单分子荧光共振能量转移技术在核糖体移位研究中的进展

核糖体是蛋白质的"合成工厂",也是临床上多种抗菌药物的作用靶点,因此,深入理解细菌核糖体的蛋白质翻译机制意义重大.蛋白质翻译是通过多步骤相互协调、多组分精细配合来实现高保真和精确调控.核糖体在mRNA上的移位作为翻译过程中最重要的事件之一,需要核糖体大规模的构象重排以及tRNA2-mRNA沿着核糖体的精确移动.在细菌中,移位是由延伸因子EF-G催化GTP水解来驱动的.近年来,单分子荧光共振能量技术(smFRET)的发展使得人们可以探究单个tRNA分子移位的动力学过程并实时观测核糖体的构象变化.本文首先介绍了smFRET技术的原理及特点,对其在核糖体结构动态及tRNA移位研究中的应用进行了较为系统的总结,并对其应用前景进行了展望.     

mRNA环结构对蛋白质折叠速率的影响

前期的相关研究发现mRNA二级结构中存在对蛋白质折叠速率的重要影响因素.而mRNA二级结构中普遍存在着各种复杂的环结构,这些环结构是否对蛋白质折叠速率也有重要的影响呢?不同的环结构对蛋白质折叠速率的影响是否相同呢?基于此想法,建立了一个包含mRNA内部环、发夹环、膨胀环和多分支环等环结构信息和相应蛋白质折叠速率的数据库.对于数据库中的每一个蛋白质,计算了mRNA二级结构中各种环结构碱基含量、配对碱基含量及单链碱基含量等参量,分析了各参量与相应蛋白质折叠速率的相关性.结果显示,各种环结构碱基含量与蛋白质折叠速率均呈极显著或显著正相关.说明mRNA环结构对蛋白质折叠速率有重要的影响.进一步,把蛋白质按照不同折叠类型或不同二级结构类型分组后,对每一组蛋白质重复上述的分析工作.结果表明,对不同类蛋白质,mRNA的各种环结构对其相应蛋白质折叠速率的影响存在着显著差异.上述研究将为进一步开展有关mRNA和蛋白质折叠速率的研究奠定理论基础.     

前列腺癌患者组织中RPL6的表达及临床意义

目的:探讨前列腺癌患者组织中核糖体蛋白L6(RPL6)表达,分析其对肿瘤恶性程度的评估作用。方法:收集2013年12月-2015年12月在本院接受治疗的前列腺疾病患者117例,根据病理结果分为前列腺炎组63例、前列腺癌组54例;另取同期进行健康体检的健康者80例作为正常对照组。采用Western-blot法检测三组研究对象的前列腺组织RPL6表达,采用酶联免疫吸附法(ELISA)测定血清肿瘤标志物含量,采用RT-PCR法检测前列腺组织增殖基因、侵袭基因mRNA表达,采用Pearson检验分析RPL6表达量与肿瘤恶性程度的相关关系。结果:前列腺癌组患者的前列腺组织RPL6表达量高于前列腺炎组及正常对照组(P0.05);前列腺癌组患者的血清前列腺特异性抗原(PSA)、前列腺特异性酸性磷酶(PSAP)、尿激酶型纤溶酶原激活剂(u PA)、硫氧还蛋白(TRX)含量高于前列腺炎组及正常对照组(P0.05);前列腺癌组患者的前列腺组织增殖基因URG11、PTEN mRNA表达量高于前列腺炎组及正常对照组,PRDM5 mRNA表达量低于前列腺炎组及正常对照组,侵袭基因IgGHG1、TMPRSS2-ER、PIK3C2B mRNA表达量高于前列腺炎组及正常对照组(P0.05)。前列腺癌患者的组织RPL6表达量与肿瘤标志物含量、增殖及侵袭基因活性均呈直接相关关系(P0.05)。结论:高表达的RPL6是前列腺癌早期诊断的可靠指标,且与肿瘤恶性程度直接相关,有望成为前列腺癌辅助诊断及预后评估的重要手段。     

核糖体失活蛋白的结构功能与分布

核糖体失活蛋白是一类在植物中较广泛存在的毒蛋白。植物核糖体失活蛋白具有RNAN-糖苷酶活力,可作用于核糖体RNA,使核糖体失去蛋白质合成的功能。根据一级结构,核糖体失活蛋白可分为两种类型。Ⅰ型核糖体失活蛋白由一条链组成,分子量在25—30 kDa之间。Ⅱ型核糖体失活蛋白由两条以二硫键相连的链(A、B链)组成,分子量在60 kDa左右。B链可以与细胞表面含半乳糖的受体结合,有助于A链进入细胞,作用于核糖体。目前至少已从9个科31种植物中分离纯化了Ⅰ型RIP。Ⅱ型RIP较少,仅在6科8种植物中发现。除了具有RNA N-糖苷酶活性,还发现一些核糖体失活蛋白可以切割超螺旋双链DNA,产生缺口环状和线状DNA。此外,一种Ⅰ型RIP,克木毒蛋白还具有超氧化物歧化酶活性。     

香菇栽培种线粒体DNA和核糖体DNA多态性研究初探

本文应用RFLP技术研究了10个香菇主栽品种的线粒体DNA（mtDNA）和核糖体DNA（rDNA）的部分小区段,利用PCR技术扩增了rDNA5．8＋ITS区段及mtDNA的小区段,分析这些片段的限制性酸切图谱,并进行菌株间的遗传相似系数的估算。结果显示：菌株间的rDNA在5．8＋ITS区段差异很小,表明同一种内菌株间的rDNA具有相对的遗传稳定性;不同菌株间未检出mtDNA的差异,表明菌株间在所研究的区段具有很高的遗传相似性。     

透视化石的内部结构

古生物学的研究对象是化石标本,要对标本的内外形态进行观察和比较,然后对化石标本进行分类,确定它们的系统位置及其在演化中的意义。在观察标本的内部形态时,通常是通过实体解剖打开标本进行观察。但是对于一些非常稀有和珍贵的化石标本来说,解剖意味着对化石标本的不可逆转的     

核糖体失活蛋白抗HIV-1作用的研究进展

核糖体失活蛋白(RIPs)抗HIV-1活性研究已有十几年的历史。RIPs类化合物代表了抗HIV/AIDS天然产物或先导化合物发展的一个重要方向。本文从介绍RIPs的酶活性及其抗HIV-1活性入手，对RIPs抗HIV-1的可能机制，从与RIPs酶活性的关系、诱导HIV-1感染细胞的凋亡及相应的信号转导、诱发活性氧的产生，以及对HIV-1整合酶的抑制作用等几个方面做了较详尽的阐述，并对RIPs的结构修饰和抗HIV-1构效关系进行了综述。对RIPs类化合物在抗病毒领域进行深入而系统地研究，能拓宽其在抗HIV/AIDS临床上的进一步应用。     

用序列比对设计的茎环结构探针检测金黄色葡萄球菌

基于金黄色葡萄球菌16S rRNA基因序列,采用序列比对设计了一种茎环结构的寡聚核苷酸探针。探针的环序列即为金黄色葡萄球菌16S rRNA基因序列的其中一个片段,同其他菌种的16S rRNA基因序列误配2个以上的核苷酸,因此能高度专一、灵敏的检测金黄色葡萄球菌16S rRNA。根据分子信标技术和酶联免疫分析的原理,评估一个实验方法,即利用能构象转换的、固定化的茎环结构探针酶联检测靶核酸。由于探针的特异性加强,这个检测系统能有效的排除假阳性即不会出现误配一个核苷酸的情况。采用微量浓度测定分析,最低下限可检测出大约4ng的金葡球菌16SrRNA。这种方法的灵敏度比其他常规检测方法高出了至少一个数量级。     

车轮虫分类与系统发育研究进展

车轮虫属一大类寄生性纤毛虫原生动物，可不同程度地给宿主造成危害，故对其研究既具有理论意义，又具有经济价值。文中简单回顾了车轮虫的分类研究和系统发育研究的历史。在分类学研究领域方面，全面介绍了目前车轮虫科已发现属的寄生部位和地理分布等；而系统发育研究领域方面，则介绍了车轮虫研究在萌芽期、探索期和发展期这三个时期的进展，包括形态学和分子生物学两方面的研究内容。并对该领域今后应进行的研究提出了建议。     

生物表面活性剂Surfactin生产菌株的定向改造策略

表面活性素(Surfactin)是芽胞杆菌属(Bacillussp.)代谢产生的脂肽类生物表面活性剂,是由非核糖体肽合成酶(NRPS)催化而得的一种次级代谢产物。由于surfactin具有稳定性好、可被降解、表面活性好等理化性质以及抑菌、抗肿瘤等生物活性,在医药、农业、食品、化妆品、石油开采等方面都具有很大的应用潜力。但是,天然菌株产率低、生产成本高等特点限制了surfactin的规模化应用。本文对surfactin的合成机理进行了简要阐述,并针对目前提升surfactin产量和改变结构组分的4种定向改造策略(启动子工程、强化外排分泌、改造NRPS结构域和脂肪酸链合成酶系)进行了综述,最后对surfactin的研究方向进行了展望。