生物膜形成中间状态下副溶血弧菌的基因转录谱分析

【目的】探究生物膜形成中间状态下副溶血弧菌的差异基因表达情况,为今后研究生物膜形成调控机制提供基因信息。【方法】以非生物膜形成条件下为参照,采用Illumina HiSeq测序平台进行转录组测序（RNA sequencing,RNA-seq）研究,分析生物膜形成中间状态下副溶血弧菌的基因表达情况,并采用实时定量PCR （quantitative real-time PCR,qPCR）进行验证。【结果】本研究共获得979个差异显著性表达基因（differentially expressed gene,DEG）,其中下调基因379个,上调基因600个。基因本体（gene ontology,GO）分类分析结果显示,共有363个DEGs注释到分子功能、细胞组分和生物学过程3个一级分类和30个二级分类;京都基因和基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）代谢途径分析结果显示,共有706个DEGs归到37个代谢通路中（Q value<0.05）,差异表达基因主要集中在细胞代谢和转运通路上;蛋白相邻类的聚簇（clusters of orthologous groups,COG）分类结果显示,有888个DEGs可归为20个类别,涉及DEGs最多的为氨基酸转运与代谢、一般功能预测基因、能量产生与转换以及未知功能基因。qPCR验证挑选的DEGs变化趋势均与RNA-seq的结果一致。此外,从转录组数据中共筛选出10个c-di-GMP代谢相关基因、1个侧生鞭毛蛋白基因（lafA）、13个极生鞭毛合成相关基因、6个荚膜多糖合成相关基因、6个胞外多糖合成相关基因、5个IV型菌毛合成相关基因、膜融合蛋白（membrane fusion protein,Mfp）基因（cpsQ-mfpABC）、14个III型分泌系统1（T3SS1）相关基因、14个Vp-PAI基因（1个tdh2和13个T3SS2基因）、3个VI型分泌系统1（T6SS1）相关基因、6个T6SS2基因、45个推定调控子基因和15个推定的外膜蛋白基因。【结论】生物膜形成引起副溶血弧菌基因表达谱发生明显变化,差异表达基因中包含生物膜形成相关基因、关键毒力基因和许多推定调控子基因等,这为后续研究生物膜形成调控机制提供重要信息。     

我国不同地区棉褐带卷蛾的性行为观察

观察结果表明,茶小卷蛾性行为反应与成虫的虫龄关系甚为密切;当天羽化的雌雄蛾已具有一定程度的交尾能力。如和交尾能力更强的1,2天虫龄的异性配对时,性行为反应的比率达到实验最高值;我国不同地区棉褐带卷蛾24小时内性行为反应基本类似,雄虫振翅和交尾率均在凌晨6：00-7：00达到了高峰。茶小卷蛾和棉小卷蛾交叉配对时,交尾率达53.33%和60．00％。但当苹小卷蛾和茶小卷娥配对时．则未见任何交尾活动。我国不同地区棉褐带卷蛾显示出很强的同源性;本讨论了我国北方棉褐带卷蛾(苹小卷蛾)与南方棉褐带卷蛾（棉小卷蛾、茶小卷蛾)．目前可视为两个不同的亚种。     

采用一种新介质纯化神经生长因子

采用一种新闻子交换介质Ｅｘｐｒｅｓｓ－ＩｏｎＣ（简称ＩｏｎＣ）使鼠神经生长因子（ｍＮＧＦ）能得到规模纯化。以鼠颌下腺为原料,匀浆后,经Ｅｘｐｒｅｓｓ－ＩｏｎＣ纯化得单一组分的ｍＮＧＦ,用ＳＤＳ－ＰＡＧＥ测定其相对分子质量约为１３．７×１０＾３,比活约２．３×１０＾５Ｕ／ｍｇ。结果表明ＩｏｎＣ可替代ＣＭ－５２,且更适于工因子的规模化生产。     

黑曲霉CICIM F0410中α-葡萄糖苷酶的酶学性质研究

研究了黑曲霉(Aspergillus niger)CICIMF0410发酵粗酶液中α-葡萄糖苷酶的酶学性质,发现该酶最适反应温度为55℃,最适反应pH值5.0,在65℃以下保持酶活力相对稳定,且能在pH值(4.0～6.5)范围内保持相对较高的酶活力。以该菌株的染色体DNA为模板,PCR扩增出大小为3.1kb的片段,经序列比对发现与NCBI上已公布的黑曲霉(Aspergillus niger)CBS513.88(登录号XP_001402053)序列有2个碱基的区别:2272(A→G),3098(T→G),导致2个氨基酸残基的变化:687(Asn→Ser)、983(Ser→Arg)。     

内生真菌和诱导子对长春花悬浮细胞及生物碱合成的影响

目的:探讨内生真茵和诱导子对长春花悬浮细胞生长及生物碱合成的影响.方法:接种内生真茵与悬浮细胞的共同培养,添加诱导子到细胞培养液中对长春花悬浮细胞进行诱导处理,检测实验处理后长春花悬浮细胞各项生化指标.结果:培养液pH值上升,悬浮细胞MDA舍量增加,细胞抗氧化酶(POD、CAT)和生物碱合成的关键性酶(PAL、TDC)活性升高.生物碱产量得到提高,诱导组悬浮细胞生物碱产量达到770.36μg/gFW,共培养组生物碱产量为693.76 μg/gFW,分别比对照组提高了48%和32%.结论:真菌及其诱导子能改变长春花悬浮培养细胞的态势,导致细胞代谢结构的改变,使生物碱的产量提高.     

中国涤螽属的分类研究（直翅目：螽蟖总科：蛩螽科）

本文报道中国涤螽属Decma Gorochov,1993一新亚属副涤螽亚属Paradecma和一新种双刺副涤螽Decma (Paradecma) bispinosa sp. nov.,并附中国种检索表和缅甸异涤螽Decma (Idiodecma) birmanica (Bey-Bienko, 1971)雌性特征新描述。模式标本保存在中国科学院动物研究所。     

鸡SNP多样性的比较研究与群体有效规模的估算

以红色原鸡(Red Jungle Fowl, RJF)、丝羽乌骨鸡(Taihe silk Chicken, TS)、隐性白洛克鸡(White Recessive Rock, WRR)为资源群, 在鸡一号染色体的Contig.060226.1上选取了一个200 kb的区域, 比较研究了3个群体的SNP (single nucleotide polymorphism)多样性、估算了鸡的初始群体有效规模大小(effective size of population, Ne)。红色原鸡、丝羽乌骨鸡、隐性白洛克鸡3个群体的平均杂合度分别为0.28533±0.03475、0.32926±0.03919、0.30168±0.04038。显著性检验差异不显著(P=0.2368>0.05)。根据Latter 和Nei的方法对鸡的群体有效规模进行了估算, 鸡的初始群体有效规模大小为20 000～150 000。鸡在驯养的早期阶段经历过严厉的瓶颈效应, 但瓶颈效应对鸡各品种SNP的多样性并未产生显著影响。笔者认为, 鸡在驯养的早期阶段群体有效规模足够大, 品种分化过程中群体迅速扩张, 品种间的广泛杂交(特别是和红色原鸡之间)以及鸡基因组的高重组率等因素是导致家鸡和原鸡以及各家鸡品种间SNP多样性没有显著差别的重要原因。     

“城市-街区”尺度下绿地景观格局对雨洪滞蓄效能的影响研究进展

在雨洪灾害频发和存量规划的背景下,阐明不同尺度下城市绿地景观格局与雨洪滞蓄效能间的关系与机制,成为实现有限城市绿地的最大雨洪滞蓄效能并提高城市防洪能力的关键科学问题。本文系统归纳了城市和街区尺度下绿地景观格局对雨洪滞蓄效能的影响要素、作用机制和尺度差异。并基于研究结论差异致因和研究不足,指出未来应增加流域尺度研究、拓展三维绿地景观格局的研究,还应分别聚焦城市和城郊区域,针对不同雨洪敏感区和街区结构,建立具有雨洪过程指示意义的研究指数集合,以定量揭示城市和街区尺度的绿地景观格局对雨洪过程作用机理,为城市规划及城市雨洪安全格局构建提供理论指导。     

人类遗传突变数据库及其应用

随着人类基因组序列草图的完成,基因组突变的研究显得日益重要,而越来越多的突变信息的积累,使得各种突变数据库相继诞生。本文根据各种数据库的功能,对目前的人类突变相关数据库资源进行了分类总结,分类为突变数据库、单核苷酸多态信息数据库、与疾病相关的突变数据库、突变对蛋白质的影响、突变图谱以及特定基因的突变信息,分析该如何合理使用这些遗传突变数据资源,以及目前的突变数据库所存在的问题。Abstract：Researches on genome mutation are becoming more and more important with the finish of human genome DNA draft. This review is to classify the existing human mutation databases, including mutation database, SNP(single nucleotide polymorphisms) databases, mutation databases about disease, mutation databases about proteins, mutation databases about map and mutation information about specific gene. We also give advice on how to utilize these mutation databases, and discuss problems of existing databases.     

慢性髓细胞白血病急变期MICM分型回顾性分析

目的：探讨慢性髓细胞白血病急变期（CML-Be）患者的细胞形态学（M）、免疫学（I）、细胞遗传学（C）和分子生物学（M）的特征及应用价值。方法：对38例CML．BC患者的MICM分型进行回顾性分析。结果：以FAB分型为基础的形态学确诊率达94．7％;免疫分型结果为：38例CML-BC中CML-AML占71．0％,其中37．0％伴淋系表达;CML-ALL占23．7％,均为B细胞性,其中66．67％伴髓系表达;CML-MAL（混合性白血病）占5．3％,均为B系和髓系混合表达;CD34＋26例（68．4％）,cD7＋10例（26．3％）,均与CD34共表达。细胞遗传学结果显示：CML特征性Ph染色体检出率为94．3％（36／38）,附加异常染色体检出率为60．5％（23／38）,发生频率较高的类型是＋Ph、＋8和i（17q）;FISH检测BCR／ABL融合基因阳性率为100％,der（9）缺失占14．7％。RT—PCR检测20例患者BCR／ABL融合基因均为阳性,其中b2a2型（12／20）,b3a2型（8／20）,1例（1／20）,b2a2和b3a2双阳性（1／20）。结论：CML—BC是造血干细胞疾病,原始细胞分化阻滞在早期阶段,预后差。MICM分型对CML-BC的诊断、治疗和预后判断均有重要价值。