秦川母牛群体遗传特性的微卫星标记研究

为了从DNA分子水平揭示秦川牛群体遗传多态性和群体遗传结构,寻找可用于秦川牛的微卫星标记,本研究选择了12个普通牛（Bos taurus）微卫星标记检测了90头秦川母牛各微卫星位点的遗传变异及多态性。结果表明,在秦川母牛群体中,12个微卫星位点共检测到了247个等位基因,各位点的等位基因数在13（INRA005）～33个（HEL13）之间,平均每个微卫星位点的等位基因数为21个;总有效等位基因数和平均每个位点平均有效等位基因数（Ne）分别分为142．6229和11．8852。各位点平均基因频率取样方差（V（pij））为2．6036×10^-4。12个微卫星位点平均观察杂合度（Ho）和平均期望杂合度（He）在0．7842（INRA005）～0．9775（BM315）和0．7952（BM315）～0．9446（HEL13）之间。12个位点平均多态信息含量（PIC）在0．7653（INRA005）～0．9420（HEL13）之间,平均为0．8965．12个微卫星位点均属于高度多态位点,这表明秦川母牛群体中所检测各微卫星位点具有丰富的遗传多态性,具备较大的选择潜力。12个微卫星位点的平均固定指数（F）为-0．0076,即各位点杂合子的缺陷度不高,即偏离Hardy—Weinberg平衡的程度不大。     

西门塔尔牛产奶性状的微卫星标记遗传效应分析

在4条染色体上选择12个微卫星标记对西门塔尔牛育种核心群6个父系组成的150头母牛产奶性状(包括乳脂、乳蛋白、乳糖、干物质含量和奶中体细胞数)进行分子标记遗传效应分析.结果表明:12个微卫星位点都具有高度多态性,杂合度(H)均在0.64～0.86之间,多态信息含量(PIC)达0.60以上,最高为0.85(ILST093);位点ILST093对奶中体细胞数有显著性影响(P＜0.05);BMS711对乳脂率有显著性影响(P＜0.05);BM1905与奶中乳糖含量呈显著相关(P＜0.05);BM6438与5个产奶性状均无相关性.     

不同基因型对南阳牛生长发育性状的影响

以南阳牛为实验动物,利用PCR-SSCP和PCR-RFLP技术研究了南阳牛生长激素(GH)基因,IGF-I基因以及IGF-IBP3基因的遗传多态,并分析了遗传多态位点对南阳牛0月龄、6月龄、12月龄、18月龄、24月龄以及36月龄不同生长时期生长发育性状的影响.结果表明: 在6月龄～18月龄,GH基因的GH-P5位点的BB基因型对南阳牛的体长、体高显著的正效应;在生长的后期(24月龄～36月龄),IGF-IBP3-P5基因位点对南阳牛的后躯发育起主要调控作用,BB基因型个体的尻宽显著高于AA型.这表明基因的正效应不是在所有的生长周期表现,而是在特定的时期内表现对南阳牛生长发育的显著影响.     

不同生长时期基因调控对南阳牛生长发育的影响

以南阳牛为试验动物,利用PCR-SSCP和PCR-RFLP技术研究了南阳牛生长激素（GH）基因,IGF-I基因以及IGF-IBP3基因的遗传多态,并分析了遗传多态位点对南阳牛0月龄、6月龄、12月龄、18月龄、24月龄以及36月龄不同生长时期生长发育性状的影响。结果表明： 在6月龄～18月龄,GH基因的GH-P5位点的BB基因型对南阳牛的体长、体高显著的正效应;在生长的后期（24月龄～36月龄）,IGF-IBP3-P5基因位点对南阳牛的后躯发育起主要调控作用,BB基因型个体的尻宽显著高于AA型。这表明基因的正效应不是在所有的生长周期表现,而是在特定的时期表现对南阳牛生长发育的显著影响。     

西门塔尔牛产奶性状的微卫星标记分析

通过对西门塔尔牛育种核心群6个父系组成的150头母牛产奶性状的测定,结合微卫星标记技术,于4条染色体上选择12个微卫星位点进行产奶性状的微卫星标记分析,研究各位点对乳脂、乳蛋白、乳糖、干物质和奶中体细胞数的遗传效应。结果表明： 12个位点都具有高度多态性,杂合度（H）在0.64～0.86之间,多态信息含量（PIC）也达到0.60以上,最高者ILST093的多态信息含量为0.85;位点ILST093对奶中体细胞数有显著性影响(P<0.05),位点BMS711对乳脂率有显著性影响(P<0.05),位点BM1905与奶中乳糖含量呈显著相关(P<0.05),位点BM6438与五个产奶性状均无相关性。     

中国7个地方绵羊品种遗传多样性的微卫星分析

利用26个微卫星标记分析了中国7个地方绵羊（Ovis aries）品种的遗传多样性。通过计算基因频率、平均杂合度（H）、多态信息含量（PIC）及有效等位基因数（N_e）,并根据Nei氏标准遗传距离,利用UPGMA法进行了聚类分析,评估其种内遗传变异和品种间遗传关系。结果表明：26个微卫星位点共检测到278个等位基因,Ne 在2.1288-13.3924之间;以等位基因频率为基础,得出位点的平均杂合度在0.0629-0.5903之间,品种平均杂合度在0.3633-0.4489之间。26个位点均为高度多态位点,PIC在0.6628-0.8712之间。聚类分析表明哈萨克羊、阿勒泰羊和巴音布鲁克羊遗传关系最近;然后与白藏羊、黑藏羊聚为一类;湖羊和晋中羊聚为一类。各绵羊品种的聚类关系与其来源、育成史及地理分布基本一致。     

牛FABGL基因的克隆及其与牛生物经济学性状的相关分析

运用同源序列克隆技术结合反转录PCR技术和3′,5′cDNA末端快速扩增技术得到了牛FABGL基因的完整CDS,3′非翻译区和部分5′非翻译区.序列分析和生物信息学研究表明,所获得的牛FABGL基因的cDNA包含994个核苷酸和780 bp的开放阅读框及198 bp的完整的3′非翻译区.该基因编码260个氨基酸残基蛋白,在氨基酸水平上与人的同源基因具有高度的相似性(88%).采用PCR-SSCP方法,在递交的包含完整CDS的长为1 925 bp的该基因的基因组DNA序列(GenBank接受号DQ409814)1 065 bp 和1 792 bp处,分别发现了两个单核苷酸碱基突变Y=C/T,R=A/G;它们分别位于该基因的第五和第八内含子.对包含这两个多态位点的3个品种(安格斯、海福特和西门塔尔)牛的共179个个体等位基因频率与部分肉质及生长性状进行了关联分析,结果发现,在第八内含子内具有GG基因型的个体的肉用性能指数(4.283±.0.475kg/cm)较具有AA基因型个体的(4.008±0.465kg/cm)高(P≤0.01);而且同一位点具有GG基因型的个体的眼肌面积(73.380±13.005 cm2)显著高于具有AA基因型的个体(67.744±12.777 cm2)(P≤0.05).在第五内含子内,具有CC、CT、TT3种不同基因型的个体之间,平均日增重差异均达到极显著水平(P≤0.01),以具有TT基因型的个体平均日增重最高(0.652±0.330kg/d),CC基因型的最低(0.421±0.178kg/d).     

中国7个地方绵羊品遗传多样性的微卫星分析

利用26个微卫星标记分析了中国7个地方绵羊（Ovis aries）品种的遗传多样性。通过计算基因频率,平均杂合度（H）、多态信息含量（PIC）及有效等位基因数（Ne）,并根据Nei氏标准遗传距离,利用UPGMA法进行了聚类分析,评估其种内遗传变异和品种间遗传关系。结果表明：26个微卫星位点共检测到278个等位基因,Ne在2.1288-13.3924之间;26个位点均为高度多态位点,PIC在0.6628-0.8712之间,聚类分析表明哈萨克羊、阿勒泰羊和巴音布鲁克羊遗传关系最近;然后与白藏羊,黑藏羊聚为一类,湖羊和晋中羊聚为一类,各绵羊各种的聚类关系与其来源,育成史及地理分布基本一致。     

IGFBP3基因多态性与秦川牛部分屠宰性状的相关性 Polymorphisms of Insulin-like Growth Factor Binding Protein 3 Gene and Its Associations with Several Carcass Traits in Qinchuan Cattle

以IGFBP3基因作为秦川牛（Bos taurus）部分屠宰指标的侯选基因,在对60头秦川牛的IGFBP3基因进行PCR-RFLP和序列分析的基础上,对秦川牛群体中IGFBP3基因座等位基因和基因型频率的分布及其与秦川牛部分屠宰性状的关系进行了分析。结果发现,在秦川牛群体中,651 bp的PCR 产物经过限制性内切酶HaeIII消化后,表现出3种基因型,其中等位基因A、B及3种基因型AA、AB、BB的频率分别为0.84、0.16和070、0.28、0.02。经序列分析发现,第299位的C→A颠换（GGCC变成了GGAC）导致了1个HaeIII限制性酶切位点的丢失而产生了该基因座多态性。在所研究的群体中,该多态基因座处于Hardy-Weinberg平衡状态（P＞005）。对13头24月龄秦川牛进行屠宰分析,发现不同基因型对秦川牛部分屠宰指标有一定影响,AA、AB及BB型个体的屠宰率、净肉率及西冷、牛柳、眼肉和嫩肩肉的产率逐渐降低,但差异不显著（P＞0.05）;AA型个体的眼肌面积大于BB型个体（P＜0.05）,AB型和BB型个体胴体脂肪含量高于AA型个体（P＜0.01）。 Abstract:DNA samples from 60 Qinchuan cattle (Bos taurus) were analyzed with PCR-RFLPs and sequencing for insulin-like growth factor binding protein 3 (IGFBP3) gene.Fragments of 651 bp were amplified with two primers and the products of PCR were digested with restriction endonuclease HaeIII.The produced fragments showed three genotypes,namely AA,AB and BB after electrophoresis.Frequencies of the genotype AA,AB,BB and allele A,B were 0.7,0.28,0.02,and 0.84,0.16,respectively.Sequence analysis showed that a transversion of C→A at 299 nt resulted in loss of the cleaved site of restriction endonuclease HaeIII and produced this polymorphism.This polymorphic locus of IGFBP3 gene was at Hardy-Weinberg equilibrium (P＞0.05).The genotypes of AA,AB,BB slightly affected several slaughter and carcass traits of Qinchuan cattle.Dressing percentage,net meat percentage,striplion percentage,tenderloin percentage,ribeye percentage and tender shoulder percentage were decreased with the genotypes of AA,AB and BB in Qinchuan cattle,but it was not significant (P＞0.05).Average ribeye area in individuals of AA genotype was significantly higher than that in individuals of BB genotype (P＜0.05),and beef fat content in individuals of genotype AB and BB was significantly higher than that in individuals of AA genotype (P＜0.01).