ分子中以Ｗａｔｓｏｎ—Ｃｒｉｃｋ碱基配对的两条链处于Ａ－构型,而第二条嘧啶链处于Ｃ２＇－ｅｎｄｏ／ａｎｔｉ构象。在银胶中,该三螺旋ＲＮＡ的表面增强拉曼效应明显。与溶液状态下相比,８３５和８１９ｃｍ－１谱带的出现暗示该三螺旋ＲＮＡ吸附到银胶表面后,该三螺旋ＲＮＡ分子的螺旋结构仍得到保留,且其构象与溶液中的相近。同时该三螺旋ＲＮＡ主要是通过核酸骨架上带负电荷的磷酸基团定位于银胶表面而吸附的。